EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM115-14327 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Neuron_cortical 
Coordinate
chr6:41506570-41513440 
Target genes
Number: 4             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 26             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXB1MA0845.1chr6:41508614-41508625TATGTAAATAT+6.62
FOXC1MA0032.2chr6:41508614-41508625TATGTAAATAT+6.62
Foxd3MA0041.1chr6:41513394-41513406GATTATTTGTTT+6.07
Foxd3MA0041.1chr6:41509793-41509805GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr6:41506990-41507002AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr6:41506994-41507006AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr6:41506998-41507010AAACAAACAAAC-6.32
HOXC11MA0651.1chr6:41513365-41513376AGTCGTAAAAT+6.02
KLF4MA0039.3chr6:41507643-41507654AGAGGGTGTGG-6.02
MIXL1MA0662.1chr6:41509818-41509828TCTAATTAAC+6.02
RELAMA0107.1chr6:41506602-41506612GGAAATTCCC-6.02
RFX2MA0600.2chr6:41506657-41506673AGTTGCCAAGGTAACC+6.01
RFX2MA0600.2chr6:41506657-41506673AGTTGCCAAGGTAACC-6.1
RFX3MA0798.1chr6:41506657-41506673AGTTGCCAAGGTAACC-6.02
RFX3MA0798.1chr6:41506657-41506673AGTTGCCAAGGTAACC+6.3
RFX4MA0799.1chr6:41506657-41506673AGTTGCCAAGGTAACC-6.01
RFX4MA0799.1chr6:41506657-41506673AGTTGCCAAGGTAACC+6
RFX5MA0510.2chr6:41506657-41506673AGTTGCCAAGGTAACC+6.6
RFX5MA0510.2chr6:41506657-41506673AGTTGCCAAGGTAACC-6.75
ZNF263MA0528.1chr6:41511304-41511325CTCTCTCTCTCTCTCTCCTCT-6.22
ZNF263MA0528.1chr6:41511215-41511236TCCTTTTCCCTCTCCTTCTCT-6.31
ZNF263MA0528.1chr6:41511322-41511343TCTATTTCCCTCCCCTCCTTC-6.41
ZNF263MA0528.1chr6:41511222-41511243CCCTCTCCTTCTCTCTCCTTC-7.05
ZNF263MA0528.1chr6:41511231-41511252TCTCTCTCCTTCTACTCCTCC-7.05
ZNF263MA0528.1chr6:41511212-41511233CTCTCCTTTTCCCTCTCCTTC-7.1
ZNF263MA0528.1chr6:41511234-41511255CTCTCCTTCTACTCCTCCTCT-7.49
Number of super-enhancer constituents: 4             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_01518chr6:41482507-41509867Th_Cells
mSE_02908chr6:41484401-41513857HFSCs
mSE_12460chr6:41507511-41508658Spleen
