EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM138-05720 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Retina_neonate 
Coordinate
chr17:85884180-85887520 
TF binding sites/motifs
Number: 12             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Alx1MA0854.1chr17:85884822-85884839GAGAGTTAATTAAAGCG-6.09
Alx4MA0853.1chr17:85884822-85884839GAGAGTTAATTAAAGCG-6.61
FOXK1MA0852.2chr17:85886998-85887012GCCTTGTTTACCCA-6.3
RARA(var.2)MA0730.1chr17:85887089-85887106AGCTCATTTGAAGGTCA+6.14
Rarb(var.2)MA0858.1chr17:85887089-85887106AGCTCATTTGAAGGTCA+6.01
ZNF263MA0528.1chr17:85884450-85884471GAAGGCTGAGGAAGAAGAGGA+6.14
ZNF263MA0528.1chr17:85884543-85884564GGGGGAAGAAGAAGGGAAAAA+6.17
ZNF263MA0528.1chr17:85884456-85884477TGAGGAAGAAGAGGAAAAAGG+6.38
ZNF263MA0528.1chr17:85884792-85884813CCTTCCTTTCCCTCCTCCCCG-6.4
ZNF263MA0528.1chr17:85884769-85884790TTCCCTTCCCTTCCCTTCTCT-6
ZNF263MA0528.1chr17:85884789-85884810TCCCCTTCCTTTCCCTCCTCC-8.88
mix-aMA0621.1chr17:85885534-85885545CCTAATTAATT-6.32
Enhancer Sequence
CCCCCTCCCA ATGAGTTTTT AGTTATGTTT TTAAAATTAG CTGGCGCTTG AATTCCATTT 60
TTCACCTAAG CTTCCCTGTT ATCTTTAAGG TCACAGAAAC ACGTAGGCTG TGGACAGTCC 120
AATCCCAGAT ATTATTAGGC TCTCGGAATT AAAAGCCCAA GTAAGTAAAT AAAAAGAGAA 180
TGCCGGGAGA TTTTCCCATG CTGAACGCCC GAAGGAAGGC CGGTCCCCTG TTTTTTCCTG 240
ATGTGATGCC CCCCCCTTAC ATTGAGAGGT GAAGGCTGAG GAAGAAGAGG AAAAAGGCTT 300
TCGACCTTTC TATCTCCAAG GTCTGTTTCT TCAGCAACAA GGAAGAATCA GATGTATTCT 360
GGAGGGGGAA GAAGAAGGGA AAAAAAAAAA AAGCAACTCA GGCGCTGATT GTCCCTTTAA 420
GCCTTTCCAA TCACAGGCTC GTCGTTAAAA TAATGCTCGC CTACTGAGCT TCCAACCGGG 480
CCATCTACCT TTTTCGCCGG CGGGGTCAAG CCCAGTCAAG CCTGATGAGG CTGCCACCGC 540
CCCAGCGAGC AAGCCACCGG CCAGCTACAC CTGTTTATCG CTGGATCCCT TCCCTTCCCT 600
TCCCTTCTCT CCCCTTCCTT TCCCTCCTCC CCGCTTGAAA AGGAGAGTTA ATTAAAGCGG 660
TAAACAAGCC GGCTCCCCTT CTAAATCAGA GCTGCAGGCA ACGGGGAGAT AACTTGGGCT 720
CCGGAGAAGA GGGATTTTCA GCTAATTTAT GGAACCCACC GTCACTCTCT CTCTCTCTCT 780
CTCTCTCTCC CCGAGCAGCC TGCTCCCTGC TTAACGGGGA AATTGAAGCA GACAGCCTTT 840
GTCTAAACAC TTCTTTTGCC CAGAATATCT TAATTTTCTA TTTGAATGTT TAATAAGGTT 900
TGGGGCGCTC CTTCTTTTTT AATTGCCATG GTGCAGGCGT TTGGGTGTTA ATGTTTGGCT 960
GGTGGCTGCC GGGCACCAGT CTTTGCTGGG CGTGGAAGGA AGGGCCAGCG TTCCCAGGTT 1020
TGACTCGAAC AGCCTGTGCC AAACGGATGA TATTACTTCT GGGAGCGGTG TACCCCCAAA 1080
CCAGGGTTGT CTAGAGACGC TTGGTCTACG TGCAACACCC TTTGCTTCAC CCTTTCCCCC 1140
CATCCCCAGC CCTGTTGATG CCCGCAGGCG TCCTGGGTCT CATCCCTGGC CCGGTGCCTG 1200
CTTTCTTTCT CTCCTGTCCT GGACCAGCTG TCAGGTACCA GGCCGGGCCT TGGCCAGACT 1260
