EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM138-00489 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Retina_neonate 
Coordinate
chr1:136461930-136466590 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ArntlMA0603.1chr1:136462773-136462783GGTCACGTGC+6.02
Foxd3MA0041.1chr1:136462405-136462417GTTTGTTTGTTT+6.32
Nkx3-2MA0122.3chr1:136462068-136462081TTTAAGTGTTTAT-6.71
ZNF263MA0528.1chr1:136464330-136464351TCTCCCTTCCCCCCATCCCCA-6.29
Number of super-enhancer constituents: 3             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_10176chr1:136460970-136463340Embryonic_stem_cells
mSE_10176chr1:136463895-136465504Embryonic_stem_cells
mSE_10176chr1:136465509-136466329Embryonic_stem_cells
Enhancer Sequence
CACATCATAC ATGCAGCACA TTCACACATG TACACACATA CTCTTCTTAC ATAAGACTTT 60
GAAAATCATT TAAATCTTTT TTCCTGGATA TAAGAATACT TTTTTGATAA AGCCATAACT 120
ACCAGGGTAG AAATGAAGTT TAAGTGTTTA TTGTTTGTTT GTGCCTCTGT TTGTGTGGAA 180
GGAAGTGAGC AGGTGCACAC GTGTCCTGCT GTCCTGTGGA GGTCAGAGGA CAGCTCTCAG 240
GAGTTGTTTT CTCAGTCCAC TGTGTTTTGG AGCCAGGTGC TGTTTCTGCC AGGTGTGCTT 300
CTGGCTAGCT GTGGAGAAGG CTTCAGAGTG CGGTGTGACC ACAGAGACAT GCCACCGAAT 360
CTGGGTTTTA TATGGGTCCC AGGGATAAAC CTCAGGTTGT CGGGCTTGTG CAACAAGTGA 420
AAAGTATTTT CACTCACTGA GCCATCTAGC TCTCAGTCCC CTAACTTCTT TTTTTGTTTG 480
TTTGTTTTGA GTCAGGGTCT TTCTGTGTAA TAGCTCTGGC TATCCTGGAA CTCTGTAGAT 540
CAGGCTGGCC TGGAACTCAG AGATTCACTT GCTCTGGCCG TCCTGAGTGC TGGGATTAAA 600
GGCATGGGCT AACATGCCCG GCTCTGTTTT GTTTTTTTTG TTTTTTGTTT TTTTTAAAGA 660
AAAAAGTTAC TAGTATGGAA AATAATTGCT GTAGCTATTT TTCTAGATAA AAGCAAAGGG 720
CAGTATTCCT GGAATGAGGA CCAAGCTGAT TGATTGTAGA GAAGATGAGG TTTTGTCCTG 780
TTGCGGTTAC ACAGGTAACA TTGCAGCAAT TCAGAGTGAG CTCTCTAGTC TTTAATGCGT 840
GACGGTCACG TGCCTAGGTG AGCGTGGGGT TATAGTGCCT GGGTTTTAGC CAGTGCTTTG 900
GTTGCCTTTT ACAGTTTTCA GAACTTGTAA AGAAACTTGA CCATTTTGGG AACAACTGTT 960
AGCAGGTGTA GAGGTGTGGG GAGTGGGTGG TCGGATTTCC TGTCTGCCTT GTTCCTTTGC 1020
TGGAATTGGC CATATTTTAT ATCAACTAGT TTGGAAGGGA CTTTCTGCAC AGATTAGCCC 1080
TTTTGTCTGA CAGAACAGTT GAGGGTCAGG AGTGCTCAGG GAAGAGAATG AAGTAGCCTT 1140
