EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM121-02888 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
NPC 
Coordinate
chr10:80435040-80436430 
Target genes
Number: 41             
NameEnsembl ID
Fam108aENSMUSG00000003346
Scamp4ENSMUSG00000078441
Csnk1g2ENSMUSG00000003345
Btbd2ENSMUSG00000003344
Izumo4ENSMUSG00000055862
Ap3d1ENSMUSG00000020198
Dot1lENSMUSG00000061589
Sf3a2ENSMUSG00000020211
Plekhj1ENSMUSG00000035278
AmhENSMUSG00000035262
Mir1982ENSMUSG00000087993
Lingo3ENSMUSG00000051067
Lsm7ENSMUSG00000035215
3110056O03RikENSMUSG00000035206
Timm13ENSMUSG00000020219
Lmnb2ENSMUSG00000062075
Gadd45bENSMUSG00000015312
Gng7ENSMUSG00000048240
Gm16099ENSMUSG00000087114
Diras1ENSMUSG00000043670
Slc39a3ENSMUSG00000046822
SgtaENSMUSG00000004937
Thop1ENSMUSG00000004929
Map2k2ENSMUSG00000035027
Zbtb7aENSMUSG00000035011
Pias4ENSMUSG00000004934
Eef2ENSMUSG00000034994
Snord37ENSMUSG00000064441
4930442H23RikENSMUSG00000053603
Dapk3ENSMUSG00000034974
2310050B05RikENSMUSG00000085779
AC155932.1ENSMUSG00000093312
AtcayENSMUSG00000034958
Zfr2ENSMUSG00000034949
MatkENSMUSG00000004933
Mrpl54ENSMUSG00000034932
Apba3ENSMUSG00000004931
Tjp3ENSMUSG00000034917
Pip5k1cENSMUSG00000034902
DohhENSMUSG00000078440
Celf5ENSMUSG00000034818
TF binding sites/motifs
Number: 6             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Nr2f6(var.2)MA0728.1chr10:80435241-80435256GAGGTCAATAGGTCC+6.61
Nr5a2MA0505.1chr10:80435121-80435136GCTGGCCTTGGACTT-7.03
PPARGMA0066.1chr10:80435872-80435892GTGGGTGAGTATGACCTCCT+6.41
RARAMA0729.1chr10:80435241-80435259GAGGTCAATAGGTCCAAT+6.23
TBX21MA0690.1chr10:80435539-80435549TTCACACCTT-6.02
TBX2MA0688.1chr10:80435538-80435549ATTCACACCTT-6.02
Number of super-enhancer constituents: 1             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_11462chr10:80433592-80436074Placenta
Enhancer Sequence
CCTGCCTTTG CCTCTGAGTG CTTCACTGCA AACAGCTACC AGCCCTCTTT ACTCTTTATT 60
TTGAACTCAC TGAGGATCTG GGCTGGCCTT GGACTTACAA TCCTTGGACA TCATCCTTCA 120
AAATGCTGGT GTGGCACACG TGTGTCACCC TTGCCTTGGC TGTCTGAGGC AACTGGCAGT 180
TTTCTGTCTG GGCTACAGCC TGAGGTCAAT AGGTCCAATC AGGAGCCCCC CCACACCCCT 240
CACACACAAA CACACACACA CATACCACAC CACACACACA CACACACACA CACACACACA 300
CACACACATG GGCCTGGCAC CCTGGAGACA TTGGTTGGGG TTGTTCTCTA TGGGGTGCCC 360
TGGGCCCTGC AGACCCATGC TGGAACTCCA CCATCTTCAT GCACGAGGGG AGGGACCCCG 420
CTCTAAGAGA TTCGGGTCAT ACAGCTGGGA GGGGGGAACA GAGTCTCCAG CCTTTGTCTA 480
CCGGCTGTGA TATGAAGGAT TCACACCTTG GACTGACTCC CACACATGAA AAACCTCCAG 540
CTGGCAGGGA GCCAATGTCC CTGGCCCATC TGTGGCTCCT CTGCCTGAAG TCAAGAAATG 600
GCTGGAACGG TTAAGAGGCA GCGGAACTGT TAAGGAAAAA CATCCCAAGA ATGCAAATTT 660
CTCCTCTGCC GCCTGGCTCC TGGGACAAGC TCTGTGTGGC TCCCTGGGTT TCAGGCTACA 720
GCCAGGCACC CAGGACTCAC ACTCATGCCA GAGCAGGTTC CAGTGACAGT TATCAAGCAG 780
GGTTACCTCC TGGGGACACT GGCTGCTGCA CAGCTAGCTT TACTTGAGGC ACGTGGGTGA 840
GTATGACCTC CTTACCTGGC CATCAGGCTG GACTCAGGAA CAGCACTAAC AAGGCAGCAG 900
CAGGTGGGAG AGTGTGCACA GAAACAAAGT GTAGAGCAGT GTGCTCTCAA ACACACATAC 960
ACACATGCAC ACATACACAT AATACATACA CACACATGCA CACACATACA TACACACATG 1020
TACATGCACA CATACATACA CACACATATA TATACATACA TGCACAAACC ATGCTTACAT 1080
GTGCATACAT ACACACATAC ATACATACAC ATACATATAC ACACACGTGC ACATACCATG 1140
TACCATGCAC ACAAACACAT GCATACACCA TGAACACAAT ACATGCACAC AAATTATACA 1200
CACACACACA CAAATGCACA CACCATGCAC ACAAACATAC ACACATGCAT GCACACACAC 1260
ACACACACAC ACGCACACAC GCACTACTTG GGGCATGTCT CCATCCCACC TCTCAGGCCT 1320
CTAAGTGTCC CTGGGCTGCA GGTGCCCTGA TATCCTAAGC CCAATGCTTC TGTTCACAGG 1380
AGTCACAGGT 1390