EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM121-27113 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
NPC 
Coordinate
chr9:13386630-13393090 
Target genes
Number: 1             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 26             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
EsrraMA0592.2chr9:13389933-13389944TTCAAGGTCAT+6.62
EsrrgMA0643.1chr9:13389934-13389944TCAAGGTCAT+6.02
FOXA1MA0148.4chr9:13388978-13388994CCTTATGTAAATAATC+6.96
FOXB1MA0845.1chr9:13388981-13388992TATGTAAATAA+6.02
FOXD2MA0847.2chr9:13387997-13388010CTAAAGTAAACAT+6.42
Foxd3MA0041.1chr9:13387493-13387505GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr9:13392386-13392398AAACAAACAAAC-6.32
NEUROG2MA0669.1chr9:13391087-13391097GACATATGTT-6.02
Nr2f6MA0677.1chr9:13388687-13388701TGGGTGAAAGGTCA+6.05
Nr5a2MA0505.1chr9:13389930-13389945AAGTTCAAGGTCATG+7.55
RARA(var.2)MA0730.1chr9:13391565-13391582AGACCTCCGGGTGACCT-6.14
RELMA0101.1chr9:13389031-13389041GGGGATTTCC+6.02
RFX1MA0509.2chr9:13392139-13392155GGTAACTATGGCAACT+6.11
RFX1MA0509.2chr9:13392139-13392155GGTAACTATGGCAACT-6.11
RFX2MA0600.2chr9:13392139-13392155GGTAACTATGGCAACT-6.23
RFX2MA0600.2chr9:13392139-13392155GGTAACTATGGCAACT+6.35
RFX3MA0798.1chr9:13392139-13392155GGTAACTATGGCAACT-6.23
RFX3MA0798.1chr9:13392139-13392155GGTAACTATGGCAACT+6
RFX4MA0799.1chr9:13392139-13392155GGTAACTATGGCAACT-6.28
RFX4MA0799.1chr9:13392139-13392155GGTAACTATGGCAACT+6.49
RORAMA0071.1chr9:13392086-13392096TGACCTTGAT-6.02
RXRBMA0855.1chr9:13388687-13388701TGGGTGAAAGGTCA+6.12
RXRGMA0856.1chr9:13388687-13388701TGGGTGAAAGGTCA+6.05
Rarb(var.2)MA0858.1chr9:13391565-13391582AGACCTCCGGGTGACCT-6.17
RxraMA0512.2chr9:13388687-13388701TGGGTGAAAGGTCA+6.05
ZNF740MA0753.2chr9:13388779-13388792ATGGGGGGGGCGG-6.67
Number of super-enhancer constituents: 2             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_02526chr9:13378332-13392164Macrophage
mSE_02688chr9:13355731-13400446HFSCs
Enhancer Sequence
TGAGGTCCTC CTTGGATAGT GGACCAGAGG TTCTTTTGGC TTATGTGTTT TCCAGTAACT 60
GTATATTATG GATCCAAACT CTGGCAGATC ATCTAGCAAA TTCTCTTCTC CAGTCCCCCT 120
GAACTCATCT TCTCCTGGAT GCTAGCTAGC CACTTAGGTG TAGGACAATA GTGGGAACAG 180
CAATCACATC TTCCATTAGC AACTATTAAA GCTGAGCATT CTACAATGGA TTTTTCATAA 240
ATTTCCTGAG CAGCCTGGTG AAACACAAGA TAAAGAACAG TCATTGTGTG CCCCTTCTAC 300
AGAGCCCATA AATAACGTCC TTGACCACAG CCCTTCAACA GAAACACGAG ACCCAGTGCA 360
