EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM113-21014 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Neural_tube_embryo 
Coordinate
chr6:87941660-87945330 
TF binding sites/motifs
Number: 19             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXA1MA0148.4chr6:87942267-87942283TCCTATGTAAACATTG+6.11
FOXB1MA0845.1chr6:87942270-87942281TATGTAAACAT+6.14
FOXC1MA0032.2chr6:87942270-87942281TATGTAAACAT+6.32
FOXD2MA0847.2chr6:87942268-87942281CCTATGTAAACAT+6.12
Foxa2MA0047.2chr6:87942268-87942280CCTATGTAAACA-6.92
Foxd3MA0041.1chr6:87945229-87945241GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr6:87945233-87945245GTTTGTTTGTTT+6.32
HNF4GMA0484.1chr6:87942970-87942985AAGGGTCAAAGTTCA+7.26
HOXA13MA0650.2chr6:87945004-87945015GCCAATAAAAC+6.14
HOXA13MA0650.2chr6:87942284-87942295CCCAATAAAAC+6.62
Hnf4aMA0114.3chr6:87942971-87942987AGGGTCAAAGTTCATG+7.1
Lhx3MA0135.1chr6:87942213-87942226AAATTAATTTTTC+6.11
NR2C2MA0504.1chr6:87942970-87942985AAGGGTCAAAGTTCA+6.38
Nr2f6MA0677.1chr6:87942971-87942985AGGGTCAAAGTTCA+6.64
RXRBMA0855.1chr6:87942971-87942985AGGGTCAAAGTTCA+7.25
RXRGMA0856.1chr6:87942971-87942985AGGGTCAAAGTTCA+7.19
RxraMA0512.2chr6:87942971-87942985AGGGTCAAAGTTCA+7.14
STAT3MA0144.2chr6:87944483-87944494TTTCCCAGAAG-6.62
Stat4MA0518.1chr6:87944480-87944494CGGTTTCCCAGAAG-6.13
Number of super-enhancer constituents: 1             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_12663chr6:87942389-87945299Testis
Enhancer Sequence
CAATCTACCT TGGGACTTAT ATATATATAC ATGAAAGTTT AAAAAAATAA AACAAAAAAC 60
AAAAATCAGT CATCTATTAG GAGGTGGTCA GGGCCCCTAA CACATCTGTG CCTTGTCCCA 120
GCCTCTATCT TACGTGAAGA AGCTGAGGTC CAGCAAAGAG GTGGGCCCAG GAGGTGTGTT 180
GGAATATAGT CCAAGCAGAC TTCCCAGCTC CTGCTCTTGT CATTGTCCAG CTAGCAGGGA 240
TCACAGGGGC ACCTGGCTGG TCACATCATG ACAGATGAGA AGCCACAGGG TGGGCAGGGA 300
ATGCAGAGTG AGTGAGTTCA CTCAGCTTCC TGGGATAACC ATTAAAGTTG CTCAAAGATA 360
ACCATCAGGT GTGCCAAAGG GGCTCTGCAT GTGTTTCACT GGCAAAGGGC CCAGAAACTG 420
CCTCTAGCTT CAGGGAGACC TCCCCAGGGA AGGGATAGCT GCTATTTGTT GCTTAAGCAG 480
CATGCTTGCT GAATGTTAAT AAGGCTGAAA GACGCCCCTC CCTGCTTGTT ATTATTGACA 540
TAACAGAAGA AACAAATTAA TTTTTCTGAT AATTGTAGAC TCTGGGTCTT CTCTATGTAA 600
GGTCAACTCC TATGTAAACA TTGCCCCAAT AAAACCTATC AAATACTTTG TACAATTCCA 660
CCAAAAGGAC GTTTCTGTCC TTTTCTCACT GTGTGCCACA GAAGGAATAA TCGACATTTG 720
GACATTTGGT GGGGAGTGTT CATTTTTCAA AAATTTTGAA TTCCTCTGTG TCCCTCTGCC 780
CCCAAGAAGT TTCAGGCCCT GTTGTAGACA AAGGAATTTT CAGTTCTGTA ACCTAGCTAT 840
ACTTTTTACT CTAAAAAAAT GGTAGTTTAT ATTTATTCAA AGCAGGCTGA GACGGCTCAA 900
CACTGATCCC TTGCCTAGTA GTCCTGAGGG CCTACATTCC ATCCTGCCAC CAAAAAAAAG 960
AAAAAAAAAA AAAAAGAAAA AGAAATATTC TTTATCAGCT CCATAATTAG CAGACTTAGC 1020
TTTTCTCCTT TAGAAGTTCC CAAGTTAGAT TTAGATTTAA GTGAATTTTG TTTTAAAGTT 1080
CAGGACAAGA AGGCCCTCAT GAAAAGCAAC CACTGACCGA CCACACTGGC CAGAGCCATG 1140
GCTGGCCGTG GGACGACGAC CTCATCCCTA AGACCCTCGG GACTGAGGAG CCCTTAACTG 1200