TCTAAGATTC TTAATGTGTG ATTAGGTTCT TAGGTAACTT TTCTTCTGTG CAGGAGAGTA 1200
GTTTAGCTTT CAGCATTGAT GCAATTTCTG TGAGTAGAAT TGCTAGTTAA CATTTTATAT 1260
GGTGTTAGTT TTTTCTTCCT TTGGTGCTAT TGGAAGTCCT TGTTCATGTT TGGCAAGTTC 1320
TGTACCATCA AGGGCTGTAT ATTCCCAGTC CTTGTTTTGT ACTGTTTTGA GACAGGATAT 1380
TGATATTTTT ATTAAGCTAG CCTGGAATTC CCAGAGCAGT TCAGGCTGGC CTCAAACTCA 1440
GTACTTTGCT TTGAATTCTA GGATTACAGG AGTATCTTAA CATACTGGGC AGACATCCCC 1500
TTTAATTTTA ATTTTCTTTT AATGTTAAGA TAAAGTTGTT GCCAGGCATG GTGATGATGC 1560
ACACCTGTAA TCCCAGTATC ATAAGGCAAG AGGAGAGAAT GTTTAAAGCC AGCTGCTCAT 1620
CTCTTAAAAA TCTGTTTCTT CCAAGAAATA TTTTTTTAGG GATAAACATT TTATCAAATC 1680
TGTGCATGTT GTGTGTATTC TTAAAAGTCA GTTTATTATG TACAAGGAAG GGCTATTTTA 1740
AAAGCTGCCT AGAGTTGTTT TTTTGTGCAT CCGTATTCAT ATTCGTGCCT GCAAATGACT 1800
GTGTGCTCAT TTCGTGGCAT GTGCACACGG AGGTCGGAGA ATAATCCTCC TGCGTGTGTG 1860
TTGGTTCATA CTTTTTTTAA AAAAAGATTT ATTTATTTAT ATGTAAGTAC ACTGTAGCTG 1920
TCCTCAGATA CTTCAGAAGA GGGCATCAGA TTTCGTTACA GATGGTTGTG AGCCACCATG 1980
TGGTTGCTGG GATTTGAACT CGGGACCTAC GGAAGAGCAG TTGGCGCTCT TAACCACTGA 2040
GCCATCTCGC CAGCCCCTGG TTCATACTTT TTGTTTAAGA CAGCCTGTTT TTCTACTGTG 2100
TATGCCAGGT TACTAGTCTT CACACTTCTG CCTCTCCTTG CCATCTTCCC ATAGAAGCCC 2160
TGGAATGAGG AATGCTGTTT CCATGTGGTT GATCTTCATG TTTGTGCAGC AAGCTATTTT 2220
ACCCACTGAG CCATCTTCCC AGCCAGCCCT AGAATTTTTT AATCTGGTTG CATCATGACC 2280
TTGGATAAAG TCTGTTTACC CCAGTGTGTA TACCTTCTCA TCTGCTCTAA AGGGATCTGA 2340
CACTGACCGA GGGCTACTGT CTGGGTTAAT TAATGGATTG CAGGAGCTTA AATCTTCAAG 2400
TCTCCCTTCC CCCCATCCCC ACCCCCTTCC TTTGCTAAGA AGAGTCTGGG AACAGATGTA 2460
GCAAGACAGA AAAGTCTGGG ACAAATACAT ATCCCTCATT TTCCTACAGA GAAGAATTGA 2520
TTTTAGTGAA ATTAGGAAAG GCAAAAAAGC CCAACACCAT CAAAGCTAGA ATAAGAACTG 2580
GGCATGGTCT GCATTCCTGT CTGCTTTAGT TTAGAGGCAG GTGATCAGTT AGAGGCCAGC 2640
CTGGCTTACT CATGTTCTAG GTTAGTTTTG GAAATACAAC AAGACCTCCC AACCCCATTT 2700
CTAACCCCCA ATCCTAGGAT ATACCTGGAT GTGATAGGTT ATTCCCAGCA TCCAGTAGGC 2760
AGAGACAGAA TCATGAGTTT AAGACCAACC CAAGATAAAT AGTGAAACCT TGATTTTAAA 2820
AAATCCAAAC TAGGGCTGGG TGGTGGCACA CACCTTTAAT TCCAGCACTT GGTGGGCAGA 2880
GGCAGGCAGA TCTGAGTTTT GAGGCCAGCT TGCTTCTACA TAGTTAGTTC CAGGACAGCC 2940
