EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM121-17728 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
NPC 
Coordinate
chr3:89083560-89084710 
Target genes
Number: 42             
NameEnsembl ID
Ubqln4ENSMUSG00000008604
Arhgef2ENSMUSG00000028059
2810403A07RikENSMUSG00000028060
SNORA42ENSMUSG00000084433
Syt11ENSMUSG00000068923
Gon4lENSMUSG00000054199
nENSMUSG00000065236
Msto1ENSMUSG00000068922
Dap3ENSMUSG00000068921
Ash1lENSMUSG00000028053
Rusc1ENSMUSG00000041263
U6ENSMUSG00000077148
FdpsENSMUSG00000059743
Hcn3ENSMUSG00000028051
Clk2ENSMUSG00000068917
Scamp3ENSMUSG00000028049
Gm16069ENSMUSG00000086718
Fam189bENSMUSG00000032657
GbaENSMUSG00000028048
Thbs3ENSMUSG00000028047
Mtx1ENSMUSG00000064068
Mir92bENSMUSG00000076255
Muc1ENSMUSG00000042784
Krtcap2ENSMUSG00000042747
Trim46ENSMUSG00000042766
Dpm3ENSMUSG00000042737
Slc50a1ENSMUSG00000027953
Gm15998ENSMUSG00000086389
Efna3ENSMUSG00000028039
4731419I09RikENSMUSG00000091513
Efna4ENSMUSG00000028040
Adam15ENSMUSG00000028041
Gm10702ENSMUSG00000074467
Dcst1ENSMUSG00000042672
Gm15417ENSMUSG00000074466
Zbtb7bENSMUSG00000028042
Flad1ENSMUSG00000042642
Cks1bENSMUSG00000028044
Shc1ENSMUSG00000042626
Pygo2ENSMUSG00000047824
Pbxip1ENSMUSG00000042613
PmvkENSMUSG00000027952
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
TEAD1MA0090.2chr3:89084377-89084387ATGGAATGTG-6.02
TEAD4MA0809.1chr3:89084377-89084387ATGGAATGTG-6.02
ZNF263MA0528.1chr3:89084017-89084038CCCCCTCCTCCCCCCGCCCCC-6.16
ZNF263MA0528.1chr3:89083667-89083688GGAGGTGGAGGAAGGGAAAAA+6.52
Number of super-enhancer constituents: 5             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_07064chr3:89080739-89086158Heart
mSE_07305chr3:89080835-89086397Intestine
mSE_08273chr3:89079886-89086258Kidney
mSE_08351chr3:89078790-89086622Liver
mSE_09332chr3:89080019-89086237Lung
Enhancer Sequence
TCTGGCCTCT TCGCTGCTCG ACTCCGCCTT TTGGGCTGGC GCCGCCAACA CCAGCCCCGC 60
CCTCGCCCCG CCCGACGCGC GCTGCCCCAG GGCTTGATGG CTACGTTGGA GGTGGAGGAA 120
GGGAAAAAGA CTCTGGGAGG AAGGACTCCC ATATCTCAGC GACGGAGAGC GCTCCGGGGT 180
CTGCACAGAT CCTCCCATAG CTGTGTGTGC TCACTTACGG GTGTGGGGGT GGGGGTGTCT 240
ATGTGAGGCT CTGTTGGCTT TGTGGGACTG AAAGCCATAG CAAGCTGGAA AAATGGAAGA 300
ACTTATACGT GTGGGTCTGG GAACCAGTGG CTTCAGGACT TGGCTTTGCA GCGCGGGGCG 360
CCAATCTTGT CAGGGTGTGA GGTGGGGGGA TATAACCACA CCTTTCCTGA GATTCACACC 420
CAGGCCCGCG CACTCGCCTT CTCACACTCT CTCGTGACCC CCTCCTCCCC CCGCCCCCCC 480
AGCAACACTC CCCCATGCCT TGACTCTGGC TTGGCTGCCC CTCCCCACAC AGACGCGGCT 540
GTTTGTTTTT GTTGGGTTTG TCAATGTTGT CTTTGTTCAA GAGATTGTGT CATCGCTTAG 600
ATGCCGGGAA TAAAGTGCGA CGTTGTGTGT GATCGAGCGT GTAACGTGTG CGGCCAGGGC 660
TAAGGGCTAC TCAGTCCATC AGTACTTTAT GCGAGAACTC ATAGTTGGGC TCAGGGGCTG 720
TAGGGGGGGA TGTTCCTAAT ATTTTCAATA GCGCCAACGT ACGCTAATGA CCTGTTTATA 780
CATTTCACGT GTGTCTTGAG CGAATGCGCG CTTGCAGATG GAATGTGGGA ATATGGTCAT 840
GAAGAGTGAC AAACTAACCG ACCTGACACA TGTACATATG GCGTGTGTAA ATGCGTGTGA 900
TGGCGGGTAG GTGTAAAGAC ACTTGTGTGT GGAAGCGTGT GAAACGCCTG ACATACATAT 960
GCTAATGTTT GTGAACAGTG TGTGAAGAAG AGGAGAAACG TGTTTGGGCG TGCAGCGGGG 1020
GTGGATTGGA GTGGGGGGTA GTTTGGGCGG CTGTGTTTGA CTGAGTCTGA CTTGGGTCTT 1080
CCAGTCGGTG GGCTCTCAGT ACCAGGCTCA GAACCCCTCC CCCTCTCCAT GTAAACAACC 1140
CTGCAGGAAT 1150