EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
MM121-17696 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
NPC 
Coordinate
chr3:88559210-88564010 
Target genes
Number: 41             
NameEnsembl ID
Apoa1bpENSMUSG00000028070
Mir3093ENSMUSG00000092988
Cct3ENSMUSG00000001416
0610031J06RikENSMUSG00000001418
Smg5ENSMUSG00000001415
Pmf1ENSMUSG00000028066
Sema4aENSMUSG00000028064
Mex3aENSMUSG00000074480
Mir1905ENSMUSG00000084728
Rab25ENSMUSG00000008601
Lamtor2ENSMUSG00000028062
Ubqln4ENSMUSG00000008604
Gm10704ENSMUSG00000074479
Ssr2ENSMUSG00000041355
Arhgef2ENSMUSG00000028059
RP23ENSMUSG00000093390
2810403A07RikENSMUSG00000028060
SCARNA15ENSMUSG00000088604
SNORA42ENSMUSG00000084433
Rit1ENSMUSG00000028057
Gm17146ENSMUSG00000091881
Gm10253ENSMUSG00000068924
5830417I10RikENSMUSG00000078684
Syt11ENSMUSG00000068923
Gon4lENSMUSG00000054199
nENSMUSG00000065236
Msto1ENSMUSG00000068922
Dap3ENSMUSG00000068921
Ash1lENSMUSG00000028053
Rusc1ENSMUSG00000041263
U6ENSMUSG00000077148
FdpsENSMUSG00000059743
Hcn3ENSMUSG00000028051
Clk2ENSMUSG00000068917
Scamp3ENSMUSG00000028049
GbaENSMUSG00000028048
Thbs3ENSMUSG00000028047
Mtx1ENSMUSG00000064068
Mir92bENSMUSG00000076255
Muc1ENSMUSG00000042784
Dpm3ENSMUSG00000042737
TF binding sites/motifs
Number: 19             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ESRRBMA0141.3chr3:88559304-88559315TCAAGGTCAAA+6.14
EsrraMA0592.2chr3:88559303-88559314TTCAAGGTCAA+6.14
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EsrraMA0592.2chr3:88563504-88563515TTCAAGGTCAT+6.62
EsrraMA0592.2chr3:88562843-88562854ATGACCTTGAA-6.62
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EsrrgMA0643.1chr3:88563505-88563515TCAAGGTCAT+6.02
EsrrgMA0643.1chr3:88562843-88562853ATGACCTTGA-6.02
Foxd3MA0041.1chr3:88561473-88561485AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr3:88559855-88559867AAAAAAACAATC-6.44
Gfi1bMA0483.1chr3:88560771-88560782AAATCACAGCC+6.02
Nr5a2MA0505.1chr3:88559625-88559640GAGTTCAAGGTCATC+8.03
Nr5a2MA0505.1chr3:88563501-88563516GAGTTCAAGGTCATC+8.03
