EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM113-24294 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Neural_tube_embryo 
Coordinate
chr8:93385070-93387350 
TF binding sites/motifs
Number: 13             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ESR1MA0112.3chr8:93386610-93386627GAGGTCATGATGACCTG-6.68
ESR1MA0112.3chr8:93386610-93386627GAGGTCATGATGACCTG+7.42
ESR2MA0258.2chr8:93386611-93386626AGGTCATGATGACCT+6.14
ESR2MA0258.2chr8:93386611-93386626AGGTCATGATGACCT-6.58
Foxd3MA0041.1chr8:93387261-93387273AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr8:93387265-93387277AAACAAACAAAC-6.32
LMX1BMA0703.2chr8:93386904-93386915TTAATTAAATT-6.32
NR2F1MA0017.2chr8:93385300-93385313CTCTTGACCTCTG-7.04
PHOX2AMA0713.1chr8:93386905-93386916TAATTAAATTA-6.62
PROP1MA0715.1chr8:93386905-93386916TAATTAAATTA+6.32
PROP1MA0715.1chr8:93386905-93386916TAATTAAATTA-6.62
Phox2bMA0681.1chr8:93386905-93386916TAATTAAATTA-6.62
ZNF263MA0528.1chr8:93385783-93385804CTCTTCTCCCTGCCCTCCTTT-6.13
Number of super-enhancer constituents: 4             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_04770chr8:93385111-93386910E14.5_Brain
mSE_05737chr8:93384803-93386896E14.5_Limb
mSE_09853chr8:93385179-93386775MEF
mSE_10061chr8:93385105-93386578Embryonic_stem_cells
Enhancer Sequence
AGACAGATAG ATGGTAGATA GATATATAGA TGATAGATTG ATGGATACAT ACATACATAT 60
ATACATACAT AAGATTCCCT TCTTACATAT GTCTATGTCC AGTTGTCATA ACCCAACCAG 120
CACACTGCCT TTGCTGAGAG TACTGCAGCA CTCTGTCTTT TATATCCCTT CCTTCCCTCT 180
CCCTCCAGAA CATTTACATG GCCTGCTGGA TCCCTAAGGG CATCTGAGGC CTCTTGACCT 240
CTGTCTGGGA GGAATACCTT CTGTCCCTAA GGCCCCTGGT GCTTGTATAT CCTGTCTTCC 300
ATCCCCCCTC GCAGCTGATG TGTCTGGCCT TGTAGTAGAG ACCTGTCTCT CTCTTCTTTG 360
AGAGGAAAGT TGCCATTAGA AGAAGCAGCA GAAGGCCACA GGGTAAGAAG CAGGCAAGGA 420
CTTGCCCCTA GCTGCCCAAA TGGCACACAC CCACTTCAGC AGTAACCTTC TGGGAACTGT 480
GCCCACGCCG TGCCCCCTCC CGCCCCGCTT TCATTAGTGA TTTTCAAAGG GGAAGTTTCA 540
GCCAGCCAGA AGGGAGCAGA TGGCGGGGCC TCAGGCCTCC TGCAGCGTGA ATGATTTGGG 600
GGAGTCGAGG CTTTCCCCAT GGTGAGTTCC TCAGGTTCCC CCAACCCCCA CGCACCTCCA 660
TCTCTCAGGC TTGTTGAGTT GAAGCTCCTG TCAGTCACCC TGGTGATTGA CAGCTCTTCT 720
CCCTGCCCTC CTTTCACAAA CAGGGAAGCT GGAACAGAGG TAAAAGGGGG CTTTTTTTTT 780
TTTCAAGCAC TTTGGGAAAG AATGAGCAAT GGAAAAAGGA AATTGGGAGC TTGGGGGAGT 840
TTACAGCAGC CCAGCGCTGC AGTTTGAAAT AGGAGCTGGG AATCCATATG TTTGGGAAAG 900
GAAAGAACGG GGCAGCCACA GGCGCAGAGC TTCAAGGGTA TGTGCGGAAA TGGCTCTGGG 960
AAAGGGGGCA GGGAAGCCCA CGTGGGTCTC CCTTTATCAG ACCCAGATGT TCGTTCAGGC 1020
AGCAGCTCTC AAGATGCCTG TGAAAGGGTC TAGGGCCTGC TGGGCTGGAC TGTGTTTTCT 1080
TAACTACCAA GCAGCACGTG AAGTCAGTGG CTGGGCGCTT TCCACTGTGC ACTCAATGAC 1140
TCCCTGGGGT CCCGCTGGGG TCTGTGCCAT ACCAATTAAG CAGAGGCCTG GCTGCCTAGG 1200
AGCTGGGCTT AGAAGTGGAT AGTGCGGGGC TCCCAGGGTA ATGACATGGC CCCTAGCAAC 1260
CACAGGCTGC TCAAACCAAC CGCCTCAGCT GCCTCTTGCC TCCAACTTAT CTTGTAATTG 1320
GAATTGGGAT CCCAAGGTTC AACTCGATTC TGTGTTGTGT CAATGACTTA GCCACTCTGA 1380
GCTTCAGTTT TGCTGTCTTT AAAGTGTGTG TGTGTGTGTG TGAGAGAGGG GGGGGGGCTG 1440
TGTCTGTGTG TATCTGTATC ACTGGTGAGG TGTTTATAAA ATATGTGTGA GAAAGGCTTT 1500
TTATAATAAA TAAACATTGT ATTAAAAGTA TTCATCATAG GAGGTCATGA TGACCTGAGC 1560
CTGTAGTTGC AATTTTTGGG GGAGACCAAA GCCAGAGGTC ACTGAGCTCA GGAATCTGCA 1620
GCCAGTCTGG GCTCCCATCT CCAAACTTAG GTGGTTCAGT GGTTATCAAC ACTGGTTGCT 1680
CCTCTGACCC AGGTTTGATT CCCAGCACCC ACATGGTGGC TCACAAGTAT CTATAATTCC 1740
ATTTCCAGGG GAATTGATAC CCAGTCTGGC CTCCATATGG TGCACAGAGT TACATGCAAA 1800
CAAAGCACCC AAACACATAC ATAAACTTTT TTTTTTAATT AAATTATTTG GAGATGGGCA 1860
TGGTGGTGCA TACTTTTAAT CCAAGCACTC AGGAGGCAGA GACAGGTGGA TTTCTATGAG 1920
TGGGAGTGGG AGGCCAGCCT GGTCTACAAG CCCAGTTCCA GGATAGCCAA GGCTATTACA 1980
CAGAGAAACC TTGTCTCCAA AGAAAATTTA AATTATTTGG TACATCTTAA ATTTTACACA 2040
GGATATAGGG CCAGTGAAAT GGTTCAGCTG GTAAAAAGCC CTTGCCACCA ATCCCCAGAA 2100
CCCACATCAT GGAAGGAGAG AGCCAACTCC CCAAAAATTG TCCTCTGATC TTCACACAGA 2160
CACACACAGA CACACACACA CACAACCAGA TAAACAAACA AACAAACAAA AGGAATTTAA 2220
TTATCAGATT ATCAACTATG CTCAAGTATG GCTGAACCTA TAATGTAGCT TCAACTATTA 2280