EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM121-17052 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
NPC 
Coordinate
chr3:5210030-5215280 
Target genes
Number: 3             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 20             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxd3MA0041.1chr3:5213463-5213475GTTTGTTTGTTT+6.32
Gata4MA0482.1chr3:5214089-5214100AGGAGATAAGA-6.14
IRF1MA0050.2chr3:5211053-5211074AGAAGAAAAGGGAAAGTAAAG-6.23
LEF1MA0768.1chr3:5212352-5212367AATGCTTTGATGTTT-6.36
POU1F1MA0784.1chr3:5211945-5211959TTTATTTGCATATT-6.34
POU2F1MA0785.1chr3:5211947-5211959TATTTGCATATT-6.37
POU2F2MA0507.1chr3:5211945-5211958TTTATTTGCATAT+6.98
POU3F3MA0788.1chr3:5211946-5211959TTATTTGCATATT-6.04
POU6F2MA0793.1chr3:5213894-5213904ATAATGAGCT-6.02
Pou2f3MA0627.1chr3:5211944-5211960TTTTATTTGCATATTA-6.52
SOX10MA0442.2chr3:5211853-5211864GTCTTTGTTTT-6.14
SOX10MA0442.2chr3:5213427-5213438TTCTTTGTTTT-6.62
SPI1MA0080.4chr3:5214697-5214711AAAAAGAGGAAGGA+6.06
SPICMA0687.1chr3:5214697-5214711AAAAAGAGGAAGGA+6.38
Tcf7MA0769.1chr3:5212355-5212367GCTTTGATGTTT-6.14
ZNF263MA0528.1chr3:5211149-5211170GGAGGAGGAAGAGGAGGAGAG+10.39
ZNF263MA0528.1chr3:5211146-5211167GGAGGAGGAGGAAGAGGAGGA+11.13
ZNF263MA0528.1chr3:5211266-5211287AGAGGTGGGGGAGGGGAGGAA+6.04
ZNF263MA0528.1chr3:5214871-5214892GGAGGATGCCGGGGAGAGGGA+6.38
ZNF263MA0528.1chr3:5211143-5211164AGGGGAGGAGGAGGAAGAGGA+8.34
Number of super-enhancer constituents: 7             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_04641chr3:5209896-5211947E14.5_Brain
mSE_04641chr3:5214099-5216020E14.5_Brain
mSE_05530chr3:5209845-5212333E14.5_Limb
mSE_05530chr3:5213407-5214064E14.5_Limb
mSE_05530chr3:5214070-5217350E14.5_Limb
mSE_09724chr3:5209815-5212170MEF
mSE_09724chr3:5213918-5217300MEF
Enhancer Sequence
TGTGTTGCTT AAGCAAATGA CAGACTTGGC AAAGAAACCG TAGGCTTTGG GATAAGTCTT 60
AAACATCTCT GAAGCTACTG GGATTTCGTT TGTGGACTAC TGAAGCCGAA AGCAGATAGC 120
TTTGGTTTAT AATTTACAGA ACTGGGACTC ATTTGAGCTG CATGGATCTC TAGTTCTCCT 180
