EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM121-17640 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
NPC 
Coordinate
chr3:86953040-86959420 
Target genes
Number: 4             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 27             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Ascl2MA0816.1chr3:86953941-86953951AGCAGCTGCT+6.02
Ascl2MA0816.1chr3:86953941-86953951AGCAGCTGCT-6.02
EWSR1-FLI1MA0149.1chr3:86958927-86958945CCTTCCTGGCCGCCTTCC-6.35
Foxj3MA0851.1chr3:86956774-86956791TAAAAATAAACAAATAC+6.81
LEF1MA0768.1chr3:86957563-86957578AAAGATGAAAGGAAT+6.42
MAFKMA0496.2chr3:86955681-86955700TCCTCCTGACTCAGCATCT-6.04
MEF2AMA0052.3chr3:86956766-86956778TCTAAAAATAAA+6.07
Nr5a2MA0505.1chr3:86956728-86956743AAATTCAAGGCCAGC+7.04
RFX1MA0509.2chr3:86958783-86958799TGTTGCTATGGCAACA+7.1
RFX1MA0509.2chr3:86958783-86958799TGTTGCTATGGCAACA-7.1
RFX2MA0600.2chr3:86958783-86958799TGTTGCTATGGCAACA-7.37
RFX2MA0600.2chr3:86958783-86958799TGTTGCTATGGCAACA+7.4
RFX3MA0798.1chr3:86958783-86958799TGTTGCTATGGCAACA-7.35
RFX3MA0798.1chr3:86958783-86958799TGTTGCTATGGCAACA+7.3
RFX4MA0799.1chr3:86958783-86958799TGTTGCTATGGCAACA-6.56
RFX4MA0799.1chr3:86958783-86958799TGTTGCTATGGCAACA+7
RFX5MA0510.2chr3:86958783-86958799TGTTGCTATGGCAACA-7.57
RFX5MA0510.2chr3:86958783-86958799TGTTGCTATGGCAACA+7.58
RXRGMA0856.1chr3:86957648-86957662TGACCTTTAAACTG-6.11
RxraMA0512.2chr3:86957648-86957662TGACCTTTAAACTG-6.01
STAT1MA0137.3chr3:86958291-86958302TTTCCAGGAAA+6.62
Sox3MA0514.1chr3:86954599-86954609AAAACAAAGG-6.02
Sox6MA0515.1chr3:86956842-86956852AAAACAATGG-6.02
Stat4MA0518.1chr3:86958291-86958305TTTCCAGGAAAGGA+7.1
TCF7L2MA0523.1chr3:86957563-86957577AAAGATGAAAGGAA+6.1
ZNF263MA0528.1chr3:86958860-86958881CCCCCTCTTTTTTCCTCCTTT-6.32
ZNF263MA0528.1chr3:86958735-86958756CTTTCTCCTTCTACCTCCCCC-6
Number of super-enhancer constituents: 7             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_04919chr3:86953059-86956760E14.5_Heart
mSE_04919chr3:86956842-86957641E14.5_Heart
mSE_05534chr3:86953143-86956780E14.5_Limb
mSE_09399chr3:86952731-86959453MEF
mSE_10288chr3:86953013-86956757Embryonic_stem_cells
mSE_10288chr3:86956799-86959261Embryonic_stem_cells
mSE_11862chr3:86953097-86956666Placenta
Enhancer Sequence
GACTGTTGGA GGCCCGAGGA GGTTAGATAG TTTTTACAAA GTTAAGAGCA GACTCAGGAA 60
GAAAACGAAG ATGCAGGGTA CCTGGAGAGT CAAAACCAGA GGAGTGAAGC AGCCAAGAGG 120
AAAGTGCACA GCACGGAGCC AGTCGGGTGG CTTCTGCTCT CTCAGTGAAC CCTGGGTCGT 180
