EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM115-09696 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Neuron_cortical 
Coordinate
chr2:32021730-32026740 
Target genes
TF binding sites/motifs
Number: 31             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ATF3MA0605.2chr2:32023549-32023561GGTGACGTCATC-6.74
ATF3MA0605.2chr2:32023549-32023561GGTGACGTCATC+6.92
ATF7MA0834.1chr2:32023548-32023562GGGTGACGTCATCC-6.27
CREB1MA0018.3chr2:32023549-32023561GGTGACGTCATC+6.74
CREB1MA0018.3chr2:32023549-32023561GGTGACGTCATC-6.74
Creb5MA0840.1chr2:32023549-32023561GGTGACGTCATC-6.74
EWSR1-FLI1MA0149.1chr2:32026130-32026148CCTTCCTGCCTGCCTGCC-6.92
HNF4GMA0484.1chr2:32022704-32022719TGCCCTTTGACCTCT-6.11
JDP2(var.2)MA0656.1chr2:32023549-32023561GGTGACGTCATC-6.92
KLF4MA0039.3chr2:32022629-32022640GCAGGGTGTGG-6.62
Lhx3MA0135.1chr2:32023816-32023829AAATTAATTTATC+6.17
Myod1MA0499.1chr2:32023604-32023617AGGGACAGCTGCA-7.82
MyogMA0500.1chr2:32023607-32023618GACAGCTGCAG+6.62
NR2C2MA0504.1chr2:32022704-32022719TGCCCTTTGACCTCT-7.4
Nr2f6(var.2)MA0728.1chr2:32024544-32024559TGACCTCTTGAACTG-6.38
Nr2f6MA0677.1chr2:32022704-32022718TGCCCTTTGACCTC-6.65
Nr5a2MA0505.1chr2:32024218-32024233GCTGGCCTTGAACTC-8.25
RREB1MA0073.1chr2:32026466-32026486GTGTGGTGTGTGTTTTGTGT-6.04
RREB1MA0073.1chr2:32026625-32026645TGGGTGTGGGTGTTTGTGTG-6.04
RREB1MA0073.1chr2:32026638-32026658TTGTGTGGGGTGTGTTGTGT-6.07
RREB1MA0073.1chr2:32026688-32026708TGTGGGGGGGTGTTTGTGTG-6.15
RREB1MA0073.1chr2:32026629-32026649TGTGGGTGTTTGTGTGGGGT-6.23
RXRBMA0855.1chr2:32022704-32022718TGCCCTTTGACCTC-6.46
RXRGMA0856.1chr2:32022704-32022718TGCCCTTTGACCTC-6.35
RxraMA0512.2chr2:32022704-32022718TGCCCTTTGACCTC-6.62
SMAD3MA0795.1chr2:32026332-32026342TGTCTAGACG-6.02
TFAP2BMA0811.1chr2:32025414-32025426AGCCCCAGGGCA+6.11
TFAP2CMA0524.2chr2:32025414-32025426AGCCCCAGGGCA+6.11
Tcf12MA0521.1chr2:32023607-32023618GACAGCTGCAG+6.14
ZNF263MA0528.1chr2:32023889-32023910CGTCCCCCCACCTCCTCCTCC-7.09
ZNF263MA0528.1chr2:32023892-32023913CCCCCCACCTCCTCCTCCCCA-7.29
Number of super-enhancer constituents: 10             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_00924chr2:32023383-32030201Myotubes
