EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM116-06452 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Neuron_cortical_E16 
Coordinate
chr2:30546880-30550360 
TF binding sites/motifs
Number: 24             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
EWSR1-FLI1MA0149.1chr2:30547025-30547043CTGTCCTGACTTCCTTCC-6.28
EWSR1-FLI1MA0149.1chr2:30548611-30548629CCTTGCTTGCCTCCCTCC-6.32
EWSR1-FLI1MA0149.1chr2:30548788-30548806CCCTCCTCCCCTCCCTCC-6.34
RREB1MA0073.1chr2:30549213-30549233CGCCCACCCACCCCACACCA+6.32
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ZNF263MA0528.1chr2:30548792-30548813CCTCCCCTCCCTCCCTCTTTC-6.34
ZNF263MA0528.1chr2:30548776-30548797CTCCCTCCAACTCCCTCCTCC-6.53
ZNF263MA0528.1chr2:30548816-30548837CTTTCTCTCCCTCCCTCCCTC-6.61
ZNF263MA0528.1chr2:30548664-30548685CCTCCCTCCATCCTCTCCTCC-6.93
ZNF263MA0528.1chr2:30548762-30548783TCCCTCTCTCCATCCTCCCTC-6.95
ZNF263MA0528.1chr2:30548414-30548435GGGGGAGGATGAGGAGGGGCA+7.05
ZNF263MA0528.1chr2:30548667-30548688CCCTCCATCCTCTCCTCCCTC-7.07
ZNF263MA0528.1chr2:30548695-30548716TCCTTCTCTCCATCCTCCCTC-7.14
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ZNF263MA0528.1chr2:30548619-30548640GCCTCCCTCCCTCCCTCCTCT-7.23
ZNF263MA0528.1chr2:30547809-30547830CCCTCCCCCACTCCCTTCTCC-7.29
ZNF263MA0528.1chr2:30548683-30548704CCCTCCTCCCTCTCCTTCTCT-7.41
ZNF263MA0528.1chr2:30548820-30548841CTCTCCCTCCCTCCCTCCCTC-7.43
ZNF263MA0528.1chr2:30548759-30548780CTCTCCCTCTCTCCATCCTCC-7.56
ZNF263MA0528.1chr2:30548692-30548713CTCTCCTTCTCTCCATCCTCC-7.88
ZNF263MA0528.1chr2:30548674-30548695TCCTCTCCTCCCTCCTCCCTC-7.97
ZNF263MA0528.1chr2:30548680-30548701CCTCCCTCCTCCCTCTCCTTC-8.04
ZNF263MA0528.1chr2:30548671-30548692CCATCCTCTCCTCCCTCCTCC-8.28
ZNF263MA0528.1chr2:30548788-30548809CCCTCCTCCCCTCCCTCCCTC-8.89
Number of super-enhancer constituents: 16             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_03192chr2:30548980-30568776TACs
mSE_03716chr2:30546867-30551907Cerebellum
mSE_03994chr2:30546808-30550239Cortex
mSE_04383chr2:30546801-30550631E14.5_Brain
mSE_04795chr2:30546977-30549960E14.5_Heart
mSE_05505chr2:30547247-30550216E14.5_Limb
mSE_06656chr2:30547076-30548765Heart
mSE_06656chr2:30548860-30549712Heart