GGTCACCGAG AATGGGGACA CAGTTGGAAG AATGAAAATA TCTCATATTT CTCATTCCCA 240
AAACGGACAG CTCTGGGACA CAGCGTTTCT GACCCAATGA TTGAGGCTTT GATTGAGATG 300
GCAGCCCACA CTGGTCATTT TTAGGCTGTT GAGGTTGGGT CCACAACCTT CTAGGCTCAG 360
CCCATGTCCC AGAATGGGTA GCGACAGCAA GAATCACAGC GGATATGGGC TGCTGCTTCT 420
TCCTCCTCAG ACCCACAATT CCTCCGCTCT CGAGGCAGCC CTATCATCAG CTGTAATGAA 480
ACACGGATCT CAGTCATCTA CCGTCTATCA CGCCACACCA GCAGGGGTGT GGGCCACACT 540
GAGGTCAGTT CTGATTGGCG CTGGAACTCG TGGTGGAGAA TTTTTAGCAG CAACTATTAT 600
CCTATAGGGA AGATAGCACA CACACACACA CACACACACA CACACACACA CACACACATA 660
CATACATACA CGGTTTTCAT CTTCTCAGAG TACATGTTAC ATGACAGCAT AAATTGCTGA 720
GCTGGAGGAC AAACCAGACT GTGTACTGAA CATTCATTAC AGAGACTCGA CAAATGGATA 780
ATCTAACCCC CCAGGACAGG GATGTTAACT CAACAAGGTT GCTATTCTTC CCAATTGTGT 840
GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTAC ACTTACTGTA 900
GAGCAGCTGC TCTGACACTC CACTATGAGG TTAATAACAT AACCAAGCCA CATTCTGTCT 960
CCTGAAGATC AGAGAGCACC GGGCAGTAAA CAGCTCACTC TAGTTCAGCA GGGACAGAAT 1020
CTACAGAGGT ACAGGCAGTT GCTCTGGAAG CCCAAGGGGA TGGAGCAGTT ATTCTTTGGG 1080
AAACTGAGAG GGCTCCCTGG AGGGCTTGCA AAACGCATCT GGATGGCAGA CTGGGCAGAG 1140
GCGGCCTGGA CTGCCCTGCG CAGGACACGG AGGGGAGACA TGCAAACAGA CCCCTACAGC 1200
CTAGTGACTT AGGAGGGATC TCATCCCAGG TGAGGCAAAG CACAAGCCTC AGGGGTGTCT 1260
AGACAGACAG ACAGACACTC CTGCCCACTG CTTGCAGCCA CCCCTATCTC CTCTTAGTGA 1320
GCTTCTTCTT AAGGAACTTT CCTCTCACTG AGAGCTGAAA GAAAGAAAAA AATTCACCCT 1380
GGGAACAAAT TCCTGTGCGA GTCCACAACA GTTTATTTTC AACTTCAAAA TTACTCAATT 1440
CAGCACTAAT TTTTCTGGGA TTCCCACATC TGGGGACTTT TTCTTTGGGA AGATTGTTAC 1500
AGTGGGGGCT TTTGTTTCAG CCGGCCGCCC CTCTAAACTC TTTTAATTGA GCCTGTTTTA 1560
AAACAAAGGG AAAAGAATCA GGAGAGGAGG CAGCTCCCTT TGCCTCCAGC CCCTTGCCCC 1620
AGCTCTGCGG TTAACACTCA GCAATGATCC TACAAGCCTG GAATCTGAGG AATTTCCTGC 1680
CTGTGCTCCC TGGAAGAGCC GAGAGAGAAC CTAGCAATTA GGCCTCCAGT TTCCATTCCT 1740
GCCTTCTTCC ACCACAGCCA GTGGACTGAG CGAAAAGCTG GTGGAGGGCC TGGGAGGACC 1800
GCATCTGTAC GGTCCTGCGG CTGAGACAGC GGTGCCCAAG GTTACTCTCT CCTTCCTTTC 1860
TCGCCGATCA ATCACATCTT TTCCTTTGTC TGCCTGAGAG AGTGGGAACA GTAAGGGACA 1920
CGAAGAGTTG TAATCCTTCC CGAAGCCATC TTGTTTCTCT GCAGTGTTTC TCTCCCCTCA 1980
ACACCACAGG AGTCCAGGCA CTCCGAGGCT GCCCACCCCA TCCTCTGGGG CTATTGTCAT 2040
TCGCCCTAAG CCCACATGCT CGTCACGGGT CTGTTCCAGG GAGCGGGTCA CAGGACTGCC 2100
TGCCCCAGGC AGTATGTCTG CCTAAGGGAT TTCTAAGAGG CAGGTTAGAG GCTGTGGACC 2160
TCTGTATTTT GGTTCAACTT AGAGACAGAG AGGCAAGAAG ATGAAAGGCA TTCCCAGGTT 2220
GTCTGAAGGA ACCACACACA GGTTTTGTGG GTGCTGCAGC AGCTGTGTGT AGCAGAAGCA 2280
