EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM115-00158 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Neuron_cortical 
Coordinate
chr1:39232160-39237320 
Target genes
Number: 4             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 15             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxd3MA0041.1chr1:39232839-39232851GAACAAACATTC-6.14
GFI1MA0038.2chr1:39235192-39235204AAAATCACTGCA+6.11
KLF4MA0039.3chr1:39232684-39232695CCACACCCTCC+6.32
Klf1MA0493.1chr1:39232682-39232693GGCCACACCCT+6.32
Nr2f6(var.2)MA0728.1chr1:39236562-39236577TGACCTCTTGACCTG-7.85
RARAMA0729.1chr1:39236559-39236577GAATGACCTCTTGACCTG-6.44
RUNX1MA0002.2chr1:39234631-39234642CTCTGTGGTTT+6.14
RarbMA0857.1chr1:39236562-39236578TGACCTCTTGACCTGC-6.93
Stat6MA0520.1chr1:39232376-39232391CAGTTCCACAGAAGT+6.09
YY1MA0095.2chr1:39233013-39233025CAAGATGGCAGC+6.32
ZNF740MA0753.2chr1:39232208-39232221GGGGGGGGGGGGG-6.03
ZNF740MA0753.2chr1:39232209-39232222GGGGGGGGGGGGG-6.03
ZNF740MA0753.2chr1:39232210-39232223GGGGGGGGGGGGG-6.03
ZNF740MA0753.2chr1:39235686-39235699GGGGGGGGGGGGG-6.03
ZNF740MA0753.2chr1:39235689-39235702GGGGGGGGGGCGG-6.64
Enhancer Sequence
AATTACAGGC ATTGTGAGCC ACTGGACTGG GGTGCTGCCA TCTAAACTGG GGGGGGGGGG 60
GGGTTCAGGA TGGAGCAGCA AGGGTGCTCA ACTGTTGTTA ATTGCTGAGT TGTCTCTTAT 120
GATCCCATTG TGTCAATGGA ATGATGTGTG TGGGGGGAAA AAAAAAACCT CATGTTTTAA 180
GGTCGTATGA CTAGGTTGGG CTACGGAGCG TCTGTGCAGT TCCACAGAAG TCATTGAGCT 240
TCTCTGACCT TCAACTCTAT ACAATTCTAT CTTAGTTACT GTTTTATTGC TCTGAAGAGA 300
TACCATGACC AAGGCAACTC TTATAAAGAA AACATTTAAC TGGGGGCCTT GTTTAGAGTT 360
TTAGCATGTT GCTCCACGCT CATCACAGTG AGAAGCAGAC AGGCCTGGTG CTGGAGCAAT 420
AGCTGAGAGC TTTACATCAT GATTCACAGA CAGCAGGTAG AGAGTGAAAT TAAACTTGAC 480
AAGGGCTTTT GAAACCTCAA AGTGACAAAC TTTCTCCTCC AAGGCCACAC CCTCCTCCAA 540
GGCCTCACCT CCTCCAAGGC CACACCCCTC CAACAAGGTC ACAGCACCTC CAACAAGGTC 600
ACACTTCCTC CAACAGGGTC ACACTTCCTC CAACAAGGCC TCACATCCTA ATCCTTCCTA 660
AACAATTTCA CTAACTGGAG AACAAACATT CAAATATATG AGCACATCGC AGGGTCTTAG 720
CAAGTAGGGT TCAGGGCAAG ATCAGAGAAG ACAGATCAGA TAAAATCACC GAAGACCAGG 780
ATTCTGAGCT GAACGACATG GAGAGACACT GCCCCGACAG TGTTGTCAAA GGCTACACAG 840
TCCCGCACAG GAGCAAGATG GCAGCTCTCT TGGCAGAGTA ACCACGGTAT AACTTTGGAT 900
GTCATTCCTA TGAGTTTATC TCTGTGCCTT TTCTCTCCAG ACCCAATGAC CCTGAAGATG 960
CAGCCCATCC TTCAGAAATC TCTGTCTCAG CAGTGATCGT GGATTCTGTT GTGCACAACA 1020
GAACACCCAG CTCCATATAC AATCTGCATG GCCATAAGGA TGGGTAAATA CCCTTGGTGC 1080