mSE_02899chr2:32022125-32039976HFSCs
mSE_03019chr2:32010930-32047319TACs
mSE_03726chr2:32022607-32023756Cerebellum
mSE_05207chr2:32022187-32023759E14.5_Heart
mSE_05207chr2:32025023-32026830E14.5_Heart
mSE_06085chr2:32021923-32023791E14.5_Liver
mSE_10045chr2:32021470-32026822Embryonic_stem_cells
mSE_11691chr2:32022091-32023725Placenta
mSE_12381chr2:32021886-32023768Spleen
Enhancer Sequence
GGCTAGAATG AATGGCCTGG TGTGGTGGCA TCGACTGCTT TGTGTGGACA CCTTTTCTTT 60
TCTTTTCTTT TCTTTTCTTT TCTTTTCTTT TCTTTTCCTT TCTTTTCTTT TTTTTTTCTT 120
CTTCCGAGAC AGGGTTTCTC TGTGTAGCCT TGGCTGTCCT GGAACTCACT CTGTAGACCA 180
GGCTGGCCTC GAACTCAGAA ATCCGCCTGC CTCTGCCTCC CACGTGCTAG GATTAAAGGC 240
GTGTGCCACC ATGCCTGGCA TGTGGACACC TTTTGAGGGG TGAAGGAACC TATGAGTCTG 300
AAAGGATTCT TTCTTCCCAT AAGGGCTGCT GGCTGTTAGG TCTGCATTAG CGACCTCCCT 360
GTGCTGCAAT CAAAGCTCCC AGTTGAAGGG TGTGATGTGT TACAACGAGG CAGTCATGGT 420
GGTAAGAGTG TGAAGTCACG GTGCATTGTA GCCAGGAAAA AGCATGAGAT GAATTCTGCT 480
ATTCAGTTCT TCAGTCCAGG ACCCCAGCCC TTGGGATGCT GCCACCCTAA TCTAGAAATT 540
CCCTCGGACA CGCCCAGAGG CTGGTCTCCA TGGTGACTCT CACCGGAAAC TGTCGAGGGT 600
TGGGAGTCGT TGCTTCCTTT CATTCTAAGG GGGCTCTTCT GGGGCTGAGG CAGACTCAGA 660
GAAAACACGC CCGATGTCAC CTGTTCTCCC GGTGTCATTG TGTGATCTTT CTGTGTCTTG 720
GATTAGTCTC TGGTTTCTCA ACTCCAGGAA TTTTTCTTGG GTTTTTAATT TTATGATTTC 780
TTCCACTCTT GATTTAATGT GAGGCAGGGG GAGAGGTTGA ATAAGTGTGT GTGTGTGTGT 840
GTGTGTGTGT GTGTGCTGCT AGAGCATACT TCTGCTTGGC TAAGATGTGG GGAGAGGACG 900
CAGGGTGTGG TAGCCCCCTC CTGGTTTCTC TTGCTTAGCT TCCTTTTTTT ACTTTGTACC 960
CTTTACTGTC CCCGTGCCCT TTGACCTCTC TTAGCCAGGG TACTCTGTAG GGAGTCTGAC 1020
AGGCTCATTC CTGGGCCTTT CTGATTCTGA GGCAGCCGCT ACTTCCTGGC ATCCCAGGGT 1080
GTGTTCCTTC TGAGTAACAG CCCTCATCTT GTGGCATGTC AGTCTGCTGC CACCAAAATT 1140
GCCGCTGGAT TTCGGGTTCT CTCTCGTCTT CTGGAAGAGT TCTAGAAGAG TAGGTGGTCC 1200
TTCAGCAGGA CACCGCTGGA TGTCTGGGTG GTGTTGCTCT GAGTCCAGCC GATGGGACTA 1260
GTGGCCATTT GAGATGAGTG CACATGTGTG CGTGACACAG CAACTGGAGT ATTTTGTGAG 1320
CCAGCCTCGG CGGCACTGCC CTTCTGTTCA TGGTTCTGAT TGAGAGGTCT GCCGCTGAGC 1380
ACAGAGTCTC AGGAGGAAGC CGCTGGTCGC AGTCTTCTCA CAATGCCTGC CCACCCCCCT 1440
