EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM121-06621 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
NPC 
Coordinate
chr12:88155340-88159790 
Target genes
Number: 5             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 20             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
EWSR1-FLI1MA0149.1chr12:88159117-88159135GAAAGAAAGGAGGGAAAG+6.33
Foxd3MA0041.1chr12:88157006-88157018AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr12:88157010-88157022AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr12:88157014-88157026AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr12:88157018-88157030AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr12:88157022-88157034AAACAAACAAAC-6.32
MEF2CMA0497.1chr12:88159328-88159343GAGCTAAAAATAACA+6.4
Nr2f6MA0677.1chr12:88159579-88159593TAACCTTTGACCTA-6.51
Nr5a2MA0505.1chr12:88159712-88159727GAGTTCAAGGCCAGC+8.25
PKNOX2MA0783.1chr12:88158084-88158096TGGCAGCTGTCA-6.02
PLAG1MA0163.1chr12:88159384-88159398CCCCCCAGGGCCCC-7.03
RXRBMA0855.1chr12:88159579-88159593TAACCTTTGACCTA-6.04
RXRGMA0856.1chr12:88159579-88159593TAACCTTTGACCTA-6.39
RxraMA0512.2chr12:88159579-88159593TAACCTTTGACCTA-6.24
SOX10MA0442.2chr12:88157843-88157854AAAACAAAGAC+6.14
TGIF1MA0796.1chr12:88158084-88158096TGGCAGCTGTCA-6.04
TGIF1MA0796.1chr12:88158084-88158096TGGCAGCTGTCA+6.18
TGIF2MA0797.1chr12:88158084-88158096TGGCAGCTGTCA+6.07
TGIF2MA0797.1chr12:88158084-88158096TGGCAGCTGTCA-6.44
ZNF263MA0528.1chr12:88159110-88159131GAAGAAGGAAAGAAAGGAGGG+6.75
Number of super-enhancer constituents: 11             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_00507chr12:88151708-88178129pro-B_Cells
mSE_01277chr12:88127683-88178050Th_Cells
mSE_03860chr12:88156238-88159616Cerebellum
mSE_04026chr12:88156887-88158603Cortex
mSE_04392chr12:88155275-88159353E14.5_Brain
mSE_04811chr12:88156930-88160639E14.5_Heart
mSE_05545chr12:88157021-88158215E14.5_Limb
mSE_06635chr12:88156946-88159646Heart
mSE_08022chr12:88156119-88159455Kidney
mSE_10068chr12:88155514-88159197Embryonic_stem_cells
mSE_10703chr12:88155356-88160063Olfactory_bulb
Enhancer Sequence
AGACTCTTTT TTTTTTTTTT TTTTTTTTTT TGGTTTTTCA AGACACAGTT TCTCTGTGTA 60
GCCCTAGCTG TACTGGAACT CACTTTGTAG ACCAGGCTGG CCTGGAACTC AGAATCTGCC 120
TGCCTCTGCC TCCCAAGTGC TGGGACTAAA GGCGTGCATC ACCACGCCCA GCTTCATTAG 180
AATCTTAAGC AATCCCTGCT CCACACACCT CTTGGTTTTC CCCAGTATAA AAATCCCAAG 240
GTGCTAAAAG TCCTTCAGTC CATCCATCCA TGTTTTGCCT TGCCGCACAC ACATCTCTGG 300
