EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM121-17391 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
NPC 
Coordinate
chr3:53009140-53013230 
Target genes
Number: 2             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 14             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Ascl2MA0816.1chr3:53012931-53012941AGCAGCTGCT+6.02
Ascl2MA0816.1chr3:53012931-53012941AGCAGCTGCT-6.02
Foxq1MA0040.1chr3:53012907-53012918TATTGTTTATA+6.32
Gata4MA0482.1chr3:53009366-53009377TCTTATCTCTT+6.02
IRF1MA0050.2chr3:53012650-53012671AATTTAAAAGTGAAAGGATAT-6.04
IRF2MA0051.1chr3:53012654-53012672TAAAAGTGAAAGGATATC+6.06
MecomMA0029.1chr3:53009361-53009375AGTTATCTTATCTC-6.42
POU4F1MA0790.1chr3:53012485-53012499ATGAATTATTGATT+6.08
POU4F1MA0790.1chr3:53013108-53013122CATTAATTATTCAA-7.34
POU4F2MA0683.1chr3:53012485-53012501ATGAATTATTGATTAG+6.34
POU4F2MA0683.1chr3:53013106-53013122GCCATTAATTATTCAA-6.65
POU4F3MA0791.1chr3:53012485-53012501ATGAATTATTGATTAG+6.77
POU4F3MA0791.1chr3:53013106-53013122GCCATTAATTATTCAA-6.88
ZNF143MA0088.2chr3:53012025-53012041TTCCCACCATGCACAA+6.12
Enhancer Sequence
CAGTTCATGG GATTTTGTTT CACTTAGAGG TATATACAGT ATCTTTGTAT TGCATGTAAT 60
TTTGTAAACT TCTAGGGCTA GGCCAAGCCT CTTCATCACT GGCTTCTGTA TTGCAGGGAA 120
CACAACTGAG ACAGTGTATA CACATGCTAC ACTGCTTGGC TCCCTCTATG CTACATCTTA 180
CAATCTGTAT AACTTTGGGT AAACATTTAG CCTTGTTCTT AAGTTATCTT ATCTCTTTTA 240
AATGGGACAA TGTGGCACGA GCCTCAGGGT TGTTTTAAAG GTAAAATGAA CTAAGATATC 300
AAGCTCTAAG GACAGGTCTT GACACACAGA GTCAATGCTC AACAAATCCA GGAGTAGCTA 360
TCAATCTAGA ACAGTGCACA AAATAAAGAA TTGAGCAAGT GAGATGGTTC AAGGGGTGAA 420
CTCACCTGTC ACCATTTAAA TGGCGGTTCC TCTGGTATTA TTGGGCTGAC CTTCAGTTAC 480
TAAAGAACAG CTGGGAAGCA TAGTTTCAGG TTGAATTTTG TGTCTGCTAT TTTTTTTTTT 540
TGAGTAAAGC GAGAGCTATT GGAACATAGA CATGCACTCA GACCATGTAC TAAGTCCCAG 600
CCCTTGCGGT CACAGTATGA GACCAGTGGA CAGACATCTA AGCAGGCTGT TCTGCACTCA 660
CTCTGAGTTG TACAGTGGGC ATGGGATGTC ACTGAACCCT AGAGATGCCA TCTGGGGACT 720
GAAGTCCCAT GATTCATGCC TGAATGCCAT TTCAGAAATT GTTTCCAAGG GCACACCCTC 780
CATAGCTCAG TAGGATGCCT CTAGATTCCT TGCATGTGTT GTGGAAGAAC AAAGAATATC 840
TTCAGATTCT AGTCAATGCA CATATATCGA GCTTTATGAA ATCATATCGC AGGACCTCAT 900
ACTTCATATT CCACTTTTAC AATTATAAAA ATTTTACAAG GTAACCTGGA GGTTAAAATA 960
GCTACAGTAA ATCTGCAGTA GCCATTTAGG ATGTGGCTTT CTGATGGAAT TCTTCCTAGC 1020
TGCAGTTAAA GTTGTGTTTT AGTTTAAAGT AAAATTATTC AACCCAGGTT ATAATCAGAC 1080
TACTCACACA TATCTATCCT TCTGCCATAT CATAGGCAGT AAATTCAACC CTTCATTAAG 1140
TCTCTTAACA GAGACTCGAC CTGGGATGGT TCTCGCTATG ATGGCTTAAT ATGTAATTTC 1200
CCATAGTATA GAATGTTGGC TGAAAAGCAG CCATTGACCG GAGCCGTCAG GAGGCTGTAG 1260
ATCTATGCCA TTGTGTTCCT TTCCCTGTAA AGATCGATGA GTCGCAGTGA TTTCCTGATT 1320
TTTAACAGCG CTCAGAATAG GAAGTGATGA AATGTTAACA TTTTCCATAG ACTTTGCTGT 1380
GGAATGCCTG TTGAAGCTAC AGGAGACTGA TTGATCATGC CAGTGGGGGG TTCCTTCCGG 1440
TGGTTTTAGA GAGAAGTCTC CTGGTTAGAT TCTGCTGCAA GGAACAGACC CTTCCTAAGA 1500
TGTGGGAAAT ATCTATTGTA AGCCTGACTA ACATGTCTGG TGGGGGTGGG GTCCTGGAGA 1560
