EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM115-11304 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Neuron_cortical 
Coordinate
chr3:89885020-89889980 
Target genes
TF binding sites/motifs
Number: 17             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
IRF1MA0050.2chr3:89885961-89885982GCGAAGTTTTACTTTCAGTTT+6.16
IRF1MA0050.2chr3:89885967-89885988TTTTACTTTCAGTTTTGAATT+7.09
NR2C2MA0504.1chr3:89887390-89887405TGAGGTCAGAGGGCA+6.95
ONECUT1MA0679.1chr3:89888246-89888260TTTATTGATTTTTC-6.43
ONECUT2MA0756.1chr3:89888246-89888260TTTATTGATTTTTC-6.88
ONECUT3MA0757.1chr3:89888246-89888260TTTATTGATTTTTC-7.58
RFX1MA0509.2chr3:89888101-89888117TGTTGCCATGGGAACT+6.08
RFX1MA0509.2chr3:89888101-89888117TGTTGCCATGGGAACT-6.1
RFX2MA0600.2chr3:89888101-89888117TGTTGCCATGGGAACT-6.3
RFX2MA0600.2chr3:89888101-89888117TGTTGCCATGGGAACT+6.43
RFX3MA0798.1chr3:89888101-89888117TGTTGCCATGGGAACT+6.26
RFX3MA0798.1chr3:89888101-89888117TGTTGCCATGGGAACT-6.37
RFX4MA0799.1chr3:89888101-89888117TGTTGCCATGGGAACT-6
RFX5MA0510.2chr3:89888101-89888117TGTTGCCATGGGAACT+6.54
RFX5MA0510.2chr3:89888101-89888117TGTTGCCATGGGAACT-6.59
RarbMA0857.1chr3:89885700-89885716TGAGCTTTTGACTTTT-6.03
SPICMA0687.1chr3:89885356-89885370GAAATGAGGAAGTC+6.15
Number of super-enhancer constituents: 1             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_07586chr3:89882713-89888321Intestine
Enhancer Sequence
TTTATTGCTC TTGCTTTTGG TGTCTTTTCA ATCTTTTGAT GTTCATTTGA GGAGTAACTA 60
TTTTTGAGGG GGCAAAAGGG ATGAGTGTGG AAAAGGAGAC CACAGCTCCC TTCCAAGATA 120
ATGTTTTAAC TTTATTAAAA TGCTTTATAA CTGGGCATAG AGAGGACAGC TTGTCTTTCC 180
ATAGGCGTCC AGTATGGTTG TTTTGAGACA GGGTGTCCAT TTGCATTCCC AGCAGTCCTG 240
CATAAGCCTC CCAAGTGCTG GAATTACTGT GGGCTTGCTT GGCCACTCCT GGCATGCCTG 300
CAACTTCTCC TTATCAAGTC TAGTGAGATT GCTGTAGAAA TGAGGAAGTC TTCAGAAGGG 360
AAAATGGAGA GTGTGGTGGA GAGAATTGGC CATGTGCTGC AGAGTGTTAG GCTGATGTCT 420
AAGTGTGGGA GTGGTTTAGG GTAGGTAGGG TGTGTCTGTC TGTCTGTCTG TCTGTCCCAG 480
TTTGGTCCTT TTCCTTGTAG GCACATTTGG CATTCACTCC TTTCTTCTGT GTGATGTCTC 540
TGGGATATAA ACCACAGGAG GGAGTGTTTG CACATGTTCA GGGCTTACCA AATGTGCTTA 600
TTTCACAGAA GTCTCCTGAG GAAGTCCTCG GAAGGAGGAA GTAGGGTGGT AGTTAAATAT 660
TGATGAAACT AGTATCTTTG TGAGCTTTTG ACTTTTTGCA CTCTCGAACT TTGAGCCTCT 720
ACTGAAGAGT CACAGAAGGA AGGGGGATGC TTGAGTCACC TCTTCTAGGG CCACTGGAAT 780
GTGGGTTTTG TAGTCTCCTG CCACAGTACC TGGTGGGATC CTTTATTGTG ATATTAGTAG 840
ACTGTCTTTT TCCACTTTGT GTGGGGATCC AAGTTGCCTT TGTTAAGCTA GATGTGAGGT 900