AAGACCCCTC TGTTTCCTTG AGGAAGTTTA CCTCCTGCCG ATGCTGTTGC CTTAGTAGGG 360
AAATCCTACC TAGCTAGGGC AGTTTGGCAA TTCTGCCAGC TGATGTCTCA ACTCCCTCAG 420
CCTGATGTCC CCAAAGCAGC CGAGCTCTCC CTGTTGCTGT AGCGCCAGCC ACCCTCCATT 480
TTGTATTCGA GGCACGTTCA CTGGTTTGAT GAAATGGTAG CCGTTTTCTA GAAGCCTCAC 540
TCCTGCCTGC ATTATTCATG GGTTCCTCTC TGCTACCAAC TGGCGTAGGC TGATCTCACC 600
ACCCCATTCA GAGAGAGAAA AGGTAGAGGC CCTGGTGAAT GATACCCAGT CCCTCCTCCA 660
GCCTTTTCTT GCCTGCCCTT TAAATGTAGA GGATTAAGAA GAGAGACCCT ACAGGCCTTA 720
GGCTCCCCGT AGGCCTGTGA TCATCTGTTG CTTCTTGTCC TGTCCCCTTG CCTACGCCAC 780
CAGGCTGGCT CACTGGATAG GGGCTCTAGA GAGCTAAGCA ATGAACTGGA AAAGTTCATT 840
TCCCCAAGCA AAGTCAATAT TCATCAACCC CAGCGGGCCC TCTATCCCTG GGATCTGCCT 900
AGCTCTTCTT TGAACACAGC AGGACCACTA GAGGTGGGGA TACCAGAAGG CCCTCCCTTC 960
TGGGTTACAT CTCTACTCCA TTGGCCTTGT CTTTTGTCCT GCCCCAGGGC TGTGACTGGC 1020
CACCTTGAGC GGCTGGCAAT GCTGAGTCCT GTTCTCCTCT GTGCTTTGGT CTTCTGCTTA 1080
CAGTCCAACA GCCTGGCCCA TTCCCTTGGC AGGAAATGGA TGTTAGACAA GAACTTTCAT 1140
AAGGATAGAG GCCAATATTG TCCTCCTTTT GGGCTCCCAC TGGGATGGGT GGCCTGCTGT 1200
CTTGCCTGTT TTTTCTCAGC CCACCCCCCA TTGCTTCCAC CTGCAGCAGC TTAGTCCTGA 1260
ACACCCTGTC ATACATCATG TCATGACAAT GTCATGTTAT AGCCTCTTCC TTGGAGACAG 1320
GGAGCCACAA GATTGCCTCC AAAGTGCCCT CCCCAGCAGC CTCCCTTAGC TTTTTCAGTG 1380
CACACCAAGT CCGAGGGTTC CAGACAGAGC CTAACTAAGC TGGAGGAGGC AGTCACGCCT 1440
CATGCTTATC CAGTCATCCA ATCATGGAAT TTACTCTGTA ATAGCTTCTT GGGTTAGAGG 1500
CTCTGCATTT CCCTTCTGAG CAAAAAGACA AACTCAGAGA TGTCAAGAGA CTGGTCAGGT 1560
ATGCTGGCAA ACACCTGTCA TCCTAGCACC TGATAGTGGA GACAAGAAGA TACTCAGCAA 1620
TACAGCCAGT TCCAGACCAG TCTGGGCTAC ATGAGACTCT ATCTCAAAAC AAACAAACAA 1680
ACAAACAAAC AAACAAAAAA CCTGAAGAAA GAAAGAGGTT TATTTTATGA GAGTAAGGTC 1740
ACAGCAGCAG CAAAAGGCAG GGTTCGGCTT CTCATCTGCA AAGTGCCCCT TAGAGATGAC 1800
TACTGTCAGA GAACACCCCC AACCCAGTTT GCAATCCTTC TTAGAGCCAG AGCTGTGGGG 1860
GGTAGGGATG CCACGCCTAG CTGGCTGGGG ATGCTGCATC TCTGTCTGCC ACTGAAGGAC 1920
CTAACTGCTA ATCAGCAGCA CTGGTATCCA GGCAACCAGC CTCCCTGGCT TCAGATAAGC 1980
AGAAACAGCT GGAGCTGCTG AGGCTGGGAG CCGCAGGGGA GGAAAGGAGC CAGCCTATCC 2040
TCGCAGGTTA TTTTGAGCCT GTTACACGCA CTATCCAGAC ATCAGCTTGA GCTAGGGCCG 2100
TTCCCCTGGT GTGTCCTTGC CACAGCCTTT GGGGAAGGGT TTCTAGGGCT CAGCCCAGCA 2160
GGGAGCTTGG CACACTCGAG GATGGGGTGG GCTGAAGAAC TCCTGGTTTT TCCCTTTCTT 2220
GAGCAAGAGA GGGAGGAAAA TTGGTACTAT ATCTAGAGGT AAAAGCTTAA GTCCATCTGG 2280
TAAACCACAG TACTTGAACT CAGCCTTTTG GGGCCTCCTG ACCTTAAGGG AAGTCAGGCC 2340
AGGCTTGAGT GCATTTTCAT TTATCCTGTA CAACCTCTTA GGAGCACTCC AGGAGGGCAG 2400
