EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM115-12033 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Neuron_cortical 
Coordinate
chr4:56655760-56658220 
Target genes
Number: 1             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 14             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxd3MA0041.1chr4:56656531-56656543GAACAAACATTC-6.14
NEUROG1MA0623.2chr4:56656237-56656247GACATATGTC+6.02
NEUROG1MA0623.2chr4:56656237-56656247GACATATGTC-6.02
RFX1MA0509.2chr4:56657094-56657110GGTCACCATGGTAACA-6.42
RFX1MA0509.2chr4:56657094-56657110GGTCACCATGGTAACA+6.43
RFX2MA0600.2chr4:56657094-56657110GGTCACCATGGTAACA+6.48
RFX2MA0600.2chr4:56657094-56657110GGTCACCATGGTAACA-6.57
RFX3MA0798.1chr4:56657094-56657110GGTCACCATGGTAACA+6.6
RFX3MA0798.1chr4:56657094-56657110GGTCACCATGGTAACA-6.72
RFX4MA0799.1chr4:56657094-56657110GGTCACCATGGTAACA+6.35
RFX4MA0799.1chr4:56657094-56657110GGTCACCATGGTAACA-6.41
RFX5MA0510.2chr4:56657094-56657110GGTCACCATGGTAACA+6.32
RFX5MA0510.2chr4:56657094-56657110GGTCACCATGGTAACA-6.51
ZNF263MA0528.1chr4:56657624-56657645TCCCCCTCCTTTTGTTCCACC-6.02
Enhancer Sequence
TATGTGGGAG GAGAGGGGAG TACTACTGGG ATAGAAAGTG AATAAATAAA AAAGAGAAAA 60
GAATGAGACC ACCCCACTAT TACTGGGACT GAGGGACACA GCGTTAATGA GCATCCACGG 120
AGGTCTTGGT GGAAGAACAA AACTCTCCTA AGGGTACCAG CTGCTCAGCT GTTCTGTCAC 180
GCAGTGCAGA GGCTGGAGAG ACAACTTAAG GACAGACCCA GGAAGGCACC AAACTTCCCT 240
TGGAAACACA GGGGACTTAC ATAATGCTTC TGAGCACACA AGAAAGGCAC TTAATCCTCC 300
GAAATCAGAG GCCAGCTCCT GGCAGTCTGA GACAGAGGAC AGAATTCCTG CCTTGAGGGT 360
CCTCACCTGC AGAGGGTCTA TATTGTCATG TGTCTTTCTT TAAACAGTGC CCAAAATGCC 420
CATGAAGCAC AAGTTTACAC AGCTGTGCTC AGGTCATTTT CCTTCAAAAG GGGACCTGAC 480
ATATGTCTCC TTTAGCTATG GCACAAACAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAGAA 540
GAAGAAGAAG AAGAAGAAGA AGAAAAATCT ATATCTCACA CTGCTAGAAA ACCCAGAAAT 600
CCAGAGCTGG TTTCCAACCA GGCCTGTGAG AAGCAGAGAA TATTCTGGGC TGGGAAAAGA 660
GGAATTGTGG ATCATAGAGA TGCTGAGGAG GGTTGAGCTA AAAAAAAAAA AAAATTAAGC 720
AAAGCATAGC TACTGGAGGC ACACACTCAG CTCAAGGCAA GGCCCCAAGG GGAACAAACA 780
TTCTCTGTGC CATAAAGGAC AGAGGATGGC AGAAGAGACA TTTGGAAGGC AGCCAGAGCA 840
CCTGCCACCA TGTGACACAT GTAGGAATAA GAGACTTCCC CGGAGGCTAC CAGATCCTAG 900
GTGGGACTAA GGCTCAAACT TTGAAAAAGG TCTAGGAGAC CAAATGTTTA GTTGGAATAT 960
AAGTGTGGCA CCAAATGAAG ACCTCCAAGA GCCTATGGCT GCATTCTGAG TTAAGAGAGG 1020
TTAGACCCTA TGCAGAAGAC AGAAGAAAAA AGGTCTATGA TTCGTCCCAG GAGAAGCTGT 1080
AATGGCAGGG ACAGGGTTTG TTTGGCCTCA CAGGATATCC TAACCAAGCA ACAGCAGCAT 1140
CCAGCCTCTG AGAATGACGT CCTCTGCTCG TTCCTGCCCT TCCCTGAGTG TGTCTGGGCA 1200
TGTTAAAACC GTGACGTGAG CTACTTGCCA CACGCAAGAA GTGAGGTAAC GGGAAGAAGA 1260
AACCATGCCC GTCAGACCGG AGTCCTCAGC ACAGTTACTT AAAGCATTGC TGGTCATCAA 1320
ACTAACAGGC CACTGGTCAC CATGGTAACA GCAATCAAAA CACCAATTCC TGCTTTCCTG 1380
AGCTGGTGTT GAATGACGAT TGTGCTGCAC AGAGGAGCAA CTTAATCCCT CAGTGCACAA 1440
TAAACAGAGT TGCCAGCTCC AGCCTCGTAG AAGATGGAGA AAAATAACTT GCGAGCGGAC 1500
AAAGTACATT TCTCAGGGTG GATGCATGAT TCGAGCCAAG AACTCAAGGA GGGAATCTTT 1560
TTGCTCAGCT TGAAGTCATT GCTGTCTCTG AGCCGCTTCC CCCACCCATC ACAGTTTTTA 1620
GGGAGGGAGA CTGTTACGAC TGCTTAAGAA ACATGATGAA TTTGTTTTAA ACCCCAGATA 1680
TGTGCATCTC TAGCCTTCCT GGCAAAATTC AGACAAAAAT TTAATGACGG CTGTGAAATA 1740
CTCACATTCG AAGTAGATCT GATAATTTTC CTTTATGTCA CCAAGGCAAC ACAGAATTCA 1800
TCTTCATCTC TTTGGAGGAT AGTGATCCTC TCCAAATGCC TGATGCAAGC GTGAAACACA 1860
AGCCTCCCCC TCCTTTTGTT CCACCCCTAC AGCCGAGTGA AGCCAAAATC CCTGGATCTA 1920
GGCCCATTGG CTGCCAAGTC ACAGCTGTCT TGGGTTTCCT CACTCCAAGG TCACTGGGCA 1980
AAATCGTAGA GACCCTGGGA TGCACCATAA ATCCAATTCC TCTTTTCAAA GCCTATTTCC 2040
TTCTCTTCTC CTATAAGAGT CTCAGAGAGG TACATTCTAA TACAACAAAG TACACAAGGA 2100
ATCCTGCTTT AATTCCCTTC TCCACTCTAT TCCATCAGCA GATCAAGGGC CCAAGACTGG 2160
CAGATGCCAG TTGCTACATC TCACTCCAGA TCTGCATGGA GAATGGAGTA AGTGGCTGGG 2220
TAGACACCAG TCTGAATGCC CTGTGGTCAG CTGTGTACCT TTGGACTAGC CAGTTCTGGT 2280
CAAGGGCAGA AGCCATTTGG AACCCACAGA GCTATCCAAT CCCAAGTCCA GTGATTCACT 2340
GAGTCTCTCA AGAAACCACA GTCTTCCTTG AACTATGACA CGGTGTAACC TTTGGTTGTG 2400
AGTGTTTTGC CACAGTTTGT TTCTCTAACT TTAGCACAGA GATAGTATCC TGTGCAGAGG 2460