ATTCCTGTCT AGATGATCTT TTGTTAGTTT TGTATCCTTG GTGATTGGAT GGAAAGAGGC 1620
GCTATTTCCA TGGAATAATA TTGGATGTAA ACGGATTTCT TGTTAAAGTT ATCATACAGA 1680
ATGATGGGTT GCACCATGTC GTTTTTCATC CTTTGCTCTG TCGTGACTCC CCTCACCCAC 1740
TGCCCTCTCC CATGCCCCTT TCATCCACCT TTGGCCTGTT CCCTTCTCCC CTAATATGCC 1800
CGCCTCTGCT TTCATGTCAA ATGCATGTGT TCCATCACAC ACACACACAC ACACACACAC 1860
ACACACACAC ACAAGCCTTA AGATCTCTTC TCTCCTCTTA TGATCTGCTT TCTCATTCCC 1920
GAATTGATAT TTGAAGTATC AAGTATCTTT TTAGAGCCTA GACAGAGGGC TCCTGTCTAA 1980
CGTCTAATAT TGCTTTCAAG TTCAGTGGTG AGGTTACAAA AGAAAACGGA GACCACCCCA 2040
CTTGTGGGGA GTGGGTGGAG GGCTTGGCGT CTCGGCTGCC CAGTTTTCAC CATGGCAATA 2100
GGAACAGAAT TTTCAGTCCT CTGTGTTCTG CTTCCTTTTT AAGTGAGCTT GGACAATACT 2160
GCAGGGACAA AGCAGTTGCC TCCTGAAAGC CAAACGAATG AATAAATTTG GCCTCTGGAT 2220
TTTTGAGCTG TTGTGAAAGA GGTTTTGTTC TTGACTCTTT TACATCCCCA CCCTCCCTTA 2280
AACCATAGTT AGAACACTTT TTCTCTTTCT TCAGATGATG TCCTTGTTAT CCAAAACACA 2340
TCGTGTAACC CAGACAGAAA ATTCTAACAC ACAAATGTTA TTCATACCTG AGCAGTACTT 2400
GGAGGGGCTA GCCACTCTTT TAAGAATTTT TAGCTTAAAT TAAAACTTTC TTTTTAAGTA 2460
CATCACAGGT ACTTCATGCT AAGAAAGATC TGGGACAGAA TTATTGTGCT TGGAAGAGAA 2520
ATAATAAGCC CTCCGGAACC TGACTGAGTA TCTCTAAATG TTATTGAATT ATTCTTTTTC 2580
TGGAACAGGG GCGAAACTGG ACGGAGGCTA TTTTAGAACA AATTATTTTG AATTACTTTC 2640
TCCAAGTAGC AATTTTAAAT ACTGTTATAC TGTTACTTGA ATATATCCCA GTAAGTTTTA 2700
TCCAATTAAT TTAACGGTTA CTGTAGGAAA CAGAGTGTCA CCCCTATGAA CTGTTAGTGT 2760
GCATGGTGGA TGGGGAACAG GGAGTCAGCA AGTCCAGCTT GGCCCAAGGA CATGCATGAG 2820
TCCCTAGAGA CACCAGACCT TCATCGTGTC CTATGCATTT CAATTAGAAC TCTAACATAG 2880
CTACTTTCCC ACCATGCACA ATAACCAGTA TGCTCTTCCT GCCATGTCGT GATGGCTCCT 2940
TATAAGACAT TCTGCTTGCC TTAAATAGAA TATAGAAAAA CAAGGGGAAA TTTCTCTTTT 3000
TCTTATAGGT CACCAACTTA GCCAGTTTAA AGTACTAATA CAAACTTTTT AATTATATTA 3060
AAAGTTTCTC TAAATGGGGG CTGGAGGATG GTTCCATGGT TAAAGCATTT CATGTTCTAC 3120
CAGGTTCAGT TCCCAGTACC CACATGGTAG TTTCCAACCA GGTAGTGGGG GCTAGGAATT 3180
GATCCTCGGT CCCCTGCAAG AGCATCAAGT GCATTTAACC ATTGGGCCAT CTCTCCAGCT 3240
TCCCCAACCC CTTTTAAGTG AAAAGGGAAA AAAATGTATA TTGAATGTTT GGCGAAAATA 3300
GAGGCAAGCA TCATACCCAA AATAGAATGT CCAGATTGTG AGGAGATGAA TTATTGATTA 3360
GTATTTTAGT TTCCTGTAAT GAGAGTGGGG AGGTCTCTGG ATATTTATAA TTGGCTGTGT 3420
GCAGCAACAA TCTTGGAAGG TCTGTGTAAG GATTGAATGA ATTGTGCTTA ATTAAAGCGA 3480
TTATACTAGG AACTTTGTGA CATTGTTTCT AATTTAAAAG TGAAAGGATA TCTTCATTAC 3540
TATACAATAA TTTCTGCCTT GTTCCCCATC CTAGGGCAAG GCTTTGGTCT GCTTAGCACA 3600
TTTAGCTAAT GCCTAATAAG TTAGACCATC CAGATACTGT CAGAAACAAA ATGGCAATTG 3660
TAATTTATGT ACCCGGGCTA TTAATATGTT CATCATACGC ATGGCTATTT CTTGACATCA 3720
TTGAATTCTT TATCCAAAAG TTCGTGGTGT CCTTATGGAT ATGCGTTTAT TGTTTATACT 3780
TAAGACCAGT GAGCAGCTGC TGTTCCACTT GGATTGGCCT TGAGGAAGAG GGCAGCAGAG 3840
TGTTGAGCAT GGTGGCTGTG TGTCCCAGAC AGGCGCTGGC TGCCTGTAGC TCCCCAAAGA 3900
GAAAGTTCCC TTATTTCTTC TCAAGGGAAT ATCTGATGCT AAGAATCACT TTTTAAATAT 3960
TAAACAGCCA TTAATTATTC AATAAATAGA TCAACTTTGT AACAAGTTCC TAAAGAAAAA 4020
CTTGATCAGC CATGCATTAG GTTTTACTAC CAATCATGAG CCTAAATGCA CAATATACCA 4080
TGTGTGTAGT 4090