EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM113-20989 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Neural_tube_embryo 
Coordinate
chr6:86428060-86430650 
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
HNF4GMA0484.1chr6:86428335-86428350TGGACTTTGAACTAT-6.26
Hnf4aMA0114.3chr6:86428333-86428349GTTGGACTTTGAACTA-6.61
MyogMA0500.1chr6:86430233-86430244GACAGCTGCAG+6.62
Nkx2-5(var.2)MA0503.1chr6:86429577-86429588AGGCACTCAAG+6.14
Tcf12MA0521.1chr6:86430233-86430244GACAGCTGCAG+6.14
Number of super-enhancer constituents: 12             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_04601chr6:86430282-86430902E14.5_Brain
mSE_05131chr6:86427730-86430954E14.5_Heart
mSE_05692chr6:86428055-86431189E14.5_Limb
mSE_06804chr6:86426868-86432155Heart
mSE_07594chr6:86429543-86431037Intestine
mSE_08230chr6:86427892-86431832Kidney
mSE_08730chr6:86427785-86429373Liver
mSE_08730chr6:86430044-86431223Liver
mSE_09131chr6:86427067-86431486Lung
mSE_11195chr6:86426823-86428540Placenta
mSE_11195chr6:86428601-86431050Placenta
mSE_12694chr6:86430060-86431049Testis
Enhancer Sequence
TGAGAACCCG AGCACATCTG CAGGGTAGCT AGTGCTTTAA ACTAATGTCT GGGCAGCACT 60
CATGAGAAAC CATCACACCT ATACTTGCCT AAACTGTCAG CTGCCTCTCT CTAATCCACT 120
GCTGGAGTTC CAACGGCCAT GACTTCCCGC TTCCCACTGG CACTGCTTTA GTTCAGCAGC 180
TCCATCCTTT TTCTGGACTC TTGGCATAGT TGATAACTTG TCTTCCTGTA TCCACTCTCC 240
CCTTACTGTA ACTCTACTCC ATAAGTTTGG GGTGTTGGAC TTTGAACTAT CCTGTAACAA 300
GGTGCTTGTT TCAAATTCAC CATGCTCCTT TGTTTAAACC CCTCTCAGAG TAGAGCTCGG 360
GCACAGTGCT TTTCTAGCCT GCAAGAAGCC CCAACACCCA GGAGCTGGAG GCAGAAGGAT 420
CAGAAGTTTG AGGTCATCCT ATGCTACATA GTGAGTTTGA GGCTGGTCTG AGTGACAGGA 480
AATGTCTCAG AAACAAAACT GAATCTTTCA AAGGCTCCTC CAGGTTTTAC TGATAACTGT 540
ACCTGTTACT TTTACTTTAA ATTTCTTCAT GATACACATA AGATCCTGGT TCCTATGGAA 600
TGGAATGCAG CTCACGGGTA GGGTGCTTGC AGTGTGTAGT CAATGGCCAA GATGTGAACT 660
CCAGCACCAC AAGAGACCAA AACAGCCCCT GAGCCGGCTT TATTCTGTCC ATTCTCCAGC 720
CATCCTCCCC TTTCCCCAAC GTGCTCCCTT ACTCTCAGCA CTCAGGAGGT GGAGCCAGGC 780
AGACCTCTGG GAGTTTGAGG CCAGTCTGGT GTACATATTG AGTTCTCTAA CAGCCAGAGC 840