GAGACCCTAA TGAGCTCAGG CGGCTGTGTG GGGACCAAAG CTTATTCAGG TTGACAGAGG 420
AACACATTTC CATGGGCTTC AGAAACACAG CTATCCTTGG TATTCAGTGC AATACACTGT 480
CTTCTTCTGC ACTCTTCCCT TTACCTCGTA GGATGTGCCC TGTTTGGTGA GAGTAAAGGT 540
TCTGAAGTGA CGAAAGGAAG ACACCTTCGT TTTATTAGTA GAGATGGATG TTAGTATTTT 600
CAGGTTGGCC CATAGTTGCC ACAACCACTT CCTAACCATT CTGTTTAAAA TAAGATGTCA 660
GAAAACCGAC AGCCTGACAG TCATAAAGAC ACTATTTTTG ATGAATTGGA ATTCTGGGAG 720
CTAAACTAAG ACAATGTTAA TTTCATGAGG AGAGATTGCA TTTTGATTCT TTTGATATTA 780
GTTTTTTTTT TCTTTTAAAG ATGTCAAATA CTAAAGACCA ATGGATTTAG TATTTTCAGA 840
TTTAGCACAA TCTTTCGTTA AAGGTTTGTT TGTTTTATGT TTTGTGTATA TGTGAATGTC 900
TGCATGTAGG TATGTCTGGT CACTCAGAGG CCAGAAAGGA GCGCTGGATT TCTGGAACTT 960
GCGTTACAGT CAGTTATGAG CCATTAGGTG GGTGCTCGGA ATGGAGCTCA GATCCTCTAG 1020
ATAAGCAGCA TGTGTTCTTT ACTGATGAGC CATCTTGCCA GCCTTGAAAT GTTATAAATT 1080
GTTTACAATG ATATTCCTCA TCTAGGTGAT TGACCACAAA TGTCCACACT TCCTATTCCC 1140
CACTCTTCTT CTGTCTCTCT CTATCCTCCA CCCTCATGCA CACTGTGTTT GTTCGTGGTA 1200
CATTAAAATG GAGCCGGAAT GACCAACGGT TCTGTTAACA ACACAATACT TGTTAATCTC 1260
CTCTCATTTG AGAAGCAAGA AACAAAGGAA TCCCAAAGCC TAGGATATGT GAAGGAACTC 1320
TTTCTGGCTC CCACTAAATG TGTCTTACAG TTCTCAAAGC ACACTGACTA AAGTAAACAT 1380
AGGCCTTTAT TCAAAGGCTT TGCCGAAAAG GGAAGAGAAT TAAATTTTCC CTAAAGCTTT 1440
TCCTAAAACA TTTGGATGTG CTTTTTTGGG TTCAGGCATG TTAGAGATAG TAAGAAATTT 1500
CAGTGTTGAG AATCAGAATT TTAAACAACG GCCAGGAAGA ATAGTGTCTA TTTTTAAAGG 1560
CTTCTTGCTT CCTCCAGTAA CCAAGGAAGT GCACGATAAT TTTAATTCTG TTTCCAGTAA 1620
ATAGGTCTAG CTTGATTTCA TTCTACAACT CGCTAGTTAG CATTTTATAC TTAACTTGTG 1680
TGATTTTCTG TAATATTAAG TAGATGTAAA TTTCCTCTCC ATGAAAGCCA GTTTCCATGT 1740
AGAATTTTCT GTGTATTTGA GATCTATGCT GTGGCCTTCC TGAATTCATG GAAAATTGAC 1800
GATACTGGGA GGGAATTATT GTAACTAAGC TTCCCTAATG GCGCTTTTTA AAACAGCAGT 1860
GGAAAAAAAA ATAACAGGGC ACTAGTCTGA TGTGAGTTTT GGCAGACATT TCACTCAGCC 1920
TGCCAGGGCA TCCCCGGAAA TTATAGACCC TCAAAGGTGT TCAGGACAAA GTAAATAAAG 1980
CAGGATACAG TTATTTTATC CCACCCCCAC TGCTTCACTC CTCCCGCAAC AAGTTCTTAG 2040
CAACATGAAT TTTGAACTGG GTGAAAGGTC AACTTTGAAG TGAGTGTAAA GTTATTTACA 2100
GGAAATGAAG CAGAAAGTGG GCCCTCATGC ACTTTTAAAT GTCCCTATTA TGGGGGGGGC 2160
GGGGGCGGGA ATGAACTGTG TCTTCTGTCA GAAGAGAATT AAATTCCTGC ATTTTCTTAC 2220
ATAAAAGCTA AATAAATACT TACCATTCCA GAATTATCCT ATTAACCCTG AAATTTTAAA 2280
ATTCACCAAG GTCCGCTTTT CCCCAACATT GGATGTGAAA GCTAGAAATA ACACTATGTG 2340
CTTAAAGCCC TTATGTAAAT AATCAGGAGC GCAGTGGGGG CAGGGAGAAA GGAGCTAGTT 2400
