EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM138-01711 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Retina_neonate 
Coordinate
chr11:53304020-53307620 
TF binding sites/motifs
Number: 11             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
EsrrgMA0643.1chr11:53306875-53306885ATGACCTTGA-6.02
FOXC1MA0032.2chr11:53307378-53307389TAAGTAAATAT+6.14
FOXD2MA0847.2chr11:53304439-53304452GTTAAATAAACAT+6.36
Foxd3MA0041.1chr11:53306103-53306115GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr11:53306107-53306119GTTTGTTTGTTT+6.32
Nr5a2MA0505.1chr11:53304825-53304840AACCTCAAGGCCAGC+6.23
RARA(var.2)MA0730.1chr11:53307284-53307301GGGTCAGGCTGAGGTCA+6.92
RORAMA0071.1chr11:53306876-53306886TGACCTTGAT-6.02
Rarb(var.2)MA0858.1chr11:53307284-53307301GGGTCAGGCTGAGGTCA+6.26
ZNF263MA0528.1chr11:53304671-53304692AGAGAAGGAGAGAGAGAGGGA+6.23
ZNF263MA0528.1chr11:53304674-53304695GAAGGAGAGAGAGAGGGAGAG+7.06
Enhancer Sequence
AATCCCATGC CATCGGATGA GGAGCTTGTG TTCCAGGAGG AGCTTCTGAC AACTTGTCAG 60
ACCACCTTGG ACACACACAG GAGCCAGACA ATAATGGGTC AGTCAGTGAT GAGAGGGAAC 120
ACACCCTGGT TAGGACTGTT TAATTATGTA TGCATATATC TCATGCCTTC CATTTAAAAC 180
CGTCAGTGCC AGTGAGGTGA ACTTGCTGGG TGGGTGGGAC CTGAAACTCT TTATTTGTTC 240
CTTTCTCAGT ATGGTCACAT GGATAAACCT CTTTCCCTAT ACTTTGATAT TTCTTGTCTC 300
TTTAATTGGT AAAGTGAGGA CATGTAGGTG ACCACAGGGG GCTGCCAGGG CCTAGGCTTG 360
TACCCTAAAA TATCCAGAAG CAAGGGTGGC AAGCCCTTTG TAGTTATTAA GGCTACTTAG 420
TTAAATAAAC ATAAATTTTA CAAGCTCAGG CCAGGTCTAG AGAGATGGTT CAGTGGTTAA 480
GAGACTGTTC TTCCAGAGGT CCTGAGTTCA ATTCCCAGCA ACCACATGGT GGCTCACAAC 540
CATCTGTAAT GGGATCTGAT GTCCTCTTCT GGTGGGTCTG AAGACAGCGA CAGTGTACTT 600
GTAAAAATAA ATCTTAAAAA AAGAGAGAGG GAGGGAGACA GAGAGAGAGA GAGAGAAGGA 660
GAGAGAGAGG GAGAGAGAGA GAGAGAGAGA GAGAGAGAGA GGGAGAGAGA GAGAGAGAGA 720
GAGAGAGAGA GAGAAAGCGC TCAGGCCAAG CAGGATGCTG TGGCACCGCC TTTAATCCCA 780
GCACTTGGGA GTCAGAAGTC AGTGGAACCT CAAGGCCAGC CTGGTCTATA TAGTGAGCTC 840
CTGGAAAAAA ATAAAACAGG ATGAAAAACC AACACCAACA CCAAAAATAT AAATTAAAAA 900
AACAAACCCT CGGCTAGAAA GATGGCTCAG TGGGTTGGAG TCAGTACTGC TCTTCCACAG 960
GACTGGGGTT CTGTTCCCAG CAGCCACAAC CAACTCCAAC AACAGGGATC CAACATCTTC 1020
ATCTATCTGG TCTCTGTGGG CACTAGCGCC CATGTACACA TACCCACACA CATTCACATA 1080
ATTACAAATA AAATAAATCT ATTTCTTTTC AAGCGGCTTC AGGGACTGGT AAGATAGATC 1140
AGTGGATAAA GGTACTTGCT ACCAAGCCTA ATTACCTGAG TTCAATTCCC AGGACGCACA 1200
TGGTGGAAGG AGAGAACTGA TCCCCACAGT TGTTCTCTGA CCTCCACAGT CACACTGTTA 1260
CACACGAATA CAAAATAAAT AAATAAATGT AATTTAAAAA GTCTTCATAG TTCAAATACA 1320
TTATATAACA TTAGACTCTA TTATGACTTT CAACCCACGC TGGCCACTAA ATTCCACGCC 1380