GAGCCCAGCC TGGTATAGCA GTTGAAGCTT TCTGTAGCAC AGGCTCTGCG TTCATCTGGG 1500
GGTTGGCATT GTCACCTGGC GGTGGCTGTG AAGTAGCCAC CTGTCCCATC TCCACTCCCT 1560
GGCTCCTCTG TGTTTTGACA CAGAAGCCTT TGCACGGAGT TTGTCCCCAC TTCATCTTTG 1620
TGGCATAGAA TTCCCAGAGG ATCGGGTGGT TACTGGGGTA ACATCACTCC TGGGTCTGCC 1680
TTTCTGTGCT GAGTTGGGTT GAGCCGAGGC AGCAGGGACT CAGTGGTAGA CAGGACTGCT 1740
TTCTCCCTCG ATGAGAAAGT TGCTTCCTGC CTGAGGCCCA CAACCGCATT CCTGTTTGCC 1800
CAGATCCCAG CTTGCTGTGG GTGACGTCAT CCACAGAGAG GCCTGGGGTG TAAACAGTCA 1860
CAGCTGCAGG GCTCAGGGAC AGCTGCAGGT GGCGGGATGG CGGCCCCAAG TGTTCCTCTG 1920
CTTGTCTGTC TCTCTAGTTC CTTTTTAAAA TTTCCCTTAT ACACATCTAC ACAAATAGCA 1980
AATCTATTTA GAACTGGGGT ACAATGCTGT GTGAGCTTCG TGGATGGTAT TTTTCTTTTT 2040
CCTCTTTTTT AAATTACTCT TTTTAAATTT TTCTTTCTTT TTTTAAAAAT TAATTTATCC 2100
TTTCATATAT TATATCCAGA CCACAGTTTC CCCACCCTCT CTCTGTTCCT AACCTCCTCC 2160
GTCCCCCCAC CTCCTCCTCC CCATCCACGC CTCCTTTGAG AAAAGGGCAG GCCTCCCAGG 2220
TTGTCAACCA AACATGGCAT AGCAAGTTGC AAAGATTAGG CACAAGCAGG CAAACATGTC 2280
AGAAACAGCC CGTGTTCTCT GTTAGGTGCC GCACAAAAAC ACCAAGCTAC ACGACGTTAG 2340
CATATACAGA TGGTCTAGGT TAGATCCATG CAGGCTCCCT GATTGTCCAT TCAGTCTTAG 2400
CCTCTGTGAG TTCGGGTTTG GTGATTTGTT TTTTGAGACA GGTTTTCTCT GTAGCCTTGG 2460
CTGTCTTGGA ACTCACTCTG TAGACCAGGC TGGCCTTGAA CTCACAGAGT TCTGCCTGTT 2520
TTGCCTCCCA AGTGCTGGGA CTAAAGGTGT GTGCCATCAC TGCCCTTATT TTCTTCACTT 2580
ATTTTTTAGA TACATGTTCA CTATGCAGCC CTAGCTAACC TTCAATTCTC TGTAGACAGG 2640
TTGGTCTTGA ACTCAGATCT GCCAAATGCA GGGATTGACG ACATGACCCA TTATTCCCAC 2700
CCCATAATTT TTTTTTAAAA AACAAGTTGT TGTTGTTGCT GTGCTGGGAT GATACTTGGG 2760
GTTTTGTTTG TTCTAGGCAA GCTTTCTACT CCTGAGCTGT ATACCACCCC TCATTGACCT 2820
CTTGAACTGG GAACCTAAAC CTGTAGTAGA ATAGAGAGCA AAACCCGGAG GCAGGCAAGT 2880
CACATCATGG CGGGTGTTTC CGAGCGACCA GGTGGCCTTG CTGGAGATGG GAGATGGCCC 2940
ATGAATCTGA GAGTTGCGTG CCTGTGTGCG ACCTGTTTGT ACGATGCATG CATGTAATCG 3000
TGTGAGTATC TGCTGTATAT GGGGTGAAAA GCCGGGAGCA TATTGTGTCC ATTTTCTCTC 3060
ACGCTCTACC TTAGTGCCCT GAGTTAGGGT CTCCCAGCCT GAGGTGGGCT TTTTGGGCAG 3120
GTTGGCTGGT TGGTGAGTTT CCTAGTGCTG AGACTGCAGG CTTGTCCAGC CATGCTTGGC 3180
TCTCTCATGT GAGTACTGGG GACACCACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC 3240