AGGGGATTTC CTTCCAATAT GAGATGCTAA CTAGATGCTT GTGATAGCTA CAGGACCAGC 2460
AACATCTTTA AATATTTAAT TTCTTGTCAG TTGTTAGCTG ACTCATGTTT ATGTATGTGT 2520
GCACTGCATA TACACATATA ACTGTGTCTG TCAGAAGGAA GTGGTGAATT AAGCAATTAT 2580
AGGGCTCATT CTGCAAGAAG AACAGAGGAG GGATCTTTTG GAGAGGAAAA AGAAAAAGCG 2640
TGCTTTACCT TATAGATTCT CAGGTAGGTA TGGCTTGGAT TTCTTTAAAA GATGCTACCA 2700
TCTATAAGTC CTAGACTCCT TCCTGTGCTG GGTCAGCAAG ATGACGCTGG GAATGTGTTT 2760
AGATGCCCCA TTTTAGTGAA TTCAGTAAAG CCTTGGTCCT ACATTGGTTC TCATTTTATA 2820
TTAGGTACCA AAATTTAGTT CTGTTATAAT TTAGGCAACA AAACTCTACT AATGTTACTA 2880
TACTCGGGCT CAGGTTCCAT GGTTCTTTAG TGTAACCTGG ACAGTGTGAC TGTGGCTGTT 2940
ATGGTTAAAT GGTTCCTCTG GTCTGAGGCC GAAAGAAGGA AAGATAGATA AAAGGCAACA 3000
CAAAACCTCT TGAGAGTTTG AGTCCAGCCT GGTCTACGCT GTGAGTTCAG CCAGAGCTAC 3060
ATCATGTCTT GAAACAAATA AAACAAAACA ACAAAACCTC TAAAGTTTTA CATTGCCTGA 3120
CCCAGTGAGG CCACTTGATT TCAGGTACAT CCAAAAGGAG ATATTTAGCC AAAGGGCCAG 3180
TTAGGAAAGT GTCTGCTTTC TATGCCTGAA GCCCTGGATT TGCTCTTCAG CACCCTATAA 3240
CTCGGGTGTG GTAACACACA TCTGTAAAAC TATACAAGGA GGTAGAGGCA AGGTAGATAG 3300
AAGTTCAAGG TCATGCTCCA CTATTTATAC AGGCCAGGGT CAGTCTGAAA GATAAGTGAA 3360
AGTCTGTCTA GAAAAAAACA ACTGGCCAAG AAATCCCAGG TGGGTTGATT CTCTGAGGCA 3420
CTATGGTAGA AGGGGCCAGG AAAATGTCGC TCCCTTTCAA GCACTGGGGT CACAAAGTCC 3480
CGTTACATCC ATGTATACTC TCACCTGCTT CCCCAACCTC AGCCCTGGGC AGTGACAAAG 3540
AAAGCCACGT TGCTGAAGGC ATGGTGCTTT GATCCAGTGG AGCTTATCTC AGTCAAGAAC 3600
GAAGAACTCA GCAGAGTACC GGAAAAGTCA CTCATCCAGA GTTAGAAAAA AAAAGCAAGG 3660
CGATTTCTAA AGGGGAGAAA AAGCTACAGG AATTATAAGT AGAGCTGCAC TTTAATTAAG 3720
CACATTGTGT TATGTTATCT CCTGCTTTTC AGCTATAGTT CTATCCCTAA CATAAAAATA 3780
TCATAAAGCC CTGATCACAG TTTTAAGAAG TTAAAAATAA AATAAATAGC AAAAGAACTC 3840
ACCTTTGCAA CCTAGTAGCT AAGAAAACAA ACATCACTAA GTCTCCATTC CAGTCTCTTT 3900
AAAATGTAGT GATACAAATT AACTCAGAGG CACAGATGCT AAGATGTGAT CAAAGGAAGT 3960
ATATAATTTT TCAGTGAGAT ATTCGCCATT GTATAAATGT CCACAGTTAT TTAACTAGTG 4020
ACCTCTGGAG CTAATGGCTG CAGAGGTCTA AAATTCACCT AAGAAGAATG CTTGCTATTG 4080
AGTCTCCTAA TACCTGAGTG GTCTAGGAGG AAGTAGTAGT CAGTGGTATT TATGACTTTC 4140
CATAGTATTC ACTTCTATTT ACCTCTCCTA GTGAGAGGAA ATAAAGACAA CCCTGGCTGA 4200
GTTAGTAGGC ACCTGCCATT CACAGGAATA GAGTGATAAA ATGTATATGC TATCAAGTAT 4260
TCAGACATGT CAAATAGAAT TGTAGGGGAA TAAGTATAGA TTAGTTTACA GGCAAGTAAA 4320
ATCTGGAGGT CATAATATTT GGACAAAAGT TCAGTTGATT TCAAATATAT AATAAGTATG 4380
ATTTTTCAAA GCAATTAAAT ATTTATCATA ACTTAAAGTA TAAATCTACG TTTTATCAGA 4440
