EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM138-02999 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Retina_neonate 
Coordinate
chr12:85881090-85884340 
TF binding sites/motifs
Number: 11             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxd3MA0041.1chr12:85884281-85884293GTTTGTTTGTTT+6.32
Lhx3MA0135.1chr12:85884289-85884302GTTTAATTAATTA-6.19
Lhx3MA0135.1chr12:85884292-85884305TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr12:85884296-85884309TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr12:85884293-85884306AATTAATTAATTA-6.78
Lhx3MA0135.1chr12:85884297-85884310AATTAATTAATTT-6.92
Nr5a2MA0505.1chr12:85884043-85884058GCTGTCCTTGAACTC-7.06
POU6F1MA0628.1chr12:85884294-85884304ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr12:85884298-85884308ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr12:85884294-85884304ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr12:85884298-85884308ATTAATTAAT-6.02
Enhancer Sequence
CACTGAACCA CCTCTCCATC CTCTTAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAGAC CACATTTCAA 60
GGGTTCAATG GCCACACGTG GCCAATGGCC ACCATGTTTG TCTGTGTAGA AGAAGAAACC 120
AAGTGTTCCC GCCCTTGTTC ATGGCGCTAC TCTGCCATTA TAGCAGTATT GTTAGGGCTT 180
ATGGGGGGTG GGGGGGTTAA TTGTAAACTG ATTTTTGAAA AGGTGATAAG TACAAGCCAA 240
AAATACGCCT CCCATTTCCT GTACCTCCAT CCACTGAGCT ACTTGTGGGA ACTATACACT 300
GTTATATACG TGGCTTTTCC CCCTATTTAA TGCATTTTGG ATCCTGCTCA TATATATTCA 360
ATAGTAATAT ACTGTACTAC GGGGAGGTAC CATAACTTAG TCGCTGATGG ACTTTTGGGT 420
GATTTCCAGT CTTTCCAACT GGGATACGCA GGAAGGTTCT GCAGGCTGCG CTGTAATGAA 480
ATCCTTGCGC ATACATGTAA ATCCTCAGAG TGCGTTAATA GCAGGGAACT CTTGGGTCAA 540
AAGCTACATA TACATTGTAA TATAGATCAC TAAATTGCCC CCTAAAGAGG TTGCGACAAG 600
AAGACCTGAT CCCCACACCA TCAAACACTC TTGTGCTGTG AATGCAAATG TCCACAGTGA 660
CACTAGTTCT CCAAGGGAGG GGCTTCCCAT TGCCTCTGAC AACCTGCCCT CTTAGACTAT 720
CTCCCAGTCA CGTCTTCCCA CTGCCAAGGA TAGTGAACAT TCTTTAGGTT TTACTCATTG 780
TGTGTGTGTG TGTGTGAGAG AGAGTGAGTG TGTGTGATGT GTAAGTGAGC ACAGGAAGAT 840
GTTTGCCACA GTGCAAGTGT GCAGGTGGGA GGGACCTTCC AGACTCAGTT CTCTCCTTCC 900
ACCCCGGTTC CAGGGATCAA GCTTGGGTCA TCAAGTTTGC ACCCACTGAC CCATCCTGCC 960
AGCCCAGTCA GTGACATTTA ACTGGGTGCT TCCTAGGCCT TGCCTCTGTG TCCCATGAAC 1020
TGTTCACAGT AACCAAATGA GGTAAGGTAG ACATTGTTAT CCTGTTTTAC AAACGAGCCC 1080
CGGGCTTAGA GAGCATTTAG GTCAGTTGGA GTCTCCTAGC TCTAGGCAGA GCTGGGATTT 1140
AACCACAAGT CGGCCTCTCT TCAAAGCCTA CCCCTAGTAC CAACAGGCTC ACCTGCTCCC 1200
