EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM121-17697 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
NPC 
Coordinate
chr3:88574130-88576210 
Target genes
Number: 42             
NameEnsembl ID
Apoa1bpENSMUSG00000028070
Mir3093ENSMUSG00000092988
AC044864.1ENSMUSG00000092876
Cct3ENSMUSG00000001416
0610031J06RikENSMUSG00000001418
Smg5ENSMUSG00000001415
Sema4aENSMUSG00000028064
LmnaENSMUSG00000028063
Mex3aENSMUSG00000074480
Mir1905ENSMUSG00000084728
Rab25ENSMUSG00000008601
Lamtor2ENSMUSG00000028062
Ubqln4ENSMUSG00000008604
Gm10704ENSMUSG00000074479
Ssr2ENSMUSG00000041355
Arhgef2ENSMUSG00000028059
RP23ENSMUSG00000093390
Rxfp4ENSMUSG00000049741
2810403A07RikENSMUSG00000028060
SCARNA15ENSMUSG00000088604
SNORA42ENSMUSG00000084433
Rit1ENSMUSG00000028057
Gm17146ENSMUSG00000091881
Gm10253ENSMUSG00000068924
5830417I10RikENSMUSG00000078684
Syt11ENSMUSG00000068923
Gon4lENSMUSG00000054199
nENSMUSG00000065236
Msto1ENSMUSG00000068922
Dap3ENSMUSG00000068921
Ash1lENSMUSG00000028053
U6ENSMUSG00000077148
FdpsENSMUSG00000059743
Hcn3ENSMUSG00000028051
Scamp3ENSMUSG00000028049
GbaENSMUSG00000028048
Thbs3ENSMUSG00000028047
Mtx1ENSMUSG00000064068
Mir92bENSMUSG00000076255
Muc1ENSMUSG00000042784
Krtcap2ENSMUSG00000042747
Trim46ENSMUSG00000042766
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Nr5a2MA0505.1chr3:88574555-88574570ACTGGCCTTGAACTC-7.4
YY1MA0095.2chr3:88575742-88575754GCTGCCATCTTG-6.32
ZNF263MA0528.1chr3:88574189-88574210CCTTTTTCTCCTTCCACCTTC-6.1
ZNF263MA0528.1chr3:88575796-88575817GAAGTAGGAGGGGGAGGAAGG+6.63
Enhancer Sequence
TGCGTGTGTG TGACATGCCA TGAGTGTATG GGTAAAGGTA GATGACAGCT CTGTGGAGTC 60
CTTTTTCTCC TTCCACCTTC ATGTGGGCTC TAAGGCTAGA ACTTAGTTCG TTAGGTTTGA 120
GCCCAAGTGT TCTACATACT GATCCATTTT CCTGCCTTGG CCTTTGAATT CTGAATGTTC 180
TAAACTCCAC CTTCCCAGTG CCATAGGACT GTAGTGTGAT CCACCATGCT ACGATCACTT 240
TTTTACTTTG CATTATTTTT TCAAGGTTTC AGTCTCTAGC CCATGCTGAC TGGTCTCACT 300
CAGGCTTACT TTGAATTCAT GACACTTCTA CCTCTGCCTT GAGCCACCAT TCCTGGCTTC 360
TTGTTTTTAG GGACCAATCT CATGACCTTG TCCAGTCAGG TTTTGAACTC AGGAAGTAGC 420
CCTAAACTGG CCTTGAACTC AGGAAGTAAA GAAACCACAA GTCTAGGTTT TGTTTCATCT 480
ACTCTCAAAA GGCTCTAGAC TTGCAATTAG AGAAAGGACG CTGCTGGAAG AAGAGAGTTT 540
GAGAAGCAAA AGATTGTGAA GAAAATCCTG GGTTTTTCAT GTGATCACAA AATGGATTTC 600
GGTCTGGGAA ACTCAAGACT TAAAGGATAG AGACAGAGAG CAAAGCTGAA GAAATACATA 660
AGATCCAGCC TTGGGGTCAA ATGGGAACAA GGGCTGAGGG GTGTGAAGAT CCATTGTCTG 720
GATGCTTTCG CTGAGATCTG ATGGCTTGTT ATGTGGAGAA CATTGGGTTC CGTTCAGTTA 780
CATATGCCTC TTACTTGGGA GTGAGAAAGC CATTTTTATT TTATTTTTTT AAAGATGGCT 840
TGTGTCTCTA CCCTAAATTT TGGAACCTAA TGTTCACACC TGGATTGTCT GAGGGATATA 900
CTCTCTTAAG GAATATGAAG GTTCTAGGTT CGCTCTGCAA CAACTCTTAC TTGATTCCTC 960
CAATCGAAGG ACAATTTTAT TTTACTTATT TATGTGGTGT GGAGCACAGC ATGAGAAGTT 1020
TGCGCTCCTG GATCGTTATG GAGGAGTTCC CCAAGAGGAA ACGACTTGGC CAAGCCTCTC 1080
TTGCTTTCTT TCCCACCTAT TTACCACAGC ACTTTCTGCC CCAGGGAGTG TAAAAGTGCT 1140
CTGAGAACCC AGAGGGCTAG GTCGCAGACC AGCCACTCCG AGATGACGTA ATGCTTTCTG 1200
TGGTACACAA AGCAGCCTCC CCCGGGCTGG GCCTCTCCAG CCCCTCCCCC AGGCCAGGAT 1260
TGCCTCCCTG GCCAGCACCA GCGCGGGTGA GTACCCCTAT TTGAAAAGCC AGACCGGGAA 1320
AACAGGGAAC AAAGGCCCCG GAAGGGGCGC CTAGGCACTG CCAGGAGGTT CAGAAATAGA 1380
CATCACGTCA TCTCTCCGCC CGGCGGCGCC AAGCGCCATT TGGTAACACC GCGAAGGACT 1440
ACACCATTAC GGTGCAGAAT GAAGCATGCA GGGCTAGCAT TTTACCCCAG CCCTAGCAAC 1500
CCTCTGACCG GCTTAAGGAG TGGCTTCATT TGTGCTCCCC ACCCCCGCAC CCTGCTTTCC 1560
CTGGAGGCCT CCGCCTCCCT TGGCTTCCAG CCATACAGCC CATAGTCTCC ACGCTGCCAT 1620
CTTGATGTCC CATCCCCCTT GCCACTTTCC TCTTCTGCAG CCCTCAGAAG TAGGAGGGGG 1680
AGGAAGGGGC ACCGCCCTGC GTGCCCCTAG GGGGAGGGCT CGGCCTACCT CACCTCTCTT 1740
CCTCCAGAAA GAGGGGTGGG GGGGGGTTGT TCACATCCTC CGCAAGCTTG CCATTTCTCA 1800
CCTCCAGACG TGCTGACAGT GCACCATCAA GGGTTTACCA TCAAGGTTTT AGCATCCTGG 1860
ACCTACCTAT CCTCGGTGGC ACTCTGCCCT TGCCAGAGCC TGCATCCCAC AGCTGAAATT 1920
CAGAGGTTCT CCACAGCCTT CTACTCATGA CCTCAGGCCC TATTCTGGCT GGGCTGGCAA 1980
TGAGAGGGTC CCATTTGGAC TTCACTCCCC GCCCATTCCT CAGCTATCTG GCATTGCAAC 2040
GGCACTGATC GCCCCCAAAT TAGTTTGTCA GGCTCTACTT 2080