Nr5a2MA0505.1chr3:88562842-88562857GATGACCTTGAACTC-8.03
RREB1MA0073.1chr3:88563130-88563150CGGGAGTGGGTGGGTTGGGG-8.4
RarbMA0857.1chr3:88562541-88562557TGTCCTTTTTACCTTT-6.18
SPI1MA0080.4chr3:88560193-88560207AACTTCCGGTTTTC-6.44
ZNF263MA0528.1chr3:88563148-88563169GGAGCAGGGCGGGGGTGGGGG+6.7
ZNF263MA0528.1chr3:88560245-88560266GCCTCCTCCTCCTCCTCCTCT-8.51
Enhancer Sequence
GGAGAGTTTG CTGAGCGTTC CCAAAGCCCT GCATTTGATC CCGAGCACCA TAGAAAACTA 60
AACACGGCTG AGAAGAAAAG ACAGGATCCA AAATTCAAGG TCAAAATCCA TTTCTCCAGG 120
GTCTCGGGAA AGCACCAGTT CTCATTGCCA CATCAAGTCA ATTTCTTTGC AACAGAAGAC 180
TACCCCAGAA AATTACAACT GATCAAATGC CTAGTTGTGG AGCCCCATCT CAACTGATGA 240
ATGTTCAGCA TAGACTGTAA GAGCCAGGGG ACCAGGAAGT CTGTTGTGAG ACTCTGTGTC 300
CTAGAAACGT CAGAGAAGCT ACACACACAT GAAGCCTCAC CAACACGACT GCCTAGACAG 360
GAGCTGAACA GAACTTTCAC CTGGAATCCC ACTGTTTAAC AGGCCTTGGG GTCAGGAGTT 420
CAAGGTCATC CAAAGTTACT CAAGAGTCTG CCGTAAAACT CCAAAAACCA GGCTGGAGAG 480
ACAGCTCATC AGAGAAGAAT GCATGTTTTC CTGGGTTTGG AGGTGTTGGC TCACAACCTC 540
TATAACTCTA GTTGTAGGGA ATCCAACACT CTCTCTGGCC TCCCAGGGAA CCAGGCACAT 600
GTGTGGTATA CATAAACACA TGTAGACAAA ACACTCATAG ACATTAAAAA AACAATCTAA 660
AGAGGATATG TCCTTATCAA AAAAAAAAAA AAAAACCCAC CAAATACCAA ACCTACTTAA 720
CAAATATGAT TACAGCTTAG AGCTGTGCAC AGTGGTACAT GCCTGTAAAC CCAGCTGCTC 780
CAAAGCCTAA AGATGGGGGA TGGCAACCTT GAACCTCGAT CCAGTAGCTT GGGGGAGACC 840
CTCTCTCAAA CCAAAACCTT TAACAGCAGC CCTGAAAGCT GTTTCAGAAG CCTAAGTTTC 900
CTAGTTATTG TTTAAGGCTG TCTCCAGATT ATCTGTTCTT GCAGAGTCCC TGTGCCCCAT 960
CCTAGTTCTC CGGGAAAATG GACAACTTCC GGTTTTCTCT CCTACATCAT TCCTCAGACA 1020
GTAACCAGCC TCCTGGCCTC CTCCTCCTCC TCCTCTGGCT CTTTTCCTTG AGCAGCATGG 1080
CCACCCCACT CAGCTGCCTC TGTGCTATGA AGCCTGCGGC CATAACCTGC TGCCATCCAT 1140
CATTCTGCAG GGAGGGCCAG ATCTCTTTGC TCCCTGGACC CCCTCCCTTT TGCTTTCTAT 1200
TGAATTCTCT GTTCGGGCTG CACTGTCAAA GGCTCTTTTG AGCCTCTGAT GGCTGGGAGC 1260
TAGGCTGTTT TCCCAGTCCC TGGGCCCAGT CAGGCAAAGA CCTCGTTGTG AAGCAAGCAA 1320
GCAGAGAGCC ATGGAGAAGA GATTTTAGCC ATGTCTGACA GGGCCTCTGC TGTGGTACAG 1380