CCCCACAAAA GCCCTTTCCC AGAGAACCAT TGTAAGACAT TTCTGTGAAA TGACTCTTAC 1140
AAAATGATTC TCTACTTAGC ACCTGCGGGT TAGTATTTTA TGGGATATCC CACATCTATT 1200
GCAAATAAAT AGAACCAACA CTTCACAGAG CTCTTGTAGT AGCTAGCCAT CACTGTTATC 1260
TTACTCAACT TTGGCATCAC CTAGGAGCTT GGTGAGGCAC AGCTCTGGGT ATCTAGGAAG 1320
GTATACCCAG AAAGAATTTA TGACAGGAGA AAGACTCATT TCTATATGTA GGTGGAACTA 1380
TCTCGAACAA GCTGGGGGCC CAGACAGAGT CAAAAAGGTA AAAAAGAAAT CCAGTTGAAC 1440
CCTGACAGTC CCTGCTTGCT TGCTTTCTGC TAAGGACAGA GTTGTTCCAC TAAGCCTGGC 1500
CCCATCCTCC CCTGGTCCCC CATGATGGGC CGAGTCCTCT AAAACCATGA AAAAATAAGC 1560
TCTCTTTCAG CTGCTTCTGC CAAAGATCGG CCGCAGCAAC GATAAACATT AACTCATATG 1620
ACCTTCCCAA GTTAAAAAGA ATTAATTCAT TTAGAGACAA GCAGGAAAGA AGTCACTGAG 1680
GTAGAAGGTA TGTAGAAACA GAGAACCCAA GGGCTCTTTT CCATTACTTT TCACAGGAGG 1740
CATTGATATA ATGCAGGTTT GACCTTGGTA AATTCACCGA AGAGAATTCA CACTTTCAAC 1800
AGGGACGTCC TGGAACTCTG GCTGCGATGC GCCTCCATGT CAGACATCTC GCACATTTGG 1860
GCAAACTCCA GAGCTCATGC CGTTCTTAGG AATCGTCGTC TTCATTTCTG CTTCGTGCAT 1920
AAATGTGATT TTTGCTACTG CAAATACCAC CCACCGGGGC AAAGATAAGT GATACGGAGT 1980
GGGTTTTGCA AGTGTCTTTG GTATTTTTAG GAAAAGGCAT TTTGAAATGT TCAGTTGTGT 2040
GAGACAGCCT GTTGTCGGGC AGAGAAGCAG GCCTGCTTGC CTGAGAGTCA TTTCTGCGTG 2100
GAAGAAAGGT TTCTATCCTG GGCCTGGCTG CATCCGCCCT GGCAACGCTG ACGCACAGAA 2160
TGTTATTGGA TTTGGAAAAG GCAACTTGGG GAAATGCGAA GCCTGAAACG CTGAACCAGG 2220
AGCAAGATGC CTCTTGAGGC GCCTGTGGGC ATACACCCCA GGTCTCCCCG TGAGCCTCAA 2280
GCCGCAGGGG CAGAAGAGAG ACAGCAGCAG CACATGGGGC TTCTGGGTCT TTTCCCAGCT 2340
GTTGTAACAA AAAGCCATAT GCCAGCTGGC TTATAAACAA GAGAAAGTTA CTGTCGCGGG 2400
ACTGGAGGCC ACACGTCCAG GATGAGAGGA ACCGCTCCGG TTCCAATGAG GGCTCGTACA 2460
CAGCCTCTTC CCTCTGTGGT TTCATGGCTT CTCTCCTTGA GACCTATCTA CAGGTACCTT 2520
ATGGCCCCTC ACATAAGCTC CACTTCCCAG ACCAAATCAC CCTCAAAAGA CCTGATTGGT 2580
AAGAACTTGA ACGTAAATTC AAATCTCACG ATGTATGGTG GTCGTGTGCA TAGTTACTGC 2640
ACGAGTTACA TGGTGTTTTA GTTTTGTGGA ACAGTGTTAC ATGTAGCTCA TGCTGGTCTT 2700
AAAAGCGTGA TCCTCCTGCT TCTGCCTCCC ACATACACCG CCACACCCAG CTTTGGCCAT 2760
TACATCTTAA TAAAAAAAAA TTTTTTTAAA GACTTTTTTA AAAAAGAATT TCAGGAGACA 2820
CAAACACTCT AACCACAGTC CTGGCTTCAG ATACTCTTAC CATATGAATA AATAATAATG 2880
TCTTTAAAAA CTGAATTGGT CTTATGCATT TAAAACTGGA TACAATTCTG CTTACTGCTA 2940
GGAATTTAAT ATTAAAAATT GCCAAGCCAC TAACAATCAT CACAGAAAAC TACCATATGG 3000
AAAAGTTATC AACATGTCTG TTTTGGAAGC ACAAAATCAC TGCAATGTTT TCAAGTATCA 3060
AAAAAAAAAA ATCCATTACA CACGTTTGGG GGGGGGGGGC AATTTTTCCT CCCCTAGGGG 3120