TGGCCATTGA GCAAAGGGCT AGGTCAGACA AGCTAGGTCT GGATCTGTCA GGCTCTGTTC 2460
TTTTAGGTTT GGCCTTTCCT CTCTGACTCG GGTTCCGTTG CACAAAACAA AGACAAACCC 2520
CACCTGCAGA GTGGATGCTG GAAACTGAGG AAGTGGCATG TGGCCTAGCC AGCAGGGTGC 2580
CTGGCACAAG GGATGCTGAG GTGGCTCTCC CCTGCCAAGT TGCTGGGCCT GCCCTGCCAG 2640
CCTGAACCTC TCTCCCACAC AGGAGCATAT CCGTCCCTCC ACCCCTCTCT CACCCCGGGC 2700
TATTTCTGTC TCCCTCTCTA AAGGTCAATG CCTTTCCCGG GATATGGCAG CTGTCACCTT 2760
TTTTTCCTTC TAAGTGACCT TGGCTCCATG CCCAGGGGCA AGAGGTTGTC CGGATGATGT 2820
TCCCCACCCC GTCCTCTACC ACATCTGGCC TGGGCATGCC CACACTACAG TACACAGGGC 2880
CCTCAGGTCA TTTCTGGGTC TGGTGTGTGT GTGTGTCCAG CTCTGGACTG ACACACTGGC 2940
CACACCAGCA GCCAGAATCC TCCTATTGTC CCCTCAAGTG TGGGACAACT GGGGTGTGTG 3000
CTGACGGCTT GTTCCAGTGC TCAGCCGGCT TGAAGGAGAG CACAGGACGA GGCAGCCTGG 3060
CTCCCTGAGA AAGTCCTCAC GAGAATATCA AAGCAGTGCT GCCCTCCACC AGCTTGGCAT 3120
CTGTGCCCTT GAGATCTAAG TCTTTGACTG GGAACAGGAG GTAATTGCCC CTCACTTTTA 3180
ACATTAGAGC AGATCTTTTG GAGTGGTATA GGAAGAAAAG CAGCAGATGA TAGCTCCTTA 3240
TCATCCCAGA GTAGAACCTT CCAGATCTAA GTCAGCCCTC TGAGAAGGAA ATGGCTTCTT 3300
CCAAGTGACC TACAAAGACC TCTGGAGACT CAGGGCCCCT TAGTACCCTT GGCGCTGTTG 3360
CCATGTGACT GACCGTAGGT AGACCTGTCT GATTCTTATT CAACAGTGTT CCAGCATCAG 3420
GAAAGTTCCC TATTTCTGTG TTGCTCTCAA CTTCATAGAG GAAAGGGCAG ACTCCAAGCT 3480
GATTATGTTC AATCTTGTGG TTCCTGCTGT TCAAGAGAGC TACGGTGTGT TCTGAGGTGC 3540
TGGAAGGACA ATGGGGGAAT CCTGGCTAAA CAGTGAAGGG CCTGCGCTGG ACAGCACAAC 3600
TGAATGGGAG CCAAGGTTTC CCAGAGCCGG GCGTCTCCAT TTCACCAACT AAAAATCAGA 3660
AGGGAAGGAG AGGACCCTGG TGTGGTGTAT AGCCCGCAAA TCTACTGTTC TGAGGGCTGA 3720
GGCAGGAGGA TCCTGAAAGT CTGTCTCCAA AAAAGAAAAG AAAGGTAAAA GAAGAAGGAA 3780
AGAAAGGAGG GAAAGCCAAC CCTTGATCAA TGGATGGTAG AGAGGGGGAG GGAGGACCCA 3840
CCCCAGCTGG TCTCTTGTCT CTCCCATCTT TCCCCCATAT GACACCCTCA GGTCCCCTGC 3900
TCTCTCCCCT GATACTGACT TGCCAGAGGG AATCAGGACT CCAAAGCAAG ATAAGCAGAA 3960
GGGAAGGGGG CTCAGGAGAC ACATTCCAGA GCTAAAAATA ACAGGGTCAG CTGGCAGGCT 4020
GGCAGCCTCA GCCTTCCTCG GGGTCCCCCC AGGGCCCCAG CCAGTCTCCT CCTCTCTCCC 4080
AGCTCTCTGC TGGGCCCCAA TCTGGGAAGC CTGGACTGCA TCTGCTGAGA CAAGGCCAGC 4140
ATCTCCTCCC GACTCTATCT CAGCTAGAGA AGGTAGAGGA GCCACCCTGG CAAGGCTCCC 4200
TCCTCCACCT CATCTAACAC TCTCCCCAGC TCATCATCTT AACCTTTGAC CTACATTCTC 4260
TTAATGTTAT CACAAAATGC AAAATTTTTG GTCCACTAGG CAAAGGCTGT TTGGGTCATT 4320
AAAGAAGAGT TCTCCTTTGA AACATACCCT ACACTCACAC CTGCAGGAAT GGGAGTTCAA 4380
GGCCAGCCTG TGCTACACAT ACCTGTCAAA CTTAAGGCCT GAGATCATGT CTCACTACAA 4440
CAGGAGCAAG 4450