mSE_12806chr6:41506492-41510981Thymus
Enhancer Sequence
GTGCCCTCTT GTGGAAGAAA AGAGACATTG GGGGAAATTC CCTTTTGGGA ATATGATCTA 60
GAGAGGAGTG AGGGCTAAAG AAATCTCAGT TGCCAAGGTA ACCAGTACAT CCCTTTCCAA 120
CCATTCACAT CAGTCTCTTC CTCTTCTTCA TTTCCATCCT AGTCACTATT CCATTTTAAC 180
CTTTCTGTCA CACACACACT CCTCCTCTTT ACCCTCAGTC TCCTGTGTTT CTTATGCTAC 240
CATCTGTTTG TCTGTTTTGC TACAGAAGAG TAGAGGAGAG ACAGAAGTTT AAACTGGGAA 300
GTATAAATGA CAATACAACC ACTATCAGAC CTGGTAACAC ATGCTTGTTT GGATGAGGCA 360
GGGGGATTGC TTCAAAATTG AGGCAAGTGC AGACTACATA GTAGAAATTT GTGTCAAACA 420
AAACAAACAA ACAAACAAAC AAGCAACAGG ACGCAAGCAG CAGTAAAAAT TCCTGAATGA 480
ACATTTTCCA TATTAACTTT TACATTTGAT CTTAGACAAA ATGCTAAGAA CTTTTCTATA 540
TTAAATTCTA TCTTGCATAG CTATCTAATG ACATCTTGTT CCTCCTTGAT TGATGTCTTG 600
AGTATCAGCC TTTATAAACT TTCTAACCTC AGCAGAAAGA TGAATGATGG AGATACTCCC 660
AGAGGTGAAA TTAACTAATT GAGTTACATA AGATTCTCCT ACCTGGTATC AGATACAGAT 720
ACAGGTATAT CCCACTTCTC TCTGCCACAT ATATCCATGA GCATGCCCAG CGTACCTCAA 780
TAGTAATGTA GAACAAGTAT AGAGTGTTTA GACAAGAGTA GCCTGGTTTA AGGACGGGTA 840
TACAATATCC TACTACTGGA TACTACAAAC TGGAAATTTT ACTGTGTGTA GGCAACTCAC 900
AGGTTCTGCA TATGTGAGTC ACTGATAACG AGTTTAATAA ATGTCTTTGG TGACTTCTGA 960
CTTGAATCAT GTTGTTTTCC AGACTTCAAC TTGACTATCA GCCAGAAATT CAGTGGCAAA 1020
CCCCCTCCAC CCATCCCTAG TGAGGGTTCC TAGTGAGGGA GGAAGGACTA AAGAGAGGGT 1080
GTGGTTTTTG CACAGATGTC TGCCCCACCC TACTCAGTGT GAGACTCCAG GCACAGAGGT 1140
AGAAGCCAGA GTGGCTGAGA AGCAGCTTCT CCGTGCTTAG GATGAATTGG TCGTCCTTCG 1200
GCCTGGAAGC TGAGAGGTTC AGTTGCACCA CCGACTCTAC CTGGCCAACA GTAATAGAGT 1260
AGAAGAGTTG CTGGAGGGTG CCTCCTGTGG CCTGCCAGTA CCAGTAGAGG TTAGGGCTTG 1320
ATTTCCCCTT TATGGTACAC CCCAGAGACA GTGGGCTGCC CACAGCCTTG ATCTCGGCAA 1380
CTGGCCATTG ATGGATAGTC TGAGCACTAA CACCTGTAAA GAAATAGAGT CATTTAGAGT 1440
AGAAACACAC ACCTCTACAC ATACACACAC ACCAGCTTGC TTGCCTTCCC TCTGAAGGGG 1500
TTACATGTAA TCAGTCTCAG GGAGTATACT AGAAGAGCCA GGGATGAAAA ATGTTACAGG 1560
GCAAGGGGAG ACAAATCCTT TCTAAAAGAT ACAAAACTGA GAGTCAATAC TGAAAGAGTG 1620
TGAAATGCCC ATATCTCAGT AATTGGAGGA CTGTGGTCAA GAGAGGCAAG CCAGTACCAA 1680
