EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM115-00231 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Neuron_cortical 
Coordinate
chr1:54953050-54956480 
Target genes
Number: 5             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 11             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Ascl2MA0816.1chr1:54956246-54956256AGCAGCTGCT+6.02
Ascl2MA0816.1chr1:54956246-54956256AGCAGCTGCT-6.02
CDX2MA0465.1chr1:54955494-54955505AAGCCATAAAA+6.62
NFAT5MA0606.1chr1:54954454-54954464AATGGAAAAT-6.02
NFATC1MA0624.1chr1:54954454-54954464AATGGAAAAT-6.02
NFATC3MA0625.1chr1:54954454-54954464AATGGAAAAT-6.02
RFX3MA0798.1chr1:54955562-54955578TGTTGCCTTGGAAACA+6.06
RFX5MA0510.2chr1:54955562-54955578TGTTGCCTTGGAAACA+6.07
Six3MA0631.1chr1:54954815-54954832AAAAGGGTATCACTAAC+6.77
ZNF263MA0528.1chr1:54955762-54955783GGAGAAGGGAGGAAGGGAAAG+6.56
ZNF263MA0528.1chr1:54955759-54955780GAAGGAGAAGGGAGGAAGGGA+6.66
Enhancer Sequence
AATACAAGGC TCCTCAGTGC CTTCACTATT TGGGATGGGG ATTTAGCTCA GGGTAAAGTG 60
CTGCCTCGAA CACAGGAGGC CCTGGATATC CAGCATTAAA TAAACAGGGC TTGAGGGTGT 120
GAGCCCATAA TAGAGGCAAG AGGATCCGAA ATTCAGAGTC AGTCTTAGAT ACACAGTAAG 180
TTCTAGGCCA GCTTAGAACA CATGGGTCCT TGTCTCAAGG AAAAAGAAAA AAGAAAATCA 240
CAATTTGCTT TAAAAGACAC CAAAGCCATT TTGCAGTAAC CATCATCACC ACTTACAGAA 300
TAAAAGGACA GCTGGCTCCC CGACAAAAAT GACAAGAGTC AGCAGCCAAA ATATCTTAGG 360
CACACTGAGA AGGCCCAGTG AGCCACCCAC GGAATTCAGC ACACACCAGC CCCAATCCAA 420
ACAAGAGCAA ACCGCCTCGT TAACATGCTC CACGAGCCAG GCGGTTTCCT CCTATTGCAC 480
CCACAGAAAC GCAAGCAAGC GTCATTAGTG AAAGCATTTT AAAACTGAAA GCTCAGGTTG 540
CCCTTTTCAT TTATTTCTTT AAGCTGCCTC TGCCTTGTAT AATAAAGGTG ATTGGGTGTT 600
TGCTTTGTGA TTCTTAAGTC CTAAGTGTAG GGTTTCTCAT ATGTAAAGAA TATTGTAATA 660
CAGACCATTT ATGAATGTAG CATAATAAAT GTTGCCACAC ACACACACAA TGGCTGGCTG 720
TCACTTCCCT TTATTACTTG GGAGAGTATG ACTTTCCATG GATTAACAAC ACAGACCAAA 780
AGAAAGCTGT TATTTCAACC CTTTGGCAAT GAGCAGATAA CAACAGAAGC CAATTTGAAT 840
CACCTCCGTT TTTCACAAAT TAAATCCAAC AGTAAAGTAT TTTACTGTAT ACTAAATGTA 900
GAGCACACGA CCTATCCCTA TATAGAAATG ATCTTCAGGA GGAAACCAAA TGATAGCTCT 960
CTAAGCAGAA GAAACAACTG CTAGGCGGGT AGAGGAAGCT TATAAGGGCT TTGCAGCTGA 1020
GTACGAAGGG GACCAACCTG AGGTGGCCAT CTAAAGAATT CTCCACCGTG GCACCTCATG 1080
TAGAAACAGC ACAGTGGTTA AGAGGACTTA GATTTAATTC TCAGCACCTA CACAGCAGCT 1140
CTCAACCATC TGTAGTTTCA TTGCAGTGGA GTCAATGTCC TCTTCTGGCC ACTGCTGGCA 1200
CCGTGCGTGC ATGCTGTGCT CAAGCCTAAG TTCAGGGAGA CACTGGTACA CGTGAAGGGC 1260
AACCCCCACA AAGCGCCATC CTCCCCAGTC CGTCTGGCTA AGCACTGGCA TTAAAGCTGA 1320
