EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM120-01332 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
NKT 
Coordinate
chr3:27090680-27094660 
Target genes
Number: 3             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 15             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
EWSR1-FLI1MA0149.1chr3:27091370-27091388GGAAAGACGGCAGGAAGT+6.18
HNF4GMA0484.1chr3:27093860-27093875GGAGGTCAAAGTTCA+6.98
Hnf4aMA0114.3chr3:27093861-27093877GAGGTCAAAGTTCAAC+7.49
Lhx3MA0135.1chr3:27093258-27093271GAATTAATTAACT+6.15
MEF2AMA0052.3chr3:27091265-27091277TCTAAAAATAGC+6.52
MEF2BMA0660.1chr3:27091265-27091277TCTAAAAATAGC+6.22
MEF2CMA0497.1chr3:27091263-27091278GGTCTAAAAATAGCT+6.82
MEF2DMA0773.1chr3:27091265-27091277TCTAAAAATAGC+6.14
NR2C2MA0504.1chr3:27093860-27093875GGAGGTCAAAGTTCA+6.72
Nr2f6MA0677.1chr3:27093861-27093875GAGGTCAAAGTTCA+6.83
RARAMA0729.1chr3:27090812-27090830AGGATCAGAAGGTCAAGT+6.14
RXRBMA0855.1chr3:27093861-27093875GAGGTCAAAGTTCA+7.22
RXRGMA0856.1chr3:27093861-27093875GAGGTCAAAGTTCA+7.42
RxraMA0512.2chr3:27093861-27093875GAGGTCAAAGTTCA+7.38
SOX10MA0442.2chr3:27092734-27092745AAAACAAAGCA+6.02
Number of super-enhancer constituents: 3             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_02708chr3:27087619-27112080HFSCs
mSE_08319chr3:27091750-27093749Kidney
mSE_08319chr3:27093811-27094750Kidney
Enhancer Sequence
ATACTCAAAT GACAGAGCAT AAGTTACAGA TGGGGCTTTT ATGGAGCCCA CAAAAGAACA 60
CCAGACACAG ACCTGGAGTC AGGGCTAGGT GGTACACACC TGTAATACCA GCACTGGAGA 120
GGTGGAGGCA GGAGGATCAG AAGGTCAAGT CTGCATGAGA CCAAGTAGCA GAAAGTGGCC 180
CTGGGTACTG GGCCTGTTCC CTCTTTAATC TGTTAGCAAG ACTGAGTATT GACAGCACAC 240
TCAGTCTTTA AACATCACGA GCACTGCCTC TCTCAGATCC TGTGCTTCGC ATGTGATTCA 300
TTGCGTCACT CCAGCAACAT GGCATTTTTC TTTATGTGAC AAGAGGAGAG GACTCAAAAG 360
GAAGAAAAAT AACTTGCTCA GTATGGCAGC GCTGAGGAGG TGGGGCAGGT GAAGGCCAGG 420
CTGCCTCGAT GCCATGCCTA GGAGCTTCAC CATGGTGCTA ACTAACGTGG CACAGGGACC 480
AGCTGAGAAA ATGGAAGTCA GGCTCTCACA AGAGAGAGGC AAAGGGCATT TTAGCAACAG 540