mSE_07479chr2:30547425-30549779Intestine
mSE_07960chr2:30545267-30552235Kidney
mSE_08810chr2:30545244-30548828Liver
mSE_08810chr2:30548888-30549760Liver
mSE_09011chr2:30545254-30548822Lung
mSE_09365chr2:30547112-30549901MEF
mSE_10696chr2:30546901-30551838Olfactory_bulb
mSE_12429chr2:30545437-30549668Spleen
Enhancer Sequence
GGGCACATGT GTGGGTGGAG CCAACCCTGG GCTGGTGGTC CTGGGTTTCC TAAGAGAGCA 60
AGCCACGCCC AGCAAGCCAG TAAGCAGCAC TCCTTCAAGG CTTCTGCTTC AGCTCCTGCC 120
CTGGGTGCCT GCCCTGTTTG AGTTTCTGTC CTGACTTCCT TCCAGGACAA ACTAAGGACG 180
TGGAAGCAGA AGTCACGGAC GTGGAACCCT TTCCCCCTCA ACTTGGTTTT CATCCGTAGT 240
GTTTCATCAG TCCCAGCCGG AAGGCAAGGA CCAACCCCTG AGGTTGTTCT GACTGCTGCA 300
CACATACAAG GGGAGTACAC AAGACCATGA GCACTGGACC CCCAAGAAAA CCAAAGTGGG 360
TTCCAGGCCC ATCCTGGCCT TCTGGGGACT GCAGTGCAGA CCCTGGTGCC ATCCGGTTAG 420
ACCTCAGAAG TTGAGGCCAG AACTTTGGAA GATGTTGCAG TTGCTTGAAG GCAGGAGAGG 480
GACTGGAGGC CCTTATGAGG CAGAGCAAGA GGTGAAACAC AGTTGTCTGG TGGTGCTGTA 540
GCTCAGGGTG CAAGGCCCTG GGTCTACCCC TAGACATAAA GGAAACAATC AAGAAAAACT 600
CCACCCCATC AGGCAGGCTC TGGGGGTGCC TGCCTTCTCC TAGTCTTTGA TCCTGACCTA 660
TTTTGAGCAC CCCAGAAGTT CTACTCAGAT GGTGGGTCTC CTGCTGCTTG CTGGAGACCT 720
CTTCCCTCAG GAAGCTGCCA CAAGGGTGAT TGAGCTGTCA GTACAAATGA CAGGCTATTA 780
GGTCTGGAGC CATTTTGATC TGAGGTTGGC CAGGGTGTTC CTGTGTTCCT GTACATAGTG 840
GGGACTGGGG GATTCTGGGG TTGAGGGCTT TCTCTTGTTC CTCAACTGTC TCCGACTCTG 900
GTTAGAAAGG CACCTCCGCC ATCTGTCATC CCTCCCCCAC TCCCTTCTCC GAGGCCCGGC 960
TGTGACTGGG GGCTGGCGTG TCTGGTAAAC AGGCGGCTGG CAGGTCCCCA GGGCCTGTGG 1020
GTGACAGGCC TGGTGCTGGC ACCAACCCCA GGGCAGCATG CCGAGGAGGA GTGGAGATGA 1080
GTTCTGGGGA CCAGGGAAGA TTTCCTGCCA TGTCTGAGAG AGTCGTGGCT GTGTCCTGTC 1140
CCTGGCTCTC CAGACCTCCG TGGCCGCTAT GACTGTCCAC CCCTTCTCCA ACGCTTCAGC 1200
CCCAGCCTTC ACATCTTCCC TCCAGCTGCC TTCAGAGAAT TCAAGTCAAT ATCTGGTGTG 1260
AAAGGCTGTC GGGTTCTCTC TACCTGGGTG AGGCTAGGCA GCCAGCTCTG TGCCCTGGGG 1320
AGCCACACTC CACCACCAGA GAAACTGAGG CCAGAGGGCA GGTGGAAGTG GGGTGCTGAG 1380
AGCTCTTAGG ACTCCACCCC CAACCCTTCG GTCAGCTCCC TGCAGTGAGG GGCCGGGTGC 1440
CTTCGCCTCG GTTGTCTTAT CTGGGGAATG GGAGGGAGGT CAGGTCTGTA GGAAAGGGGT 1500
CCTGCCAGTC TTTCTCAGCT CCCTCACCTC CCCTGGGGGA GGATGAGGAG GGGCAGGAAT 1560
CTGTCCAGGT CGGTTCCCGG CTCCCCCTCC TCCAACACGG CGCTGCCAGT TCCCTCCCCT 1620
