EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM113-25356 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Neural_tube_embryo 
Coordinate
chr9:46145500-46147420 
TF binding sites/motifs
Number: 15             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Ascl2MA0816.1chr9:46146675-46146685AGCAGCTGCT+6.02
Ascl2MA0816.1chr9:46146675-46146685AGCAGCTGCT-6.02
CrxMA0467.1chr9:46145576-46145587AAGAGGATTAA+6.14
RFX1MA0509.2chr9:46146221-46146237AGTTGTCATGGAAACC+6.27
RFX1MA0509.2chr9:46146221-46146237AGTTGTCATGGAAACC-6.3
RFX2MA0600.2chr9:46146221-46146237AGTTGTCATGGAAACC+6.25
RFX2MA0600.2chr9:46146221-46146237AGTTGTCATGGAAACC-6.37
RFX3MA0798.1chr9:46146221-46146237AGTTGTCATGGAAACC-6.08
RFX3MA0798.1chr9:46146221-46146237AGTTGTCATGGAAACC+6.15
RFX4MA0799.1chr9:46146221-46146237AGTTGTCATGGAAACC-6.32
RREB1MA0073.1chr9:46146318-46146338GGAGGGGGGTGGGGTGGGGG-6.05
RREB1MA0073.1chr9:46146317-46146337CGGAGGGGGGTGGGGTGGGG-7.35
STAT1MA0137.3chr9:46146514-46146525TTTCCTGGAAA-6.62
Stat4MA0518.1chr9:46146511-46146525TTCTTTCCTGGAAA-6.38
ZNF263MA0528.1chr9:46146322-46146343GGGGGTGGGGTGGGGGGAAGA+6.23
Enhancer Sequence
TAACAACAGG AGCATGCTGA GAGTTTTGTC CTTTAAGCAT TTCTGGAGGA AGCGTGCATA 60
CAAACACTAA TAAACAAAGA GGATTAAGGG CCGGACTCCA TGGGGGACTT GGCTCCTGAA 120
GCAGAAGGAG GGTATGTGTG CCCGCATGTC ATTTGTTGGA CTCTGTCATT CAGCTGAGGC 180
ACCTCGGGAA CAGCAATGCT GTTTCTGAGT TGGTTCAGAA AGCGTGGGTT CATGTGCCTC 240
ATGTGTGTCG GCACCTAGAG GTTGTGTTCT GAATCTGGGT ATATGTATCT GAGAGTGTCC 300
TCGTGATAAG GTGAACTTCC TGGGCGTGTC ACCTGTGTAA ATGGGTGTGC GCATCTTGAG 360
TGTGTGCCTG GATCTTTTGG TCTGTGCTTC TTTTCATCGG GGTGTGAATA GATGTAGGAG 420
GCTGTATTTG TGTAGGTGGA GGTGGGTCTG GGTACAAGTC TGCTATGCTT TAGGTATGAG 480
CATATATCCA CAGTGGTGTG CCTGTCCAGG TGGGTAGGTG AAGGATGGTG GCAGGTGAGT 540
GGCTGAGCTG TGTAGACAGG TCCCTAAGGA TTTTGCAGGT CCAGATTTAG AGGCTCCTTT 600
TTGGCTTCTG TTGCTGCTGG TCCCTAGAGG TTCTGCCTTG CTGGTCTGCA GAGAGATCAA 660
CACCCTTCAA ACCAGCTGCC TTGTTGGCTG CGGCTCACTT GGTCCGCCTC CTGATGCCTG 720
CAGTTGTCAT GGAAACCAAA GTAGGTCTGC TTCTGTCTGC CACTGGGTCC CTGGGCTAGG 780
GCAGCTATGG GCCAAAGCCA CCTCAGTAAG GGCTGGCCGG AGGGGGGTGG GGTGGGGGGA 840
AGAGGGGGAG GGGCCTGTGA GTCCTCTGAG CCTGTTTTCT CTTGAACTCT CCTGGGGCCT 900
CTTTTCTGCC TCCAAACACA AGGTCAGATC ACCTGCTGTC AGACAACTGG AATCAAAACA 960
GCCCTGTCAG AAAAGGGCCT GAACAAGTTG ACTTTTCAAA CACATACAAA ATTCTTTCCT 1020
GGAAAAAAAA AAAAAGACAT ATGCTAATTC CACATTACTG TGGATGTCAT TTGTACGCTA 1080
TTAACTCCGT GCCTAAAATA AAGTGGCTTT CAGGAGAGGG CTGGTGCTCT CTGATGGGAG 1140
GGCTCCACCT GCTTTTGTGG TTGGCTTTTC TAGTAAGCAG CTGCTCTGGG TTCACAGCAC 1200
AGGGAAGGCG AGCAAGAAGG GTAAGCGAGA TGGTGGATTC TGTGCAGTTC TGGAAACAGA 1260
GTAGCAAACA CACAGCTAGC CAAACAAGCA GAGGACAAGA AATACAATGT TAGGGAGACT 1320
CAGAAAAATG ATACACACAG GAAACAGAGG GAGGCAGTGC TTAACATAGA GGGGGTGGTG 1380
GTTAACTTGG GGTGGGGGTA GGCTTCGGGG CAGGGCTTAG GCAGGTAATC GGCTGGTGTT 1440
CTTTTCAGCC TGCATCTATA TTCCAACATT CTTCGGGGTG TGTGGTACAT ACTGTGATTA 1500
ATAAAAGTAC TGGGTTGGGT GTGGTGCTAT ACCCTATAAT CCCTGTACTT GAGAGGTGGA 1560
GACAGGAAGA CAGTTTAAAG GGCTATAGAG TGCGTTTAGA CTTGGCCTGA ACTAACCAAG 1620
AATAACAAAA GTTACCAATA TGGAGCACTA TGATTTAGTG GTGGTAGGTA GCTATGGGGT 1680
CAGTGAGAGA ATCCAGAGCA GGGATCACAA CTGGATCATT CTCTGGCCTT GCCTCTGGCA 1740
CTGGGCAGGA GTGGCCTTGG GGAAACCAAG CATCTTTGTC CGACTGCAGT TTCTGCATCC 1800
AGAACGTGAC AGGACATCTC ATTTCTTCTC TTGATGCTAA GTTAATTTTG AGTTTTCTGT 1860
GTGCCAGGCA CTGTGCCAGG AAGAGTCGGG CACATTACAA TATAAGCGCT CCTGTGGAAG 1920