AATATGAATG AGGGGCTCAA GGAGAGATTG TGATATAGTT GAGGGTCTAA AAATAGCTTA 600
AACCAGCTAG AGCCTTGGAA GTTTTAAGGC CAGAGTGGAG GTCAGAGGGA AGTGTGGGCT 660
GGGTAAGGAG TGGCTTTTTG TCTGTGGTCT GGAAAGACGG CAGGAAGTTG CATGGTAAAG 720
TCTGTGTGTT AGAACAATCT TCAGCATTTA TTTTAGATTC TCATAGCCCA GGCTGGTCAC 780
CAACTCCATG TATCCTCTGA GGAAGGACCC TGAGCTTGGG ATGTTCTTGC TTCTGTCCCC 840
CAAGGTGCAG AGATCACATG TATTTAGCAT CCTGCTGCTG ATGAGGTGCT GACAACCCCT 900
GGCTTCCACC ATGCTAAGGC AAGCACTTCC CAAGGAAGTC TACTACTAGC ACTCAGGAGT 960
GTTATGGTTT GTTTTCTGGT TCTGATGCTA GGGCCTCGTG CATACTAGGT GTGGTGGTTT 1020
GTATATGCTT GGCCCAGGCA GTGGCACTAT TTGGAGGTAA GGCCCTGTTG GAGTAGGTAG 1080
ATGTAGCCTT GTTGGAGTAG GCATGGCACT GTGTGGGTGT AGACTTTAAG ACCCTCGTCC 1140
TAGCTGCCTG GAAGCCAGTA TTTTCCTAGC AGCCTCCAGT TGGAGATGTA GAACTCTTGG 1200
CTCCTCCTAC ACCATGTCTG CCTGGATGTG CTTGCCATGC ACCCACTTTG ATGATAATGG 1260
ACTGAACCTC TGAACCTAGA GTCTGTTGTC CTTATAAGAG TTGCCTTGGT TCATGGTGTC 1320
TGTTCACAGC AGCAAAACCC TAACTAAGAC ACTAGGTCAG CCCTGCATCA CTGAGCCTTA 1380
GAGGAGTCCC CACTGGTAGT GTAGGAACTG AAATTTCAAG CAGAATCTAG TTATCTAGGA 1440
GAAAAAGTGA AGAAAGAAAT GAGTTAGGAG TTGTTTGGAG GGCAGCTGAC GAGGGCTGCC 1500
AATGTGGGAT GGGTGAGAGG GAGGAGGTCT GGTGAGCCTT GGGCTGGATT CTGAGAACTG 1560
CAGCGATGGT GGCAGTGAGC CTGATTGAGA GCATCTGCTG GTGGGTGAGG TGAGGTTTGG 1620
GTCCTTGGAG GGCACTACTG GGATATAAGA GGCCTGTTAG TAAACAGTTG GGTATGCTGG 1680
CTAACTGGAA GGTAACCTGT TGAGGTCAGG GTCACAGCAA AAGGGTGGTT GTGTGTGGAG 1740
TTGGATGGAG ACTGGGAAAT CTAGTCCAAG GCACTCCTGG GACACGCAGT ATCTTACTGT 1800
GAAAAGACAC TCTGACTTCC ATTGTGCTCA CGCCCCATAC CTCATATTCC AACACTCATG 1860
ACACAAAGGC AAGTAATACT GAGAACTCAA GGCCAGACTG AGCTACCTGA GTTAGCCTGG 1920
GCTATGTACA ACACCTCATC CCAGAAAATT AGATCCAGCC AACCATTCGA ACAAGCATGG 1980
CTTTTCTGTA CTTTATGTAA CACTAAGGAT TATGAAAGAT GTCCCTACTG CCTCATTTAA 2040
TATAGTAAAG ACACAAAACA AAGCAGTTAA CTGGCTTCCA TTGCTGTGTG CCTTGTGCTC 2100
TGTTCTGACT TTATCTCCCA TCAGCAGTCC TCTACCCAGC TTCCTGTCCC CCAACAGCCT 2160
TGCTGTGAGT TTGTTTGTCC TTGTGTGTGT GACACCTTGT CTCCTGTCCC CATGCCTCAG 2220
AGGCCCCGCT TACCCTCTTG CTTTGGCCAA TAGCCCATGC ATCTCTCAAC AGCAGCTTCT 2280
