EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

EnhancerAtlas 2.0

Tag

Content

EnhancerAtlas ID

MM121-15446

Organism

Mus musculus

Tissue/cell

NPC

Coordinate

chr2:71532050-71533580

Target genes

Number: 8
Name	Ensembl ID

Slc25a12	ENSMUSG00000027010
Metap1d	ENSMUSG00000041921
Dlx1	ENSMUSG00000041911
Dlx1as	ENSMUSG00000084946
Dlx2	ENSMUSG00000023391
Itga6	ENSMUSG00000027111
Gm13663	ENSMUSG00000086641
Pdk1	ENSMUSG00000006494

TF binding sites/motifs

Number: 4

JASPAR ID

Coordinate

Motif Sequence

Strand

-Log10(p-value)

LEF1	MA0768.1	chr2:71532515-71532530	AGTCCTTTGATCTTG	-	6.29
TCF7L2	MA0523.1	chr2:71532516-71532530	GTCCTTTGATCTTG	-	6.15
Tcf12	MA0521.1	chr2:71533341-71533352	CAGCAGCTGTT	-	6.32
Tcf7	MA0769.1	chr2:71532518-71532530	CCTTTGATCTTG	-	6.22

Enhancer Sequence

CAAGGACACT GGTTGGCATG CAGAGAACCC CAGATGATTG CTGGGAGTAT GCTGTCACAA 60
ACCAAGTAGC TACTCTAATA AGGAGAGAGT CTCCCCCAGC ACTGTCAGCA GCAGCCTGGT 120
CCTGATGATA CCCTGACTTC ACACGGTGAA CTCCAGAGCT GTGTGTGTGT GTGTTTGTAT 180
GTGTATATGT GTCTGTCTCT GTGTGCGTAT GTGTCTGTCT GTGTGTGTGT ATGTGTATGT 240
TTGTGTGTGT ATGTGTTTGT GTGTGTGTGT TTGTATGTGT ATATGTGTCT GTCTGTGTGT 300
GTGTATGTGT ATGTTTGTGT GTGTATGTGT TTGTATGTGT GTGTGTTTGT ATGTGTATAT 360
GTGTCCGTCT GTGTGTGTGT ATGTGTATGT TTGTGTGTGT ATGTGTTTGT GTGTGTGTGT 420
GTGCCTTAGC ACATGAGTGA AGGTTAGAGC ACAACTTTGG GTATCAGTCC TTTGATCTTG 480
AATGACACAG TGTCTCTGGT GTTTGGGCTG CTTATGCCAA GCTAAGTGGC CCTTGAATTT 540
CTGGACATTC TCTGGTCTCT GCCTCCCATC TCACCACAGG AGCATTGGCA TGCAACATGC 600
AACTGTGCCT GGCTTTGTAT GTGTTCTTGG GATTTGAACC CAGATCCTCA CTCTTGCTCA 660
GCAAGACTAA AAGACCCACA GAGCCATCTG TCTGTCCAGC CCTGGCATGT TCTTTGTAGA 720
TGGCACTGCA CCAGAGGAAA AGATGGCAGC AGGAAACATG CACAACTTAA TTGGTGTTTT 780
GCATGCTGGC CAAACTCTTA AATGTCAACA GTTGAGACAC TTAGCAGTCT GGGTGACTTC 840
CTGGGCACAC TAGGCCTCAG GCTTCCATCT GTAGAGCAGG CTTTCATCCC TGTGGGGTCT 900
TTACAACATA TGGGAAGAGT AGAATAGACT TCACCAGACA CTCTTGCTTG TATTGACTCT 960
TATCAGAAGG GCCTGTGTAC TGTGGAGTGT CACAGCCCAA CAGTCCTTGC AAGTTGGAAA 1020
CACAAATATC TCTTTATCCC ACAGCCCTTT CCACTCTCCT CCATGCCAGC GTCTAAACAA 1080
AGGTCAGCTT GTATGCTTTG GCTGCGTTTC CAGATTTCTC CTCGGAACCA TACAATGAAA 1140
AGATCTCTTC TTAGCCTAAA AGTCTTATTT ATTTTCTCCA CTCAGGACAA GACCCATCAT 1200
TGGCTATGAC CTGGAGGGAT TGTGTGACAC TGGCACGAGG TTGGGCTATT GGTAAGATGG 1260
CCACTCAGCT CGTTTCTCAG GCTCGAAAGG CCAGCAGCTG TTCTTGTAAC TGTGAATGGC 1320
ACTTATGCTC TTAAACGCCA CTTCAAGACA AATGTAAAGA TGAGGGTGCA TGCTTGTAAT 1380
TCCACACCTT CGGAGACTGA GGCAGGAGGA TTATGAGCTC AAGACAAGCC TGGGTGACAC 1440
AGTGAGGTTT GTAATAGATC AGATCTTGTA TTAAAAGTTC AAACAAGGGC TAGAGATATG 1500
GTTCGATAAT TAAAAGCACT CATATTCGAC 1530