AATTTTTCTT TTAATTATGT TTAGCTCCGG CTAACATTGA AATCAGGTCC TATGTTCTCT 2340
CAACTTATCA ATTGGTGGCT GGATTCCAGG TACTAGGGCA AAAGCAGCCT GGGACTTAAA 2400
AACTTGCCAC AAATAGTTCC CAAACTGGCC AAGCCAATCC CTTAGCAGGG CCTGCTAGGC 2460
CACATCTGTG TGGCCTCCTG CCAGAGTGCT GTCCCCCACT TCCCTACCCC TGTAGACTCT 2520
AGAGATCCCT GCAGTCCAGG GTCCTGCTGG CAGCACTTCC TCATTCTAGC TGTCTCACAG 2580
CACTGTATCC CTAGCTTATA TGGAACCTAC TTTACAGCAA AGGGTATTCT GAAACCCCTG 2640
ATCCTCCTGA CTCAGCATCT CGTGCTGAGT GGGAACTAGA CCTAGCTAAT TGTCTCATTC 2700
TTATAATGCA TGTATTTTTA TTTTATGTGC ATTGGTATTT TGCCTGCATG TGTCTATGTG 2760
TGGTGTCAGA ATCCCGGGAA CTGAAGTTAC AGAGACCTAT GTACTGTCAT GTGTGTGCTG 2820
GGAATTGAAC CTCCTCTGGA AGAGCAGCCA GTACCCTCAA CCACTAAGCC ATCTCTCCAT 2880
CCCCTAATTG TCTCTTGATA GCCTTCAATA ATCCTCCATG TAACTCTCTA CTGTCTCTCT 2940
TTATCCATTC AGAGGACATC TCTGAGTTGT CTCTGCCCAA AGTCTCAGAA ACGCTAATGG 3000
TTGCAGTGAC TCAACACCTT CCCTGTCTGC CATCTTAGTC ATGGCGGCGA CAGGGCAGTG 3060
ATCTCCCTAC TGACCAAGAA TGTTGCCCAG TCCTAAGCCT TACCAGATCT CAGCTCTGCT 3120
CACTGGCTTC TCTTTCCCTC TCCACAAACA GAAGGCTGGG ATGACAGCCA GCACTCAAGA 3180
CCTCTACCTC CAGCCCCTGG AGTTTCCGTA GACTCTTGAC AATTCTGACA CAGTATGGAA 3240
CTAAAATGGC TGCTTCCTGC TTCCCCTTCC TTCTCTTGTT GAGTCTTTGC TCTCCACACA 3300
CTCTGCCAGC CACAGAGGAG CCAGACTCAG AAATCCTCCA CGTCTTCAGT GGGAATAGCC 3360
ACTGGTCTAC ACATTTCCTC CAACTCAAGA TATTTGCCTT TTGAGGGCCA ATTCCCAGTT 3420
CCCCCACCCC TGCCCTGCCC TCACATTCCC TTCAAACAAA GCTTTCCTGT TAGGTTTTGA 3480
CCCTGATGAA GATTCTTAAC TGATTTTTTT TGCATTTCCT TTCCCCCTTC CTTTCTCAAT 3540
TCTGAAGGGT CTTTTGTCTT CTGAGTCAAA CAGCTCAGAC TGAGGGGACT AGAGCTCTCT 3600
CTCTCTCTCT CTCTCTCTCT CTCTCTCTCA TAATCAACTG GGAAAGAATG AGGGAGGGGG 3660
CGATAGAGGA AGTGGGTATA GGTCTGGAAA ATTCAAGGCC AGCCTGGGCT ATATAAAAAT 3720
CCTTCTTCTA AAAATAAAAA TAAACAAATA CAGGTTGTAT GTCGGGGGGG GGCAATTATG 3780
AAATTATTTT CTTTCTTAAA AAAAAACAAT GGAAATAAAA AAGGGGGAGG CCTTGAAAAT 3840
GTGAAAGGAA AAAGAGGATC CTGGAAGGAG AGGGGAGGCA AAAGAAGGAA TAGAAAACAA 3900
GGGAAGCCTG CAGACTTCTT AAGCAAGGGA GAGAGACAAG ACATGTATCC ACTGAGTAGC 3960
TTCTCCAATT CAGAGGAGGA AAAAAAAAAA ACTGGATTCA CTCCAGCCTG TGAGCCTGGG 4020
TCTATCAGTC CAACCAGTGA TCTCACATGC AATTGTCATG AATGAGTATG GGACTCAGCC 4080
AAACAGGGTT CCAAGGTTCC TTCTTACCCT GGTCCCAGCA GGAGTGGAAG GATTGGTGGC 4140
AAACCAACAC ACACAAAAGA AATGGAACTA GATAGAGCCT CCCCCTTGAA TGAAGGCAGG 4200
TGGCTCCCAG CTGAGAAACA GGCCTCTCTG GGGCAGCTCT TATCCACCTA CTCTGTCTTC 4260
CTGAGACGGC ATTCTCTCCC TGCCTGGCGG AGCAAAACAG AATCAATGAA ATGCTGCCAG 4320