CCCCTCCGCA GTGTTCCCCT CCACCGGGCA GATTGCTCTC TGACAGGTTT TGGTTTTGAC 2340
AGTCATTTAC GATAAAGGAG CCAGAGGAGT TTCTGGTTCT GATTTCCTTC GGTCTGGTGC 2400
CCTCACTGCC TCAAGGATCT GACCTCAGTG CTCACGTGCT TCTGACTCTC AACTTGGCTG 2460
AAAACCTCCT TTTGTTTCCT CTGCAGGCTT TTTTTTTTTT TTTCTTCAAG CCTGTTGTTT 2520
TCTGGGCTTC CAACTTCCTC ATAATAATTT TAAAGATTTA TGCTTGTTTT TGACTTTGGA 2580
ATTAATTAAC TACAGGCTTT TGGGGGGGGG GGCTAAATAC TAGCTGCTAA TTCTAGGCCG 2640
TCTTTTCCAA AGATGGCCGG CAAGCTTGCA CTTCACATGG AGGTGGTCTA GCCTTCTCTT 2700
TCCAGGTTGA ATACAGAGTT CCTCTCCCTC CTTCTTTTCC TGTTTAAAGA GACAGGGTCA 2760
CACCATATAA AATGGCCCTG AACTCAACCT CCTCCTGCCT CAGCCTCTTA AGTGCCTGGA 2820
TCACACGCTT GTAAGTCGAG GGGTAACCTG TAGGAATTGG TTTTCCCCCT GTCCCTGGGG 2880
TCAGGTCTCA GGTGGTCAGT GTGTGTGTCT GTGTGTGTTC TGCTATGTAA ATTGAGGGGC 2940
AACACACATA CATGCATACT GACACACTAA CATACATACA CACATTACAC ACACACATAC 3000
TCTCACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAT ACTAATCAAC 3060
TTACAAGCTT GTGCCACACA TTTTTTTTCT TTCAAATGCT TAATTTTAAA AAAAATTTCT 3120
TTTGCTTTTA TTTATTTTGT GTGTGAGTGT GTGGGCACAG GTCTGTCAGA GCACACACGT 3180
GGAGGTCAAA GTTCAACTTG TAGGATTCAG TTCGCCTCCT CTTCATCAGC CTCAGAGGCT 3240
GGACTCAGGT CCTTAGGCCT AGCCGCAGGT GCCTTTACCT GCTGAGCCGT CTCCCTGACT 3300
CTCTTCTGAA TGATTGAACG TCCATTTTGA TGAGGCTGTT GAGCTTGCTA CAAAACCTCT 3360
GACTGAGGGT TTTTTTTAAA ATTTGTTTAA TTTTTTAAAA CTTTTTATTG ATTCATTGTG 3420
AGTTTCACAT CATACATCCA ACCCCACTCA TCTCCCTGTC CCTTCATTTT CTCCCTCTGC 3480
CCTTGTAGCT TCCCCCCAAA AGAAAAAAAA ATGCCTTGTG TGGAAGCTGT GGCGTGTCAC 3540
AGTGTGTCAC GTGGTACACC CTTTTATCCA CACATCTTGA CTTGCACATG TTCACTGCAG 3600
TGAGTCACTG GCCTGGCTCG AGGGCTCTGG CTTCTGCTTC ACCATCAATA ACTGATCTGC 3660
ACCGAGACTC CTCTCAGATA TCCAGCTGCT GCCCTGTGTC ATGGCTATCT TGTAGGAGTG 3720
GAGCCTCTGT GCACTCTAGC AGTTATAGAT GGGGTAGATG TTGGGGTGGG CCAACTCAAA 3780
GCCCTGAATC TGGTCTGTGT GGTAGCTGAG GCAGTCAGCC CATCAGCGCT CTATCATTGC 3840
CCCACTAGTC CACCCAGTGT CACAGCTGGC AAGGGACAGG CTCAGCTCTC CCACTCTCAC 3900
GTCCTCAGGG CAGCTCACCC ATGCCCACAC CACCAAGGTC AGCTCTACTG TGCTACCCAT 3960
GCGAGGTGCA GAGCCCACTC 3980