GTACCCGCTG TCCCAGACCA TCTTAGGGTA TCCTTGTCCT GCTAGGGTTG GGCCCTGGCT 1320
CATTTCCGGC TGCTCCAGTG AGCCCACAGC TCTGCCTAAT TAATTCTAGG AGGAGGCTCT 1380
CTGTGGCTCT CTTTCCCAAC CGATAGCTGG AATTCCTAAA AATGTAAGTG GAGCTCGTAC 1440
TGAAATTAGT TTTGAGAAGA TCGTGGGCAA GCTAAATTCT TGTCGTTTCA TGCGTAAACC 1500
TTCATGAAAA AATAACAACA AAACCCCAGA AATGTCTTAT CCATATTTCA AGGCAGCCTG 1560
CTTTTCCGGG TGCCATATCC AGTCATCATG TTGACAAATT AATGGCAGAG AATTAGTTGT 1620
ACATTAAAGA TTTAAACGAT ATTATGCAGC ACATTGTCAT AAAATGATAT AAAACAATAG 1680
GAAAATAAAT GTAAATGAAT TCAAGTTACT GACATGTAAA ACACCAGACT GACATCTGTA 1740
CACTTAACGC GGCGATCAGG CGCGGTGGCG GAGCCCCGGA CGCCGGCGTC CCTCTGTGAA 1800
GACGCCCGCA GGGGCGCGCG GTCCAAGGTT GGGGAAGGAT TGTTTGAGGG GGGGCCGCCG 1860
GCCGGGCACC CGGCGTGCTA AGGGTTAAGT GCGCCGATCG CGGCTCTCTC GACTCCCCTC 1920
CCCTGTGTCC TGATTTCCAG GCCCACCGAG CCAACCGAGA AAGTTTTCAA TTCGACGAGG 1980
CTGGCGTGTT TCAGGGGCTG AGCTCCTTAG AAAGCTTCGG GGGGCCCCCC CAAGGGCCGA 2040
CGTGCAAGGG CGGGGGCGAC TTGCCCTGTC CTGGACACGC TAATTACAAG GATTCGGTTT 2100
CCCGGCTCTG AAGGAATGCA TTACCTGCAG CAAAGCAGGC CGGGCCTCTC AGGAAGGCCC 2160
CAGAGGAAGC CGAAGGCCCC AGTGAATTCC AGCCCCATCC CTAGGTTTAT ACCCACAACC 2220
CCAGCCCACG CTGAGCGACT AATCGCTTGG CCATTGTCAG GGCTGTTGTC CAATCAGACC 2280
CTGAATAGCA AAACTTCACA ATGCCGAGTA TGAATTAGAG GGGAACAAAT GTGGATGCAG 2340
ACTTTTTTTG CAACAATACC TAACTGAGCC TTTCAGACAG GACAAGGGAT GCACAAAAGC 2400
TCGACGGAAA TTGGAGTAAC TTTTGGAGGC CCTTGGAGCT CCCGTCAATA AGCGGCAGCT 2460
CCATAATGGC GGCCTGGACC TCCTCCATCA GCCTTCCCCC AACCTTTTTT TTTTTTTTTT 2520
TTTTTTTGGT GAGGTGGATC AATTGTTCGA GAGGTGGGGG AAAATTGTCA TAAAAATTGG 2580
GCATTTTTGT TGTCCCTGTC TTGGAAACGG TGGCTCTCTG TTGAACGAGG CCAAGTGGGT 2640
TTCCCTCTCT TTCTCGCTTG CCCCCCCCCT TTTTTTTAAA TGTGAATTGT AGATTTGGTC 2700
ATTATTTAGC CTACGATAGT AAAGTCCTGA CAATGTCGCC TCCCTCCTCT GTCCACCCCC 2760
AAAAGAACAG AATGGCTTCT TGAGCTATAC AAATGTCAGG TCTCTGTTTT AAATTTTAGC 2820
CTTGTTTACC CAACAGATCA GAATTCATTA CTGTGTAAAA GTGGTTCCAT TTTCTGATCT 2880
TTTTATTCAA AATGTTGAGA GTATCAAAAA GCTCATTTGA AGGTCACAGG TTTCTGTATC 2940
TATTCTCTTA AGTGTTTTAG AAATTCATAT GGACGACACA AAAGGTGGAT AATGTGAAAA 3000
CACACAGCTC ATTGTTTATC CTAACCTTGC CACAGTTATT AGATAAATGA GTGTGGGGAG 3060
GAAAAGTGGC ATTAAAAGCC ATTGTGAACT GGGAATTTTT TTTTCCCCCT GAAGACTGTT 3120
AATTTTAGCC CTTGATCTGT AAAGGTCAAT TTCTAATTCT TTTTACTGCG CAGTTTATAT 3180
AACTTCTGCA TTTCAAGTCT ATAAAAAGCT TCTGCAGACT TTTCATAATG TAGGTAGCAA 3240
TTTATTTCAT TATGGTTTGA ATTTTTTATG TAAGTCCTAT GGACATTTTG ATGAAATTAT 3300
CAGGCTTAAA AGCTGTGGTG CTTTTCATTG GGGGGTGTGG 3340