AGAATGTTAG AAGCTAAGAC ATATGTTGTT TTGCTTTAAT TTAGTTCATT CAACAAAGAC 4500
GTGTCCTGCA TTTTCTATGG GCCAAAGATT AATGCTACTT TACCATGGGA CAAAAACATG 4560
TCACTCACTC CAAATGTAGC CTGAACACTT ATTTGCTGAT CTATTGTTTG TTCAGCGTGG 4620
TCTTGTAAAA TGAAAGTATG GATCTTTAAA AAGATTCTGA GGAAGCCTCT ATGCTGTGCA 4680
CTGGTAGGTA GGCCTGAGAG TGGAAGACAT ATCTTTCCCA GCTGTAACAC ACACGCGAAT 4740
GAGAAAGAAC AAGTGTGTAC CAAGCACCAG GAAGAATGAA AGTGATTCCA ACAGACACAT 4800
AAAGAGAGAA ACTGGGGCCT GGCTGTTTAA GATATAATCT GTGAGCCAGG AGTTTGGAAA 4860
GCTCCTGGCA ATGTTTAAGA GTCAGACTCA GTAGCCTCAC CCCACACCTT CTGAATCAAC 4920
GTCTCTGGGT CAACCAGACC TCCGGGTGAC CTGTATGCAC ATAACAATTT CACAAGCACT 4980
GAGCTAAGGA TGACATCATG TGATGGTGTC TGTCTTCCCT TCCTCTTCCT GGACCACTCT 5040
AATGCAAGTG GTCTGCGCTG TTCTCAAGGT CAGCACAGCC AGTGAAAACA GTGGGCCCCT 5100
AGAATGGGAA GTCAGCAAGA ACAGCTGACC GAAAAAGGAA GTTACTATTG AGGAAGGTTT 5160
GGTCTGCTTT TATAGCCCCT GGAGGAGGAA CAACACTCTA CAGAAGCTGT TAATGATGGG 5220
CTGGATTTGA AGGCAGTGAT CGGTGCCAAA TTCCAAATGT GTTGTTACTC TAAACTTCCC 5280
CTCCAGATGC CTTGTTATAC TGCAGAGTTT CCAGCGGGGA AGATCCACTT GCAAATGGCT 5340
GGTTACATAA ATATACTCAA AGTGTGTCCA CATTAACCTT GTTTTCAACT TCTTTTAGTC 5400
ATTTCATTAA CTTCCACTGG GCAGAAATCA TTTGGCAGCG ATTGGAAATG TCTAGTTGAC 5460
CTTGATAGAT AGATTTTAGC AGTGATTGCT CTGTTTAGCA GTTCTCACAG GTAACTATGG 5520
CAACTTTCCA TCTCAGCTGT GAACACGCTA TGCAAACTCC AAATGAAAAC AATGCCCATC 5580
AGTCCCCTTT CATAAGTAGC TCAACAGCAC TGTGCAGTTC ATCCTAGAAA AGACTTTGTG 5640
TTTACAGGGC AATCACTGAA ATGGCACCAC AGAAGAAAAC CCATGGCCTG AGCATATAGG 5700
CTGACCTGTT AGCATGACGT TCTGTGTTCT GGTCTGAAAA CAAAAAACAG AAAACAAAAC 5760
AAACAAACAA AAAAAGCAAG ACAAAACAAA GTAACAGCAG CAAAAAACCT CTCCACTTTA 5820
GATAGAGAAA AATCATGGGC CAAAATCAGG CATTTTGCCT TATGTTTGTA CCTGTCCGAG 5880
CTACCTTCTT AGAATAGTTA CCAAGCAGTG CTTCTAATTC CCTACTTTGC AGATGCAAAC 5940
ACAGAACCTG CAGGAGACTA AGCTCTGTAT GATGGCTGTA CATCAGGCCT GCTCTGACTA 6000
ATAGGCTGTA CTGCTCCATC CTTTTCCTGC CAACCACCTC CTGCTAGAGT GGCGAGCCCT 6060
TGCCCTCAGC AACCCTTGTG GAACCCAGGT GCTTATCAGC AGCTCCCAAC CTCCACAAAA 6120
TGTCTACATG GCATTTGGGT CTGGTCATCT CTCCGCCAAC CTCATCCTGT CGTGTTAGAA 6180
CCGTACACCC TGTGATCCAT CTCCCTGACC CCACATACAC CCAGTGCCTT CACTCCTCTG 6240
TGTGTTTGCT GGTGTCCATC CTTCACCATG ATCAACTGTT CATCACTTCT CTCGTACTGG 6300
AATCCTTTAG GCGCCACTGA AATGGTGTCT TTGCTGGGAT GTTCTTCCTA ATCAACAGGC 6360
TTAGCTGTTT ACCCAAGCTT GAGGGTGATA ACTCTGCTGC CATGGTAATT ACACACTGAA 6420
TTGGACCACA TTGAGACTCT CAGCTCTTAA GGGGAGGGAC 6460