EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM121-12739 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
NPC 
Coordinate
chr17:87771140-87773000 
Target genes
Number: 7             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 12             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
EWSR1-FLI1MA0149.1chr17:87772689-87772707GGAAGTGAGGAAGCAGGG+6.26
RFX1MA0509.2chr17:87771615-87771631GGTTTCCATGGTAACC+6.82
RFX1MA0509.2chr17:87771615-87771631GGTTTCCATGGTAACC-6.8
RFX2MA0600.2chr17:87771615-87771631GGTTTCCATGGTAACC+7.25
RFX2MA0600.2chr17:87771615-87771631GGTTTCCATGGTAACC-7.28
RFX3MA0798.1chr17:87771615-87771631GGTTTCCATGGTAACC+7.38
RFX3MA0798.1chr17:87771615-87771631GGTTTCCATGGTAACC-7.51
RFX4MA0799.1chr17:87771615-87771631GGTTTCCATGGTAACC-6.82
RFX4MA0799.1chr17:87771615-87771631GGTTTCCATGGTAACC+7.14
RFX5MA0510.2chr17:87771615-87771631GGTTTCCATGGTAACC-7.24
RFX5MA0510.2chr17:87771615-87771631GGTTTCCATGGTAACC+7.27
RREB1MA0073.1chr17:87772618-87772638GGTGAGGTGGGGGTTGGGGG-6.49
Number of super-enhancer constituents: 3             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_02738chr17:87749106-87776827HFSCs
mSE_03133chr17:87751040-87784551TACs
mSE_10959chr17:87771248-87772200Olfactory_bulb
Enhancer Sequence
AACCCACTGG TTCCTGAAAA CGGAACCAAG CGAAGATTCC CTGCTCACTT CCCATTCCTG 60
CTGCCGGATC TCTTCTTAGG TTGTATGAAT TCTGAGCCCC AGCTAAGAAA AAAAAAAAAA 120
AATCATAGGC CACAATGTCA CACAGCCTTG TCTGTCCCTT GCCATGGCTC CCCCTGTCTT 180
GGGGTCAGCC CAGCTAGTGT TTGGTGTTTT ACAAGGCACA CCTTCTCCTT CCTCCTGCAT 240
TTCAGCATTG GCTTTCCAGG TTAATGCCTC ACTAGAGGTC ACATCCAGAA GTCTGGATTA 300
TTGAGGAGGA CTGGGCTGCC GCCATTCCTC GTGGATCTGA GCCCGAGACC TCAACCCCCA 360
AACCCAACAG AATCCAGTAA CAAGTACAAT TTTGAAGTAA CAGCGTACCA TTTTTCATTT 420
ATGCTTATTA TTGTTTGTAG CTATTTTCTT GAAATTGAAG CAGTTTCCAA CCATGGGTTT 480
CCATGGTAAC CGAATAGCCG TCCAGAGTAG CTCCCTGCAG ATGTTACTGA AAATGGTCCT 540
TTTTCTCTTC CTGGGGTGCC TTGCTGATTT AATGAAATTG GAGCAAGTTG GAGCCAGGGC 600
TGCCCACTCT CAGTTACCAG CAACCAGAGG GGCAGCCGGC TTCTGAGTGG GCAGCCCATC 660
CCTTTTCCAC AGGCTTTGTT CCTGCCAGCA TCCCACACGT ATGCATAAAG AATAGCAAAT 720
CGCAAGCCTG GAGAAGATTT AGTAAGCATA CTTTCCTAAA GACGTGTGAA TGCTTTAGCA 780
TGTTGCTCTC AAGTGTTCCC CTCATCTAAA TGTCTTCCTT GTGCTGCTGG CCTGTGACTC 840
AGGACATCTG GGCTCTCATC CTGGCTCTCG TTTTGGTTGA CTTGGGTGAC ATAGGACAAG 900
AGTTAACTCC CATTGTTCCC AATGTCCCCT TTTATAAGTG GATAATAATT GTCCCTAGAT 960
TATAGTGTTT TTATATCAAA TGAGATAATG CCCGTGGAAG TCTACAGTGA AATAGGAAAG 1020
GAGACCAGCT AGCATACAGA CCACTGTTCT CCGGGCCCCT TCATTGACGG GCATTGCAAT 1080
CAATCATAGC ACCCCCAGAG AAATGGACTT TGGTTACAAA GGCCTGTATA GCACCCCCAC 1140
CCAGCCATCC CAGGCCTACG GGAGTGGTAC TAGATTCTAG GGGTGACAGA GGAGGCCAGC 1200
CTTGACCACC CACAAGTTAT GAGAGAGCTT GGGCATTGCG TCATTGGATG AGCCAGGGGT 1260
TTTTTTTATT CCCTCGTATC AAGGGGAATA ATCATTTGGT TCCTTATGAC TTCAAAGTGT 1320
GTTTTCGGGT TCAGGTGAAC TGCAAGCGGT GAGAAAGAGA CCACTTAGGG TACCTTTGTC 1380
ACCATAGTGA CAAAACATCC TGCAGCAGCA AGAAGCCTAA GCCCAAGCCC CACCTTCTGC 1440
CAGGTAGACT TCTGTGAGCC ACATCGCATC AGTAAGGGGG TGAGGTGGGG GTTGGGGGGG 1500
CTTTGGCACA AACTGCCTTC TAGTTCCAGG GAAAGTTTAT GGTCAGTGGG GAAGTGAGGA 1560
AGCAGGGAGG AAGCAGGGAG GAAGCAGGGA GGAAGAGGAA GGACGAACCA GCAAGGCCAG 1620
AATTCCCTCT GGGACTGCTT CACTGGTTAG CTACCCAGGG AGCGGTGGCC TGGAGTTGAG 1680
TGTGCCTTTC AAGCCCAGCT GACCTGCACT TAGGTCCACT TTGCCTTGTT CACTGTTTAA 1740
CCGAGGCCGA GGAACCTTTC AGAGGTTCAG AATTCCTGTC TGTGACGTGG GGATGGCTAT 1800
GCCAAGCATG AAAGGCTGCT GTTAGAGTGC AGCTGAGTAA GCGTGTAGCG TTATGTATGG 1860