TCTGAGGTAG GACAGGCCAT TTAGAGTATA GCTTGCTGCC TGCGAAGTTT TACTTTCAGT 960
TTTGAATTTC CTTTGTATTT AGTAAGAGGG TTCTATTGTT TTTTAAGCTG TGCTGGGATC 1020
AGACTTGGGC CTTACCCCAG GCAAGCTTTC TACCATTCAG CTACACCCTG CTTTGTCTAG 1080
ACTTCAACAG GTGACAGTGC AAAATTAAGT GCGCTTATTG TTAGCGATAA AAAGATGCAT 1140
ATTTAACATG AAAACTTACC TGCCCCGGCT GGCCTTGGGT TCTGGACTCA ACCGATCCTT 1200
GTGCTTTGCC TCTGGAATAG TCTCCTCCGG GGTTCAACTG CCAAGCCTGC GTTTCCACTG 1260
TTATCTTTCC TTCTTAGTAC TAATTTTATT CAGAAGTATG GGTGTCTGAC CCCCTTGAGC 1320
TGGAACTGCC AGTACTTGTG GATGCAACTC CCACCCCACC ATGTTGGACT GGTCCCAGGA 1380
GCCAAGGTCT GCAAGAGCAG CTCTCCCTAC TGAGCCATCC TGCCAGCCTC ACTGTAACCA 1440
TTTTTAAGTG AATGGTTCAT CTTACCCTTT AAAAAATATT TCGCCGGGCG TAAAAAAAAA 1500
AAAAAAATTT CTCCTGCCAG GCAGTGGTGG CACACGCCTT TGATCCCAGC ACTTGGGAGA 1560
CAGAGGCAGG CAGATTTCTG AGTTCGAGGC CACCCTGGTC TACCAAGTGA GTTCCAGGAC 1620
AGCCAGGGCT ACACAGAGAA ACCCTGTCTC TGAAAAAAAC AAAATCAAAC TATACACACA 1680
CACACACATA TATTTCTCCA AGTTTCCCAT AGTATTTTTG ATTTTTCCTT TTGTTGTGCC 1740
TTAAAACATT GGAAATAACA CCAAGGGAAG AAGAGTGGGC TTTGAACACA GGTTCTAACT 1800
TTGAGCCTAA ATTCTTGGTC TCCGAAGGAG GGGTAGGATA TTTGGGTGTT TGTTCCTCTC 1860
TTTGTTAGAG GCTTGGATTG GTTTGGCTGC TGCTTGCCTT CCTCTGCCCC CCATTTCAGA 1920
GCACACTGCT CCAGGAGAGG CAAACAACCC TTTGCTCTGA GTGCCTCTGC TAGACTCCAC 1980
CTTTGTTGAC TCTGGGACGG CAGATAACTT CAATTCCCAG CTTTCCTGCC CCTTGGTAGA 2040
ATTTCCCCAG GACAAGCTCA CTGGGAGAGG CATGCATGGG AACACAGGGC ACAGCAGTCC 2100
TTTCTTCAGC ATGGGCCTGG CTTTTCTAGT ACTGTGTCTA TCCTGAATTA CACCTGTGAC 2160
TTTTATATCT AAAACGAGAA ACCCCAGTGT GGCAGAGTGC CAGATTTAGA CTTCTCCCGT 2220
CTGTCCTTGG CCCTGCTCTG TCTCTGCCTA CCAGCTCTCG CAGCTCCTTA CATTAAGGGA 2280
TGTGGTATGC TTTGGGCCTC TTTTCACATT AAAACTACTA TCGAGTATGC ATGTAATGTT 2340
TGTGGGTCGT ACACGCGCCA TAACGTGTGT TGAGGTCAGA GGGCAACTTT GTGGAGTCCC 2400
ATTTTCACCA TTCTGTGGGT TCAGGGGATC AAATCCAGGT TGTCAGGCTT GCACAGGAGG 2460
ACAGCCCACT GTAGCATTTA AACTAAAACT TCTGTCATAG ACAAGACTGC CGTCAGCCAT 2520
CTTTTAATGT GACCAAATGG CTGCTGCATT CCACCACCGA ATTTTGCTTC CTGAACAATG 2580
GAGACTCCTG TTACTGTTGA ATGGAAGACC TCACACTGTA GCCTCTAAAT TGTGGGGAGG 2640
TAGGCAGGCT CTACTGGGCA TTAGGTGAAA TCTAGAATAA TGGGGGAAAA AAAAACCCCA 2700
AAACAAAAAA CCATAGAGTG TAGTGTTTCT CAAACTCAGG CTAGCCTGCC CCGGGAGCTG 2760
GTGTGGCCTG CTGACCTGAG CGGTGTGTGA GCTGTCTTCC GTATTCCTCT GGAGGGAGTA 2820
TCAGATTTTG ATTTTTGCAG CCTTTTGTTT CCTTGTAAAG AGAACTGCTC AGCTATAGGG 2880
AAGAAGTAGA ACTTTCTGCC CTAAACCTAC CACCCTCTGG ATCAGCTGAA GCTTTTGCTG 2940
