EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM113-22609 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Neural_tube_embryo 
Coordinate
chr7:80750660-80754190 
TF binding sites/motifs
Number: 11             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
EGR1MA0162.3chr7:80751889-80751903GCTGCGTGGGCGGA-6
EGR2MA0472.2chr7:80751891-80751902TGCGTGGGCGG-6.32
EGR3MA0732.1chr7:80751889-80751904GCTGCGTGGGCGGAA-6.13
FOXA1MA0148.4chr7:80753347-80753363CAATGTTTACTTAGTA-6.13
FOXC1MA0032.2chr7:80753349-80753360ATGTTTACTTA-6.02
FOXD2MA0847.2chr7:80753349-80753362ATGTTTACTTAGT-6.32
Foxa2MA0047.2chr7:80753350-80753362TGTTTACTTAGT+6.44
RREB1MA0073.1chr7:80753721-80753741GGGGGGGGGGGGTATGGGGG-6.01
RREB1MA0073.1chr7:80753720-80753740GGGGGGGGGGGGGTATGGGG-6.44
ZIC1MA0696.1chr7:80751806-80751820CTCAGCAGGGGGGC-6.18
ZNF740MA0753.2chr7:80753720-80753733GGGGGGGGGGGGG-6.03
Number of super-enhancer constituents: 28             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_00389chr7:80728813-80754010pro-B_Cells
mSE_01523chr7:80662346-80773459Th_Cells
mSE_02681chr7:80731224-80764627HFSCs
mSE_03000chr7:80728755-80771487TACs
mSE_03459chr7:80752445-80752863Bone_Marrow
mSE_03982chr7:80751273-80752089Cerebellum
mSE_04060chr7:80751282-80753626Cortex
mSE_04416chr7:80751110-80753688E14.5_Brain
mSE_04807chr7:80751431-80753544E14.5_Heart
mSE_05509chr7:80751081-80753496E14.5_Limb
mSE_06583chr7:80751249-80753369E14.5_Liver
mSE_06612chr7:80751246-80753522Heart
mSE_06612chr7:80753757-80754126Heart
mSE_07229chr7:80751242-80753696Intestine
mSE_08080chr7:80751435-80753991Kidney
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mSE_09049chr7:80751325-80753714Lung
mSE_09494chr7:80751426-80754236MEF
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mSE_10773chr7:80751274-80753605Olfactory_bulb
mSE_11288chr7:80751310-80752907Placenta
mSE_11971chr7:80751381-80752954Spleen
mSE_11971chr7:80752979-80753451Spleen
mSE_12651chr7:80751315-80752082Testis
mSE_12651chr7:80752108-80752838Testis
mSE_12880chr7:80750510-80751237Thymus
mSE_12880chr7:80751301-80754308Thymus
Enhancer Sequence
GATTGCTTGT ATGTAACGAT AGTTTTTTCA GTGCCTGCTA CCAAGGTTTT CTAGGTTTGG 60
GCCTTCTGCT CCAAGGTAAA AATTGCTCTG AGCATTAATA CCCAATACAA AGGTGGCAAT 120
TCTGAGTCAG ACTTTCCCAC GGCTCCCAGA GACTGTTGCA TGTACATTCC CAGCTCACCT 180
GCAGCACGCA GGAGTGCAGG CTAGAACAAG CTAGCCTCAC CTAGGCTCCT TCTGGATATT 240
TTAGTGCAGG CTCCACCAGC AGCAGCATTT TAGGCGGTAA CAATTTCCTT TTGTCTTACT 300
TTCTAAATCT GTAAAACATT CCTAGCTTGC TTGCAGTTTG CAGAGGGAGT GCAGGACTGA 360
AGGAGGTAGC CTGACACCAG CTCCTAAAAC TGGTCTTAGC ATAGCACTTG GCAGAGTTGA 420
GTTTCAGGAG CTGTAATTGG TATTATTTAG CAAGGCACAA AAGTTCTGAG ATACACAGCA 480
AAGTTCATAT CCCTAAAGAA ACTTTCACTC CAATACGGAT TTTCTTTTTT TTGGTTTTTT 540
CGAGACAGGG TTTCTCTGTG TAGCCCTGGC TGTCCTGGAA CTCACTTTGT AGACCAGGCT 600
GGCCTCGAAC TCAGAAATCC GCCTGCCTCT GCCTCCCGAG TGCTGGGATT AAAGGCGTGC 660
GCCACCACGC CCGGCCTCCA ATACAGATTT TCATAGCACC ATCTGACCCT ATCTGGGCAG 720
AAACTAAATT TTAAATAGAA AAATGGGCAG GTATTTTAAA CGAGGGAATT GTATCACTTC 780
CCCAAGTGAA CATGTTCCTA GAGTTAACCA TCCCTGCACA GTTTAAATCT CCTTCTGAGC 840
TACATTAACA TGAAACAAAT TCAACAAATT TTATCCAAAG AACGTGGGGG ATTGCACCAG 900