TTCCCTCTTC AGAACTAAGT CGTATGGTAA GGCAATAAAC AGATATGCAC ACACGTAGTC 240
TGACATGGAG GCCGCAGTGG CTGTCCACTG CGAGCCCATG TGTGTGAGTG CAGTGGCCAC 300
TCGGCTTTTC CGCACATTCT TCCCTGCTGC TGTTGCCGCT GTCACGTCAG CCGGTGATTT 360
GATAGGCTTG TCGGGTTGCC ATGGTGTTGA CTTCTTGCCT CCAAGGGGCT GCCCAATGAC 420
TGGAGGTCTG GGATTAAAGC GGGAAGAGGC AGCGGCCACA GCGATTTTCT GAGGCAGCTG 480
CATCAGCTAG AAGAAGAAAA GGGACGAGGA CTTTAGCCTG CTCTCCCTCT CAGGGCTCAC 540
AGTGAGGGAA AGAATAGAAA GGGTGGCCTG GTGAAACAGT GACCTTCGCA AACCAAAAGA 600
CACAAGGGAG GGTGGGAGAC CACTAGGGAA TAACTCTTGG CACACTGCAC GTGCCAAGAA 660
GAAAAATATT CCATAATTCG CTATTCACAA TCACAGCCGG ATAGGGTGGA AGAATTCAGA 720
GTGAGGTAAA AGGTGTTTTA AAAGGTTCTG TTGCCCATCC CTCTACATCC AAGCCTTCAT 780
TCCCGCAGTG CGGTCAGTTG ACAAAGAGAC GCTTTTCAGA GAACTTTAAA TCTCAGTCAG 840
GCACTCATTT CAAGAACAGA AAGGGCGGTT AGTTGGCCAT CAGGTGCAAG GAGTCAGGGG 900
CAGAGACTGG GAATCCAGGA GCACGCTCCG TGTGCAATCC CCAGACGGAA ACTGTAAACT 960
GCGGGCTGCA GAGGAAAGAG CTCGCTTCTG TTATAAATTA GGAGTTAGGT GAAGGTTACG 1020
CAAAGAAGAA AAGGGAAAGT AAAGCTGCTA AAAGAATAGA GTAAAACCCC TGGGAGTTCA 1080
ACTTGAAATC CCCCCCTCTC ACTCCCTAAC CCAAGGGGAG GAGGAGGAAG AGGAGGAGAG 1140
CACATTCTGG TGTGATGAGA ACTCTCTGGA ATGTCTGGAG GAGAGGTTTG AAGTACGAGG 1200
GTAAGAAGAC CCCAGTTGCC AAATAAATGG CAGGAGAGAG GTGGGGGAGG GGAGGAACAG 1260
TGGAGACTTG TCCAGATTCA CCGGAGGGGC TCAGCACCAG TGGGATTCCA GTAGAATGGA 1320
AACAGAGGTT TAGTTTAGGC TCCGAGCATA CTGAGGGAGG AAGTGACTTG CTGTGAGTAG 1380
GAACTATGGC GAAGGTGCAA GCAGCTGAGT GCGAGGATGA AAAGGCAGCC TAAGTCAACT 1440
GGAAGGACTC CAGGCAGAAG CCATGGTCCT ACACTGTATG CCGTGGGCAG AAGATGAAGG 1500
TGACAGTGGG TGGGTCAGAG TTCCAGGGAA GGGTGAGAAG CGCTCAAGCC ATATGTCCTA 1560
GCTCGGCGCC CCTCTCCCAG CGACTCGGGG ACTTTCCGGG AAGGACCAGC TGAGGGTCTC 1620
CAGAGTCGCA AGTCCCAAAC ATATGCCTCA CTAACTACTT TATGGCCACT TTCTTTCATT 1680
GATCCTCTTT AGCAAACAAA CACAAAGCCT TTGCAGCAAC ACTTGCCCTG CCCGCAGCTA 1740
GAATGTCCTA AGCTCTTAGC GACAGCAAAT CTGACATTTC CAAATAAATC GTTTTTTTCC 1800
TCATCCTAGG TTGGGGGATT TTCGTCTTTG TTTTCCTATG TAATCCGGGA TTCATATTTT 1860