GGACTCCTTA ATCTTTGGTT CTTCTAACAC AGGCTTGCTC TTGCAAGTGC ACCAAGAGGT 3000
GTTTTCTCTT CCTCTTTTTC CACCCTTGTG AAGAATTCAG TTGTAAATGC TGTTTGGTAG 3060
AAGAAAGTGC CAGAGCCAGC TTGTTGCCAT GGGAACTATA CCCTGCCCCC AGAGCCTGTT 3120
ATCTTTTTCC AGTTTGGGTA ACTAGGAGCT GGAAAGGGAC TTAACATTTC ATGTGCTTCC 3180
TGCAGATCCA GCTGCATTTT TCTCTTTAAT TCCCCCCACC CCCAGGTTTA TTGATTTTTC 3240
TGTGAATCAG TGTTTTTGCC TGTGTGGTGT ATGTATGTGT ACCATGTATG TGTTTGGTGC 3300
CCATGGAAGT CAGAAGAGGG CTTTGGAGCC TCTGAAACTG GAATTATGGA TGGTTGTGGA 3360
TCACTGTGTG GGTGCTGGGA ATCAAACCTG GGTTCTCTGT AAGAGCAACT GGTGCTGTTA 3420
ACTGCCGAGC CATCTCTCCA GCCCCTCAGG CTGCATTTTT CATGTTTTTG TTGTAACCGT 3480
CGTAAGGGGT AAGTACTGTG TGGTATTGTG AGTGTATCAC AGCCCTGGTC TGATAGCCTG 3540
GCTTGCTCTG GACTGGTTGG CCCTGTTGAG TTTGTGAGGA TAAATCTGTG TTGTCTTCCA 3600
GGACATCTGT TTTCCTAGAA GAGACAGAAC TAGAGAATGC TTGCCTTTGT GGTGTTCTGA 3660
ATGGTAGAGT TAGGAACACA AATGGTTTCT CAGGAATTTC AATTTATGTA GACTTCTCAG 3720
TTTAATTTTT TTCCCTTATC CTGGTCTCCT GCCTCCTTCC CCAATCTCTC CTGTGTTTGT 3780
ATGTGGAAAT TTTTGTTCCA ATCCTGACTG TTAGCAGGAT CTTATCCAGT TATATCCCTC 3840
CCTGTAGGGC TGATGGCCCA GATTCTCCAG CTGCTACCAC CCTTGACTGT TAGAGGAAAC 3900
CAGGGTAATG GAATTCAGGC ACAGTCTGGG CTGGAGAGGG GAGCCAGAGT TCACCGGGAT 3960
AGAAGCGTTT GAACGTCATC ATGTGTAGCA AAGATCTTAA ATTTGGGGTG GTGTTTATTT 4020
GTTTGAAACA GGGTCTCCTT GGGTAGCCCA CGTTGGCATT GAACTTACCC TGTCTTCAGA 4080
GTGCTAGATT GTGGCCACGT ATAATCCCAT CTGTGAGAAC CCCTTCCAGA CTGACAGTAG 4140
ACCAGCTATG TTGGTGACTT ACTTGGACTT GAGCGTGTGC TTTGTTGCAT ATGAAGCCAG 4200
GGAAGTTACT ATTAGGAATT GTACTGAAGT CCAGTGAAGC TTAGTAGGAG GTTGTTAGAG 4260
GCATAGAATA GAAAGGCAGG CAGCCAGCCA GAGGCGTGGC GCTAGGTGGA AGCTAGGGTT 4320
CTTGTTTGTT TTTTATAAGG GAACACACTG AAGGGGCGGG GTGGGGGAAG ATGGACAGTT 4380
TGTGGGGACT AGTTCTCTTT GTCCCCCGTG TGGTTCCCAG AAGTAGGGCT CAGATCCTCA 4440
GCCTTGGCAT CTGGTACCTT TAGCTGTTGA GTCATCTTTG CAGCCCAAGA GAGCCCAATC 4500
TTGCGTCCTT TCCCTTTCCT GTCTGGAGAG CTGTCTGGAA GGCATTAGTT GGTCATCTTC 4560
CTGGTGTGTT CGGGGAAGGA GATCACAAGG TTAAACTGGT ATACATAGAG AAATATAAAA 4620
TGATAGAAAT ACTAAACACC GGGTATCCTG GCATTTGCCT GTAGTCCCAA CACTCAGGAG 4680
GATCTGGAGT TGAAAACTGG AAGTAGCTGT CATTGAAGGA GAAGTCTGTC TCCTCTAGCT 4740
GCTTTTTTGA GACAGGATCT CACTGTGTAG ACTAGGACTA GACTGGCTTC AGACTCAGGG 4800
AGACCTACTT GCCTCTGCCT CCTGCGTGCC ACAATTGAAG GTGTGTGTCA ATACACCCGG 4860
CTTTGTTGGC CCTTATAGGT TCTGGGATTT GAATTGAGTC CAGAAGAGAA AAAATGATAC 4920
TGTGTGGATA AGGAACTGAA TTTTAGAATG CTCTGCAGGG 4960