EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM121-18936 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
NPC 
Coordinate
chr4:56655370-56658750 
Target genes
Number: 1             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 19             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxd3MA0041.1chr4:56656531-56656543GAACAAACATTC-6.14
NEUROG1MA0623.2chr4:56656237-56656247GACATATGTC+6.02
NEUROG1MA0623.2chr4:56656237-56656247GACATATGTC-6.02
NFKB1MA0105.4chr4:56655702-56655715AGGGGGTTCCCCT+6.52
NFKB1MA0105.4chr4:56655702-56655715AGGGGGTTCCCCT-6.64
NFKB2MA0778.1chr4:56655702-56655715AGGGGGTTCCCCT+6.22
NFKB2MA0778.1chr4:56655702-56655715AGGGGGTTCCCCT-6.27
RFX1MA0509.2chr4:56657094-56657110GGTCACCATGGTAACA-6.42
RFX1MA0509.2chr4:56657094-56657110GGTCACCATGGTAACA+6.43
RFX2MA0600.2chr4:56657094-56657110GGTCACCATGGTAACA+6.48
RFX2MA0600.2chr4:56657094-56657110GGTCACCATGGTAACA-6.57
RFX3MA0798.1chr4:56657094-56657110GGTCACCATGGTAACA+6.6
RFX3MA0798.1chr4:56657094-56657110GGTCACCATGGTAACA-6.72
RFX4MA0799.1chr4:56657094-56657110GGTCACCATGGTAACA+6.35
RFX4MA0799.1chr4:56657094-56657110GGTCACCATGGTAACA-6.41
RFX5MA0510.2chr4:56657094-56657110GGTCACCATGGTAACA+6.32
RFX5MA0510.2chr4:56657094-56657110GGTCACCATGGTAACA-6.51
ZNF263MA0528.1chr4:56657624-56657645TCCCCCTCCTTTTGTTCCACC-6.02
ZNF263MA0528.1chr4:56655719-56655740AAAGGAGAAGGGGGGAGAAAA+6.37
Enhancer Sequence
GTTTCTAACA CATCCTCTTT CCTCTTGATT TGCATGCTGC CCGAGGTATA AAGCAAGTTA 60
CTGTGGCAGT CACTGGCTTC TTGAGCTCCT CTTGGGCCTT ATTCACTACC CAGTTACTCG 120
TACACATCCA GTTGCTGGAT GGAGCCAGAC CACCATGAAC AGAATCCCTA AGCCACAGAC 180
AGAGTCTGAG CCGCAAACCA GGTCGAGCAA GGACCTAGTT TTGAACTGGA TATGAATTGA 240
GATTTTGGGG TAGCCTGGGC TTTGAACATT TGAGAATAAG ACAGGTTTCA TGATCAAAGG 300
TGATTAGAAA ATAATGAGGG GGTGTTACCT AGAGGGGGTT CCCCTTCTCA AAGGAGAAGG 360
GGGGAGAAAA TGGGGCAGGG TGGGGGAGAT TATGTGGGAG GAGAGGGGAG TACTACTGGG 420
ATAGAAAGTG AATAAATAAA AAAGAGAAAA GAATGAGACC ACCCCACTAT TACTGGGACT 480
GAGGGACACA GCGTTAATGA GCATCCACGG AGGTCTTGGT GGAAGAACAA AACTCTCCTA 540
AGGGTACCAG CTGCTCAGCT GTTCTGTCAC GCAGTGCAGA GGCTGGAGAG ACAACTTAAG 600
GACAGACCCA GGAAGGCACC AAACTTCCCT TGGAAACACA GGGGACTTAC ATAATGCTTC 660
TGAGCACACA AGAAAGGCAC TTAATCCTCC GAAATCAGAG GCCAGCTCCT GGCAGTCTGA 720
GACAGAGGAC AGAATTCCTG CCTTGAGGGT CCTCACCTGC AGAGGGTCTA TATTGTCATG 780
TGTCTTTCTT TAAACAGTGC CCAAAATGCC CATGAAGCAC AAGTTTACAC AGCTGTGCTC 840
AGGTCATTTT CCTTCAAAAG GGGACCTGAC ATATGTCTCC TTTAGCTATG GCACAAACAA 900
AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAGAA GAAGAAGAAG AAGAAGAAGA AGAAAAATCT 960
ATATCTCACA CTGCTAGAAA ACCCAGAAAT CCAGAGCTGG TTTCCAACCA GGCCTGTGAG 1020
AAGCAGAGAA TATTCTGGGC TGGGAAAAGA GGAATTGTGG ATCATAGAGA TGCTGAGGAG 1080
