EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM115-12421 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Neuron_cortical 
Coordinate
chr4:127316250-127319690 
Target genes
Number: 1             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 11             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxd3MA0041.1chr4:127316303-127316315GTTTGTTTGTTT+6.32
RFX1MA0509.2chr4:127317571-127317587CGTTGTCATGGAAACT+6.53
RFX1MA0509.2chr4:127317571-127317587CGTTGTCATGGAAACT-6.53
RFX2MA0600.2chr4:127317571-127317587CGTTGTCATGGAAACT+6.41
RFX2MA0600.2chr4:127317571-127317587CGTTGTCATGGAAACT-6.47
RFX3MA0798.1chr4:127317571-127317587CGTTGTCATGGAAACT-6.5
RFX4MA0799.1chr4:127317571-127317587CGTTGTCATGGAAACT-6.74
RFX4MA0799.1chr4:127317571-127317587CGTTGTCATGGAAACT+6
RREB1MA0073.1chr4:127319637-127319657CCCCCCACCACCCCCACTGC+7.22
ZNF263MA0528.1chr4:127317446-127317467CCCCCCTCCCTCTTTTCCTTC-6.79
ZNF263MA0528.1chr4:127317460-127317481TTCCTTCCCTTTCCCTCCTCC-7.13
Enhancer Sequence
TTTTTGGTTT TGGGGTTTTT TTGTTTTGTT TTGTTTTGTT TTGTTTTGTG GTTGTTTGTT 60
TGTTTGTGAT GGAGTCTCTA TGTAGTTCTG GCTGTCTTGG AACTCACTGT GCAGACCAAG 120
CAGGCTTTGA ACCCAGAGAA ACCCACCAGC ATCTTCCCAA ACTGGGACTG TATTATTTTA 180
GTTATTTTCA CAATTATGTG AAACAACCAT CATGTTTGTT TCCTTGTTTC TCAAGACCAG 240
AAAACTGAAG TTTGGGTGGT TAAGAAATTT CTCTGACTGT ACGTGGATGA CTGGCCATTC 300
GGTAAAGTGC TTGCCTTATA GTATGGGTTC CAGCCTCAGA ATCCATGTAG AGAAGCCAGA 360
GTGGTAGTCT GTGCCAATAA TCCTGGCACT GGGGAGGCAG AGACAGGTGG ATCTGGGGGC 420
TCCATGCTCA GCAGGTCTAG ACTATTTGGC AAGCTCCAAA CCATTGAGAG ACTCTTGTCT 480
TGAAAAACAA GGTAGTAACT CTGGACGAAT GACATCTGAG GCCGTCCTCC CACCCCCTGT 540
CTATTTGCAC ACACACACAT ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACCC 600
CTAGGTGACT GAGGCAGGAG GATTGAAAGT TCTGGGCTAG CCTGAGCTAT TAAGTGAGTA 660
TAAGGTTAGA CCCTGTCTCA AAATACAAAG TATCAGAAGG GCTGTGGGTG TTGCACAGTA 720
CTGGAGTGCT TACCTAGCAA ATTCAAGGCC CTACCTTCAG TCCTCAGTCC TCCAAGAAAC 780
AGATTGCCCA GGCCCCTGGA GCCAGAAGCA CATAGAATTT CTCCGATTCT ATAACTTGTT 840
CTGGACACTC CTTGCTGTTC CACACACAGT GGCCAGCAGG ACATGAGTGA CTGGAGCACT 900
GGCCTTCCGA AGCCAGGTCT GTGTGTTCCA GACCTGGTCA GCCATTGGAT GTGGGCAAGT 960
CACAGCGTTC AAGGATACAG GCACTCCTCA TGTTCCTGGA CTGTGAGATT GGGATTATGA 1020
GCAATGACTT TCCTGTTCCC CATTTCTTCT TCTTGATCCT TCCTTCCTCT CCATACACCT 1080
CTCCTCAGGC ATCCCTCTTG CCTTTTCCCC ATTATCCTCC ATTCCTCAAC TTCCTGACTT 1140
CCTTGTCCCC TCTTCTGCCC CCTCCCTTCC TCTGACTCTC TTGTTCATTC TGTTTCCCCC 1200
CCTCCCTCTT TTCCTTCCCT TTCCCTCCTC CCATCTCAAC TCCCCTATCA CCAGTATTCC 1260
CCCTCCTTCA TGGCCTCTCC CATTTCCCCA ACCCCCTTGC CTCTAGAGCT GTGCTGCCTG 1320
