EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
MM121-17690 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
NPC 
Coordinate
chr3:88432160-88433700 
Target genes
Number: 33             
NameEnsembl ID
Apoa1bpENSMUSG00000028070
Gm3764ENSMUSG00000091070
Mir3093ENSMUSG00000092988
AC044864.1ENSMUSG00000092876
Cct3ENSMUSG00000001416
0610031J06RikENSMUSG00000001418
Smg5ENSMUSG00000001415
Pmf1ENSMUSG00000028066
Slc25a44ENSMUSG00000050144
Sema4aENSMUSG00000028064
Mex3aENSMUSG00000074480
Mir1905ENSMUSG00000084728
Rab25ENSMUSG00000008601
Lamtor2ENSMUSG00000028062
Ubqln4ENSMUSG00000008604
Gm10704ENSMUSG00000074479
Ssr2ENSMUSG00000041355
Arhgef2ENSMUSG00000028059
RP23ENSMUSG00000093390
Rxfp4ENSMUSG00000049741
2810403A07RikENSMUSG00000028060
SCARNA15ENSMUSG00000088604
SNORA42ENSMUSG00000084433
Rit1ENSMUSG00000028057
Gm10253ENSMUSG00000068924
5830417I10RikENSMUSG00000078684
Syt11ENSMUSG00000068923
Gon4lENSMUSG00000054199
nENSMUSG00000065236
Msto1ENSMUSG00000068922
Dap3ENSMUSG00000068921
Ash1lENSMUSG00000028053
Mtx1ENSMUSG00000064068
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXF2MA0030.1chr3:88432905-88432919CAAAGGTAAACATA+6.05
Lhx3MA0135.1chr3:88432235-88432248TAATTAATTAACT+6.64
Nr5a2MA0505.1chr3:88432613-88432628GATGTCCTTGAACTC-6.49
RFX4MA0799.1chr3:88433252-88433268CGTTGTCATGGTTATG-6.08
Number of super-enhancer constituents: 5             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_00952chr3:88419788-88434464Myotubes
mSE_04056chr3:88432212-88434842Cortex
mSE_05020chr3:88433246-88434496E14.5_Heart
mSE_08176chr3:88432177-88434314Kidney
mSE_10797chr3:88432079-88434521Olfactory_bulb
Enhancer Sequence
GAGCCGTCTC TCCAGCCCCA AATGCTAGGT TTAAAGACGA GCTTCACTCC TGCCTGGCTT 60
GTCCTCTAAC ATCTTTAATT AATTAACTTA ACTAATTACT TTAGATACAG GGTCTCACTG 120
TGACATTCTG ACTGGCTTGG AATTTGCTAC GTAGGCTAGT GTGGCCTCAG ACTCAGAGAT 180
CGGCCTGCCT CTCCTCCCCA GTGCTGGGAT TAAAGCCGTG CCCCACTGTT CCATTTATCC 240
TGCCTTTTCT GACTTATTGG TTCCGTGCCA TGGTTTGGAC GTGGGTGTCA GTTTGTTCTT 300
CTGCCGTGTG GGACCTGGGA ATCGACCAGG GTCATCGGGT GCCTTTGCTT TTCTTTTAAG 360
CTGTCTTCTA ACCTGTTTGT TTTGTGTTGT GTTTTGTTTT TGATCGTAGT GGTGGTGTTT 420
TGAGATAGGG CCTCATATCA CTATATAGCC AAGGATGTCC TTGAACTCCC AAGCTTCCTG 480
CCTCCACCTC AGTGCTGTTT GTGCATGAGT GTGTGCGCAT GCACATACAC GTTGTTGTTG 540
TTGTTGTTGT TTTGAGACAG TTGTTCAGTA GCCCAGGCTT GCTGCAATAG TCTTAGTCTT 600
CCTGTCTTAG TCAGGAGTTA ACAGGCATGG GCTACCACAG CTGACATTGT CTTTTCACCT 660
TTTCTGGCTC TTGGAGCTTG GGGAGGAACA GTAAAGAAGT CAAGGACTCT GACAGAAGCT 720
GGAGGAGGTA GGGGAAGCTT AAAGGCAAAG GTAAACATAG ACCTCGGGGT AAGAAGGTAC 780
TCAAGAGTGC TGCAGGCCTA GCGCTGTGAT CTGGAGTTCA CAGGGTTTCT TGGGTACTGA 840
GCCCCCACCT CTGTACGTAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACTCTG 900
CTAGTGAGGG ATCTCTTTTG GGCTTTGACT GAGTGTAAGT AGAAGAGTTA GAGGGTTCGG 960
ATCCTGGCCT CTGAGTTGAT GGTGTCTGAA GAGGCATCCT GGCCCCCACC CCCAGCCAAT 1020
CTAATAGGGG AATCTCCTGC TTTGCCATCC CTGCTCCCCC ATGACTGCTC TGAAGACAGC 1080
AGCTCCAACA CCCGTTGTCA TGGTTATGAG AGGAGCTAAC TCCCATAGAT TGGAAAGCGC 1140
TGGTGAGCTG GCACCCTCTG CTTCACTGGT CCTCCCCTCT CTCTGCGCAT CTTCCCCCGG 1200
CACAGAGAAA TCGTACAGCA GCCCGGGGGC GAGCAGAGCT AAGGCTGGAA GGTGGAGTGA 1260
GGACGCAGAG CTCTAGAGCT AGGGAGATGA GTGGGAACAG GAGGCAGCCC AGTCGCCGGG 1320
GTCAGGTAGG TCAGAGGCCT CGAAGCCTCA GGGACTGACT ACCCAGGGCC TGGTCATGCC 1380
TGGACAGCCA CCTCGGACAC CCGTGCATAG TGGGTTATGC TTTAGCAATT GCTGTCACTT 1440
CAGCCTCTCT AGGCAGGCAT TTCTCCCATG CCTCTGCTGT TTATCTGGAC GCCAGGTACC 1500
TGACTGAGTG TCTTCTGACC TCACTTCTGT CTCTCAATCT 1540