EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM113-25381 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Neural_tube_embryo 
Coordinate
chr9:47712040-47713910 
TF binding sites/motifs
Number: 15             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
LEF1MA0768.1chr9:47713013-47713028AGAGATGAAAGGGTT+6.2
RFX1MA0509.2chr9:47712736-47712752GGTTGCCATGGCAATC-6.01
RFX2MA0600.2chr9:47712736-47712752GGTTGCCATGGCAATC-6.68
RFX2MA0600.2chr9:47712736-47712752GGTTGCCATGGCAATC+6.73
RFX3MA0798.1chr9:47712736-47712752GGTTGCCATGGCAATC+6.82
RFX3MA0798.1chr9:47712736-47712752GGTTGCCATGGCAATC-7.15
RFX4MA0799.1chr9:47712736-47712752GGTTGCCATGGCAATC+6.06
RFX4MA0799.1chr9:47712736-47712752GGTTGCCATGGCAATC-6.8
RFX5MA0510.2chr9:47712736-47712752GGTTGCCATGGCAATC-7.14
RFX5MA0510.2chr9:47712736-47712752GGTTGCCATGGCAATC+7.1
RREB1MA0073.1chr9:47712462-47712482TGTGGTGTGGTGTGGTGTGG-6.09
RREB1MA0073.1chr9:47712467-47712487TGTGGTGTGGTGTGGTGTGG-6.09
RREB1MA0073.1chr9:47712472-47712492TGTGGTGTGGTGTGGTGTGG-6.09
RREB1MA0073.1chr9:47712477-47712497TGTGGTGTGGTGTGGTGTGG-6.09
RREB1MA0073.1chr9:47712866-47712886TGTGTGTGTGTGTGTGGGGG-6.95
Enhancer Sequence
TGGATCCCCA GAAAGCGCAT TATATATGTA AACGATTCCA GAGTCTAGAA AAACGTTTAA 60
GCATTTGGGG AAAGGACTAC TCAGTCTACC CCGAGAGAAG CATCACTGGG GCTGCTTTCT 120
CTTCCAGCCT CCGAAGCCAC CAACGGAGAG GGCTGCCCAG AAGGGGACCT GCCCTTGGCA 180
TCTCTTCCTG AAAGCTTGGT TAAGGTTTAA CAGGACAAGG GGGAGCGTGA GGAATATCAA 240
AATTCTTGCC AGTGCTGAGC AAAGAAAACT TTGTCTGTTT GTCTGTTTGT CTGTCTGTCT 300
GTCTGCTTGT CTGTAGAGCT GGGTTTGCTC TAGGATCGGC CTGAGTGTGT TAGGCATATG 360
CATATGCGCA AACATGAACG TGTTGTGTGT GTGTGTCTGT GTGTCTGTGT GTCTGTGCGT 420
GGTGTGGTGT GGTGTGGTGT GGTGTGGTGT GGTGTGGTGT GCACTCTGGC CTCCCTGGCT 480
GTGCTTGGAT GCTAAGGTTC CTAAGTGAGG CTGTGTGCCC ACCCCTTGGA AGGCTACATG 540
CTAATGAGTG AAGCATTACA ATGCTGCTCC CCAGGGCCCT GAGCCCAGGA TCACATCTCC 600
ATTAATACAC CCCTGGAGTT CATTGTGATT GGCATCGCTA CAATAAACAG TAAATGAGTG 660
AATAATAATT GGCCATCTAT TTGACAGTGT TTCTGAGGTT GCCATGGCAA TCACACCTTT 720
TATTAAGCTT TATTAAGCTG CAGCACAGGG AGTGAGGAGG AGGTGGCCCC AGTACACTGG 780
GCAGCTGCAT TGAAGTCTGA CCTGCTCAGT GACCTTTGAG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG 840
TGGGGGTACC TGTAGGTGCA GTTACTGGGT CTTGTCTGGG GACACCTCCT TTTCACTGAT 900
GAAAAAAAGA AAAAAAATCC CCCAAACAAT TACCTTCTGT GGGTTTTTGG GAGGGACTAT 960
TTAATGCCTA ACTAGAGATG AAAGGGTTTC TGTCTTCCTT CTTCAAATGT CTGAGAAGTG 1020
AAGACTGAAG TGCAGGGACT AAACAATGCT ACTATATGTT TGCCCTGAGC ATTTCCCCCT 1080
GAACCACAGT AACAAATAAA CTAAGGCCAA ACCTGGAAAT CAGAACAATG ACAGAAGTCA 1140
CTCAGAGTCG GTGCTGTAAT CCGTCCTGCC TTGAGTGTGC AGGCTCCACC GCTCTCTCTG 1200
TCAGTAAGTT CTGCATCCCT CTCTGCACAG GCCAGATCCC TGGCATTCCT GTCCACCAGG 1260
AGCAAGACCT TGTAACGTCA GCATCATTTG CACACACAGA AGGAAGGAGC ACACCTGCAC 1320
ACAGGGACAA CACCATACCC AACCCCTGCT TCACACACTT CACAGAAAAT TGGAGCAGGG 1380
ACTTCTATGT TTGATTGAGG CTCTGACCTT CCTTAATTCT TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG 1440
TGTGTGTGTG TGTGTGTGCA CACGCGCGCA TGCACGTGCG TGTATCTGTA TGCCTATCTG 1500
TCCCTTTGTC TGTCTGTGTC TCTCTGTCTC TGTCTTTCTC TCTGAATTAC TGTACTTGTG 1560
CAAAGGTCAG AGGAGGTTGT CAGGTGTCTA TCATTCCCCA CCTTATTCCT TTGGGACAAG 1620
ATTCATTACT GAATTTGAGG GTTCATAGCT TTAGCTAGGC CAGTGGCCAG TTAGCTATAA 1680
AAAGCTTCCT GTCTTTACCC CCTCCCCCAC AGCGCTAGGG TGTTAGTTAC TTATGGCCAC 1740
ACACTTGCCT TTGGATGTGG GTGCTCAGAA TTTGAACTCA GGTCCTCATC CTTTTACAGC 1800
AAGGATCCTC TTACCCAAGG AGCCATCTCC TTACCGTTCA CCTTATGAGA TGAACTCATT 1860
CCCTTAACAG 1870