EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
MM113-25618 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Neural_tube_embryo 
Coordinate
chr9:61034970-61036410 
TF binding sites/motifs
Number: 18             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ESX1MA0644.1chr9:61036253-61036263GTTAATTGGT-6.02
Lhx3MA0135.1chr9:61036371-61036384GTTTAATTAATTA-6.19
Lhx3MA0135.1chr9:61036386-61036399TAATTAATTAATG+6.46
Lhx3MA0135.1chr9:61036374-61036387TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr9:61036378-61036391TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr9:61036382-61036395TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr9:61036375-61036388AATTAATTAATTA-6.78
Lhx3MA0135.1chr9:61036379-61036392AATTAATTAATTA-6.78
Lhx3MA0135.1chr9:61036383-61036396AATTAATTAATTA-6.78
POU6F1MA0628.1chr9:61036376-61036386ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr9:61036380-61036390ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr9:61036384-61036394ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr9:61036388-61036398ATTAATTAAT+6.02
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POU6F1MA0628.1chr9:61036388-61036398ATTAATTAAT-6.02
ZNF740MA0753.2chr9:61035806-61035819GGGGGGGGGGCAG-6.33
Enhancer Sequence
TCTCCAAGTC AGTAGCTAAG GAAACCACAC CTCAGCCGCC CACCTGCCTG TCTGCCACAC 60
ACAAACCTCC TGTCTGACAC CTCTAACCAC TTCACTTTCC GGCTATCACC CCTCACCACT 120
GAGCCTAGAG GTCTAGTCCC TGAAAGGGGC CCCCAATAGG CCCTGTTTAG TTAGAGGTGG 180
TTTTTGTCCA CACTGCTGGG CTCCTGCTAG GACCTAGGAT CTCAGAGTCC TTCCCTCTTT 240
TCTTGTCTTC CTGCTGTCTC AGGGCAGAGC CTCGGGTGGT CTATGACACT CCGTGGCATC 300
TGGGGCAAAC TTTAGTCATA AGAAACAGTA GTGTACAATA TTGGTTACTT TTCTCGTTAC 360
CCCAACAAAA TTCAGGAAAA GCAAATTAAG GGTTAATGAG CAAGAAGTTG ATCAGGTAAA 420
GGGGCTTGCT GGGAAACCTA ATGATGGGAG CCTGATCCCT GGGACCCATG TGGTAGAAGG 480
AGAGCTGATT CACACAAGTT GTCCTCTGAC CTACACATGC ATGTGTATAC ACAGACAGAC 540
AGACAGACAG ACAGACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACCCCAAA TAAATAATGT 600
AATTACAAAA TACTTTAAAG CAACTTAGGG AAGGAAAAGT TTATTCTAGC TCACAGCTTG 660
AACATACAGT CCACAGATGC CATGGAGGTG AGAAAGTCAC ATGGCAGGAG CTGGGGTAGC 720
TGATCACACT GCTGCCACAG CCAGGGAGCA TGGAGACAAG AGCTGGGGCT CAGCTGTCTT 780
TCTACTTTGT ATTCAGTCTG AGACCCCAGC TGGTAAATGG ATGCTGCCCG CACTTGGGGG 840
GGGGGGCAGG GCTTCACACC CCAGTTAGCA CAATCCTTTA TAGAGCAGGC CCCAGGTTTG 900
TTTCCATAGC TATTCTAAAT CACATCAAAT TTACAATCAA TATCAGCCAT CAGGAGAGTC 960
ACCCACCCTC AGCTCAGTCC TGGAAGAAGC CCTGGAGAGG TCTGCCAGCA TCCTGCTGCA 1020
GAATGACCAG GCTGGATACT CTGCTCCAAC CCGAGCCTAC GCTCTGCTGT GCATGTGAGC 1080
TAATGTCTAG GACACACACA CACTTAGTAA CTGTCACTAA GAGGGTCTTT CCCCTGTTAT 1140
GAGAAAGGGG GCAAGTTTAA TCAATTGAAA GGCTTCCAAA CAAAATTTGA GCTTTTTCTA 1200
AGGGTGGATG AATTCTACCT GCTGCAGAAG CTGCTGTCTG TGAGCCCTGC AGACAACAGA 1260
TTTGTTCTGC TGACCATCAA TTAGTTAATT GGTCATATCT TTTACATCAC CTCTTACTGG 1320
TTCTACTTCA TAGACTATAC CATCTAATAG CTCCTCTGCC AGCACCCCAA GGAGGACAAC 1380
TCATGTCTAA GCATAACTCC TGTTTAATTA ATTAATTAAT TAATTAATGT TCTTATGTGC 1440