AAAATGAGGA GACGACAACT CCAGCCTCAA CTTTGTAAAC CTAGTAGTAG TCACTTTTAT 1920
TTGCATATTA ATTTTTGCTA ATCAGAAGTT ACTCAGTTTG GAGGAAAACG CCGGCAAAGA 1980
AACCTACTGG TCTGCATCTA CCGGAAAATT ACACTAGTCT GGCAGGCACC ATTAAGCAAG 2040
ACCCCTTGAG TTGTCTCTGA AATCTACCTT TAAAAATAAG GAAAGTATTT ATTTTAAAGT 2100
AGCCCCTTTT CAAACGCCGT TTCTGCCCGA GGTTTTTCTA GACAAGTCAA AGGGTTGTTG 2160
AATTATTCAT TATTGTAATT ACTATCATCA TTGTCATTAC CCCCTTCCAT GTGGAAATAA 2220
TTTTATTATC GTAATTTGAT ATCTGAAGAA TTTCCTGTTA GTCGTTTGAT AATCATTTCT 2280
TCTACTGAAA AGAAAAGTTT TGTTTATAAA TGAGATAGAG AAAATGCTTT GATGTTTGCT 2340
ATAGATTTCC GTTTATCTAA TCGATCGGAA TGCCAATAAA ATCGATTAAA GGTTTAGTGT 2400
TTTACAAACA ACCATTTTGT GCTTTTTGAT TTTACGTTCA GAATGATTTT AATAAAGCTA 2460
ATGTTTTCCT TTAACAGTCT CTCTTTAAAA AAAAAAGCTT CATCGTTTTC CCTTTTATTG 2520
TAAGAAGTTC CCACTTGAGG TTCACCAAAT TAAAAAATAC ACACAAAAAA TAAGCAATGG 2580
TTTAAATTTC ATTCTCTTTC TGCCAGAGGT ATTTAAATAA AGACCTTTAA AATCTTGGTG 2640
AATGATACCA ATCATTCAGT GATTATGGGA TATTAAATTA AACTTAGATA AATCCGCACT 2700
GAAGGAGGCA GGACCCAATC CTGAATTTAT TTCCCATTTT CTCTAAAAGC ATCACTGCGC 2760
TCCTCTCCTT GCAATGACAA TGTGCCAAAT CTGGGCATTT TGAAAACATT TTCCATATGC 2820
TTTAGCGGGG GACTGATAGA AGAAGAGAAG GGGATGATCT TTTGCTCTGA GGTATTTCAT 2880
TTAACCTTTT CTCTTACACG TTAACTGATA ATTCTTTAAA ACAAAAGTTT GAAAATAATT 2940
TAATGCACTG TGCCTTTTCC ACATTGCTGT TTATCCCTAA AATGCAGTTT TGCTTATAAT 3000
CTAATGTGAA GCTATCATTT GTGTACCCTG ACGACATTTT GTTTAAAAAT AGTTAATCAA 3060
TTTGGTCTCT GCTGGTTGTC TTTGTAATTA AATGTGGACT TAATTATATA TTTGGGAACT 3120
TAAATCAGAT AGGCTGTTTG TGATAGAATT CAATGGAGCT TTTGTGCCTC ATATTTGAGG 3180
ACATTCCCTA CAATGGTGCT GGCTTTTCCT TAACCAGTAT ATCTGTACTA TTGTCTTAAA 3240
GTGAATGTTT AGATAAATGT AGTGTCATGT TTTAAAATGC TTTTATTTGG TAGCCAGCTC 3300
AGAATACCAT TTCTATAGAA GTTTATTGAC ATGATTTTAA AAGATCACAA TTTTGTCTTC 3360
TATTCCACGA TCAGTTATTT CTTTCTCTCC TGTTTTTTTC TTTGTTTTTG TTTTTGTTTT 3420
TGTTTTTTGT TTTGTTTGTT TGTTTTCCAT CTCTATCTTT TCACATCTGG ATTGTTCCGT 3480
TGGAGCTTCT CCCCAGACTA ATAGCTCCAT ATGTTAGAGG AGAATGGGCT TGTGATCCTG 3540