TACATAATGA GAACCCTGTC TACACACATG CAGACAGAGA GTGTGTGTGT GAGAGCCTCA 900
GCTCAGCCAC CTTTGCACTT CCTACAGTGC TCCAAGGCTA GGTATGTTTT CGTTTGCTGG 960
GGTTGTGATT TGTGACTGGG TAAATGAGTA GGTGAGCCCT GTCTGCTGCT GCACTCCACT 1020
GACAAGCCCG AAGTTGATCA GGCTTGGTCC CAACACCTCC AGGCTCACTG CTTATCTTGC 1080
ATAGTGAATA ACCCAGCACT ACGTTTTGCC AGGTGGGAGA CATGCAGGCC CCTCATAGTC 1140
CTGCCTCATC TTCCCCAGTG CTGGAATTAC TAGCATTGGA CACCATACCA AAGGGCTAGA 1200
AGGGTTAGGG ATGGAGTTGA GGGTTAATAC GTTAATACCT GCTGTTGAAT GGTATTTTGC 1260
AAACTTGACA AGAGTCTCTG TGTCTCAAGG CCACCTTCTG GCATCTTCCA ATCTTTCAGT 1320
GTCACAAGCC AGGATGTCCT GTCAGGAAAC CTGAGTAACA CCAGCCTCTC TCTCTGTGGG 1380
TGAGCTTTGT GGGGGTGAGC GGGGGTCACT TCCTTGGAAG CTCCTTGCTG CTTCTGACAG 1440
GCTTTGCTGA GCCCTGCAAG TGTGCTGGAG AGTGACCAGC CTCCAGGGCC TTCTGCTCTT 1500
TGTCCTCAGC AATCTAAAGG CACTCAAGGG AAGGAAGGTG CATCCTCTCT GGGGAGGAAT 1560
GGATTGTTCT AATGTCTGCG ATCTGGCCAC ACTTGGCATC TGTGAAAGCA ACTTGCTTTC 1620
AGAGCACATG GAGCGCACCT GGCAGAGGTC TCAGATCACA TGCATGAGCT GAGGAATTGT 1680
AGCTAAAGAA AGCTAAAAGC TGGATGCTAT GGCTGTCAGG GTCAGATTAA TGAGTTATTG 1740
AGGTTGTGTG AATTAGTTTA TACTTCAGCT ATCTGTGATC TTTGCAATAT AAAAGCTAAT 1800
TCCCCAAAAA CACTTAAGAA AGAGCAATAA AGAGAGGCAG AGGCAGGCAA ATTTCTGTGA 1860
GTTCTAGGCC AGCCCTGTCC ACATAGTGCC AGGAGGAATT ACATAGTGAC ATCCTGTCTT 1920
AGAAAGAAAT GGGGGTTGGG AGGAAAGCAA TGATCATAAA TTGTATGTTG TCACACACAG 1980
TGTGGTGACC TTAAAATGGC TAATACCATG AAAATATCTA CAACTTGGTG ATGTGATTGG 2040
TTTACTGAAA ATGTATTTTT TTTTAAGCAA AGTATTCCAG ACAATGATAG CCAATTGACA 2100
ACCCCCTAAC AACCCTCACA GATGTCAGGG CAGGAATTTG GTCTCATGTT TCTGCCCCCA 2160
ACTCCTGGCC TCAGACAGCT GCAGATACAT ATTCCATGTA GCTCCAGTCT CTGAAATACC 2220
AAATGGAAAT TTACTGGGGC TCTCAACTAA GCCAGACTCT CACACAAACT GTACTGCCCC 2280
ATGGGACTCT CCACAGGGCC AGATATTTTA TGAGAACGGG CATTCCCAGT TGATTGGGTC 2340
AACAAAACGA AACCAAGGAA CTGTGTCTTA AAACTAATGT ATCCTGTTTA ATTGTACACA 2400
AGGGACACTC CACTCCAAAG CAAGAGCCAG GCAAATCTCA GGTTTGTAGA CTCGGTGAGA 2460
ATATTGGAGG CTTTTGTGGA GCTTTGTTTT CTTTAGAGAG GGATGACCAG CTGGCAGGGG 2520
GCTGGACGCT GCCTTGCAGG AGGAGGGCAC CAGCAGAGGA GACAGGAAAA CACAGTCAGC 2580
AAAACTGCGG 2590