AACAGAGCAG AGCTCAGCAT GACCCAGCCA AGAGGCTGGA GCGTTCCTGT CTGTGGCTCT 1260
GTGCCTGTGG CTTGTGGTTT CAGAGTAGTG TTAGCTATTC ATCTGGAAGC AAGGGTCAAA 1320
GTTCATGTCT GGGGTAAATT GCACAATGAG CAGTGTTTCC CCAGCCTTAG GCAGTACAGT 1380
TTTTCACTGT TAGACACACC AGTCAGTCCT GCCTCCTCAC TCCTAGTCTT GAGTAAAAAT 1440
GTTTTTGTTT TTTTGTTTTT TTTGTTTTTG TTTTGTTTTG TTGCTTTTTA ATGTTCCTGT 1500
GCCATAGCTA AAGTAGAAGA GTGTCAGGGC ACAGAAAGTC AGGGACTGGG GGTTCAGGGC 1560
AGTGGCTCCT TTCATTTCTG GGTGGCCCAG ACCAGGATCA ACACCATGGG CCAGGACTTT 1620
GGGCACTTTG TAAGCCTTCA AAATACTTCA AGATAAAACT TCAAGAGTCG GGGGTACATG 1680
CCTTTAGTCT CAGTACTGGG GAGGCAAAGG CAAGAGGATC TCTGAGTTGG AGAGATCCTG 1740
GTCTATATAG TGAGTTCCAG GATAACCCTG GCTATGCAGA GACCCTATCT CAAAAAAAAA 1800
AAAAATCACC CCAAAAAAGG GTGAGCAGAT CCCTGGGGAT AACCTAGGAC CACAGTGGCC 1860
TTGATCTAAG GAGTTTCTGC CCTCGCCCAT CCAGGTTGGT CTTCTGTTAC TAAATACCGA 1920
GGCCTTGGGC TTTGATTTTA TTATTTTTTT TGAAGCTTAA ATTAATCCTG CCCCCATCCA 1980
AACCAGTGTC TCCCATAGCC TGGAGGCCTG AACAGCCTAT TCTACATGGG GGCCCTTCTG 2040
TGATTTCAGC TTAACACTAA TCTCCCACAC CCTTCCTCAT GCCCCGTGAC TCCACACACC 2100
AAGTAGGGCT GTCCAGTGCC ATTCCTGCGA CTTTTACATG TCTTTCCTCC AGGGCACCTC 2160
AAGTTCTGGG ACATTTTTGT GCTAGCTAGT CTCTTCTGGT CCTATCGGCC AGTCTATGTA 2220
ACCAAGTTCC GTGTAACTGG CACTCATGCT CACAAACTTC ATCTGCCTAA GTGAGCTAGG 2280
AAGGGCCTCA GGCCAGGTGC TGGGGACAGG GTAGCCAGCC CCATCCAGAG GGCCTCAGGC 2340
GACCCACAAG GCTGTTGCCC AGCTCAGATT AGCAGGGATG AAGGAAGAGC TTGTGGCTGA 2400
CATGGTTTTG GCCCACTTAG GATGGCCCAG CTCCTGGAAA GATGCAGCTG CCTCCCTGGT 2460
TCTCGGGTTG GAAGGCAGCA GCACCTACAG TCAGTCCCAC TGCCTTTCAG CTCAGCAGTT 2520
GGCCGTTGGG TTAGCGTTGG GAACACTCCC CGCCCCTCCC CCGCCCCCAT CCTATCTCCA 2580
TGGAGATCCA CACTTTCCCC GCCCACCAGC CACAGAGGCA GAGGCGGGGA AGGGGGGCAG 2640
GGGCACCGGC ACCAGCACCC CTGCGCTGCA GTCACAATGC CTTCTTCTCA CAGACCCTTC 2700
TCCAGCCAAT AGAAACTAGG GAGGATGTAG TGGGGGTCTT GAAAATGTGT TCGGTGGCCC 2760
CAAGGCCGCC CTACATTAGT GTTTACTGCA GCCACGCCCT TGTCCTATGG ATCTGGCGAC 2820
CGGTTTCCCA GAAGCCAGAG AGGGAGGCTT CAGGGGGTTC CCCATGGACC ATATTCCAGG 2880
TAATTTGAGG TCATTGCTTT GGAGACTGCG TCCCTCCCAC ACATCAGGTT AAAGTGTCTC 2940
CTCTTTAGTT TTCGCCCAGA AAGCTGAAAG AGACAGACGG ACAGACAGAC AGACAGACAG 3000
ACAGAGACAG ACAGACTGAC AAACCTGCAA GCCGACCTCT GGGGTGCCAC AGCCACCTGA 3060
GACTACCAGA CTACTGGCTG GCTTCTCCAG TGACCATTGG GTGAAGAAAG GCCCTATTCC 3120
TGTATTTTCC AGGCCTGGGC AGCAAGCACC TTATGGCTCA TTATCTCAAA TCCAGAACCC 3180
TGGTCCCTGC AGTAACAGGG ACATATAACA GCCCCATATG GCACACCACT AACATTTCTT 3240
GTCCTTTTAC TTATTTAATT TCCTTTTGTT CCAGGAAATT TAAAAAGCAA AAAATAAAAA 3300
ACACCCCCCC CCAAAAAAAA ACAAAAACAA AAACCAAAAA ACAAGCCAAT AAAACACCAA 3360
GACAACAAAC CAAAAAACCC AAGCAAAACA CAGTGCTGGT CAGACCCCTC TCAGGGCTGC 3420
TCAGGCTTGG GCCAGGGAGA AAGTACAGGT GGACCAGGCA CATGATGGAT TAGAACAGGA 3480
GGGGCCGAAG CCCTGCAGCC TCATGTGGAC CCCAGCATAC ATGGCATACT GAGTGTCCTT 3540
TGTGTGGGGT TTTATCATCT TTTTTTTTTG TTTGTTTGTT TGTTTTGTGT GTGTGGTTTT 3600
TTTGTTTTGT TTTTAAAGAT TTATTTATTT CATGTATGTG AGTATACTGT AGCTGTCTTC 3660
AGACACAACA 3670