GGCTTGTGTG CTTTGTGGGT GGTAGTGGTG ATAAGAAGTC CTCCTTAATT GCAATAAGCG 3600
ATGTTGAAGA GCTTGTGAAG TTAGTCAACT GCTATTGTTT GGGAAGAGTC CCCGTCTGAT 3660
TTTGTTTATA AACACTGGGC TTGATGCCCA GAGGGAAAAG AGGTCACTGT ACTATCTGAG 3720
CTCTGACCTC CAGGAGGCCA GAGGGCTCTG ACTCCCTCCC CCCCCTTTTT TTTCTTCTCT 3780
CCCTTAATTC TTCTCCCTCC CGTGGCACCC TGTGTAGCTC CTCCTTCCTT TCCCATTCTT 3840
AACTTTAACT GTGTCTGAGT TTACATAATG AGCTTTCCCA CCCCAAAGGT CAGAGCCTCC 3900
AGAGAAAAGG TCTAAAGTAG ATTGCCTCTG AAATAAAAGC CTAAAGTTTC TCCAGAAAGA 3960
GAAAAATCTA TAAAGGTTTA GAGCAGAGAC CTTGGAGCAT GAGTGTTATT TTAAGATAAA 4020
TAAGTAAATA AATATGTAAG TAAATAAATA ATAGTATAAA GGAGATAAGA ACCAGTCTAG 4080
AGGAAATCAG AAAGGGATTC AAGTGTCCAC AAATACTACA CACATACAGA GAGGCTTAAC 4140
ATGCTCTCTC CCCTTTGAAT GCCACTGCGT TTACCTCTCA TATCAAAGAT GGTATGTTGC 4200
TTCTCCACGT TAACTCATAT TGTAACACAT ACGGGCAGAC GCTCGCGCTT GCGTGCACAC 4260
ACACACACAA ACACACACAC ACACACACCT TTGTTACTGC TCCAGGAAAC ACACTTTGTT 4320
CATAATAAGG TTTGGACAGA CACACACACC TTTTGAATTA TCTCACTGTA AATCTGTGCT 4380
TGAGACACCT TCCCAAGCAA GCCCTGTACT TTTCCGTTCA TTTTCAATCA ATGTCCCATT 4440
TCCTCCTGAC CTATGCAAAT CCTCATATCC CTACACACAC ACACACACAC ACACACGGGA 4500
GAGAGAGAGA GAGAGAGAGA GAGAGAGAGA GAGAGAGAGA GAGAGAGAGA GAGAGCAGTC 4560
TTTGGTATCA AGTTTTAAGT GGATTGGAAT GAGCTGCTGA GTTAAACAAA AATGTTAGTT 4620
AACAGACTGC CTTTGTTAAA TGGCCCCTGG GTGGAGAAGA TTCAACAAAA AAGAGGAAGG 4680
AGGGGGGCGG TTAAGGATCT GAAAGTGTCT GCTTTGCTCT AAAGAGATCC TAATGCTGAA 4740
ATCTTGTAAT ACCTTGTTTC AAACAGAGCT TATCTATAGA GCCCAGAAAC CCGGTCAAAA 4800
GACTGGGAAC CTTACCCTTG GGCTGGAGTT GTTCTTGAAC TGGAGGATGC CGGGGAGAGG 4860
GAGGTGGGGC ATTATTAGCG ACTTGGTGAG GGGAGGGCAG ACTGGAAGAA AGGACAGCTG 4920
GCGACTCTTT ATCCGGTTTG GAAAGCCCAG AGTGTCCTCA GCGTGGATTT GTGAAATAAA 4980
CTGCTCCAAG GAAAAAAGTC TAGAAGTAGA AGTTACCTTT TGTTTCAATG TTAATTGTCC 5040
CTCATCTTCA ACACTCAACA CCTAAACACT TGATGTAGCC TTGGGGTTCG CCAACAGTTA 5100
AAGACTCTGG CAAGGTTCTA GTGGTAGGAG AGAATTGAGC TCCGCTAGGG TAACTAGCGA 5160
AAGTTCTCCG TGCATGAGGA AAAACTAAAA AATAAAATAA AATAAAAAGT TCTCCTTTCA 5220
CTTTGAAAAA TAAAGTAGGC AGCGCTCCTT 5250