EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
MM138-00613 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Retina_neonate 
Coordinate
chr1:168209580-168213800 
TF binding sites/motifs
Number: 18             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ALX3MA0634.1chr1:168213697-168213707TTTAATTAGA-6.02
BARHL2MA0635.1chr1:168212399-168212409GCTAAACGGT+6.02
EWSR1-FLI1MA0149.1chr1:168211182-168211200CCTTCCTTCCGAACTTCC-6.6
LEF1MA0768.1chr1:168211600-168211615AAACCTTTGATGTTC-6.2
RFX1MA0509.2chr1:168210964-168210980AGTTCCCATGGCAACA-6.08
RFX1MA0509.2chr1:168210964-168210980AGTTCCCATGGCAACA+6.1
RFX2MA0600.2chr1:168210964-168210980AGTTCCCATGGCAACA+6.3
RFX2MA0600.2chr1:168210964-168210980AGTTCCCATGGCAACA-6.43
RFX3MA0798.1chr1:168210964-168210980AGTTCCCATGGCAACA-6.26
RFX3MA0798.1chr1:168210964-168210980AGTTCCCATGGCAACA+6.37
RFX4MA0799.1chr1:168212932-168212948GGTTGCCGTGGTTACC+6.04
RFX4MA0799.1chr1:168210964-168210980AGTTCCCATGGCAACA+6
RFX5MA0510.2chr1:168210964-168210980AGTTCCCATGGCAACA-6.54
RFX5MA0510.2chr1:168210964-168210980AGTTCCCATGGCAACA+6.59
SOX10MA0442.2chr1:168209734-168209745TGCTTTGTTTT-6.02
Tcf7MA0769.1chr1:168211603-168211615CCTTTGATGTTC-6.11
ZNF263MA0528.1chr1:168210015-168210036GCCTCTCCCTCCTGCTCCCTC-6.09
ZNF263MA0528.1chr1:168210874-168210895TCCCCCTCCCCCTCATCTCCC-6.46
Number of super-enhancer constituents: 3             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_10800chr1:168209731-168210666Olfactory_bulb
mSE_10800chr1:168210990-168211673Olfactory_bulb
mSE_10800chr1:168211757-168213654Olfactory_bulb
Enhancer Sequence
CATAGAACAA GTTCAATCCA GCTTGCTTAG ATACAAGGAA AACAATATGG CTTTCCACAG 60
GCTTTCGGTG ATTTTTTTTT TAATTTCATT TCAAAGGCCC CTGGATTTAA AAATTAATTC 120
TCCACAGAAG GTAATTCCTC AAATCGCCAT TCACTGCTTT GTTTTGGTTT AATATTGTTT 180
CCATCGCAGA AAGAAAAGAT TTTGCTTATT GATCGCACTT TAAACCAAAC AGCAAAGTGG 240
GGAAGAAATT ATCCCTGCTG TCACCTTGAA CTGTCACATT TCCACAGTTA TTTTGATCGC 300
CAGGGATAGA GGTTCCAACT GACTTGGGTG TATCTTTTGG CATAGGTAGC AGGCAAACCC 360
CAGGGGCATC CCCAGATTCA ATAAATGAGC TCTGGTGGCT GATCGATCAG TGTGTCACAG 420
AGCAGGGCTG TTCTTGCCTC TCCCTCCTGC TCCCTCTTCA GCTCCACTCT CGGGCAAGGT 480
CTCTTCACAT GAAACAATGA GGAGCTGGGC AGGCCCCTGC CTCTGCCTGC CTCAGGATAG 540
