EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM121-17676 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
NPC 
Coordinate
chr3:88227520-88228640 
Target genes
Number: 33             
NameEnsembl ID
PrccENSMUSG00000004895
Mrpl24ENSMUSG00000019710
NesENSMUSG00000004891
Apoa1bpENSMUSG00000028070
1700113A16RikENSMUSG00000086082
AW047730ENSMUSG00000091886
Gm3764ENSMUSG00000091070
Mir3093ENSMUSG00000092988
AC044864.1ENSMUSG00000092876
1700021C14RikENSMUSG00000010538
Cct3ENSMUSG00000001416
0610031J06RikENSMUSG00000001418
Tmem79ENSMUSG00000001420
Smg5ENSMUSG00000001415
BglapENSMUSG00000074483
Pmf1ENSMUSG00000028066
LmnaENSMUSG00000028063
Mex3aENSMUSG00000074480
Mir1905ENSMUSG00000084728
Lamtor2ENSMUSG00000028062
Ubqln4ENSMUSG00000008604
Ssr2ENSMUSG00000041355
Arhgef2ENSMUSG00000028059
2810403A07RikENSMUSG00000028060
SCARNA15ENSMUSG00000088604
SNORA42ENSMUSG00000084433
Gm17146ENSMUSG00000091881
Gm10253ENSMUSG00000068924
5830417I10RikENSMUSG00000078684
Syt11ENSMUSG00000068923
Gon4lENSMUSG00000054199
nENSMUSG00000065236
Ash1lENSMUSG00000028053
TF binding sites/motifs
Number: 2             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
NR2C2MA0504.1chr3:88228063-88228078GGGGGTCAGAGGGGA+6.04
Nr5a2MA0505.1chr3:88227673-88227688ACTGGCCTTGAACTT-7.44
Number of super-enhancer constituents: 1             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_08821chr3:88224433-88230228Liver
Enhancer Sequence
AGTTATCAAA TGAAATGGAA AGTAGACTAG CTCAAATATG CACGTGTTAC AACTCTCCTC 60
ACATAAGCAA AACTCAGAAC TACTCTCTTG CTTTGCTTTG CTGCCTTTGC TGCTGTTTTG 120
TTGTTTGTTT GGTATGAGTT TCAAGTGGCC CAAACTGGCC TTGAACTTCT GAGCCTCTTA 180
TCTGCAATTC CTAAATGCTG GGATTATAGA TGTGAGCCAC GATAACACTT GCCGGGTTTA 240
TTCTGAGCTG TGTGCTATGC GCATTCTACC AACTGAGCTA GATCTTTGGC CCTTGGAGTT 300
AACAACTGTG GAAGGATTTT GCTAACAGTA AAGTATTTCC CTTACTGCAC AAGGTTCTAC 360
TGAGCAGGGT TACTCCAAGT CCTCACCAGC CATCTGGTCC ACAGATGGCA TGGACAATAT 420
AGTTGTCTAT ATAAGAGCAG ACCTAGGTGT GGTAGCACAG GTCTATCACA CTAGCCCAAG 480
GGGGCTGAGG CAAGAGAAAC AGGAGTTTAA GGTCAGCCTG GTTTACACAG TAAAACCTGT 540
CTTGGGGGTC AGAGGGGACT CAGGCCATAC TGTAAACCTG CTGATAAGAA ACAACACTCT 600
AACATCTCTA GATAATATAT GGATTGTAAA ATGTGAGAAG CATTGCTTTA CTTATTCCAG 660
CTTGTCAGTT TTATAAGAAC TATAACTATT CTCAGATTCC AGCATCATTA GAACCAGGTT 720
AGGAGTCCTC TGATTCCATC CTTGGTAGTG GACACAATGA TGATTAACTG GTCCATTCCA 780
ATCAGCCACT CCCACCACAT CGGGTCAACT CCTGACCAGA CACCAGGCTG CCATTCTCAG 840
ACAAAACAGA TACTTCCCAG CACCCTCTTT TCTTTCTCTC TGCCACTTCA GGTTCTGCAT 900
TCTGGGAGCT GTCACCCACA TAAACGCGAA TTAACTGTCC CGCTAGCTAT TCATTGCCCT 960
TCACTAGGTC CTGACTATGT CGCCTCCCAA TCTAAGCCTC CTCCCTCCGG CATGGTGAGG 1020
TTCCACCTAG TCTTCATTGG TCTTCAATAG ATTTCCACGT GATCCTCCAT CACACACACC 1080
ACATGACAAT CCCCTCCACA CACTCCACGT GACACCCTCC 1120