AGGAGCCGTT TCATTTTGAT AATTCTTGGA AGGCCTCAAA TAACAGCTAA GAGCATTCTA 1380
CAAAGATGCC AGAGGGCACG GGAGAATGGA AAATTACAGT TGAAATCTCA TCTTTAAAAG 1440
AGCCAGTTAA GCCACTGACA TACAAGCCAA GCTCAACTCT ACCTGACTAA GGAAGCCAAG 1500
GATAAGGACT GATTAAACAA ACTTTAAAGC TCTGCAGTTT TTAACCATTT TATATTCTAA 1560
AACTTGGGCT TTCCCTCCAC CCCTACACAA ACTGAATGAC AGTCCCGGGC TTTTGAACAT 1620
GGTTGGAAGA GAGGAATCTT CCTGTGGGGC AGTTAGGAGA ATCACTTGAT GCTGAGTGCA 1680
TGACTCAGGG GTAGAAGAGT TTGCCTGGCA TAGGCAAGGC CCTGGGTTCA GAGGTTCAGT 1740
CCCCAGCAAT ACAAAATAAA CAGACAAAAG GGTATCACTA ACCCTCTGTA TGCACAAAGG 1800
CTAGTCACCA CACCTTTCCC GTCTACTTTC TCCCTACCTG CAGAATCAAA CCATGCCTCC 1860
TACTTCCTTT TTAAAGGAAA GGGAAACAGC CAAGAGAAGT GGAGCTTCCC TAGATCCTTC 1920
TGAGGGTGCA TGATATCCAC AGAGCCAGTT TTCAGGAGCC TTAGAAATCA TCTCCTTCAC 1980
TGAATCGACT CACAACTCAC AGCTCTGGCA GAGAACCTGG GTTCACTCAG TTCCCAGCAT 2040
CCACAGGGTG GCTCACAACC ACCTATAAGT CAAGTTCCAG GGGATCATAT GTCCTCTTGT 2100
AACTTTTACA AGACTCTTGC ACAAACATAC ACACAAAGAA ACATAAAAAT TGAATCTTAG 2160
ATAAAATAAG AAATACATGT TGGGAAACAT CCAGTATTGA CACTAATAAC CATTGAGCTT 2220
TCAAATGCTG GTGCTCTGTC ATTTTTGTAT CTAGGGTTCT ATTTACATGG TATGTTCATG 2280
AACACATACA TGTACTTACT GTGTGTCCTC AACCTCTGTA TGCTTAACAT GTTCAGCAAG 2340
GCTTTTAAAC TGCAAGTATA GAGATGTTTT TATCCCTGCC CTAGTCCCAT GTAAACTGGC 2400
CTTTTATAAG CAATAGAGCA GACAAAGTTT GAATATGGAG ATGTAAGCCA TAAAACTCCT 2460
CTCTCTTAAT GGAGATTAGC TACAAAAAGC ATGCTACTCC TAAGCAGAAA GCTGTTGCCT 2520
TGGAAACAGG ATTTGTAACT ACTGCAATCA CACCTCGTAG CAAAGATGGC CAAGATCTAT 2580
TTTAATTCTT AAATGCCTCA AGGAACTGCA GATGATTGTA GTTATGGAAG ATAGCCAATC 2640
TGTAGTAATG AGGAAGCACA TGCCAAAATT AGAAAGGCTG CAATTGAGAA AGAAGAGGTA 2700
GAGAAATAGG AAGGAGAAGG GAGGAAGGGA AAGGCAATTC AAACCTGACA AGTAAACGAA 2760
TCCAAGAACC ACACAGCTGA AGGATCAGTC CTTTCCGTGA TTAGAGCCAT TCCATCCTAT 2820
TTACCTTACA ACTGCCTGCA GCTCCGTGCT TCTTGCAGGA ACGCAAAGCT GAATAAGGCC 2880
ATCCCTTCTG CAGGAAACAC ACACTCAAGT CACATTCATA TAATGTTGAT TTTGGCATGG 2940
AAAATGGGGG TTTGGGGGAG TGATAAGAGG CTTCAGAGAT AATGTAGCAG TTTTTCTAAG 3000
CTGGAATTTA AATATGTAAG AGTTTTTCAG AGAAGGTAAA GATAGGGCAT CTTGGGCAAA 3060
GGGCAGGACA GGCACAAAGG CACAGCACGA TCCTGTTGAT CAACAGGACC TGCATTCTGG 3120
TAGAACACTT CCATATGCAA AACACTTCCC CACGCATGGC ATTTGCCATC TCTAGCTCCA 3180
CCCCTTAATT GCTGGCAGCA GCTGCTAATC ACTCTGATAA CCAGAATGAT CCTCATTTCC 3240
ACATGTCCCA GGAGTGTGAA GACGGCGCTG TCACTCCAAT GGAGAAGTAA AGGACTAGGA 3300
ATAGAGCCAT GGCGAGGCTA AGCCCCAAGG ATGAGGATGC AGCAGAGGCC AGAGTGCAGC 3360
CTCTCGGAAG CCCCAGCAAG GTTCAAACTA CATAATTTTA AAAAGAGAGA ATGGTTTGTA 3420
AAAGCAGTGA 3430