ACAGCTGCTC TCTCTCTCTC TCTCTCTGCA AAACTTCTAG CCCTGCTGTT GGAGGGAGGC 600
AGTCCACCCC CACTGGGGCT ACAGAGGGAA GAAGAAGCCC TTTCCCGAAG GAAACCAGGC 660
AGTTGTTTCC AAATGAAGAG GAAAGGAATG CCAGGCAGGC AAAAACACAC ACTGTTAACA 720
TTTTGTGGAA TTCGTCATCA GTTTCTGCTT CGTTATGGGC CAAATGTAGT GCTAACTGAG 780
GAGGCCAGAA ATAGGTGTGC TCTCAGCAGG TCCCCACGAG TAGGCACCAA TTTGGGATTG 840
ATTCTTTCCC ATAAATACAA TGCTGTAGAA TTACCTTTGT CTTCCTGTCA TTTTTCTATT 900
TTTTTCCTCC ATCTCCTCCT GCGACTTACC CAAGAGTACT GCGTAGATTA CCTAGGCAAG 960
TAAAAGAATG GGCGGGCATG GACCTCTCTC TCTCTCTCTC TCTCTCTCTC CTTAATTCAA 1020
GCTATTCACA GTCCTGTGTC TGGTAGAAAA TAAATGTCTC TGCTCACTAG TGTTTTTAAA 1080
AGCCATTAAG AACCGATTAA CTAATCAATG GATTTGAGGG AGGGGATATC TCCCAGGAGG 1140
TGACTCCAGG GCTACTTAAT GGAAGTATTT CCTAAGATTG TGTGGAAATG CCCTGGCACC 1200
CATCCCTGCT TCCCTGCAGT TCCAGTTTGA ATCCTGTCCC ACATCCCAGT GATTTCAGTT 1260
CAGGCTGTTC AGAGAGGCTA CTTGTTGCCA AGACTCCCCC TCCCCCTCAT CTCCCTCTTT 1320
GCCAGCCATA GCCTGGTGCT GCTAACCAGG GAGATTTGCC CATTAGAAGG GCCTCAGCTC 1380
CCAGAGTTCC CATGGCAACA GCCTCCTTGG AGGTCTTTTG TTGCCTGCTA AAACTTTGAT 1440
CTCAGAGAGT GGCTGCTGCT GTTTCTCTCT GGAAGATTTA CAAACAGAGG GAGAACGGTA 1500
AAAGAATTGG GGAAGAAAAA AGAAGTTTAC TCCTGGCAGA AGGGAGAGGT GGGGGAAAGG 1560
AATTATCAGA GCCACACTCT GGCCCCAAGT CCAGAGAGAG AACCTTCCTT CCGAACTTCC 1620
TAATTCTGCA TTCCTCTCCC CACATTTCAT TTGCAGACTT GACCATGCTT CAGGCTTGGG 1680
CTCATCCCTG GTAGGGTGGA AGCATCCTAC TTTAGCACAC ACCAGCACCT TCAGAATTCT 1740
AGATGGCTTG AGATAATTCC AAAGACTCCC ATGAACAGAG GGGCAAAATG AGGGGTGGGC 1800
TGTTCTGGGC AATGCTCTCA TGTCTCTTCT CCAGCCTCTT TGTCCTATCC CTGGCCTGGT 1860
CTGCCCTAAA ATTTACTCAG ACGCCCTTGC TGTTTTTATG AAGAATGAGA AAATGTATTG 1920
AAAGGAGAGA GGAGAGCCAG AGGAGTTACC CAGGCATCTA ACTCCTCTTA GAAACTGTAG 1980
CTAGGAGAAG AGGCAGAGAG TCCCTCCAAG ATATGGAGCC AAACCTTTGA TGTTCTGGGC 2040
AAGCTTCTCT TAGTTTCAGG AACTCATTGC ATAATCCTAA TCTTGCTCAC TGATAGACAC 2100
CACAGAGCAG GTCAGTATTG CTTCAATTCA GATTTATATT TAAATTGTGA TAAAAAAAAT 2160
TTCATGAGTA TTTTTAGCTG TACTGGGATC CCACACAATG AAGACACAAA ATACATAAAT 2220
GACTTCATTG TGTCCCTGTT AAAACTTTGT GTCCTTTATG AAGATAAAAG TTGTGGTTTG 2280
GTGGCGATGA AAGAACAGTT AAAAAAAAAA AAAGGATTAA AGCTGTGCTT GGATAATAAG 2340
TATCTGTGTC ACAGGTTCTC AGTAGAGGGG TGCTTGCTCT GCAGGAGACA TTTGGCAGTG 2400
