EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM138-00297 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Retina_neonate 
Coordinate
chr1:87503660-87506260 
TF binding sites/motifs
Number: 6             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
EWSR1-FLI1MA0149.1chr1:87504294-87504312GAAAGGAAGGCATGAGGG+6.28
Foxa2MA0047.2chr1:87504339-87504351ACAATGTAAACA-6.04
IRF1MA0050.2chr1:87505394-87505415TCTTTCTTTCTTTTTTTTTTT+6.25
SPI1MA0080.4chr1:87504903-87504917AAAAAGAGGAAGTC+7.01
SPICMA0687.1chr1:87504903-87504917AAAAAGAGGAAGTC+7.34
ZNF143MA0088.2chr1:87505813-87505829TACCCACAGTGCACTG+7.3
Enhancer Sequence
TTAAAGGGGA AGATACAATC TTGCTTTACC TTCTCACAAA TGTCCTTACT TTCCTGCTTG 60
GTCAAAGTCA CAGATGCCCT GTTTATCTCT GAGTTCAGCC TGCTGCGATG CCACAGCCCA 120
CGGGCACCTG CGAATATCAC CCAACATTTT TGGGCAGAGG AAAGAGAAAA TGGGCAGATG 180
GTATTTCAGG ATTGTTCTGA GAATAGTTTG TTCTTGTTGG CATCTGAAAG AGTCTTGAGC 240
AGGGGTCGTC AGGCTATACC CTGAGAGGCA CCATTCTCAA TTGCTTAGCA TGTAGGTATT 300
GGCATTTTAA GTGCTTAAAA AAAAAGACAC ATCTTCAGTG GCAGCCGGAG GGGATGTGCT 360
GATGTGGATG GGAGAAATCT CACCAGACTC CATTCCTAGA GGAAGAGCCA TAGCTATTAA 420
TGGCTGTTAA CAAAGAGAAA ATCAACCAGT ATTCTCCAGG AATGAACCCT CTGTTAGGTT 480
ATCCAGTGCT TAGTGGTCAG CCCTAAACAC ACATGCATAG GAGTGCAGGT TGTATGTATG 540
TGTGTGTGTG TGCACGCGCG CGTGTGTGTG TTATGTATAT ATGTGTGTGT TTATATATAA 600
AACAATAATT AGAGATGGTT TTGAGAGAAA GTGAGAAAGG AAGGCATGAG GGGATTGAAA 660
AGAAAAGGGA GCAGGAGAAA CAATGTAAAC ACAGTATTCA TGTATGAAAA TTTAAAAATA 720
TATATAAACA TTTAAAATAA ACAAAAGGAA AACATGTGCC CCAATTTATT TGATTTAGTT 780
TTCTTGTTAA TTATTTAGTT AGCGTGAAAA TGATGGGTCT CAGCATGGCA TCTTCATACT 840
TACATACCCT ATTTTTGCTC ATTCCCTTCC CCTCTTGCAG GAGTTGGTTC TCTTCTACCG 900
TGTAGGTCCC AGGATTGAAC TCAGGGCATT AAACTATAAG GGGAGGACAT TTATCCATGG 960
AATCTTCTCA CCAGCTCTTC TTCCCCCCTT TTTTGTTTTA GAAATTGATT TATTTCTTCA 1020
TTATTTGAGA CAAGTTTTCA CTGTATAGCC CAGGCAAACC TTGAAGTCAC TAGATAAGGG 1080
CCAACAGGGT GCCTCAGTGG ATAAAGGTCC TGACCAGGCA CTGGGACCTG AGTTTGATGC 1140
CCAGAACCCA TACAAGAGTG AAAACAGAGA ACCAACTCCT CAAAGTTGTC CTCTGATGTC 1200
TAAATATGCA GATATTGTAA CAAGACTAAC ACTAGGTAAA GTGAAAAAGA GGAAGTCGCT 1260
ATGTCGGCCA TGAAGGTAGG ATGCTGTGAC GACAGGCATT GGACCATGCC CAGATGATTT 1320
CTCACTTCTG TCATATGAAC ATACGTCATA ATTGGTTTCC ATTTGCCACC CAGAATGGAA 1380
TCAATTACAC AAACACTCCT ATGTGTCATT GGGCTTCTTG GGCCTTTCAT TCTCAGAGAA 1440
TCTTCTCCCT AAACACTGTC TCTGGACAGA GAGAACTGGC CACCTGAGAT TTCAGGCATT 1500
GTAGCAGCAG TGTAGTTAAT AAGTGCGAGA CTCCATTACT GCAAGAGATG GGGAACCAGG 1560
AGGAGAGAAG AAAGCATGTG GAACCATGGA TGAACCACAC ATGAGCCACA CATGTCTCAG 1620
TCCTGGGTCA ACTGCGTTGC CTTTACAAAT GAGCTGGAAG AAGAGGTTCT GCTTTTTTAT 1680
TTTAATGTCA TTTCCATTTA CCCTGAGGTC TATAGATTGT GTTCCAGTTT CATTTCTTTC 1740
TTTCTTTTTT TTTTTTTTTT TTTTTTTTTT TTTTGGTTTT TCGAGACAGG GTTTCTCTGT 1800
ATAGCCCTGG CTGTTCTGGA ACTCACTTTG TAGACCAGGC TGGCCTCGAA CTCAGAAATC 1860
TGCCTGCCTC TACCTCCTGA GTGCTGGGAT TAAAGGTGTG TGCCACCACG CCCAGCCCAG 1920
TCTCATTTCT GTTGCTATGA TAGCATACAC TGACACAAAG CAACTTAGGG GAGAAAGAAC 1980
AGGTCCAGGT TACAGGCCAT CATTGCAGGA AAGTCTAGGT GGGAACTTGA AGCAGTTGGT 2040
CATGTCCACA GTCAAGAGCA GAGAGCAATG AGTACAAGCG TGCCTGTCAG TGTTCAACTT 2100
GCTCCCTACA CTTAATGCCA CCAAGCCATT TCCTTTTACC TAGGGATTGG TGCTACCCAC 2160
AGTGCACTGG ATCTTTCCAT ATCAACTAGC ATAATGCGGA CAACCCTGGA CAGAAATACC 2220
CAGAGATTAC CCTAATTTAG ACAATCCTTT ATTAAGACTC TTACAATCCA AGATGATTAT 2280
AGATTGTGTC AGGTTGACAA TTAAAACTAA TCACAGTACT GGACATGATG GAACATAATT 2340
TAAATCTGAG CACTCAGGCA GCAGAGGCAG GTGAAATCTA TGTGTGAGGA TAGCCTTGTC 2400
TACATAGTAA CTTTTAGGCA AGCCAGACTT ACAGATGATA ACCCTGTCCC GAGCAAATCA 2460
AACTCAAAGC ACCAGAACTT GATCACTAAA TGAGATGTTT AAAATTTTAA TTTTATATTA 2520
GCAGACCAGT CTTCATGTCA GTAATTATCC AGCCATTGGT AGCATCTTGT AAACCAGTAT 2580
CTACTTCTGC ATGGAATCTG 2600