EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
MM116-07377 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Neuron_cortical_E16 
Coordinate
chr3:55154860-55157050 
TF binding sites/motifs
Number: 13             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CrxMA0467.1chr3:55155589-55155600CTAATCCCCTT-6.32
GSCMA0648.1chr3:55155588-55155598GCTAATCCCC+6.02
MEF2CMA0497.1chr3:55155765-55155780TTCTATTTTAAGCAC-6.29
RFX1MA0509.2chr3:55155851-55155867TGTTTCCATGGTGACG-6.13
RFX1MA0509.2chr3:55155851-55155867TGTTTCCATGGTGACG+6.14
RFX2MA0600.2chr3:55155851-55155867TGTTTCCATGGTGACG+6.28
RFX2MA0600.2chr3:55155851-55155867TGTTTCCATGGTGACG-6.2
RFX3MA0798.1chr3:55155851-55155867TGTTTCCATGGTGACG-6.38
RFX3MA0798.1chr3:55155851-55155867TGTTTCCATGGTGACG+6.43
RFX4MA0799.1chr3:55155851-55155867TGTTTCCATGGTGACG+6.3
RFX4MA0799.1chr3:55155851-55155867TGTTTCCATGGTGACG-6
RREB1MA0073.1chr3:55155999-55156019TGTGTGTGTGTGGTGTGGTG-6.11
ZNF263MA0528.1chr3:55156063-55156084GGGGGAGGTAGGAGAGGAAGG+7.21
Number of super-enhancer constituents: 2             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_04199chr3:55155043-55157216Cortex
mSE_11093chr3:55154103-55158702Olfactory_bulb
Enhancer Sequence
TAAACCTTCC AATGTACCCT CCCTTGCTCT CCTTCAAATC CATACCCTTT TAACTAGTTG 60
TTATTACATG CATATATCTG CATATATTAT GTATATATAT ATTTCCAAAT ATAACCTGTA 120
CTGTCTGTAT AACATTTATA TATATATATA TATGTATTCA TATACTCATT CCTAAATATA 180
ACCTGCACTG TCTGTATAAC ATTAATTTTT ATTTTGAGGC AGGTATTGCT TGTAGAGTGA 240
ACACCTAAAG GTCTGCCCGT CTGCTAGTTA GCACTGTGTG CCTGCCAGAG GTGGGAAAAA 300
GGAGGGTTGA GACCACAAAG ACTCCAGGCC CCTTACAGCC GGTGTCTCTC TAGAACACAA 360
GGCCAAAGCC CTCCCTTGCA GTGACATGAA AAAGGACCTG ACAGGAAGTT ACCAATGGCC 420
AGTGCCAGGG AAAGTTGTCC CTTTGAGTAA CTTCACCTTT GCTAATTGTC AAACGAAGTT 480
TCTACATGTG GAAGAAGGAG GCTTCTTCTG TCGCCTTATG TGCTTCCCGG CCATTGACGC 540
CTGGAACTCA TTTGCCACTT CCTCAACGCT TGCTCTCCAG TTCACACTTA CAGTGCTTCA 600
TTTCTCCATA TTTTGTTTTG CACAGAGCAC AGGAGCCAGT GTCAGCCTTT CTGAGGGCCT 660
TGCCCATGTC ACACCTGCTA TTGTTGATCC TCCTAACCTG TGAGTCCCAG CGGAGGGCTA 720
ATCGGAGGGC TAATCCCCTT ACCAGGGATG CTGTTTCCAG GGAGAAGCTG CTATCTGGTT 780
CTGCACACCT CTAAGAAGAA CAGCAGTGGA GCGGGATGAA GGGAAAGGGA AGCCACTGTC 840
AGCCGCGCGC TGCATATGCA CAAAGATGCG CAGGTCTCCC TAATTGCTGT TTTTATTTGC 900
AGAGTTTCTA TTTTAAGCAC ACACACTCAC ATGTGGGTTG ACAGGTACCA GCCAGTAATG 960
GCTGTGTCTG TCTGTAGTGC CTGTGAATGC TTGTTTCCAT GGTGACGAGA GGCACTGCAG 1020
AGACAGGATT ATGGTGCTTC TGGGAGCAGG GTGCTGCCAC AGGAGGCCTT CTGGGTTCTG 1080
GGGTGTGTGT GTTTGCCTCT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT 1140
GTGTGTGTGT GGTGTGGTGT GTTAGGGTAG CTTGCAGCTG TAAAAACCAA AGGGACAGGG 1200
AATGGGGGAG GTAGGAGAGG AAGGCAAAGC TTGAATGTTA GAGAAGTCTA GGGAGGGAGG 1260
AGAGCTGGGT CAGGATAATT CTAGAAAATA GAAGAAAAGA ACTATGAATA GAAACGAGAA 1320
AGGCACACAA CAAAACCCCC TCCTCTCTGC CAGATATCCC CCCCTGGGAC TCGAAAGGCT 1380
TCTGGTGGCA GAACACAGAT GACAAAGAAA AAGGATTTGG AAAGCAGAGG TGGTTGGACT 1440
TCCTAATTTT CTGGAATTCT AGGGTAATAC TGTGCCACCC CCTCGTCCTC CTCAGCGTTG 1500
CGGCTGGAGG AGAGACAGAG TGTCTCCCAT CCACCTCGAG ATGCCGAGGT CTTAGGTCAT 1560
GTGAGGCTGT TGATTATCCC CCAGGCTCTG TTCAGCTCGG ACCCAGGATG AAGACCACCC 1620
AGAGCCGGCT CACAACCATG CCGTCTGGTC TGAGGGGATG ACTAAACGGT GGCCCAGTTT 1680
CGGCTGCCAA CGTCTTTCAG AGGCCATGAG AGGACGCCAG CCCGGTTCGG TCTATGCTGT 1740
TCTTTGTCAG ACTCTTTGAT GACTAAAGAT GTTTCTGAGC TAAAAGTCAG GCACCTCTCC 1800
AAGGGCCATG GACAAAGGGA ACCTCCCAAG ATGGTTCTGT AGTCACTAGT TACGAACGGT 1860
GTTGGCTCCC TGGTTCCGGC CTGGCACTAG TGACACCCAG TCATCGCACA TGGAGTTTTC 1920
TCACGGAGTA GCTTGTCCTA ATGGTGGTGA TTGGTGACAT TTTATAAACT CAAGGCCCAA 1980
GGATGTTGGA TAGTAGAGGA GATCGAGTAA GCCAGATGGC TGGAGCCAAT GCTGTCGTTT 2040
ACAGCCCCTA GTTTCCTCTT GAGTGCAAAT CCTTCATCTG AACTCTGCTT GTAAAGAACT 2100
GTGAAATGCC CAGGAGATGC AGCCTATGTT TGGCTGTTCT TGGTCCATGC AGAGCTCTAG 2160
TTTCCGGATA TCTGACTCTG TCTTCTGGCA 2190