CAGCCCCTTC TCACTATGTG AGCTTCGGGC TTCCCCATTC TCCTGCTAGG GTCCAGTTCT 1260
CTCTCGGGTC CATTTGCCCT TCATTCTTGT TCTCTCTCCT CCCTAGAGCC AGAGCAGACG 1320
TCTCCATTCG GGACTCCTTA CTCTTCAGTA CCAGTTCCCT CTACTCTTGA TCTTGAGACT 1380
GCCCTACCTG AACCCCGGAT CTGCCCAGCC CTCCCCTAGG TGATGCCTCA GACTTTGGGG 1440
TTGGAAGAGC TGGGGAGGGG AGCAACGGTT ACCATCACCT GACCGTACCC AGCCAATTCA 1500
CAAAGACAAG ATGTCAAGTT AATGAGCCTG TAGGCTTCTA ATTAGCTGTC AATTACCTCA 1560
AATTAATCAA CTCCTCGCCT AATTAAGCAT TATCGGCAGG TGGGCACAAA GCAGACCATT 1620
GTGTGGGAGC CATGAGAAAA GCTGGGCTGG CAAACTTGGT TAGGATCAGT GCTGTGCACC 1680
GCAACAGCCT CCCTACAGCT CTGAGCTAGC GGACAGCTAA GAGGCACCAA GGACCTCTCT 1740
CCCCACTACT GGGGTCTCCA GGACCTCCTG AGGAACTGAG TGAGTGGACA GGGAGATGTA 1800
GAGCTCAGAG TCCGGTGGGA CTTTAGGGAA GTGGATCAGT AGGAATGGAG AGCCATGAAG 1860
AACCCTCAAG AGCAGCCCCT GACCCCTGAG ATCCTGGGCA GGAGTGGAGC CAAGAGGAGG 1920
CCGGGAGTTG AGGCTCCCAG CGGATGTGAA CTCTGTGGCA CTGGAAATGA CTTAGACTTC 1980
TTTGGGCTGC TTTTCCATTC TAAAAATTGA GAAGACTTTT TCAAGGCCTT CCCAGACCTC 2040
TGAGACTCTC CTTGGGAAGT GCCTGGTCCA CACTAGTCAG TGTGTTCAGT GGTGTAACAG 2100
TGGAGGCGAG CCACACACAA CTCAGCGGCT TCGCCTAAGA ACTGCTCAGG GTATGGAGTC 2160
GGTACCTCTA GGCTCCTGAC AGTCCCCAGC TTTCAGTACA CCCCTGAAGA CTGTGAATTG 2220
GTGCTCTACA ACATGCCAGG TGCTGGAGGC TGAGGTATTC TGGCTACATC TGTGTCCCCA 2280
TCTCTCTACA CCTTTGGGTA CCCAGGGCTC AGGTGTCCCT CTCCACTCAC AAAGAGCCCT 2340
GATACAATAC ATGGCTCATC ATATGAGTTA AACACCCATC TCCAACTAAA GAAGTGGAAG 2400
AAAGGGCCCT GTCCAACTTA GGTGGGAGGT GCAAGGCCTA AGGAGCCAGG CCTTAGGACA 2460
GACCTTGGGT ACTGAGATTA CATTTCTGAT ATGGTCCTGG CAGCTGAATA CTTTTGACCC 2520
TGGGACAGGG TGAGCTTGGC TGCTGGGACT CCAGCACACC GAGTATGTTC ACCATCTCCA 2580
CCCTGGCACC TGACATCATC TTCCCTTGTG GGGCGATGGA GGCCACTTGT CTTTCACTTC 2640
TGTGGAAGCT TGGAGACGTT CCCTCATCCC TGGTATAAAT CAGTCACCTA GCAAACATTT 2700
ATTGTGCTTG CTGATCAAGG GTCACAGTGG AAAGGGAGGT GGCTGGGCAA ACAGAATTGT 2760
TAATGTTGTG CCCTGGAGAT GAAAGGGACA GTAGGCCCTT AGGAAGTGCC TACTGTGTGC 2820
TGGCAGGAAT AGCATATAAA AAAAATTGGT GAATATATTA TTTGTGTCCA TAGGTATGTT 2880
TAATGGGTTG TTTATCAAGA TAGATGCTGT GTTTACAGTA TTTGTTTAGC CAGAGACTCA 2940
GTGTATAGTC TAGGCTGTCC TTGAACTCAC AGTCCTCCTG TTCAGCCTCC TAAGCGCAAG 3000
GTTTACACAC ATGCCAGTAC ATATATACAC GCATGCCAGT ACACATATAC ATGCATGCCA 3060
GTACATATAT ACACACATGC CAGTACACAT ATACAGGCAT GTCAGTACAT ATATACACGC 3120
ATGCCAGTAC ATATATACAC ACATGCCAGT ACATATATAG TTTTGGTTCC TTTATGTCTT 3180
TGGGTTAGTT GGTTTGTTTG TTTAATTAAT TAATTAATTT TTTACTTATT CACTTTACAT 3240
CCAGATCACT 3250