EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM113-23480 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Neural_tube_embryo 
Coordinate
chr8:10663630-10666440 
TF binding sites/motifs
Number: 14             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Alx4MA0853.1chr8:10666240-10666257GTTTGTTAATTAACTGG-6
Foxd3MA0041.1chr8:10664758-10664770AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr8:10664762-10664774AAACAAACAAAC-6.32
Foxj3MA0851.1chr8:10664751-10664768TACAGATAAACAAACAA+6.04
Foxj3MA0851.1chr8:10664138-10664155AAATAGTAAACAAATTA+6.09
RFX1MA0509.2chr8:10664187-10664203GGTTGCCATGGGAACA+6.38
RFX1MA0509.2chr8:10664187-10664203GGTTGCCATGGGAACA-6.4
RFX2MA0600.2chr8:10664187-10664203GGTTGCCATGGGAACA-6.65
RFX2MA0600.2chr8:10664187-10664203GGTTGCCATGGGAACA+6.83
RFX3MA0798.1chr8:10664187-10664203GGTTGCCATGGGAACA-6.85
RFX3MA0798.1chr8:10664187-10664203GGTTGCCATGGGAACA+6.92
RFX4MA0799.1chr8:10664187-10664203GGTTGCCATGGGAACA-6.31
RFX5MA0510.2chr8:10664187-10664203GGTTGCCATGGGAACA+6.96
RFX5MA0510.2chr8:10664187-10664203GGTTGCCATGGGAACA-7.13
Enhancer Sequence
CATCAGGATA TACACTAAGC ACGCCCTCCT TCCCAGCAAC TGACACCTTC CACAGAGCCA 60
GGGCTCTCTG TGGCAGGCAC TAAGCATCAG CAGCCTGCTG ATAATTCTCT GACAACTTCA 120
TCAGCCTCCT GGAATACAAA CAGCCATAGA AATATTGACC AGTTGGATTC TCCGGCCTTC 180
AGAGTGTGAG CTCTATGGTT GTATCCAGAC ACTTCTGTTC CTACAACTGA AGTAGAGATG 240
ACAGTCTCAG CACACAGCAG ACATCAAGCA ACAGCAAGAA GATGACACCA TTTGGTGAGG 300
TTCCTCTAGC TGTGCAGCCT CGTGGTATGA AACATAACCC TTGGCTTCCC CATTTATAAC 360
ACAAGCTGGC CTTCGAGAAA GCTTAGTTCC TCAGAGTCTC TTCCATGTAA AAGAGCACTA 420
AGGGGTTTTG TTCCTGTTTT TCTTTCAAAC GTCAGAAAAG CAGACTCTGG AGTAGAGACT 480
GAAACCTTGG GGCGTGTTCT TGAGTTTGAA ATAGTAAACA AATTAAAGAA TTGTTTTCAA 540
CAACCCTGTA CTTCTCAGGT TGCCATGGGA ACAGGGGTCA GCCTGTGGGG ACTGGAGGAG 600
TCTTTCAGAA GGGATAGACC ACCTGTGGTG AAGCTAACCT TTGAAGAAAG CCGGTTTGCT 660
CCCTGCATAA AGCCTGAAGA CTACCCTGAG AGAAATCCTA CTCGCCTCTG GTCTGTTCCC 720
TAGAAGTGAC ATACAGCCAT CATTCAAATT AATGTCTGTG CAACTATGTT TGAAATGATC 780
AGCTGGTTGG CCGAAAAGGA GCAGCTGGTT GGGGTTTCTT CTAGCTACCA ATGGCAGACA 840
GCCTCGGCAG ACTTTAAGCA GTTTTAGCAG TTAGTAATTG TTTGTACTGA TTACCACATT 900
CAGGATTCGA TTCACCTATA AGGGTGTGTG ACCTGCCACA TTTATGATTA TGGGGAGAGG 960