AGAATCTACA CCTTTAACAG GTGGAGAGAT GGAAGCAACA ATTTGAAAGT AGGTTTTCAA 1740
CAGGGGAATG CACCCACCCA AGAACATGCC CAGGAGAAAG GCAAGGAGAG AGTACAGCAT 1800
AGTTCAAGAT GGTCTTTGTC TAGGCTTGTC TACTCTGCAC TTGTACTTCC TTTTCTAAGC 1860
CAGAGATGCA CAGGCCCCTC CTACCTCAAG ACTGGCTGCC AGAGTGGAAG TTTAGATCCC 1920
CTTGAGCTGG GGAGGAAATG AGGCTGGGCT TTCTTAAGCA GGTGGTGAAT CATCCCCACC 1980
CTCCCTGGGA ACCAGCTGTG CTCTGCGCTT GTTAGCATTA TTACACTCCT GCCTGATGTT 2040
CTGGTATGTA AATATAGTTA ATGATTCGTT ATTTATGGGC AAACAAGGGG CAACACTCTA 2100
GGTACTCCTG GAGACATCCT GGTGTCTTTG ACCATCAGAG CAACTATTGC TAGTAAAATA 2160
ACAAAAGGGG ATTTTATTTT AGTCAGTGCC AAGATATGTC ACCTACACTG TTTGAAAGGA 2220
AAGACATGAA GGCAGATAAC AGCTCAAGAG ATTTAGGTCT CTGGAGTTTT CAAAGGAGAA 2280
GAGTGTAGTT CTGAGTAAAG GAACCTGTTA TGTCATCCAA CAGGAGAAGT GCACATCCTC 2340
TTCAACCTTG GTAGGTAGGA CTAGAGACCC AGACAGGCAG AATTAATTAC TAAAGGAATC 2400
AAAGCTGGCC TGTGTTCCAT GTGCCTACTA AGGCCCATCT AGATCTATTT TATTTGTTCC 2460
TTTACTTAAA CAACATATTA CAAGGCCTCA CAATTAGATG GGACCAGGTC AATACTGTAG 2520
TTCATTCCTC TTGCTGTGTA GAAAACCTGT GTTAATTCTG AATCTTACTT GTCTCGTGTT 2580
TAAGATGTGA CAAATAATAC CCAGTAAGAA GGACTACAAC ACCAACAAAT GCCAAATGGC 2640
TCAAAGATAT GTTTTGCCCG ATACACAGCA AGCACTCTTA CAAACATTGC CTTTAAAGCG 2700
CAAGCAAACA GCCAAGACGC AGGGATTCAC AAGGGGGTAG ATCTGGCAGG TAAGAGCTGA 2760
AGATGCCAGA GACACAAGAA GTGTAATGAT GCTGGGCAGA GGGGGGAAGA TCTGAAGGGT 2820
AGTTGGTAGA GCTTCATTCC ACTGAGATGA GGCATAGCAC CCTGAGATGC TTGGAGGACA 2880
GCCAACTGGT CCCTTGGAAC CTCACTTGTG CGGTTCTTTG TTCTCTGAAG CATTCATTTA 2940
TAAACCAATT ATTCAATCTT AGATGTGGGA GAGTGGTTTA AAGTGAGGAC CTGGAAAAGG 3000
CAGCAGTAGG CGTGGCCAGC CAGGGAGGTT GAGCCTGAAG CAAATGAGCT GTTTGAAGTG 3060
CTTCATCACT TCATCGGGGT CTGGTGACCT AATGCATTTG TTACTGATGC TCTTGCTTCA 3120
GAAGCATGAG TTAAAATTGG AGCTATTCAC TCTGATGGCT TCCGTTGCAG CACTTTCCAG 3180
TTGCTTACAC CGGAGTGCCC CACATTTATG GAGGGAGTGT TTTGTTTGTT TGTTTCATCT 3240
TTTCTAAGTC TAATTAACCC TCTTACAATA TTTATTTTAC TGAGAAAGCA AGTGATACAC 3300
ACAGTGCAGT GCGCATGCAA TAAACACTTA GAAGTATGAT GAAAAATAGC TACGGGCAAT 3360
GCAGGAACCT AATGCTGTTG GAAAATTGCT CAATCTCAGT TTGTATAAAT CTTTTGCTAG 3420
