EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM121-18174 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
NPC 
Coordinate
chr3:122176770-122180860 
Target genes
Number: 6             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 11             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
RFX1MA0509.2chr3:122179769-122179785GGTTGTCATGGCAACA-7.54
RFX1MA0509.2chr3:122179769-122179785GGTTGTCATGGCAACA+7.56
RFX2MA0600.2chr3:122179769-122179785GGTTGTCATGGCAACA+7.23
RFX2MA0600.2chr3:122179769-122179785GGTTGTCATGGCAACA-7.32
RFX3MA0798.1chr3:122179769-122179785GGTTGTCATGGCAACA+6.88
RFX3MA0798.1chr3:122179769-122179785GGTTGTCATGGCAACA-7.43
RFX4MA0799.1chr3:122179769-122179785GGTTGTCATGGCAACA+6.6
RFX4MA0799.1chr3:122179769-122179785GGTTGTCATGGCAACA-7.22
RFX5MA0510.2chr3:122179769-122179785GGTTGTCATGGCAACA+6.82
RFX5MA0510.2chr3:122179769-122179785GGTTGTCATGGCAACA-7.15
RREB1MA0073.1chr3:122179599-122179619GTGGTGGTGGTGGTGGGGGG-7.04
Number of super-enhancer constituents: 3             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_04130chr3:122176687-122177466Cortex
mSE_07650chr3:122176067-122178954Intestine
mSE_11302chr3:122176084-122177664Placenta
Enhancer Sequence
GAAGTAGAAC ACCCCAGGGC TGCTAGTCTC TTGTGTCTGC CTCTCTCAGC GCAGAAGCTG 60
TGTTTTCTCA GGTCAGCTTT GTGCACGGAT CACACAGTGG AAGCCTAGCC TTCCGGTCTT 120
CCCATTCAAA AGGAAAAGGA GAGCTTCCTC CTCAATTCCA GTTTGAAAAA TCCCAGGGAA 180
GCTCTCAGGT TCATCTCAGG TTGGTCATAT GTTCACCCTC AGACAGCTCA CTGTCCAGTA 240
CTCTGACTGG ATTACACATC CAGCTCGCAA GGGTGAAGAC ACATGCTATC TAGTAACTGA 300
GCTATTGAGA AGCACTGAAT TAGGTTGTTA GGTCCGCTGT CAACAAGCAG TCACTGATAA 360
GCAGGAGGCA GGAGACACTC CCCCACCCCC ACTCTCTAGG GCTGCCAGCT CTGAGAGTTG 420
TAAGGTTACA GGAAGTCTGC TAAGTGACTG AGCCCACATC AGAAAAGGGG CAGGCTTATT 480
CGTCAGTCCA GCCAATGGGA GAAAAGGACA GGAAGTTCTC CTAGTCAGGG AACTTCTAAA 540
GATGCCCTCT TATGCCAAAT CAACGTACCA GTCGTCTCTG CCCTTTCTCT GCTGTGTCTC 600
CCTGTCTGCA GCATTATATA TTAAAAGACG GTTTCGTTCT CACTAGTCTC TTGAATTTGT 660
TATGATCATA TTTCCAACAC CACCATCTGG TATTTACACT TTTCCCCATA AATGTTTTAG 720
GATCATAGTA GGCTATTTTT CTAATTATCT CTGTCTTCTT GGGATACACA TATACTGTGT 780
TGACACATGA CTGCTAAACT CTGCAGATAT TCCTCCCCAT ACCCTTTTCC ATCTTCTTAA 840
AACCTGTACA CAGCTCTCTG CAGTTTCACT CTCTTTGGTT TATTTATGGG CTGGATAGTT 900
TCGTGGTGGC CACTGTGACA GAGGAGATAG AAGTGGGCCC TTGGGAGAGC TGTGTATCAC 960
CTGATTATCA CCTGTGTGGC CTTGGAAAGA TTTCTACATC TGTTATCGCA AGTGACCCAG 1020
CCCTAAGACA CAGTGTTCCA GATAATGATC CAGACTCTCC AGACCCATTC CTGCTGCTCA 1080
CCCTGGTACC TCCCCCTTCC TCCACCCAGC CCTCCCACTT ACTTTGGAAG GAGTGCCGTA 1140
AGGTGCACAG GGACAGGGTG GGGGTTGGTG GCATTCTACT AGCCTTTGAA CACTGGCAAA 1200
AACAACCCAT TGTCCTCACC CTAGGCACCA AGTAAAGAAA ATATTGACCT TTTAGATGTC 1260
ACTTCTGAAG ACATCGTTGT ACTTGGCAGC CATCAAGGAA GTGAAGACAT TGGCTGCCGA 1320
TCAATGCAGT CTCTCACAGA GAGCCTTCGG ATCCGGCCTT TCCCCACCAA GGGCACAGGA 1380
GGTCTATACA CAGAGAGGTG TTCCTGGCTT GTGCTCAACA CCTGAGGCTT GCTGCCTCCT 1440
GGTCCAGAGA TTCTGTTCTC AGCATCCCCA ATCTATGAGC TACACTTCCC TGACTGTTAT 1500
ATGTTGTCCA GTATCCCTGA CATTGCGGAT GAACCCTCAA CCTGTGCTGC TGGACTATCT 1560
