EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM121-02783 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
NPC 
Coordinate
chr10:79302890-79304630 
Target genes
Number: 42             
NameEnsembl ID
Shc2ENSMUSG00000020312
Gm16517ENSMUSG00000020308
Cdc34ENSMUSG00000020307
GzmmENSMUSG00000054206
BsgENSMUSG00000023175
PolrmtENSMUSG00000020329
Fgf22ENSMUSG00000020327
Rnf126ENSMUSG00000035890
Fstl3ENSMUSG00000020325
PalmENSMUSG00000035863
9130017N09RikENSMUSG00000035852
Ptbp1ENSMUSG00000006498
E130317F20RikENSMUSG00000091994
Gm17134ENSMUSG00000090860
Prtn3ENSMUSG00000057729
BC005764ENSMUSG00000035835
Med16ENSMUSG00000013833
Kiss1rENSMUSG00000035773
C030046I01RikENSMUSG00000035781
Arid3aENSMUSG00000019564
Wdr18ENSMUSG00000035754
Grin3bENSMUSG00000035745
ORF61ENSMUSG00000013858
Cnn2ENSMUSG00000004665
Abca7ENSMUSG00000035722
Hmha1ENSMUSG00000035697
Polr2eENSMUSG00000004667
Gpx4ENSMUSG00000075706
Sbno2ENSMUSG00000035673
Stk11ENSMUSG00000003068
MidnENSMUSG00000035621
CirbpENSMUSG00000045193
1600002K03RikENSMUSG00000035595
Efna2ENSMUSG00000003070
Ndufs7ENSMUSG00000020153
Dazap1ENSMUSG00000069565
Gm15122ENSMUSG00000087672
Rps15ENSMUSG00000063457
Apc2ENSMUSG00000020135
Mex3dENSMUSG00000048696
Mbd3ENSMUSG00000035478
Uqcr11ENSMUSG00000020163
TF binding sites/motifs
Number: 6             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ArntlMA0603.1chr10:79302979-79302989GCACGTGACC-6.02
CDX2MA0465.1chr10:79304076-79304087TTTTATGGCCT-6.02
ESR1MA0112.3chr10:79303976-79303993GAGGTCACCACGACCCC+6.19
ESR2MA0258.2chr10:79303977-79303992AGGTCACCACGACCC+6.28
Foxq1MA0040.1chr10:79303879-79303890AATAAACAATG-6.02
SP2MA0516.2chr10:79303735-79303752AAGTGGGAGGGACTTTG-6.34
Number of super-enhancer constituents: 11             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_04504chr10:79303153-79304081E14.5_Brain
mSE_04845chr10:79302976-79304654E14.5_Heart
mSE_05508chr10:79302762-79304677E14.5_Limb
mSE_07352chr10:79302988-79304675Intestine
mSE_08114chr10:79302803-79304677Kidney
mSE_09089chr10:79302817-79304681Lung
mSE_09812chr10:79302961-79304656MEF
mSE_10291chr10:79302623-79304692Embryonic_stem_cells
mSE_11035chr10:79302942-79304508Olfactory_bulb
mSE_11888chr10:79303090-79304641Placenta
mSE_12235chr10:79303866-79304386Spleen
Enhancer Sequence
ATTCCTGATG CTCCCGCCTG GCTATGGCTT GGCTACCAGG AGTGACCCAC TGGGTTCCAT 60
CTCCTGCACC ACACAAACAG AACTTGGTGG CACGTGACCA TCATCTCAGC AATCAGGAAA 120
TAGAGGCAGA AGGACCAGGT CATCTTCAGC TACATGTCCA GTTTGAGCTA GCCTTGGCTA 180
CATGAGACCA TGTTCAAAAA GGCAAAAATC AATGCAGGCA GCAGGCACCC TGCATAGCCC 240
TTCCTTGCCC TGTAGTCCTT CAAGCTTGGC AATGTCTAAG GAGCCACTAG GGCATCACCA 300
GAGACAGATG GGAGATCACA TCTAAACCTC CAAACTCAGA AAATTGGGCC AAAGACATCC 360
CTAGCAGGTT TTTCCAGCCC TCAGAGGCAG TAACGTGCAC CTGAATTGCT TGAACTTGCT 420
GGAATTTCTT CCATGGTACA GCAAGCAGAC TCATGGCTGT GTGGGACGTA GACAGGAGGA 480
GTGTAAAGGG GGACAGGGAT GTTGAGGGAT ATGCTAGTGT TTGGATACTG GGTTCCAGCC 540
CAGCCTGTAG GTGGCAGGAA CCCCTTCTTC CTACCTTGAT GCTCTCTGGT GGTATAGCCC 600
CTGCCTAGAA CCCACACAGC GAAGGGCTGG AGGTGTGACC ACAAGGATCC TAAGGACCCT 660
CCCTGCCTAG AATCCTCCAG TTAGAGCCCT GTGTGTGCTC AGGGGTGGAG CCCTGCCTAG 720
AACCCCGCAG TGAGAGGCTG GGAGCAGACT CAGTCCTTAG CTCGACTCTA GCCAAGTACG 780
CAGCTCGGGG TTTATGATAA TATATGGAAG AGTGGAAGAA AATCACCCGC TGTGGAAGTC 840
TGAGGAAGTG GGAGGGACTT TGCCGCGGAA TGTCTGTGCC CACGCCTGGG CTGTAGTGGT 900
AGTCTAACTC CTCACACCCC ATCCCCCAGG CTCCTTCCAA GTCCAGACAG AGAAAGGAAT 960
TCCTGGCTGA GTCTAATTTA AAACAAACAA ATAAACAATG TTTGCAGGGA GGAGAATGAG 1020
AGGAATGCGG GCGGGGCTCT TCCCTGCGGG AGAACCGGAG AACTGGGGCC TCGGACTGCA 1080
AGAACAGAGG TCACCACGAC CCCAGCAAAC TCCCACCCCA TCTCTGCAAA GAGCTGGAAA 1140
GCACTGTTAA GCCCACCCCG ACCGGCCTTC CAGGGTTATT CTGTTGTTTT ATGGCCTTTT 1200
TGCTCCGCTG GCTGCAAATT GGGGGAGGGG AGAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAACACGGG 1260
AGGCGGGGTA ACGACAGATT CCGGATCCCT GGTCCCGGAA ACCTTTGTTT CTTAAGGCTG 1320
GGCAGCTGCT CCTCAGAGAC AGTTAGGGCT CTGGACTTGG AGCACCGGTC AGTGTTTTTA 1380
CTTCAAGGAA AGCTCTAACC TAGAGCAAGA GCCCAAAATT TCTCAGGTAG TTTGAAAAAC 1440
AGTGAGGTGG TTTTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTTTCT 1500
TTCTGAGGTG GTTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG 1560
TGTGTTTCTT TCTTAGTACT TGGTAAGCTG AAGCAGGAGG ATTGCGGCAA TTTTAATGAC 1620
AACTGGGCTA CATGAGACCT TGATTGTCTC CAAACATTGT TGGTGCCCAC CTGTCATGCC 1680
AGCATTCAGG AGGTGGAGGC AGGCGGATCA AATGCAAAAG ACTATCCTGG GCTATGTGAG 1740