CCGTTGTCAT GGAAACTTCT CAGCCGGTTG CAGCCTTTCC CCAGATCTCA GCTGGCCAAA 1380
GACCAATAGG AGAAGTCTAA TGAAGTGGCC CCAGCATTCC CTTCCTCTCT TGGCCTCACA 1440
AAGACCTCAG GAGCCTGGTG CAAAGGCCTG AGCCATGTGT CACTGGAAGC GTGGACTATA 1500
GTGACAGGAA ACATTATCTA GCGCTCAGGG GCAGGCCTGG GCACAGAACT GGGCACAGTC 1560
ACCTTCACTG GCACTGTCAC TGCCACCCAG CAAAGACTCT ACTGTACTTT TGCGCACGGT 1620
ACTGCTCACA AAGAGCCACC CCGTCTCCTG GTCCACACAG AGGCCTCTGT GAAGCTGAGT 1680
TGAGCCTTCC CTGTGGCTAG CCGTCAGCTT GTAAACCCCA GGTTTCCTTT GCTGGAGCTT 1740
TGCCTCAGTA AAAGGGGTTC CAACCCGACT TTGGGGTCTC TGCTTGCTCC CTGTAAGAGG 1800
AGGGGCGCTT TCATACTGAA CCTGTCATGT AGAGGGGTTG AGACGACGTG GCAACCAAAA 1860
AAATAGATCC AAAGAGCTGT GTGTGCACAG GTGGCTTCTC CCACCCACAG GAAAAGAGAG 1920
CCCAGCCCAC AGGCTGTTCT TCCCTGGGGA GAAATGTGTT CCACTGGGCT TGCTCTCTGC 1980
ATCTGCTACA GCCACCCACC AGGAACAAGA AACTCAGCAT ACCATGGCCC TGCTCCCCCC 2040
GCCCCCACCC CAGACTTCTC TGGGCCATCG TTATTTTGAT TTCAGTTTAG AGAATATATT 2100
TAGATCACTA ATTACGAACA AAAATGCCCC AGCTCTACTT TACGACCAAA TGTGCTACTG 2160
CTTTCTAAAG TGGTGGGCTT GAGTCATGCC CCCCTGTACA GTCCACCACA GTAGAGGTTA 2220
CCTAGTCCGT CCCCCCACCC TCGAGACCAT GTCTGCATTA AGCAGCGTTT CCTGTGGCCA 2280
CATCTTCTTC CGGATGCTGT CAAACCCCAT GCCTTATAGC AGCATTTACC CTCTGCTCAT 2340
CTCATGTGAG GGTTGCTGGG CCATGGTCAC CGTCCTTGGC TCTCTGGGGG TTCTGCTGGG 2400
CTTGGCATAG CTCTAGCAAC CAACCAGGTA TTATTCTGGA CCCTCGCTAA AGGAGAAGCG 2460
CTGCAGCCTG CTGTTCTTGT GGTGGTGGCT GCAGCTTGAG GGAGGAAGAG CTAATCCTGG 2520
AAGCATGCTG AACTGAAGCT GGACTAAGTC CTGTTTGCTT GAGCCCTGGA GGGGAGCAGG 2580
GAAATGGCTC AGTATGCTGC GAGAGAGCAG GATGCAGGAC TGCTTACAAA GCAGAGGAAA 2640
GGCTTAGGAA CAAAGAATAG ACAGCTACGA GTCCTTAATG TCCGAGAATA GATTGAGTCT 2700
TTATCTAGGA CCTTTATTCT CCAGTGATTA CCTGAAATAA AAGTGTGAAG TCAGCTGGCA 2760
TGGGTGGAGA GCTGAGGTTT TCAGTTTGTG AGCTAAGTGA CTTTGGTCCA GGGAGTGATC 2820
TCCAAGCTCT GGTTTCTGCA TAGCAACTGG TTGTTATGGC AATCTCCATG TGAGGCCCAG 2880
GACTATGCAG GGCCAGGCAC ATAGTAGGTA CTCAGCAAGT CTCAGCACTA TGGTGTGCAA 2940
ACGTGAATGT TATTTTCATC CCAATAAGTC AACCATCGAC AGCGAACACA GTTATTAGCA 3000
CAGGTGAACG GAGAAAGCCC TTTTCCAGCA ACATTAACAA TGGACCTCTC CCAGCTGCCT 3060
GCTGCTTTCT CCTCCTTACC CTAGTGGCTC ACAGCACCTG GCCAGGTGAG GGCTGAAGCC 3120
GACAGCAATC ACTAGTGACC ATGCATAGGG CTCCAGCTCA TTCGTCTTCA CGAGGCTACA 3180
AGCACAGTCA CCCCTCGATA TCTGCTGGTG TTGTGTATCT ACAGAGTCAA CCGGAGACAG 3240
GTGAAAAATA TTTTTCAAAA CCTTGCATCT TGGAGTCACG CCATGAGAGA AGCGCAGCAT 3300
GCCTCCAGGT TGCTCTGTGT CTTCCCGGAA TAAACTGTTT CCTTTCCTGT CAAAACATTG 3360
TATCCGTATC AAGCATGCAC AGACACTCCC CCCACCACCC CCACTGCCAT TCCCTAAACA 3420
ACACAGTGTT GTAAAGCTTA 3440