TGGGCTCTGT TACAGGAGAA ACCCTGCCTT GAAATAAATA GCAACCTCCC CCCCCCCCCA 3000
AAAAAAAAAA AAAAAACTAG TGGATACTGG GGAGGTTAAC TGAAGGGCAG CCATGAGGAA 3060
GTCATGGCTG GTGAGACTCT TCAGTGATGG CTCTGTTTTG GGGTCCTGTA AGTAACCCCT 3120
CAACCATTAT CTGGGAAGCC CAATAAATGC ACTGAAAGAA AACCCACACA GAGAAGCCTC 3180
CCCCCACATG AATCTAACAA GTATAATCTT CCTTTTTGCT TGCTTGCTTG CTTGTTTATG 3240
AGGGGTTCAT GTAACCCAAG GTGTCCATGA ACTCCCTACC TCCCAGGTAT TGAATTGTAG 3300
CTTTGCATTA TCATATTCTA GTTTATTCCT TGTTTTAGAT GTGTAAATGT TTTGCTTGTG 3360
TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTATACG TACTAGTGAG TGCCTGATGC 3420
TTAAAGTGGT CAGAAAAGGG CATCGGATTC CCCTGGAACT AAAGTTACAA ATGATTATGA 3480
GCTGCTTCAT GGGTGCTGTG AATTGAACCT GGTCTTTTGG AAGAACAGCA AGTGCTCTTA 3540
CCACTGAACC ATCTCTCTTG TTTTTATTTT TTAAAGATTT ATTTGTATGC ATTTATTTTG 3600
GTCTATGTGC ATGAATATGC ATATGTGTGT GGGAATTCAG GTACTTAACT TGTGCACCTG 3660
TAGAGGCCAG AAAAGGACAT TAGAGCTTTA GAACTTGGAA TAACAGTGTT GGTGGATATC 3720
CTGCTTGAGG TACTGGTTCT GGGATCAGAA CCCCAGTTCT CATGATTGTG CAACAAGTGC 3780
TTTTAACTGC CGAGCCATTT GCTCCAGCAC TGTTGCGTTA TTCTTGAGAC AGGGTCTTAC 3840
TGTGCAGTTC AGGCTAACAT CTTGGTTGAT TCAGGTGTAG ATTTTCTCAG TACCTGAATC 3900
TTTAATTTGA AGCCTGCCGG ATCTATAACT GAAAAACAAT TTGTGTATGT GTGTGTGTGC 3960
GCGCGCATGC ACACACACCT GTATAGTAAC AGCAATTGAA CTAGGGCCTC ACTCTTGCTA 4020
GGCAAGCATT GTGCCAGTGA GCTACAGCCC CAGCACATCT GCCACTTTCT GTGTCACAGT 4080
GTTTTAAAAA ATAGACAAAC TTTTTCAATG AAAGTAACTA GAATTCGCAA TCAGAAAAAC 4140
TTGGAACTCT GAGTCTGGAG ATTTATGGAT CTTATAAAGA ACCCCATTGG GTTCCTAGTG 4200
CCCATGTCAG GCTTCTAACT GCCTATAATG CCAGCTCCAG GAGTCCAACT CCTCAGACTT 4260
CCAGGGACAT TTGAAGTCAC ATGCATATAG AGACACATAA CTAAAGCCTT GGAATTATGT 4320
AGTCTCTTCT ATTACTTCTT AGGTGGACCT ATATTTTATA TTTTACTTCT CTTTGGTGGG 4380
CCTATGCATT GTATACTTTT ACTGTGTTTT TACTACTATG CTTTTGTGAG TGTATGTATT 4440
AGTCTTAAGT CAAACTTAAT AATGTTTTCT AGATGTATGT AAGTACTGTC CAGCTGAAGG 4500
GATGGCTTGC TCATTTGATA CAATGCTTGT CTGTATGAAA TATGAGAGCC TGAGTTTGAG 4560
ACCAAGAAAT ATACAAAATC TGGCTGTGTG TAGTAGCCTA TTCTGGTCAT ACTGTTCATT 4620
GCTGGGGAAG CAGAGAACAC AGGAAGGTGC TTGGGGCTCA 4660