EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM118-00475 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
NIH-3T3 
Coordinate
chr1:72272270-72274040 
TF binding sites/motifs
Number: 8             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
EWSR1-FLI1MA0149.1chr1:72272724-72272742GGAAGGCAGGAAGTGAGG+6.53
KLF5MA0599.1chr1:72272573-72272583GGGGCGGGGC-6.02
Nkx3-2MA0122.3chr1:72272902-72272915ATTAAGTGGATTT-6.2
PKNOX1MA0782.1chr1:72273839-72273851TGACACCTGTCA-7.22
PKNOX2MA0783.1chr1:72273839-72273851TGACACCTGTCA-7.22
SP3MA0746.2chr1:72272558-72272571CGCCACGCCCCTC+6.18
TGIF1MA0796.1chr1:72273839-72273851TGACACCTGTCA-6.92
TGIF2MA0797.1chr1:72273839-72273851TGACACCTGTCA-6.92
Number of super-enhancer constituents: 2             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_10125chr1:72271505-72272551Embryonic_stem_cells
mSE_10125chr1:72273712-72274091Embryonic_stem_cells
Enhancer Sequence
ATTAGCTGTG AATGCCTGGG CGACAGAACA TCCCAGGATC GCGCTTGTGA TGGGCTCAGG 60
AGAAGCTTTT GGTAGTTAAA TAGCCAAGTG AGAAAGGGGA GGATACGGTG TCAAGTCACA 120
TACAGCCTCA GGACTGGAGG AAACAGCACG GACGAAGAGC AGACTGCCTG AATCGAAACC 180
AACCCTCAGC TCCTCAGGCT ACCTGTTCCC ACCTCGCTTT CCTCTGTGGA GGAAGAAGCG 240
TAGGTGGGCC GCTTTGAGAC TGCCAGGAGG AGGCGGCTCA GTGCGAACCG CCACGCCCCT 300
CGTGGGGCGG GGCATGCAAA TAATACTCGG CGTGCGCGCT CGAGAACGCC GGGAGAGCCG 360
GGGTCGTGGA CGTTGTAGCT GAAGCTGTGG GTGCTGGAGT GGGAGTGAGG CGTGGAGGAT 420
GCAAGACGCG CACGGGAGGA GGAAGGAGCC GCGGGGAAGG CAGGAAGTGA GGGTTGCGAG 480
CGGTCACCAC GAAGTTAATG TGTCTCGCGG ACGCAGAGCA CGGCTGCATG GTGTGTGCTG 540
GGTATCGCTT CTCGGCCTTT TGGCTAAGAT CAAGTGTAGT ATCTGTTCTT ATCAGTTTAA 600
TATCTGATAC GTCCTCTATC TGAGGACAAT ATATTAAGTG GATTTTTGGA ACTAGGAGTT 660
GGAATAGGAG CTTGCTCCGT CCACTCCACG CATCGATCTG GTATTGCAGT ACCTCCAGGA 720
ACGGTGCACC CCCTCAGGGG AATAATATTT GTTTAAAATT AGAGCTAATT ACTCGTTTTC 780
CCTTTGTCTT CCAAAGGTTT GTTTGATTTG GGGCTAACTT TAGAAGCATC TTTTCAGAGC 840
CCTAATACTT GAGAGGCAGG TGAATTTCTG AGTTCTGAGG CCAACCTGCT CTACAGTGAG 900
TTCCAGGATA GCCAGGGTTA CGCTGAGGAA CCCTGTTTTG GAAAACCAAA TAAAATACGT 960
TTCTAGTCTT TATCTTTTGT AGTATTTGAG TACCTAATAA AACTCTGAGC TTCTAGTGTT 1020
ATTATCTGTA TCCTTTGTAG TCAAGATTAT TATTATGATG TGCAAGTTCC AGCTTGGCGT 1080
AACACAAAGC ACCTAATGAC TGTTGTATCT AACACCCTTG ACTAAGGAAC CAGCTGGTGG 1140
TGTCAAAAAC TCTAGTATTT ACTAAAACTT TTGAAAGTCA ATTTTTTAAA AATAGCTTTC 1200
TGTGTATGCA TATGCGTAGT GTGTTTGTGG GCACACAGCC ATAGGAGTGG GTTCTTTACT 1260
GACTTCAGGT GAGTTCTATA CTGGCAGTAT ATGTCAGGGA AAGCTGTGCG TATTTATACC 1320
TGCCTTAGCC TCCTAATTTC TAGGGGTTTC CCCCTCATGG TCTTTTTTTT TTTTTTAAGA 1380
TTTATGTATT TATTATGTAT ATAGCATTCT TCCTGCATGT ATACCTGTAG GCCAGAAGAG 1440
AGCACCAGAT TTCTTTATAA GTGGTTCTGA GACACTATGT GGTTGCTGGA AATTGAACTC 1500
AGGACCTCTG GAAGAGCAGC TCTGAACCTG ACCCATCTCT CCAGTCCCTG TTACAGTCTT 1560
AAAACTTTTT GACACCTGTC AAAGAATGTT AGGATTCAGA GAACTGGCTG TTCTCCCAGA 1620
GATCCCTGTA ATTTCAGGTC CCCCATGCTT CAGGTCCCAA TACTCAGTTG GGAGCTCACA 1680
GTGTTTTGTA AGTAAATAAA CATGCCCAAA CCACCCGTGA ACACACACAC ACACCACAAT 1740
AAATCCAAGT TTAAAGAGAA AAACTCGGGG 1770