TGAAAACAAC CCGCCCATTA ATGAGGAAGG GAGACATTCA TGTTCTCAGA AAGCGTGAAG 3180
GGCTGATTGC AGACAAAGAA GTCCTGAGAG CCCGGGCCCG CGGCTCCCAC GCCTTGCGGG 3240
TCGTTCATGC GGGTTCTCTG CTCAGCCAGA AACAAGGCTT CCTTTTTCAG AAGCATGGTG 3300
GGAGTCAGGC CCTGCCATTG AAGATGATAG CTACTACATC TCCGGGGCTA TTTCAACCTT 3360
CTGGAATAGA CCGTTGGGGA GTAGGAGGCA CGGGCAGTCA TGAGTGTGTG AGCCAAGCTT 3420
TAAGTCAAAG AGTCAAAGTC TCTCTCTCTC TCTCTCTCTC TCTCTCTCTC TCTCCAACCC 3480
CCCCCCCAAT CTCTCTGTCT CTTTGTGTTA CAGACAGCGG GGACGCGGGG GGGGGGGGGC 3540
GGTTGTGGTC AGGGGTGTGG ACGCTTGAGC ACAGACTCAG CCAGAAAGCT CCGGTGACCC 3600
TGCCGCTTTC TCCGTGTGCA GTGCTGGGGT TACAGGCATG GGCCCGGCCA GACCCAGCTG 3660
TTTACATGGG TGCTGGGATT TGAACTAAGT CCTCGCGCAT GTGCAGCAAG CATTTCTACC 3720
CACCGAGTTT TGTGCCCAGC TCAAAGTTCA TTCTAAAAGT CTGCCTTGCC CTCGTTCTCT 3780
CTCTGCATTC CTAGCATGCT GCAGATAGCT CCTGCCCACC CTCTCAGCTA CCCCAGATCT 3840
TGTGAGGAAA TGCCACTGAA CCACTCCAGG TGCCAATTCT CCTCAAATAA AGTGGACAAG 3900
CTCTCCCTGG GCTTGCCTTG CAGGGCTACC CATGCAGCTA TGAGGGAAAG TTGTTTGGGA 3960
GTTCTGGGTC ACAAAGGCAT GAAAAGCCCC CGAGGGAGGG GTTTCCAAAC AGAGAAGAAC 4020
TTCACCCACA CTGGCCTCAG ATAAAATCGA CAGCTCTGTC CTGCATCACT CTGCAAAGTT 4080
ACCCTTCTTC CCACCCTCTG CATCTTCCTC AGGGGATTTC TGAAGTTCCT GTGGTATTGT 4140
TGGATCAGCA GACGGAGCGC ACGCGAGTCT AGTTCCCACA GCTGAACGTT GGCGCTCTGA 4200
TTAGCATATC AGCTTACTTA AGGTAACACT GTAGTTTCTC AAGAGGTTAA AAGGATTTCT 4260
TTACCACTGA TAAGGTTTTA CCATACCTTC TTCTCGTAGG AAAGAGAGTT CATAACACAG 4320
GCTGCTGAAC AAGCAATGTC TCTACGGAGT AAGATATCTA GCATTAGTAC TGGCCTCTAG 4380
ATCCCACATG ACAGTCCCCG AATGACCTCT TGACCTGCTT TATCCTGGCC CCCACTCCAT 4440
CAAGCCTTTC TTAGCTAAAG AACCAAAAGC AGGATTTGAG CACTTCTTCG GGAGTTTCTT 4500
GTTTCGTTTA TTTGCCCTCT ACAGAATTTC TAAAAAAGGT TTGCCTCTGT CGAAACCCCA 4560
GCAGGACCAA CTCTGAACCA ACCACACAAG GGCTGCGCCG GCACACCAAC AAACAGTCAA 4620
GAGAGATGGG GGCTGGCATC ACAGGCTAGG AGGAGCAGAT GGACTGAGTC ACCAAGACCT 4680
CCAAATCCAG GGGCTCAGGA TAAAGAAAGG AAGAAGGTCC GTGGGAACAG ACGTGGGAAG 4740
TGATCGCCAA AGGAACCAAA CAGGAACTGG GAAAGGCTGC GTACGTTGTA AATCCCCTAT 4800
AGCTCATTTT CTATAGCTCA TCGTCCACAC CAGATATGGG GAGGACACTG GGGACACATG 4860
CCTATTGGGC TGTCTGGGCC TCCGCTTCCT CAGTAGCCAA ACAGGAAGGT ACCGACCTCA 4920
AGAGTGTGCT GTGAGCTTTA GACCGGCTTC ATAGCCTCCA GCTCACGAGG TCTGACATTT 4980
GAGTATAAGG TATAATAGGC TCAGATCAAC CTGTGTGATA AATATCACTC CCTCTCTGCC 5040
TAGGTCAGTG CACATAAAGT TTTCTTTGAC AGTCAGACAG ACACTGGGTT CTGAAGGCTA 5100
GAGGCAGTCC CTGACCCATA CATGATATAA AACAGGGGTT GTCAGGCTGT AGGAACTGAT 5160