EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM118-22041 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
NIH-3T3 
Coordinate
chr7:80750560-80754030 
TF binding sites/motifs
Number: 11             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
EGR1MA0162.3chr7:80751889-80751903GCTGCGTGGGCGGA-6
EGR2MA0472.2chr7:80751891-80751902TGCGTGGGCGG-6.32
EGR3MA0732.1chr7:80751889-80751904GCTGCGTGGGCGGAA-6.13
FOXA1MA0148.4chr7:80753347-80753363CAATGTTTACTTAGTA-6.13
FOXC1MA0032.2chr7:80753349-80753360ATGTTTACTTA-6.02
FOXD2MA0847.2chr7:80753349-80753362ATGTTTACTTAGT-6.32
Foxa2MA0047.2chr7:80753350-80753362TGTTTACTTAGT+6.44
RREB1MA0073.1chr7:80753721-80753741GGGGGGGGGGGGTATGGGGG-6.01
RREB1MA0073.1chr7:80753720-80753740GGGGGGGGGGGGGTATGGGG-6.44
ZIC1MA0696.1chr7:80751806-80751820CTCAGCAGGGGGGC-6.18
ZNF740MA0753.2chr7:80753720-80753733GGGGGGGGGGGGG-6.03
Number of super-enhancer constituents: 27             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_00389chr7:80728813-80754010pro-B_Cells
mSE_01523chr7:80662346-80773459Th_Cells
mSE_02681chr7:80731224-80764627HFSCs
mSE_03000chr7:80728755-80771487TACs
mSE_03459chr7:80752445-80752863Bone_Marrow
mSE_03982chr7:80751273-80752089Cerebellum
mSE_04060chr7:80751282-80753626Cortex
mSE_04416chr7:80751110-80753688E14.5_Brain
mSE_04807chr7:80751431-80753544E14.5_Heart
mSE_05509chr7:80751081-80753496E14.5_Limb
mSE_06583chr7:80751249-80753369E14.5_Liver
mSE_06612chr7:80751246-80753522Heart
mSE_07229chr7:80751242-80753696Intestine
mSE_08080chr7:80751435-80753991Kidney
mSE_08614chr7:80751335-80753561Liver
mSE_09049chr7:80751325-80753714Lung
mSE_09494chr7:80751426-80754236MEF
mSE_10229chr7:80750482-80751256Embryonic_stem_cells
mSE_10229chr7:80751258-80752906Embryonic_stem_cells
mSE_10773chr7:80751274-80753605Olfactory_bulb
mSE_11288chr7:80751310-80752907Placenta
mSE_11971chr7:80751381-80752954Spleen
mSE_11971chr7:80752979-80753451Spleen
mSE_12651chr7:80751315-80752082Testis
mSE_12651chr7:80752108-80752838Testis
mSE_12880chr7:80750510-80751237Thymus
mSE_12880chr7:80751301-80754308Thymus
Enhancer Sequence
TCCTGTCTTG TCAGGACCTG GTGTTTGTAA GACTGTTTAT GCAATACTGA AGCAGTTTTT 60
TCCCCTCTCC ACTTTGTGAA CAGGATGGAG GGTGACAGAA GATTGCTTGT ATGTAACGAT 120
AGTTTTTTCA GTGCCTGCTA CCAAGGTTTT CTAGGTTTGG GCCTTCTGCT CCAAGGTAAA 180
AATTGCTCTG AGCATTAATA CCCAATACAA AGGTGGCAAT TCTGAGTCAG ACTTTCCCAC 240
GGCTCCCAGA GACTGTTGCA TGTACATTCC CAGCTCACCT GCAGCACGCA GGAGTGCAGG 300
CTAGAACAAG CTAGCCTCAC CTAGGCTCCT TCTGGATATT TTAGTGCAGG CTCCACCAGC 360
AGCAGCATTT TAGGCGGTAA CAATTTCCTT TTGTCTTACT TTCTAAATCT GTAAAACATT 420
CCTAGCTTGC TTGCAGTTTG CAGAGGGAGT GCAGGACTGA AGGAGGTAGC CTGACACCAG 480
CTCCTAAAAC TGGTCTTAGC ATAGCACTTG GCAGAGTTGA GTTTCAGGAG CTGTAATTGG 540
TATTATTTAG CAAGGCACAA AAGTTCTGAG ATACACAGCA AAGTTCATAT CCCTAAAGAA 600
ACTTTCACTC CAATACGGAT TTTCTTTTTT TTGGTTTTTT CGAGACAGGG TTTCTCTGTG 660
TAGCCCTGGC TGTCCTGGAA CTCACTTTGT AGACCAGGCT GGCCTCGAAC TCAGAAATCC 720
GCCTGCCTCT GCCTCCCGAG TGCTGGGATT AAAGGCGTGC GCCACCACGC CCGGCCTCCA 780
ATACAGATTT TCATAGCACC ATCTGACCCT ATCTGGGCAG AAACTAAATT TTAAATAGAA 840