ACTAAATCAT TAGCTTTGAT AGTTCTCAGA GCTGTTTATT GTGTCTCTGG AAGGCTAAAT 1020
GAATGAATGT GTCAGTGTGA TGCTGGTATT GGTTGCAACT TCCCAAACAT AAAGTATGCC 1080
CATTTCTTGG ATCACTAACT CAAATACACT AATGCTACCA CTACAGATAA ACAAACAAAC 1140
AAACACAGAA GTCATTCCTT GCTTTGGATT GAGATAAATA CTTCTTAGAG AATTCCCTTA 1200
TGTTTATGTA GCTTTCTATA TTTGAATGAG ACAGAGCAAA GATCTGAACA ATAATATTCA 1260
TGTTTACAGC TAGCCTTCTT GGATCAGTGC CCAAGTGAGG TGGCTAATAG GATCAGCTCT 1320
GCGGCCTACT GTACCTCCAT GCCCTCCCTG GGGAAGCTGC ACCCTGGCAC CACACTGGGA 1380
TCTGGAATCC AAAGAATGTG TTTGCATTTA TCCCACAACT CTCCTTTACT CAGGGGTCCA 1440
CCCCTGGGAT TCCATTCTGG TGACTTTCAA ACGTGTAATT ACTCATTAGT CCGTTCCCAC 1500
AGTCATGGGG AGGACTTGTT TACTGTTCAG AGAGGGTGGG GAACGGAGTC TGGGAGTCTG 1560
CGTCAGTTGA ATATCATGAA TAAACACACA TCTGCCGTGA CCACAGCGTT CCTGAGCACT 1620
GGAGATTTAG GAATCAAAGT CTATGTCTTC GTTCTTCAGC TCTGGCACTC TCGGAAATTT 1680
GCCTGTAGAC CGTCCAATAG CAGCCCCTGG TCCCGCCTGC GTCTAAGGCT CCTGTCAATA 1740
AATGATGAGC TGGGTTTGTG CAGCTTGCAC TTCTATGTTT CTTGAGAGAC CTGGTTCTGG 1800
TTAACACAGC CCTGTACTTT GGCCACACAG AGTTCTGGTG TCTCCTCAGG AGGTGAGAAA 1860
AGATGTGCCT CCCCGTGTCA CAGCTCTCCA ATACAACAGA AAGAGGCTCA AATCACATGC 1920
ACAGAGCACT GGGCAGTGGG GAATCTCATC TGCAATCACC ACAGGGCACA GTGAGTCCCC 1980
AAACCTCACA CAAGCATACT TAGTTGCTGA GAATCACCCA CCGGTGGTGT ATTCACTTGG 2040
TCTGGCCTTG AAATATTTAG GCCATGAAGA TAGTCTATGG ATTGTGTAAA TGACATTTTT 2100
TTTTGTTTTT GAGACACAAG TGCACGCAGA GTTGCCAAGC CAGTCAGTAG AGTATTATCT 2160
ATAAAACAAA CACGCCAGAA CACCTTTCCT CAAGTCCCCC TTTTACCTCC AGGCCTCAAG 2220
CACCAAATTG GAGTTCACAG TGTTACAATA AGGTCTCCCT GCAAGTACAG ATCCAATGCC 2280
AAGAGGATGG AGGGAGTTGT CTAGGGAACA GAGTAGGAGG ACTGGGCTTA GTGACTAAGA 2340
GTTGTATTCT GGCTGAGATG CTAATGTTCC GGTGACCTCA GCCAAGTCCT GTAAATTGTT 2400
ACTATCTGCA AAGTGGAGAT AATCGACAGC CCTGCCCATC CTGCAGGAAG GCCGGCAGAG 2460
ACTAATTAGA GAGCTCATTT GAGATTCAAA GTACTTTGTG GCCCACAAGG AAAGTGTTGG 2520
AAGAACAAAG GAAAAAGCTT GCGCTCTGCT CCTGCAGTCT GGGGACCACA CCAAAGACTC 2580
TCCCAGGAAT TCATCTGTTG GAGCACCAGT GTTTGTTAAT TAACTGGTAT TAGGAAGTCA 2640
TTGTGGCTAC CAGGGGTTAA TGGAAAGACT GAACTTGCTG AGATGGGTCT ATAGAGGTGT 2700
AAATCGAGGC TTCCTTTGCT GAAGGAGAGG AAGGGGTCCC TAAGCTAAGC ATCAGGCTGC 2760
CTGGAGTTAG ACATCCAGTC TTGCAACTAT CTTCTAGAAA TTCCAAGCAG 2810