EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
MM113-20660 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Neural_tube_embryo 
Coordinate
chr6:47228130-47229980 
TF binding sites/motifs
Number: 11             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxd3MA0041.1chr6:47229220-47229232AAAAAAACATTC-6.52
Gfi1bMA0483.1chr6:47228535-47228546AAATCACAGCC+6.02
RFX1MA0509.2chr6:47229402-47229418TGTAACCATGGCAACT+6.64
RFX1MA0509.2chr6:47229402-47229418TGTAACCATGGCAACT-6.64
RFX2MA0600.2chr6:47229402-47229418TGTAACCATGGCAACT-6.57
RFX2MA0600.2chr6:47229402-47229418TGTAACCATGGCAACT+6.63
RFX3MA0798.1chr6:47229402-47229418TGTAACCATGGCAACT+6.42
RFX3MA0798.1chr6:47229402-47229418TGTAACCATGGCAACT-6.57
RFX4MA0799.1chr6:47229402-47229418TGTAACCATGGCAACT-6.89
RFX4MA0799.1chr6:47229402-47229418TGTAACCATGGCAACT+6.93
RFX5MA0510.2chr6:47229402-47229418TGTAACCATGGCAACT-6.07
Enhancer Sequence
GTAGAAAAGA AATTTGGCGT AGGGACAAGA GACTAAGTTG TTAAAAACCA TAGCATTAGG 60
GCTGGGGAGA TGGCTCAGCG TGAAGGCTGG AGTTCAGATC CTTGCACCCT CGTAGACTTG 120
GAGGCCACAT GTAATCCTAG CACTGAGAAG GTAGAGACAG GGCACCCTGG GGCAAGCCGG 180
CTAATTAGAC TGCTGGAAGC AGCAAGTTCC ACCTTCTGTA AGAGAGTCCT CAATAAATAA 240
AGTGGAGAGT GACCGAAGAA TATACCCAAG GTGAACTCTC AACCTCTACA TGTGTGTGCA 300
CACATATGTA GTCTCACCTG AACACACATA TACCCACACA CGTTTGGATA CACAAGCACA 360
CATTCAAGTA CACTGTGCAC AAATACAAAC ACACAAAGAG AAGAAAAATC ACAGCCACAG 420
AGGCAGGACG CCTTCAGAAA TACATTTTAG TGGTGAATGG GCTGATGTAG TGACCAGAAA 480
CCATGCTTCC CAGTTCCAGA GAGACTATTC TGGAAAATAA GGGAGTGTGG AGTTGTTACA 540
ATGAACAAGG GTGGACATAA AAGGGTGTGT GTGTGTATAT ATATATATAT ATGCTTTCCA 600
AGTTCAATTT CTAATTTTTG ATGTATGGGG CTTTCTCCTA TTAGATGTCT CTAATTTTTA 660
CATGATAAAG TGTTAATGCT TTATGCTGTG CGTGGGGTAT TTACAGCCTC CTCCATTTGG 720
AACATGCTTT ATGAATTAGA ATTATGAATC TGTATTTCTC ATAATGATTT TGTTTTGATG 780
ATCATATCTG CATATTTGCT CCACTATAAA CTTCCTTTTG TGGGAGGAGA CTGATAAGAA 840
ACCAACTTTC TTTTTCCTCA GTGACTGGCT CATTGCTCCA GCGCCAGTGA TTGACATGTG 900
TCCTTTATTA CATTCTAAAC TACCCTTTAT AGGCAAGCTA TTTCTCAACT CTGCAGCCTG 960
TAACAAGATC TGATACTTCA TGAAACAGAA GCAAGTTCTG GGCTCTTCTG GATGCACTGA 1020
ACAGCATACA AAACAAATTT TCTCTCATTT TTTCTTTCTT TTCTTTCCTT ACAATAGATT 1080
TAAAAAAAAA AAAAAAACAT TCTGGCTAGG ATTCTATCCC ATTCTCTCAG ATCACCCATT 1140
CTCCAGCTCC TACCCCACAG GGCAAAGCAC TTAGAGCCTT TCCCATTTTC CCCAAGTCTG 1200
TGCCTGACAG GCATTTCAGC CATTAGCTCT GTCACAGGGG GCTGGCTAAG TGGAGGGCAA 1260
CCCTGAGGTA CCTGTAACCA TGGCAACTTC TCTGTTGGTG GCAGAAACAG GGACTCCAGC 1320
AAGGCGCAAC ATACATTTTG CCTTGTTCCT GTACCACAGA AATGCTATCA GGGGCTAGTG 1380
AAAATGGAGA TTGTGCTCAG GGCTTTCCTG TCTCCAGTAA TCTTTGTTCT CATCATATCT 1440
TCTATATTGT AGCTTTTGTT GTGTTTATTT TTGTTTTGTC TTGGTTTGCT TTTGAGACAG 1500
GATGTTAGTG TGTTGTCCCG GTTGTGTTAA ACTTCTAGTC TTAAATGAGT CTCCTGCCTC 1560
AGCATCCTAA GTAGCTGAAA CCACAGCTAT ACCCACCACC ACACATGACT GTGCTGCATT 1620
CTTTTTTCAC TAGAAATAGG GTCAGGTAGC CCAGGCTGGC CTCAGACATG CCATGTAGCC 1680
AAGGATAACC TTGAACTTCA GATCCTTCGG CCTCCACCCT CCACATTCTG GGATTACAGG 1740
TGTATTAACA ACATGCTTTG TTAGTGTGAT GAAGAAAACT AAACTCAGGC CCTCATATAT 1800
GAGTGGGTAG GTACACTATA AATTTATATT TTTTTAATAA ATTTTATAAA 1850