EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM138-05995 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Retina_neonate 
Coordinate
chr18:60890690-60893620 
TF binding sites/motifs
Number: 11             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
E2F6MA0471.1chr18:60891775-60891786CCTTCCCGCCC-6.62
EWSR1-FLI1MA0149.1chr18:60891906-60891924CCCTCCTTCCCACCCTCC-6.04
GATA2MA0036.3chr18:60891877-60891888AGAGATAAGAA-6.32
Gata1MA0035.3chr18:60891877-60891888AGAGATAAGAA-6.32
Gata4MA0482.1chr18:60891876-60891887AAGAGATAAGA-6.02
Nr5a2MA0505.1chr18:60893538-60893553GAGTTCAAGGCCAGC+8.25
TCF3MA0522.2chr18:60890983-60890993AGCAGGTGTT-6.02
ZNF263MA0528.1chr18:60892714-60892735CCAACCTTCTCCTCCTCCTCA-6.31
ZNF263MA0528.1chr18:60891910-60891931CCTTCCCACCCTCCCTCCTTT-6.37
ZNF263MA0528.1chr18:60892711-60892732GCCCCAACCTTCTCCTCCTCC-6.56
ZNF263MA0528.1chr18:60891906-60891927CCCTCCTTCCCACCCTCCCTC-7.54
Number of super-enhancer constituents: 8             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_02684chr18:60882505-60908736HFSCs
mSE_03043chr18:60881691-60909034TACs
mSE_07285chr18:60892112-60893543Intestine
mSE_08053chr18:60886356-60893438Kidney
mSE_08451chr18:60890886-60893404Liver
mSE_09088chr18:60890766-60893538Lung
mSE_09411chr18:60890919-60893536MEF
mSE_12232chr18:60890958-60893422Spleen
Enhancer Sequence
TCGGTGCTCT TAACCACTGA GCCATCTCTT CAGCCCTACT TAGCTATTAA AGGGATCCCT 60
AGCACACCCC AGAACCCCAC CATCCCAGAT CTCAACACCT CCAGCTGCCC CCCCCCACTA 120
AAACACATGT AATTGTGTTC TTGCTCAGCA CCCATAACCT AGAAGGCAGA ACCTGTCACC 180
CTGACAGACC ACAGGGGTCT TTGCTGCTAA CTGCTCCTTC TGGGTGTGGT GTTGAATCTT 240
TGTGAAGTAT TTTCTGCAAA CCTATCAGGA ACTTTCAAAG TAACCCCCTA TGAAGCAGGT 300
GTTAGGATGG GCCCATTTAT ACAGGTGAGA AAATAGAGGA CCAGAGAGGT TCTTTCATTT 360
GCCCAGAGTC TCACAGCCCA GCAGCAGAGG AAGTATTCGC TGTCCACTTG CCTGAGTCGA 420
GCTCAAACTC TTAACCACCT TACTACGCTG TCTCCTCAAA CATTCCTTAC TGCCCTGGGA 480
ACTAGACGCC AGGACGACAC TGCTGTACAG AGGAGGGTAG AGCAATGCCG AGAGCCTGAG 540
GCCCCCACCT CCCCTTCAAG CTCCCCGAGG CCCACCAAAA GCAAAACTCC TTCCCAAGAG 600
GCACGCCAGA CAGAGGGTTT GAGACCTTCA CCACAATCTG CCGCCCGCTG TCGGGAGGAG 660
GGATAAGGCA GGTTTGCCAA GAGAAGACAG AACTGAGGGA GGTAGACTAT TGTCTCAGAG 720
CAGATTCTGG GCAGGACAAG GCACACCTTA CGACCCGACA GCTCTCAGGG CCCCCAGGTA 780
CATTCCACCA GTGTGTGCTA CACCCCAACA AAACTGACCA GAAATCGCAG TTCTCTCTCC 840
AAAGCCTGCT TGTTCTGAGC CCTCCCTGTC TTCTCAGTTA GTGTCAACAA TGTCCTTCCG 900
