EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM121-07026 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
NPC 
Coordinate
chr12:120402140-120404610 
Target genes
Number: 2             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 14             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
DMRT3MA0610.1chr12:120403510-120403521TTTGATACATT-6.02
FOXD2MA0847.2chr12:120402378-120402391ATAAAGTAAACAT+6.15
FOXD2MA0847.2chr12:120403711-120403724GTGTTTACTTAAC-6.48
LHX2MA0700.1chr12:120402541-120402551ACTAATTAAC+6.02
MYCMA0147.3chr12:120403340-120403352GGGCACGTGGCT-6.18
NFAT5MA0606.1chr12:120402370-120402380AATGGAAAAT-6.02
NFATC1MA0624.1chr12:120402370-120402380AATGGAAAAT-6.02
NFATC3MA0625.1chr12:120402370-120402380AATGGAAAAT-6.02
Nr5a2MA0505.1chr12:120404387-120404402GATGGCCTTGAACTC-7.49
Nr5a2MA0505.1chr12:120404416-120404431GCTGACCTTGAACTT-9.03
RARAMA0729.1chr12:120404421-120404439CCTTGAACTTCTGATCTC-6.54
Rhox11MA0629.1chr12:120403226-120403243ATCTTTTACAGCTTCTT-6.03
Sox3MA0514.1chr12:120402660-120402670CCTTTGTTTT+6.02
mix-aMA0621.1chr12:120402541-120402552ACTAATTAACT-6.14
Enhancer Sequence
CTTCTTTGGA GAATATTCAC AATTAAAATA TTTCATTTTT TTGTAGCTTG CTATGTCAAA 60
ATTTCTTACC CATATGTAAG TTTGTTTAGA ACAGTGACTG AGAGAGCTAT AGTGGTGTGT 120
ACAGTTCAGT ACTATGTGGA AAACATGATT TAAAAAGGAT ATTGAGCAGC CCCAAGCATT 180
CAGCATGTGT TTTTCCTTTT ATGCTTTCTC CTCCTTTATT GCTCAGCAGT AATGGAAAAT 240
AAAGTAAACA TCTGCAGAAG CAAACTCAGT ACTACTCTAA TAGGGAAATA AATATTTTCT 300
CTAAACCCTG GTGTAAGATT TCATTATTAT TAGACATCAT GACTCTGAGA AGTAGGAGTG 360
TTGCATCTTG GACAATACCC AAATCTCTCG TCTCACTTTT TACTAATTAA CTTCACTAAT 420
CTAGTCTGTT TGCCTCCACA AATTCATTAT GTGTTCTTCC TCGAACAATA ATCACTTGCT 480
GAAGAAAGAA AAGCCATGTT AGGAGAGGGA AAATGCTAGA CCTTTGTTTT AGAACCAGAT 540
CTCTGGCAAA CTCTCACTGG AAAAATTTGT ATAAGCTCTG TGCTTGCCTG AGGTCTACTC 600
TAGTCTCTGA GGAATATGGT TGCACAATAG TGGGTATTCC ACAGAGCTCA CAAGCTGCCC 660
CAGATTCATA AAACACTTCC TGGACTGAAG CATGTGTTTC TCCACCCATT TTGCACGCTT 720
CAGGGACCTG GTCTGAATGC TGCAGTTGCC TAGGAAAGAG CATCTAGAGA GAGGATGTGC 780
CAAGGCCATG AGCATAGTAG CATCCAGTCA TAGCTGATTC TGGCTCCAAA GCTCAATGCT 840
AACCCAGCAT GCCTCTTAAA TGAGGCAAGG TTTCAATAAT GGGGGCAAGA GATCTTCTAC 900
AACTAGGTGG ACTTAATAGA GACCATTGTT TGTGATTGGT GACAAAAGAC TTTGTGGAGT 960
TAAAAAACAC GCCCATTCCT ATTCATTGAA ATGGGAACAT CAGATGCCAG TATGGTACAA 1020
TGCTTCCTTG TTAAAGATAT TATGAGTACA GAATACAAAG TGTGTGTCCA AAGGTGGTGC 1080
TATTTGATCT TTTACAGCTT CTTTCCTTCA GGTTAGTGAC CCTCATAGCT TATGTCCTGA 1140
CAGATTGTGA TATCCCTTGG CTGACTTAGT CTACTCCATC AGCTAAGCCA ATCCTTAGAG 1200
GGGCACGTGG CTTGATCCCT ATCCTGGCTT TTTGCCTGAT GGGAGCTTAG CCAGAGAGAC 1260
TGAAAGAAGA CCCTGTAAGA GTGGTTGAGT GGACAAATAA TTAAGGTGCC TAACAAATGC 1320
TCTTTTCCTT TCCTTGCATA ATAGTTGTTA AGGGGAGGGA AGTCTTGTAG TTTGATACAT 1380
TTCAGAAATA TTATGAATGT GTTAGCCAGA GGACCCGTTG AGGGTTCAAG TCTGTATTCA 1440
TTTTTCCCCA ATGTTGTTAT GATGATCCAA CATTTGCCTC TGGTCATGCT TTTCTTAGCT 1500
GAGGTCAGGC TAGGTCTTTT TCTAAGGAGT TTTAAGGGAA CACTGTTTGC AACAACACTT 1560
AAGTCAGAGT AGTGTTTACT TAACTTAATT AATGATATGT AGGGGCCCTC TTTATTAGAA 1620
AGGCACTTGG CTTTCTGGAG AGATTGCTGC AGCCTGAGCT GGCAGCACAT GGGACTCTTT 1680
TCTGAGCCAA ATTCACTGTG GGCTAAGGGA ATGAAATATG GGAAACTAAG ATGTGCAGGA 1740
CATTTCTACT TTGCTATTTC TCCGGGGCTG GGTTTTCTAT TTGTTGAAAT AGTAGAATCA 1800
AAATGAACGT TTCCAAAGAT CTGACTGTAA GTATAGCTTG TATTTCACAG GTGGTTTTAC 1860
AGCTTAGACC TGTGCAAAGT GTTTTGAGTT CTTTTGGGAG TGCTCCAGTA AATTTTTGTT 1920
TAAAAGTAGT TTTTGAGCAT AGCTCTCACA TCTTTCCCAT TATACATCCT CTTTGATTTG 1980
AGGTACTAAA CATACCTTTT ATTCAATACA CTTTTTATCC TCTATTTTGT ACATGAGATA 2040
TAGGCCCACA GAAATTTTGC AGAAGTGCTT ACATTTCTTA CTTTACTATA TTTTAGACCA 2100
AGGTTTTTAG CTTAAAAGCA ACACATTCTT TCCACTGTGT CAAATTCAGA ATTATCCACC 2160
TCAAAGTTGT TGTTTTTTTC TTTTCACTTT TCTCTTTTTC TTTTTCTTTT TTTTCCCTTT 2220
TAATAGGAAG AATTTTACAT AGCTCAGGAT GGCCTTGAAC TCCCCATGTA TCTGAGGCTG 2280
ACCTTGAACT TCTGATCTCT GGGTACCAAC TCCCAAGTTC TCATATGTCA CCTGATGCCT 2340
AGTTTCATGT GGTGCTGGGA ATTGCACACA GGCTTTACCT ATGCCAGGCA AGTGCTCTAC 2400
CAACAGAGCT ACACCTCAGA CTCATAAGAT GTGCAGGACA TTTCTACTCT GCTATTTCTC 2460
CAGGGCTGGG 2470