AAATGGGCAG GTATTTTAAA CGAGGGAATT GTATCACTTC CCCAAGTGAA CATGTTCCTA 900
GAGTTAACCA TCCCTGCACA GTTTAAATCT CCTTCTGAGC TACATTAACA TGAAACAAAT 960
TCAACAAATT TTATCCAAAG AACGTGGGGG ATTGCACCAG TTTTGAGGCC TCCATTCCTA 1020
TCCTGGAAAC CATAGCTCAT GTCTTGAGGC ACGCCCCAGG CTTTTCTCCC ATCTAGAACA 1080
CTTGTGGGAA GGGAGCTTTG TGCAGTTGTG ATAGTAAACA TTCCACACTC TAGAGACCGA 1140
CATACAACTC TCTCTGCTGA GCTCAGGCTG GGCCACTGGC TTTGTTCTCC GCACACATAA 1200
ATATAAGTTT TGGAGGCCAT CTTGGAAACA GGAGAACTCT GGGCGCCTCA GCAGGGGGGC 1260
TGACCGTAAC TAAGCAACGG AGGCGCACCC AGTGCCGCGC AGCCGCAGAG CGCCGCGCAC 1320
GAACGCCCCG CTGCGTGGGC GGAACTGATG GGGGAGGGCG GCGGCGGAAA ATTACCTTAG 1380
GTTCTTCTTA AAGGCACAGA GGCCTTACCT GCTAAAGGTC CAATCGCCAG CCGATCTAGG 1440
GTGCATGTTT TACAAAGCCT ATTTGTAATG CAGTCGACCT TATATTTCTC TGTGAATACG 1500
AATTTTATTT ATCTTCTCAG AGAAATAGAA TCCAATCCCA AATTAACTTC CCCGTGTAAA 1560
CTTCAGTCAC TAAGTAAGCA AATAGTGGAA TAAACAGGCT TCTTCAAAAT CAAGTTAACG 1620
GGCATGGGGA GGGGAGAGCA AATCAAACAA AACAGCCACC AAATTAACCC TAAAATGTCG 1680
AATGGCGAAG AAAGAGAGCT AATGAAGTCA GGAAGGGGAT GAAGTGAGCA CCCAGGAATA 1740
AAGTCACGAC TGTGTAGCAG CTTTAAAAAT GTACAGATTC TGAAGCAAGG AAAATTTATT 1800
CTTGACAGAT GGATTGGCAG ATTATAGTAT ATACTAAAAA TTAACAGAAA AACAAGATGT 1860
CTGTTAAGTA AAGCGGGATC AGAAAACTCT CCGCATAGGT CACTTTTTTA CAGCAAATAA 1920
AACCATAAGA CTTTTTGCTC TTCTTTTTAG AAAAAGAAAT GCAGTTTTTA AAAGTGTTTG 1980
GTGGCACACG GGTGCTGATG GCGGTGCAGT TATACCACAG TACGCTTGTG GAGGTCGGAG 2040
GACCTTGCAG GGAGTTTGTT CTCCCATGTA TGTTCGGAGG ATTGAATTCA GGTCTTCAGA 2100
CTTAGCAATA ATCACTTTTA CCCTCCGAGC CTTATCTCCA GCCTCCACCT CGCTTCTTAT 2160
CAAAGACATT TCCTTCGATC TAGCAGTTTC TATGATTTAC AAGTTAAGGA ATAATTCATA 2220
ATGGTCCTAC TTATGTGAAA GAATAAACGC AGGGTCTGGT TCAATGGAAA TCTGCAGGGG 2280
ATAATGTGCT GCTCTGCAAG TCTCTACAAT TAATCTCCTT ACTAAAAGCC TTCCTTGAAA 2340
ACAACAACAA AACAAAACAA AACAAAACAA ACAACGGAAG AAAAAGAAGA AGAAAAGAAA 2400
AGAAAAGTAG GAAAGAAAAG AAAAGGAAAA GGAAAAAAAC GTGTCCTCTC TGAAATAAAG 2460
CCATTCCCAC ATTCCGAATC TCCATTTCCA ACGACAGAAG ATCTTTTGCA CTCCTCAGAT 2520
GGTTTGCTTG TTATAAATGA TTTCTCTTCC AAACTGCCAT TAGGTGTACC CTAATAAACA 2580
GCACCATACA TCCTCGGAAG CACCTGGGGC TCTCACCACA AATGGGGGGA TGTTCCAGTC 2640
CTATCACGGC CCTAACAAAC CAATTGTCAA TCCCAGAATC GACCATTTCT TCCCATGCTT 2700
CTCAGCCATT TTAAACCTAA TTTTCACATC TACTTTAAAT CCCTACAAAT CTTCCCCCTT 2760
GTCCCTACTG TAAAGTCTTT ACAATGTCAA TGTTTACTTA GTAATTTGTA AAGGGTACCG 2820
TGTTCCTTTC AGAATATGGA ACCGTGTGAT CTTGATACTA AGAAAATGTT TTGCAATGGT 2880
TTAGTGTGCA GCTTGTTAAG TTTCAATTTG GCTATTAAAG AAAGGACCAC ACTAACTTTC 2940
TAGAAGCACA GGGAGATAAG TCCTTTAGAT TAACAAAACA AAACAAAACA AAAAACCAAA 3000
ACTGTGTGGT GCAGAAGAGG TGCCACCACC ACCTTGAGGG GAAAGATTTA ATGTCTAAGA 3060
ACTGTGTCTT GGAAATAAAA ATACACACAC TTGCAGCTGG TGGGGCCATG TCCTTAATTG 3120
CCTTCATGTT TCATTACCAC AGCTAAAGAA CAGAAGCCTT GGGGGGGGGG GGGTATGGGG 3180
GACTTTTGGG ATAGCATTTG AAATGTAAAT GAAGAAAATA CCTAATTTTT ACAAAAAAAA 3240
AAAAAAAAAA AAAAAAAGGG AACAGAAGTC TGAAACGGCT GCTTTGTAGC CGAGACGGTG 3300
TTTCTAACGC TTGCAGAAAG TATGGTGTGG GATGACAGAT GATGCCGGCT AGACAAGGCA 3360
AGTTCTCATG TCCTTACCAC CTTTCTTCCA GAGGTCTGTT TTCTAGCACA GACTGTTCTG 3420
TATAATTCCT AGTAATCTAG GATAGTCCCC AGAATAAACA GAGAGAAAGG 3470