TTTTGAGGCC TCCATTCCTA TCCTGGAAAC CATAGCTCAT GTCTTGAGGC ACGCCCCAGG 960
CTTTTCTCCC ATCTAGAACA CTTGTGGGAA GGGAGCTTTG TGCAGTTGTG ATAGTAAACA 1020
TTCCACACTC TAGAGACCGA CATACAACTC TCTCTGCTGA GCTCAGGCTG GGCCACTGGC 1080
TTTGTTCTCC GCACACATAA ATATAAGTTT TGGAGGCCAT CTTGGAAACA GGAGAACTCT 1140
GGGCGCCTCA GCAGGGGGGC TGACCGTAAC TAAGCAACGG AGGCGCACCC AGTGCCGCGC 1200
AGCCGCAGAG CGCCGCGCAC GAACGCCCCG CTGCGTGGGC GGAACTGATG GGGGAGGGCG 1260
GCGGCGGAAA ATTACCTTAG GTTCTTCTTA AAGGCACAGA GGCCTTACCT GCTAAAGGTC 1320
CAATCGCCAG CCGATCTAGG GTGCATGTTT TACAAAGCCT ATTTGTAATG CAGTCGACCT 1380
TATATTTCTC TGTGAATACG AATTTTATTT ATCTTCTCAG AGAAATAGAA TCCAATCCCA 1440
AATTAACTTC CCCGTGTAAA CTTCAGTCAC TAAGTAAGCA AATAGTGGAA TAAACAGGCT 1500
TCTTCAAAAT CAAGTTAACG GGCATGGGGA GGGGAGAGCA AATCAAACAA AACAGCCACC 1560
AAATTAACCC TAAAATGTCG AATGGCGAAG AAAGAGAGCT AATGAAGTCA GGAAGGGGAT 1620
GAAGTGAGCA CCCAGGAATA AAGTCACGAC TGTGTAGCAG CTTTAAAAAT GTACAGATTC 1680
TGAAGCAAGG AAAATTTATT CTTGACAGAT GGATTGGCAG ATTATAGTAT ATACTAAAAA 1740
TTAACAGAAA AACAAGATGT CTGTTAAGTA AAGCGGGATC AGAAAACTCT CCGCATAGGT 1800
CACTTTTTTA CAGCAAATAA AACCATAAGA CTTTTTGCTC TTCTTTTTAG AAAAAGAAAT 1860
GCAGTTTTTA AAAGTGTTTG GTGGCACACG GGTGCTGATG GCGGTGCAGT TATACCACAG 1920
TACGCTTGTG GAGGTCGGAG GACCTTGCAG GGAGTTTGTT CTCCCATGTA TGTTCGGAGG 1980
ATTGAATTCA GGTCTTCAGA CTTAGCAATA ATCACTTTTA CCCTCCGAGC CTTATCTCCA 2040
GCCTCCACCT CGCTTCTTAT CAAAGACATT TCCTTCGATC TAGCAGTTTC TATGATTTAC 2100
AAGTTAAGGA ATAATTCATA ATGGTCCTAC TTATGTGAAA GAATAAACGC AGGGTCTGGT 2160
TCAATGGAAA TCTGCAGGGG ATAATGTGCT GCTCTGCAAG TCTCTACAAT TAATCTCCTT 2220
ACTAAAAGCC TTCCTTGAAA ACAACAACAA AACAAAACAA AACAAAACAA ACAACGGAAG 2280
AAAAAGAAGA AGAAAAGAAA AGAAAAGTAG GAAAGAAAAG AAAAGGAAAA GGAAAAAAAC 2340
GTGTCCTCTC TGAAATAAAG CCATTCCCAC ATTCCGAATC TCCATTTCCA ACGACAGAAG 2400
ATCTTTTGCA CTCCTCAGAT GGTTTGCTTG TTATAAATGA TTTCTCTTCC AAACTGCCAT 2460
TAGGTGTACC CTAATAAACA GCACCATACA TCCTCGGAAG CACCTGGGGC TCTCACCACA 2520
AATGGGGGGA TGTTCCAGTC CTATCACGGC CCTAACAAAC CAATTGTCAA TCCCAGAATC 2580
GACCATTTCT TCCCATGCTT CTCAGCCATT TTAAACCTAA TTTTCACATC TACTTTAAAT 2640
CCCTACAAAT CTTCCCCCTT GTCCCTACTG TAAAGTCTTT ACAATGTCAA TGTTTACTTA 2700
GTAATTTGTA AAGGGTACCG TGTTCCTTTC AGAATATGGA ACCGTGTGAT CTTGATACTA 2760
AGAAAATGTT TTGCAATGGT TTAGTGTGCA GCTTGTTAAG TTTCAATTTG GCTATTAAAG 2820
AAAGGACCAC ACTAACTTTC TAGAAGCACA GGGAGATAAG TCCTTTAGAT TAACAAAACA 2880
AAACAAAACA AAAAACCAAA ACTGTGTGGT GCAGAAGAGG TGCCACCACC ACCTTGAGGG 2940
GAAAGATTTA ATGTCTAAGA ACTGTGTCTT GGAAATAAAA ATACACACAC TTGCAGCTGG 3000
TGGGGCCATG TCCTTAATTG CCTTCATGTT TCATTACCAC AGCTAAAGAA CAGAAGCCTT 3060
GGGGGGGGGG GGGTATGGGG GACTTTTGGG ATAGCATTTG AAATGTAAAT GAAGAAAATA 3120
CCTAATTTTT ACAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAGGG AACAGAAGTC TGAAACGGCT 3180
GCTTTGTAGC CGAGACGGTG TTTCTAACGC TTGCAGAAAG TATGGTGTGG GATGACAGAT 3240
GATGCCGGCT AGACAAGGCA AGTTCTCATG TCCTTACCAC CTTTCTTCCA GAGGTCTGTT 3300
TTCTAGCACA GACTGTTCTG TATAATTCCT AGTAATCTAG GATAGTCCCC AGAATAAACA 3360
GAGAGAAAGG CCAAGAGGAG AGCAACTAGA ACACAGAGAA CAGAGACAGA ATGTAGATGG 3420
AAAGTCACCA GACTCCTCCC TCTTAAATTC TCTATATAAA GTGGGTCAAA TTACTAAGAG 3480
ATCAAATTAT GATAAATTAG AATCCAATTC TCTTTAAGCC ATAATGAAAT 3530