AACGTGATGA AATATATATG CAAGCCAGGA TTTGGGGGAC TGGACTGAAG ATAACATACA 3480
CACATACTGT CTTTGACTGC CTCTGTTGTT TATGCCACTC TTCTTTTTTG TTCCTGAATT 3540
AGTATTTTTT AGGGAGTGGG ATGGACTCCC TAGAAGGCCC TTAAGTGAGA ACTAAGCACA 3600
GAGAAGAGGG AAGGTAGGCA GTGGCATTAG GAAAAAGTGA AATAACTGTT CTTGCTTTCA 3660
GTGGGACTAT ATCGTATTTT CCTTAGGCTG GCAGGTTTAG GTGCCATCCT AGCCCATGAT 3720
ACCTAATATA ATCCATTGGT CACACTGGCT CAGTGTCATT GCCAAGTGTA GAAACAACAC 3780
AATCTTCCTC CTTCGGTGTG AAACAGCAGA GTGGGGGAGA GGAGCCGCAT CAGTCAGATC 3840
AGAAATACCA GCTGGCTCCT AAATCCTGAT CATTATCACA ATTCTAGCTT GAAGCTCCTT 3900
CCATATGGCT GATGTCTTAG GGGAAAAAAA AAGCTCTCTT CCTTCTCCAT TACCATCTGC 3960
AATGCTGCTG ATTCATTCAG TCATTCAAGG CATTCATCTG TTGATAGGGA TGTAATCCCT 4020
GGGCTCTGTA GCTGCAAAGC TTTGGAAGGG AAGGGTCTGG CCACCTTTAG CCCCAATGAG 4080
GTGTTGACTA AACTGGGTAA TCAGAGACTG GTTTGCCCTG TGGCCTGCTC TCTCCTTAAC 4140
CTTTCAAGGC ATTTGAAGGT GGGGGCCCAT TTCTCTGATA AACCTCCTAT GAAATTCCTT 4200
TGCTACCTTC TGGGCCTTCT TCTACCCCTC CCTATGCTAG ATTTGATTCT AAATTAATTA 4260
CTACAGATCT GATAAGCTTC ACATTAAGAG AATGGCTGAA TTAGTCATCT TCTCATTATC 4320
ACTTATACGT TTTATGTCTA AATAATAAAC TTGGGAGGCA TTTGTAATGT CTCTTTTTTC 4380
CTCTACAAGA GTTAAAAATT ACTACAGCTT ATGGAAAGGA GTGGAGAGTC AGTCAAAGTC 4440
ATGTGTCAGA ATTCCTTGTG CCTGTTGTGG CTTGCATATG CCTTCCAAGG CATATGTACT 4500
AAAAACTTAA TCACTACTTC AATAGCGATA AAAAATCCTT CAAGAGTGAT TAGAGCATGA 4560
AGGCTTGGCG CTTAAGATGG ATTAATTCTG TTATGGTGGA AGTTCCTTAA AAAGATGAGC 4620
TTGACATGTT CTCTGCATCT CCCTCTCCTT TTCCCTCTCC TTCTCTCTCC TTCTACTCCT 4680
CCTCTATCTT CATACTCTCT CTCTCTCTCT CTCTCTCTCT CTCTCTCTCT CTCTCTCTCT 4740
CTCTCTCTCT CCTCTATTTC CCTCCCCTCC TTCTCTCTGG TTCTTACTGT TCTTCTCTTT 4800
TCCCTTCCCC TCCTATTTTT CTCCTTGCAC TTCTACCATG AAAGAGCACA GCAAGAAGGT 4860
TTTCTTCTAG ATACCAGACC TTTAATCTTG GACTTTGCAA CCTCTGGAAT AATAAACAAA 4920
TAAATTTCTG TGCATTATAA GTACTTGTTT GTATTTCCAT GATAGCACCA CAAAATACAA 4980
TACAATAATG GCCTAATGGC CTTCCTTTTG CTTATAGGAG CCCTAACCAG GTAAAGTTTC 5040
GAGAGAGAGA GAGAGAGAGA GAGAGAGAGA GAGAGAGAGA GAGAGAGAGA AGATAAAATT 5100
AGAAGCTCAA TCTTGAAACC AGAGGAGAGT GGTGATTATT TCCTGGGTAG GGAAAAATGT 5160