TTCTTCAGTG ATACATACGT TTCTCACCCT GAAGATTATC CGTGGAAAAA AATCTTAATC 4380
CCGGGCAGAC TTTTACACCC AGAATGTTTG AGTATGAGCA AGGAATTAGA AGCTTGCTTA 4440
AATAGCATCC AAGTCAATTC GAAAAAGCAA ACAAGCCTGG TTAATATCCT CAAAGACATG 4500
AAGCATTCCG CAGTGTGTGT GGAAAAGATG AAAGGAATCA GGTTAGTGGG TGTTAAAATG 4560
TTGAGGCACC GTCCAGTACA GTCAACGGGG CGGGGTGTTC ACTGCAGGTG ACCTTTAAAC 4620
TGAGGAGTTC TCTGAGGTCT CCAGTCCCTC TTTACAGAGC CTCTAATGGA AGGCTAGAGA 4680
TGATGCGGGT TATTTGTTTC CATGAAACAG TAGTTGGCAT TTTCTCTGCT TTCTTACTAC 4740
TGGCCAAGTG CGACACTGTG TTAATACAGC TTAACTCATT TAATTAGTTT ATTTGCTCCA 4800
TAAAAGATTT GAGGCAACAC AAATAGACAC ATCTGGTCAG TAATATAAAA AGTAAACTAA 4860
GAGAACAGCG AGTGGGAATG GTTACGGCTA GGAGAGGGGA AAGACCACTT AGGTGTGTGT 4920
GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTATGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT 4980
GTGAGTGTGT GTGAGTGAGT GTGTGTGTGT GAGTGAGTGA GTGTGTGTAT GTGTGTGTGT 5040
GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTTTAC CAATGGGTCC 5100
TCATGAAAAG ATGCTAACAC GGGCAACATT GTTCAGTGCA CACCACAGGC ACCATGACAA 5160
ACGCTCAGCT CAGTCAGGGC AAAGACTATT TGGTCTTGGT TCACAACTTA CCACCCTGAT 5220
GCCTGACTCT CTAAAGGTAA AACTGACAGT ATTTCCAGGA AAGGACTAGA GTGAGCATTC 5280
ACAGAGAAAC TCGCTGTGGC ATCAAACACA GCCCCAGCGA TGCCCCCGGC AGAATGCTGT 5340
TCCTCTGGAC CTTTGGAGGA ATGCGGCAAG AGCCCTGTCA CCCCAAGGCT AGGGCAAGCT 5400
TACCCTCCAG AAAGATTTTA TTTTCTTTAT TTTTTTACCT TGTTCTGAGG AGCTGGGACT 5460
ACAGGAGGGC AGAGGACTAG ACAGGCATGG CTGAGCCTGG AATTCCTGGC TGCCTCTTTG 5520
AAGTTTTCTT GGTGAGCTAG GGGTGGGGAA TGGACGGGAG ACACCAGGCA GAAGTAGGCC 5580
AGATCTTAGG CCAGTCTCCT GACACATGCA GGACTAAAGA GCCCGCAGTG TGTTACTTAA 5640
TTATCTGTAA ATGGTTTTTG TTCCTGTCTT TAAACATTTA CCTCTATTGA ATAATCTTTC 5700
TCCTTCTACC TCCCCCTTTT ACAAGCTATC TCCTTTTCTT TGCTGTTGCT ATGGCAACAA 5760
CTCCAGGCAT ATAACCGCTC TCGGATTTTA AATAAAAGTT GAGACTTCTC TCTTTCCCTT 5820
CCCCCTCTTT TTTCCTCCTT TTTCATCTTT CTAGGGATGA GGCTTGTCTC GTTTCCTCTT 5880
CCCTTCACCT TCCTGGCCGC CTTCCATTTC ACACCCGGCG GTTTCTTTAT CAAGTTCCGT 5940
CATTTTCTCT TTGCATCAGC CTCCTGTCTA AGCCCTCTTC TCTGTCTTTG GGCTTCCAAA 6000
CTGGTCTGAA CCTCCTGGTA GCCATGACAG CAATAGTTGA GCCCCCGAGG AGGCATGGGG 6060
ACAAAGGCTT ATCTGGGGAA AATAGGGACC TGCTGGTGGT CCAGGACCTG GGGAAGGGTC 6120
AATCTATGCT CCCGAGGGTT CACAACCTTC CTTTCTGAAC CTTAAATCCT TTAGTGGCCA 6180
TGGGCAGCAG GCTCCTTATA TTGCCAACCA CCTGACACCC AGAGAGGCCT TTCAGATCTG 6240
CACAGGGAAG GCAAAGCAGG GCGGGCTGGG GAGAACTGGA GGAGGCAGGA GTTTTCTAGC 6300
ATGTGCTGGT GGCTACTAAG AAGTTATGGT AAGCAGGGCC AGGAGGGGAG GCCCACAGCT 6360
CTGATCCTCA CCTGGCGCTT 6380