TACGCCCGCT GAGCTGTGGT GGGCGCTTAT GGTTTTGACC ATTCTGATCC TTGTTATGGC 1440
AGTGGGAATC TCTTGTTTTG CGTGTGTGGC CTCTCATTAT GGGCCCCTTC TGGCCTCTTA 1500
AGCGCCATCA GCAGGGGGGT CTCCAGCTAA AAGGGACTTG AGGGGGATGG GTGGCCAGCA 1560
GAGGCTGCAA AGGGACTTTG CCCAGATAGC AAGCTGTTTT TTTAGTCACG ACTTCCTTCC 1620
GGAACAAATC ATGTTTTGTT CTTGCTTACT AGCCCAGGGG AAGCGAGAAG GCCTCTCTCT 1680
CCTCCTTTCT CAGGCTTGCA GCCTGTTGTG CCTGATCTCA ATGAGGTCAT AGTTCTGAAT 1740
CCTAGCACCA GGTCACATGC CCGAGTTGAA AACTCAGTTT TTGCATCTGC GATTTTTTTT 1800
TTCCAGGCTG TTTTTGTGAT AGGTCAGACT GGTTGCTTGG TTGCTAAGTC GGGAGAGCAG 1860
CAAGCCTGGT CCTCTGAGAC TTGGAAAAGC TGGGTACCCA TGAGGTGATG CTCCTCAAGC 1920
AGTCCTCTGC TACTTTTCCT CCCCCCCATT TCTTTTCTGC CTGCTTAATT CTACTACATG 1980
AGGCATTTTG TTGTTGTTAT TGCTTTAAGA CAGGGTCTCA TACAGCTCAG GTTAGCCTCA 2040
AACTTGTGAT ACACCTAAGG ACAGCCTTGA ATTTCTGATC TTTGTTTGTT TGTTTGTTTT 2100
GTTGTTGTTT TTTTGAGACA GGTTTTCTCT GTGTAGCCCC GGCTATCCTG GAACCCACTC 2160
TGTAGACCAG GCTGGCCTCG AGCTCAGAAA TCCGCCTGCC TCTGCCTCCC AAGTGCTGGG 2220
ATTAAAGGCA TGCACCACCA CTGCCCGGCT GAATTTCTGA TCTTTCTACC TTCCTCCTCT 2280
CCAGGACTGG GGTTATAACT ATGCACCACG ATGCCTATTT TATGGGATGC TAAATATGGA 2340
GCCCAGGGTT TTTTATTTGC TAAGAAGATA CTCTATGTAT TGAGCTTTAT CCCCATCCTT 2400
AATGTATAAT ATTTATTTTT ACTTATGTGT ACGTACGTAT ATGTGCCTGT CTGAGCAAGT 2460
GTGTGTACAT ACACATGAGC GCGCGCGCGC GCACACACAC ACACACACAC ACACACACAC 2520
ACACTGTGTT CAAGTGCCCA AAGAACCCAG AAGAGGGCAT CAGATGCCCT GGAGCTGGAA 2580
CAGGTTAAAT TGTGAGCAGC CTAGTGTGGG TGCTGGGAAG TGAACTCTGC TGTTCTGCAA 2640
GAGCAACAAG TGCCCTTAAA GGCTGAGCCA TCTCTCCAGC CCCACATACG GTAGAAGGTT 2700
TAACAGAAAA GATTCTTTTA CCCACACCCC CTCCCCTCTG AGGGAATTTG GAGGCTTAGT 2760
TGGTTGGTTG CTTTTTTTTT TTTTTTTTTT TCCTCACTAG GCTGTCTGAA TTAGGATGGG 2820
CCTAATTTAA GAAGCCTGCA GAATGCTGTT AAACCATGAC CTTGATTGTG AAGTAGTGAC 2880
CCTGCTGACT AGGCTAGATG ATTCAGAGAC TAGACTTCTT GCTGTGACAG ATGAATACCA 2940
ATTCAGCCAG GATCTGAAAT TATAGTACCA GTGTTTAGAG ATGTGAGACC CATCAATGGG 3000
CATTTGCCCT TGGGACAGAG AGAGTTGTCC TGGTTTTAAA GACAGCCTGG TAGACACAGT 3060
TCAATTTGTC CCTAACCTCT TTCATAGCCA TAATTAACTC GCCTTCTACT TAGATGAAAG 3120
ACATCAGCTT GTCTTGCTTC CTTGTCTGTA CTCCTAAGTG CTCATTAACA GAGGGGCCCC 3180
CATCAATCAT GTGGAGTGAG CGGTAGGAAG AGCCTGATGT CAGGTGTTGA TTGAGACTGT 3240
CTAGGAATAG TGTGTTTGAG AGAGGGGTCA GGCTGAGGTC ATGGGTGAGA GTCGAGGTGG 3300
AGGTTAGACT GGCAGCAGGA GCTTAGTTCT AGGTTCTTGC CTTGTTGAGA CTGTCAGCTA 3360
AGTAAATATG GAGCAGATTT ATTAGCAGCC TTCAGAGCAA TCATCTGTGA CATTGAACAA 3420
TGCCTGCAGG CTGCCATGTT TCCCACTGTG TGCATAATGG ACTAAACCTC TGGTATTGTA 3480
AGCCAGTCCT GGTTAAAGGC TTTCCTTGAT AAGAGTTGCT GTGGTCATGG TGTCTCTTCA 3540
CAGTGACAGA AATCCTAAGT AAGGGCTGGA GATGGCTCAA TGGTTAAGAG CACTAACTGC 3600