GTGCCGCCAG CCAGCCACAC TCTCCTCTCA CCCCCACAGC TAATCCCTCA GCAAATCTGT 960
CAGCTCATCC TACAGGATAA ATCCAGAGGC AACTCCTAGT GGGCCCCCCT CCCTGCCACT 1020
GAGCCACCAT CATTCATGGG GGGCGGGGGG GATGGTCACC TCCTGACATC CTGCATAACC 1080
CCTGCCCTTC CCGCCCATGA TCCATGATCT GCAAGAAAAG CTAAGCAGGT GAGTCCTCCA 1140
CCCCAAGCCT CGAGCAGGTT CCCCTTTCCT CAAAGTTCTC CTTCCTAAGA GATAAGAAGC 1200
CCTTCCCACC CATCCACCCT CCTTCCCACC CTCCCTCCTT TCCTCCCACT GCCTGCCTGC 1260
CCAGGTGCTT TGGTGCTCCC TCTGCCTGGC ATGCTCCTCC CTCCTGTGAC ACCCCCCTGC 1320
TATCCCCAGG CCAGCTCTTC TCTTCTCCTG GGTACTCCTC ACCACTCAGC ACACAGTGTT 1380
TGCTGCTTTG CTGGCACTGC CCCCTTGGTG GTGTGACATG AAAACAGAGA CTTGGTCTAG 1440
TCTGTGTACT GTGTCAGTTC CTAGAAAAGG CCTGAATGAG GCAGATGTTT GTAAAAATGT 1500
GATGAATGTG ACTACTGCCT CCCTTAGTCA GACACATCTA GTCCCTGAGT CCTGAAGGGT 1560
GATACCACAC CCGGGCCTTA GTGAAATCTC TAGGCTTTCA TGTGACCAGT TCTGGCCAAA 1620
TTCCCAGTGG TGACCACTGG ATTCTATGTT CCATTTCTCT CTGCTTCCAG TCCTTGGGCC 1680
CCTGGAAAGA AGCTCAAGGT CCTGACACTT GGACTGGCAG GAGTCCTCAC AGGGCTGCCG 1740
CTAGTGTCCC CCAAAGCCCA CAAATGCTCT CAGCAGGTGG AGGGGAAAAC CAGGGCCTTG 1800
TCTGTCCTTC TCTGACAGCA GGAAAACTAT CAGAAATTAG CTTTGTTCTC AAAGGAAAGC 1860
ACAAAGCCAG TGCCAGGCAG AAGTGGGCAC AGAGACAGCT GGCCCATCAT AGACAGTGCA 1920
AGGGAAAACC AAGAAACAGG ATGCAGGGTA TTTAAGGGGT CACTCACATA CCCAGGCTAG 1980
TTCATGCCTC CAGGATACTG TGGGCCTGCT CAGTCTTCCA GGCCCCAACC TTCTCCTCCT 2040
CCTCAGACAA TCAGCTGATT GTCTCCACTG GGTGATCTGC CACTAACTGT GCAGAGGAAA 2100
ATGAAGACAG AAGCAACGCC CGGCTTGGAG GAGAAGACCC GAGGTTCCAG CCCAGATTTG 2160
CATATACTCA GGCTCCGCCC TTTAGAACCT CAGTTCCGTC CTGTACTTAA TGTCTCAGCC 2220
CATGTGCCAC CGGACCTCAA TACACCAATC ATTTCTTACA AGGCCCGAGA GCAGAGGCCC 2280
AGTACTTACC TGCTAAGAGC CAAGCTGCCA GCGTCTTCCC CTTCCGGATC AGACAAAGCA 2340
CACCTCTCCT GGCGTACCTG TCTCCTGAGC TGCCAGCCCA TGGGAAGGGA AACCCTCTGG 2400
GCCTTCACCC CACCTCACAA ACCTGCCTAA TGCGCTACCT TGAAGAGTTG CTCAAGAAGC 2460
ATGAGGAACC ACAGAGACAG GGAGGAGCCC TACAGCTGGC CCAGAGGAGA AAGAGAAGCC 2520
AGGGGTGGGG GAGGGGAGGT GTTCCTGTTA AAGTTACTCT GAGGCCCTCT ACAAGCCCTG 2580
GGCTCTGTGT ACTACAACAC AGTGAATGCT CAACATGTAA TCTGACCTCA AAGAGCTCTC 2640
CATGGCTGGA TATTCTGGAG AGGAGAAGAC TATATCCTAG AACAGAGGCA GGGAACAGAA 2700
ATCTATAGGC AGTTTCTGTA AGTTTTCATA TTCACAGAAT AATTGTGATT TATTAGCAAA 2760
GACCACTTCC AAAAAGTGTA ATCTTCATTG GCTTGGAAGC CCACACCTTA ATCCCAGTTC 2820
TTTGAAGCAG AGGCAAGTGG ATTTCTGTGA GTTCAAGGCC AGCCTGATCT ATATAGCAAG 2880
TTCTAGGCTA TCCCAGGCTA TACAATTAAG AACTTGTCTC AGAAAAAAAA 2930