CCTATGCCCT GACATGTCAC ACTGGCTAGA GCCTGGAAAG CAGACATGCC ATGTGGTGAG 5220
TAGAATGGCG GCCTCCCAAA GGCGTCTAAT GAAGAGGTCA GGTCAGCCAT TAGAAAATTC 5280
ACAGGAGCTC ATAGACACAT TCTGAGTCTG TTGGCCACCC ACCTCATTCC CTACAGACCT 5340
ATCAGTTTAA TAAGTCACAC TGTTCTGCCA ACAATATTGT GCCTAATGGC GGTGGCCCTG 5400
AGAACTGTAT AAATTCTCGC TTGGATGAGC TGCGTGGGGT CGCTATCTTC CTATGTGCAG 5460
AATGACCCCA GTATGCTGGA TTAAATAAAA TCCCTATGGC TTTTGCATCG ATTTCAGCTC 5520
CATATGGTTC ACTCATGGAG TCCCTGGTAA GCTAAGGCTC AACAGTCTTA CATCTACACC 5580
CTAAATCCCA AGAACCTGCA CATATACTTG TTTACGTGAA TATGAAAGAA GAGATTAAGC 5640
AGTCTTGTGA GATTGCCTTA AATTAAGCAT CTATCCAGAA TTTTCTAGTA TGTCCAATAT 5700
ACTCAATCTT TGAACATGAC TGAGAAAATC AGGGGAAAAA GAAATGCAGC CAAGGACGGA 5760
GGGTAAGGGG GTGTTAGACT ACAGGCATTG AAGATTGGTC TGAGCTAAAG ACTGCAGGTG 5820
GTTTCTAGAA TGTGAAGAAG GTTTCAAAAT AGCCATCAGA CTGGTTCTAG GCCTTGGACA 5880
GCAGGTGGAG CAGACAGCAG TCCCTGCCAG AAGAGTGAGA AGCCCCAGCC ACCAGAAGCT 5940
ATGACGTGTT TTCTTAGGCA GCAATATATA AAGAGAAACC CAAACCAACA TCATATGAGG 6000
TAGGATAGAA AGACAAGGAA AAGTAGGAAG ACGTGGGAAG AAAATGAGCC AGCCCCTCAT 6060
TTGGGGGTCA GTGATACCTT CTCACCAGCT TAGAAGCGAG AGTTCCAGCA CAAGTAGCAT 6120
TTGATGGGAA GGCGTCTGCC ATAAAGCATT TGTTTCATAT CTAAATATGT TATGCTAAAA 6180
TAACAGCGCC CTAGGCTGAT GGCCTGAATG TATGTGACTT GGATAGTAAG GCCTTATTCT 6240
TGTCTCATAG TTTCTATGAG TCTCAAACAA ACCTTGTTCA CAGTGAAGCC ATTCTAACTT 6300
CCTGCATCTC TGTGGCCTAA ACATTTACCT CACCAACTGC AATTTTGTCA CCACCATGGA 6360
ACTGCTCTGT CATTATTTAG TTAGTTTCCT TAGAAATAAT TCTAAGAGCT TCAAAATCCA 6420
ACAGAATAGT CTTATACGCG TTCTCACGCC CGGCCAGGAA AGAACACAAC AAACCAGAAT 6480
CTTCTGCGGC AAAACTTTAT TGCTTACATC TTCAGGAGCC AGGAGCGCAA ACCCCCAGCC 6540
CCAAAAGCGA AAGCCACCCC AATTACATCT TTAGGAGCCA GAGCTCCGGC GCGCCAAAAC 6600
GCAGAGCGCG CTCTATTGTT TACATCTTTA GGAGCAAGCG AGCAGGCGCC AGAGCCAGAG 6660
AGATGCCAGC GAGAGAGAAT GGCGGAAACC CCGTCCCCTT TAAGGAGGAG TTATCCTTCG 6720
CTTAGGACGC ATCACTCCCT GATTGGCTGC AGCCCATGGC CGAGCTGACG TTTACGGGAA 6780
AGGCAGAGTA CAAGTAGTCG TAAAATACCC TTGGCACATG CGCAGATTAT TTGTTTACCA 6840
CTTAGAACAC AGGATGTCAG CGCCATCTTG 6870