EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM121-09454 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
NPC 
Coordinate
chr15:27725770-27728720 
Target genes
Number: 3             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 9             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
EsrraMA0592.2chr15:27726251-27726262CTCAAGGTCAT+6.02
EsrrgMA0643.1chr15:27726252-27726262TCAAGGTCAT+6.02
RARA(var.2)MA0730.1chr15:27727854-27727871AGGTCACTTAAAAGTCA+6.57
RESTMA0138.2chr15:27728133-27728154ACTGCGGTCCTTGGTGCTGGA-6.6
Rarb(var.2)MA0858.1chr15:27727854-27727871AGGTCACTTAAAAGTCA+6.69
ZNF740MA0753.2chr15:27726342-27726355CCCCCCCCCCCCC+6.03
ZNF740MA0753.2chr15:27726343-27726356CCCCCCCCCCCCC+6.03
ZNF740MA0753.2chr15:27726344-27726357CCCCCCCCCCCCC+6.03
ZNF740MA0753.2chr15:27726345-27726358CCCCCCCCCCCCC+6.03
Number of super-enhancer constituents: 5             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_04050chr15:27725612-27728748Cortex
mSE_04987chr15:27725671-27727204E14.5_Heart
mSE_05507chr15:27725588-27728659E14.5_Limb
mSE_10722chr15:27725603-27729531Olfactory_bulb
mSE_12289chr15:27725943-27727225Spleen
Enhancer Sequence
CTCTCAGTGC ACGCTGCAAA ATCAGCCTGG ATCTCTTCCT CCAAACTGTG CAGAGTTATG 60
CATCTTTCTA AGTTATGAAC TTACGAATCA AACCACTTTG TCAGACAGCT CCTCTGTGAC 120
CTCAACAGCT TCCTGTCTCC TTTGGAGTCT CTTAGCTTCC TGCAGGAGTC ACATTCTTAA 180
GACTAACATT TCACAACGGA TTTTGCCAAT ACAATGTAAA GGCCTCTCGC CTGTACACCG 240
TCCATTTCTA CTGATGGATT CTGGAGGGAA CATAAGAGGT ACAGAAGGCT GAGTTCCGAG 300
CGCGGACTTT CGCCCTCTGC TCCTCTTGTG TTCTGTGTGG GCGTCTACAG AGGTCTTTTC 360
TGGGCATAGC CACTACTCTT TGGGCTGACC GGTCATGCCG TGTGCTGAGC AGCCTCAGAG 420
TGGGCTGATC TACTGATCCT GGGACACTCT GGGCAGTGTG GTCATTCCAC ACTGTTGACT 480
GCTCAAGGTC ATGATTTTCC CAAAACTTTC AAGCCAAGCA TGGGACAAGG ACAGAGGTGT 540
TTATTATTTG AAGGGCCTTT CAAACAGGCT CACCCCCCCC CCCCCCCCGC CTGCACTGTG 600
AGCCAGCTCC GGAACTCTTT ATTGTGAGTG GTCTGGAAAT AGCCCTGTGC TCGCCTCCTC 660
CTCTCCTCTT CCTGTGCCTC CCCATGAATG TAGAACTCTG AATTTACTAG AAACAAATAT 720
TACGGCTTTG TTCTCTGACG TAGGTTCCTC TTCTTATAGT TCAAAAAGAA CTGGTTTCAG 780
CTGCATTACC CACTCACTGT GTACCTTAGT TTAGAGTGAG CGTCTATAGC CAAAGCCATC 840
TGAATTCTCT GTGTCATGGA AGTTAGTCCA GGACCTTGGC CAAAGCATCA CCTCACGTCT 900
CCCTGAACAC AGGGATACAT AGTCAGTCTA GTCTGCCAGG CCCACCTCCA GAGGCCTGAG 960