CCTCTCTCCT GCCTTCTGGC TGCCAGCCCC TCCCCACACG GCCCCAGACC CCAGCTGCGG 1680
TGTCTTTACA GCTCTGACCA GCCGCTCAGC CTCTCCGACT CCTCCCTCCC TCCTTGCTTG 1740
CCTCCCTCCC TCCCTCCTCT CCACTTCTCT CCAACATCCT TCCTCCTCCC TCCATCCTCT 1800
CCTCCCTCCT CCCTCTCCTT CTCTCCATCC TCCCTCCATC CTCTCTCATC CCTCCCCCCT 1860
CCATTTTCTC TCATCCCTCC TCTCCCTCTC TCCATCCTCC CTCCAACTCC CTCCTCCCCT 1920
CCCTCCCTCT TTCTCTCTTT CTCTCCCTCC CTCCCTCCCT CTCTCTCTCT CTCCCGGGGA 1980
AGAAAGGTCA CGGTGCAGCT GATTACTCAG AGCTCAGTTG CTGTAGCAAC CGGCGGGGGA 2040
AGTGGGACAG GCTGGCTTTG AGGACGCGCG AGGTCGGCCG CGGGCGGCTG GAGCCGGCGC 2100
GGGCCCCGGT GCGCGGGAGG CCGCCTGCAG CCCGGTTCTG CGCGCTGCGG CCCGGCTCCG 2160
GGTTGCGGTT TTAATGAGGA GCCCGCGCCC CTCCCGGGAC TGCTAGGAGA GAGTTTCTGC 2220
TCCTAGTCTC GGTTCCCCCG GCTCGGTGTA GGTATCCGCC CTCCGCCTGG GTTCTGCCAG 2280
CGCCTCCTTT CTTCTCTCCC AGCCGCGTGA GAGCAGCTGC CTCCCCCTGC GTGCGCCCAC 2340
CCACCCCACA CCAGCTTTAG CCAGGTGTCC AAGGAGACCC CAACACCCTG TCCATCCCCC 2400
TCAGCCTTTG TTATTACCAG GGAGACCCAG CAGGAGACAG GTGCACAGGG GCTGGCTTAA 2460
AGACCCACCG TGAGCGAGCC TGAACCTCTC TCTAAGCCCT GAGAGCCTAG AAGACTCGGC 2520
TGGATTGCTG GAGAAAGCCA GACCCCTGCT GTCCTTGGCT CCTCTCCAGC TAGCAGCCAG 2580
ATGAGCAAGG TTAGAAGAGA CTGGGTTAGC AGGGGTCCAG CCTTGACAGG AAGGGAAGAG 2640
GATCCAATCC CCAGCCTGTC ACCTCCACCT CCACCACATA CACACACACA CACACACACA 2700
CACACACAGC CTGGGGAAGT GACCAGGCCA CTTTAGGAAC CGGTTGACAT CTTTTTCAAA 2760
TGTTAAACTA TGGCTGGGAG GTGTATTGTC AGAGGTAGAG CATTTGCCTA GAATTAGAGG 2820
GAGCCCTGGG TTCAAATCCA GCATCACACC TAAAAATTAG AATACACAGT TATTTACCCC 2880
AATCATTCCA CTCCTAGGTA AGTGTGTCAG AGATAGGAAA ACCAATGTCC GTACAAAGAA 2940
GGGTCATGGA TGCTCAGGGC GCCACTATTG ATACAACACA AATCCCGGAA GCAGCCCAAG 3000
GTGTGCCCAC CACTCCAGAA GCTGCGGAGC ATGAGAGAGC ATAGCCTGCT TGCTCAGATT 3060
TCTCCAACAC TCTAGAAAAT GCTACCTGAT CTATGAAAGC AGAGTGCAGT TCTGAGGGTG 3120
CTGGGGGCCT GAGAAGGACT ACAGAGGGGC TCGGGAATCC CACTGGGCCA GGCTGATTGC 3180
TTCCTGGGTG AACAAAGGAA AATAGAGGTT CCAGCCGCAC AGGTCCCTAC TTGTACAGTC 3240
ACACAGGGAA GAGAGGCCCT AGCACGTGCA AAGGTCCAGT GGCCAGGGTG GGATCAGTGA 3300
GGGGAACATT GCAGGATATC CTGTGGCCCC TGTATGACTC TAGCACCCTT GAGTATGGTT 3360
TGCCTGAGTT TGTGCTACCC TGCTCTCAGG GATGCTGCTT GCTGGTCCTG GGCCTCCGAG 3420
TCTTACCTGG TAAATGTGTG CATTTAATTC TGGTTCTTCA GTTCGATTCC ACTGATCAAC 3480