TGGGCTAGAA CCAGGATCCT GAAGGATCCA CTGGGATCAA TGGAAACCCG TGGAGGGCAG 1440
GTCCACTTCC TTGTAACTTG CTAAGCGCCT CCTTCAGAGT CATTTTTCTA ACTAGAACCG 1500
GCTTATGTGC CCTCAATAAA CCTTTTGTGG GACCAGAAGT CTGTAGGATC ACTATGGCTC 1560
TAAATCACAG CCATGAGACA ATGTGAGGGG AAACAGCTCT CTGTCCCTGG AATAGTAATA 1620
TGCTTTCTTT CTCCTTCAGT CCCCATACTA GACTGGATGA TCCAGACGTC ACATGCAAAT 1680
CTGAGATTTT AAGGATCCTC TCATTCCCAT GACACTGCCC CAGGTAAGCA ACTCGACCCA 1740
AGGAACACTG AGGCCATCTC ATGATTCTGT CGTCCCCTCT GCCAGTCGGC TTCTCCCAGC 1800
TCTCTGCCTG TACCTCCTGT TCCAGGCTTA GGATGAGAAT GAGAGTTCAC TTATGATTAT 1860
TAAATACAAT ATAAGGAAAC AAAGCAGTTG CTTAAAAATT TATTTTCAAG GGCTGGAGTG 1920
AGCTCAGCAG TTAGAGCACT GGCTGCTCTT CTAGACAACC TGGGCTTGAT TTCTAGCATC 1980
CGCATGGCCA CTCACAACTG TCTGTATCTT CAGTTCCAGA GGATCCAATG CCCTTCTTTG 2040
GCCCCTATAG GTATTTGGTC CACAAGCATA ATGCAGGCAA AATACCCATA CACATAAAAC 2100
AAAAATAAAT TAAAAAACAA TCAATTCCGG GCAGTGGTGG CACACACCTT TAATCCCAGT 2160
ACTTGGGAGG CAGAGGCAGG CAGATTTCTG AGTTTGAGGC CAGCCTGGTC TACAAAGTGA 2220
GTTCCAGGAC AGCCAGGGCT ACACAGAGAA ACCCTGTCTC AAAAAACAAA CAAACAAAAA 2280
CCCAAAAACC AAAACAACAA CAACAACAAC AACAAAAAAT CAATTCCATA GTCCAGGCAT 2340
TGAGGCACAT ACCTTTAATC CCAGCACTTT GCAGATAGAG GCCTGGTCTA CATAGCTGGA 2400
GATATCTAGA TCTACACAGT GAGATCCTGT CTCAATAAAA TTTTCCCCTA GGGGCTGGTG 2460
TGCCTCACAC CTTTGTACAT GTTGGACAAG CACTGTACCT ACTAAGCCAT ATTCTCAGCC 2520
TTCCTACACA GGAACCTTAG AAGGAGGGTT TGGTTGCAGT TACAAGCTAT AAGAGGATGT 2580
CCTGGGCTGG GGATGTAGCT CAGTGTGTGT TAGACCCAGA GTTAGATCCC CAGCTCATCC 2640
CCCAGGCCCC TCTTTAGAAA AAACGATGCC TTTTAAAGAT GAGCTGGAGA GTGAAATGTC 2700
TGGAGTAGTT CTGGCTGAAG CCCACACTTT GTCCTGAGGA GGATTTGGAG GCGGCATTTG 2760
GGCTCTTTGG CTGGGGATCC TGGGGATGAA TAAAGGACAG ACTCCCGGGT GCTGCTCAGA 2820
GATAAGGGCT CAGGAAGTGT GGGAGTCTGG CAAGCTCTGC TGTCCTGTTG GGGCCTCTCC 2880
TACTTCGATG TATTGCTCAG GATCCTAGCC CTGGCTTCAT CCTCATGAAA GGAGTTAATA 2940
AAGTGGGAAG AAACTTGGCT CTCCCCAAGA ACTCCTGGCA GTTTAGCAAA TGCCATTGTC 3000
TGTGCTCTCT GCCCAGTGCC CTGGATTTGA GGCTGCTTTG TCTCCAGCCT GAATCAGTTC 3060
CTTTTTGGCC AGTCTTTTCC CAGCTGCAGC TCTCGGCACA GAGCCACCCC TCCCCCACAG 3120