ACACACGAAC ATTAAAGCTA TATCACGAGT GCAAAAAGAA AACAGATGTT ATAGAAAGAA 3300
AACCGAGCAG CTGATTGTCC CTGTGTTCCT GACGTGGGAG CCTTGGAACT GGGACAGTGT 3360
GGTGGTGATT AAAGTGTGCC CACAGTGGAC TGCCGAGCTC AAGAGAATTT TCTGAGAATT 3420
ATAGTACACC TGTCTTTTGA AGGCTCATAC AGGGGCTGGC CCACAGGTCC TGTACAATCA 3480
CAACTTGGAT CTCGTGATTT CTGAGGGTGG ACAGCAGTCT GAAGACAGGT CTCCTGTGTG 3540
TGGAGGAGCA GGTCTGTTCA GCAGGAGCCC CAAGGTGGGC AGAAGCTGTC TTGGGGAAGC 3600
TCAGGCCTTA CTTGCTGCAT ATAGTGGAGG GATGGGAGCT GCTGAGGTTT TACTGGGCAG 3660
GCACTGGCAG TCTGGATAGA CAACAGCCCC AGGGCATCTG TTCTGGGTCA TGTGTGGTAT 3720
TAATGCTCTG GGTGGCCCAG GTTGCCCCGA AACTCCACAC CTTTCTGCTT CAGCCTTATT 3780
AGTATTGTAA ACCGCCACAG CCAGCTCACT GTCTAGTTTC TTAACATAGA TCTAGCAAGT 3840
TCATCTCGTG TATGTGTGTG TATATGTGTG TGTGTGTGTG TGTGCGCGCT TGCGCTTACT 3900
ATGTTCAGCA TGAGCCCAGT GCCCTGTGCA GGCTAGGCAG GTCCTCTCAC CACTCACTCA 3960
GCTACACTCC AGGTCCCTTT TATCCTTTAA TCCCTGAGGA ATCTGGCCTT AAGTCACAGC 4020
TGGTGCGGGG TTGGGACAAG CTGCAAACCC AGTGTTTCGG ACATGGGACT GGGGAGAGAT 4080
GTAAGGTAGT GTTAGGGCTT GGCAGCGGGC TCTGGACTGG ACAGTGGGCT GATGGGAGGC 4140
TGTGTGAGGT TAAGCTCGTT GCTGTCTGAG CTGTAGCCCT GATGAAGGAA GGGGCCTGAG 4200
GACTACAAAT GGAGGTTGAT GTGTGTCAGG CCATGGAAAG GCTGTGAACT GAGTGCAAGA 4260
GAACTGAGCC TGGGAAGAAA GTGGCTTTGT TTCTTATTTT AGTTTTTGGT GCTAATTTGG 4320
GCTCAGAGTC CTCTGGTGGT ATCTCCCATA ATAAACCGTA GCTCATTAGA ACTCCACAAT 4380
TCAGTCCTGT TTCCTCTATG CCTTCCTGCC TGCCTGCCTG CTTACCTGCC ATCCATCCAT 4440
CGAGATAGAG TTTCTCTGTG CAGCCCTGGC TATCCTAGAA CTTGCCCTGT ATTCTGTTGA 4500
CCACACTGGC TTCAAACTCA GGGATCTGCA AGCAGATTGT CCTTGGTGAG GTCTCCACAG 4560
AGGAGAGAGC CTTGGCTGTG GTGTTTCAGG CCTGGCTTCA GCTGTCTAGA CGGACCAGCT 4620
TCTGACTCGG AATGGACATG TGGGATCACC GCTGTTTCCT AAGGGCTACT TTGCTACTTT 4680
TGCTTTGCTA GTGTGTGTGT GGTGTGGTGT GGTGTAGGTG TGTGTATGTG TTGTGTGTGT 4740
GGTGTGTGTT TTGTGTTGTG TGTGTGTGTG TGCATTGTAT GTGTGTGGTG TGTGTTTGTG 4800
TGTGTTGTGT GTGTGTGTGT GTGCATTGTA TGTGTGTGGT GTGTGTTTGT GTGTGTTGTG 4860
TGTGTGACTG TGTGTGAGTG TATGTGTTGT GTGTGTGGGT GTGGGTGTTT GTGTGGGGTG 4920
TGTTGTGTGT GTGACTGTGT GTGAGTGTAT GTGTTGGGTG TGGGGGGGTG TTTGTGTGGT 4980
GCATAGGTCA GAGGACAGCT TGGGAGTAAG 5010