TATAGTTTAT TCAGGGCCGT GGCCAGCTGA GCTGCACCAG GAATCAGGGG CGAGCCTGAG 1020
GAAACAGAAC AGGTTCACTC CATGCGGCTG CTCTCACATG ATGCAACCCC AAGAGACCAA 1080
GCACTTCGAG TGGAGAGCTC CCATGGCACA CCTTCTGCTT CTGACAGCTC GCACTCTCCA 1140
GGATGTACAC TCTGAAGGAG GAGGCCCTCA TCGGACTGGT TATCTGCACT CTAGTGTCTC 1200
TATATTGTCA GTGTTAAAGT CTATCTTCCA GAGATGGGAG GTGGAAGAAG GTCCGGAGCC 1260
CCAGTCCCTC CCACAGCCCT GCTGGCCTGT TTGCCATCCC CTGCTCAACC ACAGTCCCTC 1320
TTTGTTTTCC CTCACCCAGC ACCTATGGCT TATTGGTTTG CTTGCTTGTT TGTTTTTAAG 1380
ACGGGGTATT GTTAGGTAAG CCAGGCTGGC CTCGAACTCA CAATCCTATG TCTGCCTCCT 1440
GGGTGCTGGG ATTGCAGGTG TGCATCACGG CCCAGCAGGC CATTTAAAAC AGGCGTGGGA 1500
AGATGGGTCT CTTGCTCACT GTTTATGCCT TGGCAGCAGC TATCATTTTC TGACGACCTA 1560
ACATGGGTGC TGCCAATGCC TGCTCTTGGA TTGTTCCTGT TCTGAGAAAT GCTTAATGTA 1620
AAGCTGGAAC GGGGGAAAGG CTCCCAACAC CAGGCCCTCT GCAGAATAAT AGCGGCTTGT 1680
GTGGCTCCGT AATTATATGC TCCGCAGAAA GCACTTCTTA ATCACGGGGT CTGGGATTCA 1740
TTACTCGGCC TCGGATGTGC AGTGCCCAGG AGAGGGGCGA TGTTTTTAAT TCTTGGTGCG 1800
ACTCCACGTT CTTGAGTTTT TCTTCCCACA GGGATTTACA TTAGCAGCTG TTCAAACAGA 1860
ATAAAACTGT GCTTTCCAAT TGAATTAAAA AGCCGCACAC AGATCCTCCA TTGTATGTGT 1920
TTTTAAGAAC ACGTGGGCAG GTATGGGTTT GAGATGCCTT CGTGAACCTG GGGTGTTCTC 1980
TGGTGGCAGG GTCCCTGTGG TATGACGCAA ATGCCCAAAC ACGCTGGAAT CTATTGTTAA 2040
TGTCACTAAA GACTCTGATA CCCTACACTT TTTGGAACTG TTTTAGGTCA CTTAAAAGTC 2100
ACGAGTTATT TCCGTCTCAT CTGAGACAGG CAGCTTAGGA GTCGGCTGCT GGAGTGAACG 2160
GAGGGAAATC ATGAGATGCT TTGGGGAGGA TGCTGAGGCC CAGGCTTGTG GAAGGCCACG 2220
GGTACCCAGT CTCGACTGAG GCCTGCTGTC AGGATGAGGA GGTCTGGAGG TGAGGGCGAC 2280
TGTGAGTCAC ACTTAGTTCA GAACAGGCTC CAAAACTGCA TTGCTCTTGG TGTCCACGGT 2340
GCAGCCTGGA CTGGCCCCAT GCTACTGCGG TCCTTGGTGC TGGAGTCTAC ATCTTGAACA 2400
TTCTATCCAA GGTGAATCAG AGGGCGAGAC CGGAGCTCTG TGACTGGGAC GAGCCTTCTT 2460
CTGCTGTCTA TACTGTGACT GGAAGGGCTG GCGTTGTCTT CAGGGCTGGG AATGTGGTTT 2520
GGATGGGGCA CGGTAATCAC TACTACTGCT TGGTCTCCAA GGGAAAAACA CTTGGACATA 2580
CTCTATGTTT TGGGGTCAGC TGGGAGTATG GGTGGCCTGG GTATGGCTTT TTGAGTATAA 2640
ACATACCTGG TGACATGATG AAGTTCCCAT CCCCATCTGT AGACCTCAGG GAAGGAGTGG 2700
GGAGACCTGG CCTCATCCTA AACCCACAGG GTAAAGAAGA GCACAGGAGC TATCAGGCGC 2760
AGCCGTGACC TCACCTGTGC AGACGATAGG GCTGAGCTGA GGACAGCATC CATGGGGGGC 2820
AGATAAGCCC TCAGACACTC TGTAATTGGC ACCCACTGTA AACACATGCT GACTTCATCC 2880
TGACATTGTG GTTATACTCG TGGTCATGAT CAGAATGAGC TGTGGCGCTC AGTGACTCCA 2940
GCACAGGCCC 2950