GTCACTGGAT GAGGGGAGGT CTGCCTCCTG GATTTGCTTT AGATTAGAGT GTTCTGGTCC 1620
TGGCAGTCAG GTGTGATGCT TCTGTTAGCA CATCAGATAA AGCAGGTTCT GGCTTGCTCT 1680
CATTACTCAT TCTAAGAACT ACTGCTTGCT GCCCAGACCA TGGTGATAAT GATGCCCCCC 1740
TCCTAGTGTG CTAAACGAGA CACTGGTAGA ATTCTCAGCA GAAATTCTGG CCCTTGGGAA 1800
CATCACACAC TAGGAAATGA GGTAGAGAGA TGTGGGTGAC CGCCATGGCC TTTCTAGATG 1860
CACTCCCCAG ATGTGTGGCT GCCAAGAGGT TGCTGAGATC AGACTTGTAC ATATTACACA 1920
TTTACTGTGA TACACAAGGC CCTCCCACCA GAGGAGCACA AGGGCTTGTC TTTTTCACAG 1980
GGGAAAGCTA CTTCACAGCC ATAAGGGGTC TCAACACTGC TTGCCTGGCT CCTCCTCTTA 2040
CCAGTCACAG CCCTGCTAAG CCAACCGGTG TCCATGGCAA CCAGACAAGT GTTTTGCAGG 2100
TCCAGTCATG ATCACTAGGC TATTTTGCTC ACTTCCTTTC TACTGGCTAT TGAAAGCCTT 2160
TCTGAATCTT AGACTGGTGA CCTGACTCAG CAGGTAAAGG TACCTGCCAT GAAACCTGCT 2220
GACCTGAGTT TGATTCCCCA GAACCCACAG GGTGAAGGAG ACAATAGATT CCCACATGGA 2280
AGCTTGGACA TGCGCGCATG CATACACACA GACACTTTAT CTATTAAGTT ACTTTTTTAA 2340
AAAGTGGATA ACCAATCAGT GGGGACTTCT AGGTCCCCTA AGTGTTTGGG AATTGAGTAT 2400
AAGCTCTAAC CTATTTCTCC AGTGAGCACA TTATCACCCA GTGGTTCGTA TGGATCATAG 2460
AAGCCATACT TCACCTCCCA GTTAAGAGCT CCTAATACAG ACTGATTTTC AGTGCTGTTT 2520
TGGCAGAATG CAGGATTAAT CACTGTCTCA TTCAGATGAT AATAGCCAGG TTGTTTCTGA 2580
CTGACAAAAG ACCATTTTTC TACTGAAGTG TTTTTCATTC AGGTAGCTAA ACTTTATTGC 2640
GAAGGGATTA ATTCCACTGT TTTCTGTCAG GGTTGGAATG AGTGTGGTCT CCCTCGGTGC 2700
CTGCCTGCCC TGTGCCTAAG CAATCCTCAC TGTGACTGGT GGATTCCTGC TGTTGCAGGC 2760
TTAGGGGAGG CAGAGAATAG TTTCTCCGGG GAATACAGAC AGGCAGTATA AATTAGAACA 2820
GCATGGATGG TGGTGGTGGT GGTGGGGGGA GAACGGCACA ATCTTCATGA GGCTAGACAC 2880
AACATGACTC TAGAAATAAG TTAAAATCAG ACAGTCCAGA AATTTGGACC AGAGCAGTAT 2940
GAAGAAATTA GGCACCTGGG AGATGGTTCT CAGGGCACTC TAAGCAGAAG CCAAAGATCG 3000
GTTGTCATGG CAACAGCCAC CCAGCATGGA GGTGTTGGAG GAGTGAGATT GGCAGGACAG 3060
CAGGTCAGAA CATAGACTAA AGTCTAATTT TGCAGCCAGA GACAGGGACA ATGACAGGGG 3120
TGGTGGTGGG GTATCACCCA GATCTCACGA ATTACCCATA GGTACTCAGT CAGGTTGGCT 3180
GGAACAGGGG TATCCAATAG TAGATGGGCT TTGGGGTGAG CATGGAGACA AATACTGTGG 3240
CTTTGTGTCC TGCCTGTTTC CATCAACAGC TCATCAGATA ACGATGATGC AGGGGACCCT 3300
CTGAGACATC TGAGCAAGTG TGATTAAAGA TCCTTCGTAT GTCTTCCGAT TATCAGGTTT 3360
TGAAGTTGAG GATTAAAATA TACTTTTAAT GCTAAATACT CTTGATCATC TATCTCCTCT 3420
TTAGTTCTAG TTTTAAAAAC TCAGAAGGGT CCTCAGCACC AGCTGCAGTC CGGCAGTGAC 3480
TCAGTCATTG TCCACCTTCT CTGAGGACAG AGGTCCGGGT CGCCCAGCAT CTGAGAGTTG 3540
TCAGCGACAG AGGATGGTTT CTAGTGCCTT TCTTCAAAGA GGAATGGAAA CTCACATTTG 3600
CAGACTGTGC CTTGCATGTA TTGGGGATCA GGCTTTATAA TGTTATCATT CGTTGCCTGT 3660
AATCACCTGG TATGTTTGGG GAGCAGCTTG AGGTTTTGAG AGGTCAAGTC ATCTCCCAAG 3720
GTCACTTCAG CTAGCTACTG GCGCAGCACT GACGCCTGGA ACATGTTCGG AGTCTCTTTA 3780
GAGCCACGTG GATGTCTGTC TCCAGGCTCA GTTTTGGAAG GTGCCAATTT GCAGAAGTGC 3840
CTGTAAGATT GCCTGTAAGA TGGGAAAGAG CTCAGTTGGT CCTGATGGGG GTGGGGCACT 3900
CCCCGAAGGC TCCGCTGCAG AGGGACCGCT GTGCCTCTTC TGTAGTCGTT GCCTGTCAGC 3960
TCTTTATGTT GTTCTCACTA AAAGTAGGAG GGAAAGAAAA GGCAGTGTGT ACAGCAGAGA 4020
AAACCCAGAA GGAGAGATGA TGGAAACAAG CTTTGCTCTG CATGTGATGT CTGCATGGTT 4080
ACTGTGGAAT 4090