TTTGGATGCC TGTTTTGCTT GTCACGCTGG CCAAGAGTTA TGAACCCAGT GAAGAGAGGC 2460
TGGGAAGGCT TTGGAGCCTC CTACAATACA GACTAGTTCA CGATACTCAT GCTCTGACTT 2520
TACACATCCC AGATGCCAAG TGTAAGGAAG TCCACTTGGA TACTGCACAT GGTCCAGTGT 2580
GAGCATGGCA TAGAGGCTTG GGGCCAGACA GCCCTTGGTA TACTAATACG AGCTTAGTTT 2640
CCCCAATCTG TAGGAGAGAG GGGTCTTAAA AGTCATCCCA AAGGCTGGTT GTTAAGAAAA 2700
AAATCCAGTA GCTATTAGTT CCTTCTCTTA CCTCTTGCCA CTCTCCACAT GCCCCCACCA 2760
GTGTGTCATC TCTAATCTGA GGGAACCCTC TTTAAGGAAA TCTATGTTGA AGTATTCCTG 2820
CTAAACGGTT GGTTTTTTCT TAAGCAGATT TAATGAGTCT CTTGTGAATT GACCGCTAAG 2880
AATAGACTCA CATTTTCTCA TTGACGTCCC AGCCCCCTTT GAAATCATCC TGATGGTGAT 2940
AAACTTGGGG TTTATCTGAC CCAACACACT TTGTTATCTT TGGGTTGTCT CATTTTGGCA 3000
CCCCGTTTTC TGAGGCATTA GGATGTACAG CTCCCTTCAA CTACATCAAT CAAGCACTGC 3060
AGCCCAGGGA AAGAAGGTGC CTTCATGGAA TGGTAGCTGG TTGGAAAATA TACCCAAAGA 3120
CTTCTGACCT GACACAGCTT TGCATTGCCC TGCGTCGCTT AAAAACCAAA TGAGGCCTGG 3180
CAGACGCTCT TCATGAGTGC CCAGTCCCTC AGCCACCCCA GCCAAGGCTG GCCCCAAGCC 3240
TGCTCTACCC TCCCTCCTCA CAAGCAGCCC AGCTCACTGT TTTTGCCTCA CTTGTTGCCC 3300
ATCCCTGTGG GAGGAACACG GCCTTCAATT AGCGTGCATT CCTGACCACC TCGGTTGCCG 3360
TGGTTACCCC GGGAGGTGCT GGAGCAGCTG GGTCAACCCG CGCGCTCTTT GTAGTCTTCT 3420
GAGCCCTTGC GTGGGGGAGG GGACACAGGG CCAGCGCTGG AGTGGGTGGT ACCGGGAAAT 3480
CGGCTCAGTC CCCCAAGGAA AGAATGGCAG TCCGTCAAAG CGGGTCAGGA GACAGTTCCA 3540
TTTTCTCCAA AGCCAGCTGC CTCTATTCAA TGCATGCAGG TTTGGTTCAC ACGGGGACAG 3600
CGCCTCGGAT TTTGTTGAAT TGGCTTCCCA GAGAGGGCTC TGGGAAAGGG TCCATCATGG 3660
AAGCCCTTTA TACCCCAAGA GCGCTTCGCC ACCAAGGAAA GGGCAGGAAC TCTGGCCTGA 3720
ATGACCTTAT AGCAGTGTAC CCTCAGTGCC TGTCTGAGAC CTCAGGGCTT TTTTGGTTAA 3780
GGAAAGTAGT GGTCCCTGAA TATTGGATCA AGTCTAGTGG ATATCATTGT GCAAATCTGT 3840
TTCACCCAGC ACAATAAAGT GCAAGAAACC ACACTGATCC CCACAAACTC AATTTCCTCC 3900
TTCAGTGGTG TCCCGCCATC CTCATCGAAT TTTGAGTCAG TCTAGCTCTC TTCTATATTC 3960
CATCATCTCA GACCAAGTCA AGCATGTTAT ATTACTAATG ATATTTTCCA TCCATTCACT 4020
GTTTTGGGGG CCGGAGGTTG GATCACTAGA GCACTTTGCA CAGGCCAAGT ACCTTTGCAA 4080
CCATTATTAT TGTTTGTTAG TTTCTGTCCG TATGTCTTTT AATTAGATCA CACGGTGTCA 4140
CGATGTATCC CAGTAATCAT TTTTCTAGTT GCAATTGCAA GACGTGTTGC GATTTTTTTC 4200
AACAATCTCA TCCAACATTT 4220