TACTGGACTG TGAGCACACG AGTGGCCTGG AAGAGTGGTG GGTGCTGTTG GAAACAGCCC 3180
TCCTTCCAGG ACAGACAAGG CTGAGCACTC GAGCCCTGTA AATGGAAGCC AGGAAACTGG 3240
AAAGCGAGGA GCAGAGACTG AGGAAAAGTA GGCAGGAGAA GGCAGAGGAG GGGACTTTCC 3300
CTTCTGTCGT CTCCACTGTC CCTTCCTGTT ATGTCCTTTT TACCTTTTGA GCTAGGATGT 3360
CAAGTATTTT AGGCTGTTCT TGAACTTGTA GGGAAGGCTG ACTTTGAATC TCTGAATCTC 3420
TTGCTTCTAC CTCCTAAGTA CTGGGGTTGT AGGTACCACC CTCCACTTTC ATTTCATGTG 3480
GGACCAGGGA TCTGTCCTAA GGTTCTGTAC CTCATAGGCA AGCACTCTAC CAACTCAGCC 3540
ACATCCACAG CCCTTGTGTG AGTGTGTGTG CGTGTGTGTT TCTGAGACAG TTTCCTGCAG 3600
CCTCGGTTGA CATTCAGCTT CCGAGAGCTG AGGATGACCT TGAACTCCTA AGCCTCCTCA 3660
TCTCACCGAC CAAGAGCTGG GATTTCAAGC CTCTGCCATG ATGCCCAGTT CTCAAAGTCA 3720
GAATTGGCTA GTACAGGATT CCAGTACTCA GTCAGCAAAA GCAGGAGGAT TATTGTAAAC 3780
TCAAAGGCAG CCTAGGCAGA GTTGAGTCTC TAGCTGCATA TGTAGCAGAA GATGGCCTAG 3840
TCGGCAATCA ATGGGAGGAG AGGCCCTTGG TCTTGCGAAG ATCATATGCC CCAGTACAGG 3900
GGAATGCCAG GGCCAGGAAG CGGGAGTGGG TGGGTTGGGG AGCAGGGCGG GGGTGGGGGG 3960
AGGGTATAAG GGGCTTTGGG GATAGCATTT GAAATATAAA TGAAGAAAAT ATCTTAAAAA 4020
AAAAAAAAGG CAGCCTAGGC TATATAGTAA GTTCTAGGCC AGCCCAGTCT ATGTATTAAG 4080
CTCCAGGCCA TTGAGAATTA CATAGTAAGA CCCCATGTGT CACGAAATAA AACAATAAAA 4140
GTAAGTGCTG GAAATGTAGC TCAATTGATA GCGTGCATGC TTGCACGTAC ATGTGAGTCC 4200
TGGGTCTAAC TCTCGCACTG CAGGCACTGT GTGCTAGTGC ACACCTAAAC CCCATGGGAT 4260
TTAGCGCATG GGATGCAGGG AGGACAACAA GGAGTTCAAG GTCATCTTCA GTTCCACCAG 4320
ATTCTTTTTG TGTGTGTGTG GTTTTTTTGA GACAGGGTTT CTCTGTGTAG CCCTGGCTGT 4380
CCTGGAACTC ACTCTGTAGA CCAGGCTGGC CTCGGACTCA GAACCTCTGC CTCCCGAGTG 4440
CTGAGATTAA AGGCGTGCCC CACCACGCCA GGCTGTTCCA CCAGATTCTT GATCAACATT 4500
AAAAAATAAG TCTCAGGGCT GGAGAGATGG CTCAGTGGTT AAGAACACTG ACTATTCTTC 4560
CAAAGGTCCT GAGTTCAATT CCCAGCAACC ATTTGGCCTC TGGGTTGCAA ACAAACACTG 4620
CCAACAACTG TCTTTTTCCT CCAATAAGGT GAGAACTTCT TAAGGATAAT AATACGCCAG 4680
GCACGTTACC TGGTTCCTTA TTGTGACCTA ATGGGGGAGG CAGTGTTGTC AGCTGAGGGG 4740
AACAGACTGA GAGGAGTTAG GTGCCCACTG TCTTGCAGCT GGGACGCAGA CGCTGAGGTG 4800