EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM118-06374 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
NIH-3T3 
Coordinate
chr12:117564680-117565780 
TF binding sites/motifs
Number: 6             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
IRF1MA0050.2chr12:117565339-117565360CTTTACTTTTTTTTTCTTTTT+6.58
NR2F1MA0017.2chr12:117565491-117565504CTCATGACCTCTG-6.04
Nr2f6(var.2)MA0728.1chr12:117565487-117565502TGAACTCATGACCTC-6.26
RARAMA0729.1chr12:117565484-117565502AATTGAACTCATGACCTC-7.35
RarbMA0857.1chr12:117565487-117565503TGAACTCATGACCTCT-6.58
SRFMA0083.3chr12:117564794-117564810TTTCCTTATATGGTGA-6.59
Enhancer Sequence
TAGTTTTGTT CTTCCTCAGA TGAAGGCACT TGTAAAATAA GTTGCAGCAT TAGCTCACAA 60
CTGCTGTTGC AATGCCTAGA AGAAAGGGAT GAAGTTGAAA TGTTCAGCCA GCCTTTTCCT 120
TATATGGTGA ACAAAGCTAC TGAGCATGCT TTAGAGGGAA GGGAATTTTC TTCAGTTACT 180
TTCAGCTGGA AAATATGAGA ACTTATTGCT GTTAGCTGCC AAATAATTCT TCCTGAGTCT 240
GGTGAAAAAT ACAACCAGAA GGGCTTTTTA GTTTTACTGG TTTTTTTTGT TTTTTGTTTT 300
TTCTGCCCAG ATGATTCAGA AACAAGTGCC AGAGACTTGT ATTAAACAGT TTCTTGTTTT 360
CTGCCTTCTA GTTTGTTTAA TTAGTTTTGA TAATGTGATA CTTGTGGAGT GACCCTTGAA 420
AATTCTTGAC ATGATGAAGT TTGAAGCCAA GTGAACAGTC CCAAGTGGAG TATTGGAGGT 480
AGGGTTTGGA GACAGGGAGC ACTGCAGTGT GGGGTCTCGG CGACAGCTTT GCACTGCCTG 540
GTTTCTCCTT GTCTTTCTGT GCCATTTCTC TAAGTCCCAG TCTCCTGTCT GTGACAGAGA 600
GTGACACTAT ACCGTAACTC ACAATTGAAT GTCTGTGCTC TTAAAAGCAC ATAGCAAACC 660
TTTACTTTTT TTTTCTTTTT AAAAGATTTT TATTTATTTA TTTTTTATAT ATATGACAAG 720
TACACTGTAG CTGTCTTCAG ACACACCAGA AGAGGGCATC AGACCCCATT ACAGATGGTT 780
GTGAGCCACC ATGTAGTTGC TGGGAATTGA ACTCATGACC TCTGAAAGAG CAGTTAATGC 840
TCTTAACCGG TGAGCCATCT CTCCAGCCCC TCTTCAGGAA CTTTTGTTCA CAAGGTGTTT 900
TCAGAGTCTT CAGTTAACCC CAAAAGAACA AGTTATAAAA GCAGGTCTTT TCCAGAAGTC 960
CTCCACAGAG CAACTGAGGC TTGCTCCATG TGGTTTTCTT TGGAGACGGA TTTCAGCCAA 1020
GTGAAGGGGA TTTCTTTGTC AAGTAGAACT ATCTTCCTTT TAGAGTTATA ATAAGAATTT 1080
GAACCTTACT GGGCTAGAAT 1100