GGTTGAGCTA AAAAAAAAAA AAAATTAAGC AAAGCATAGC TACTGGAGGC ACACACTCAG 1140
CTCAAGGCAA GGCCCCAAGG GGAACAAACA TTCTCTGTGC CATAAAGGAC AGAGGATGGC 1200
AGAAGAGACA TTTGGAAGGC AGCCAGAGCA CCTGCCACCA TGTGACACAT GTAGGAATAA 1260
GAGACTTCCC CGGAGGCTAC CAGATCCTAG GTGGGACTAA GGCTCAAACT TTGAAAAAGG 1320
TCTAGGAGAC CAAATGTTTA GTTGGAATAT AAGTGTGGCA CCAAATGAAG ACCTCCAAGA 1380
GCCTATGGCT GCATTCTGAG TTAAGAGAGG TTAGACCCTA TGCAGAAGAC AGAAGAAAAA 1440
AGGTCTATGA TTCGTCCCAG GAGAAGCTGT AATGGCAGGG ACAGGGTTTG TTTGGCCTCA 1500
CAGGATATCC TAACCAAGCA ACAGCAGCAT CCAGCCTCTG AGAATGACGT CCTCTGCTCG 1560
TTCCTGCCCT TCCCTGAGTG TGTCTGGGCA TGTTAAAACC GTGACGTGAG CTACTTGCCA 1620
CACGCAAGAA GTGAGGTAAC GGGAAGAAGA AACCATGCCC GTCAGACCGG AGTCCTCAGC 1680
ACAGTTACTT AAAGCATTGC TGGTCATCAA ACTAACAGGC CACTGGTCAC CATGGTAACA 1740
GCAATCAAAA CACCAATTCC TGCTTTCCTG AGCTGGTGTT GAATGACGAT TGTGCTGCAC 1800
AGAGGAGCAA CTTAATCCCT CAGTGCACAA TAAACAGAGT TGCCAGCTCC AGCCTCGTAG 1860
AAGATGGAGA AAAATAACTT GCGAGCGGAC AAAGTACATT TCTCAGGGTG GATGCATGAT 1920
TCGAGCCAAG AACTCAAGGA GGGAATCTTT TTGCTCAGCT TGAAGTCATT GCTGTCTCTG 1980
AGCCGCTTCC CCCACCCATC ACAGTTTTTA GGGAGGGAGA CTGTTACGAC TGCTTAAGAA 2040
ACATGATGAA TTTGTTTTAA ACCCCAGATA TGTGCATCTC TAGCCTTCCT GGCAAAATTC 2100
AGACAAAAAT TTAATGACGG CTGTGAAATA CTCACATTCG AAGTAGATCT GATAATTTTC 2160
CTTTATGTCA CCAAGGCAAC ACAGAATTCA TCTTCATCTC TTTGGAGGAT AGTGATCCTC 2220
TCCAAATGCC TGATGCAAGC GTGAAACACA AGCCTCCCCC TCCTTTTGTT CCACCCCTAC 2280
AGCCGAGTGA AGCCAAAATC CCTGGATCTA GGCCCATTGG CTGCCAAGTC ACAGCTGTCT 2340
TGGGTTTCCT CACTCCAAGG TCACTGGGCA AAATCGTAGA GACCCTGGGA TGCACCATAA 2400
ATCCAATTCC TCTTTTCAAA GCCTATTTCC TTCTCTTCTC CTATAAGAGT CTCAGAGAGG 2460
TACATTCTAA TACAACAAAG TACACAAGGA ATCCTGCTTT AATTCCCTTC TCCACTCTAT 2520
TCCATCAGCA GATCAAGGGC CCAAGACTGG CAGATGCCAG TTGCTACATC TCACTCCAGA 2580
TCTGCATGGA GAATGGAGTA AGTGGCTGGG TAGACACCAG TCTGAATGCC CTGTGGTCAG 2640
CTGTGTACCT TTGGACTAGC CAGTTCTGGT CAAGGGCAGA AGCCATTTGG AACCCACAGA 2700
GCTATCCAAT CCCAAGTCCA GTGATTCACT GAGTCTCTCA AGAAACCACA GTCTTCCTTG 2760
AACTATGACA CGGTGTAACC TTTGGTTGTG AGTGTTTTGC CACAGTTTGT TTCTCTAACT 2820
TTAGCACAGA GATAGTATCC TGTGCAGAGG TGTAATCGCT GTGTACCTAC TCCTTGGCAG 2880
CTATTACGTT TCTCTGGCTA TAAAAGCCTA AATCAAAACA TAGTCTCTGT GGAGTTCCAA 2940
TTTTTCTAGG TGTATAATGA GTCTACCTCA TAGGATCACT GAGTGAATTT AAAATACAAG 3000
ATGTGAGCCA GAGGGAAAGA CCATCAGCTA AAGGTAGAGC TACCAAGCCT CATGACCTGT 3060
GTTTGAATCC CAGGAGCCAC ATGGTAGAAA TGGAGAATCA ATTCCCACAC ATTGTCTTCT 3120
GACCTCCCCA CATGTACTGT AATGTAGTCA CACACAAATA GTAATATTAA ACAGGCTGAG 3180
CAAGTTATGT TGGGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTCTGTGTG TCTGTGTGTC 3240
TGTGTGTCTG TGTGTCTGTG TGTCTGTGTG TCTGTGTATG TGTGTCTGTG TGTCTGTGTG 3300
AGTGTGTATG TGTAACAATG ACAATTATGA GAAAAGAGCC CATGAATTTG AAAGGGAACC 3360
AGAGGAAAAC ATGGTAGGGA 3380