EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM113-20013 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Neural_tube_embryo 
Coordinate
chr5:135015060-135018570 
TF binding sites/motifs
Number: 12             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXA1MA0148.4chr5:135018355-135018371GTTTGTTTGCTTAATT-6.05
Foxd3MA0041.1chr5:135018351-135018363GTTTGTTTGTTT+6.32
GATA5MA0766.2chr5:135017925-135017935CAGATAAGGA+6.02
Gata1MA0035.3chr5:135017924-135017935ACAGATAAGGA-6.14
IRF1MA0050.2chr5:135015395-135015416GAAAGGAAAGAGAAAGTGAAG-7.86
RARA(var.2)MA0730.1chr5:135017605-135017622GGGTCACCGAGAGGTCA+7.36
RREB1MA0073.1chr5:135016055-135016075GGTTGGGGGTGGGGTGGGGG-6.52
RREB1MA0073.1chr5:135016054-135016074TGGTTGGGGGTGGGGTGGGG-8.38
Rarb(var.2)MA0858.1chr5:135017605-135017622GGGTCACCGAGAGGTCA+7.45
TFAP2B(var.2)MA0812.1chr5:135017738-135017749TGCCTCAGGCT-6.14
TFAP2C(var.2)MA0814.1chr5:135017738-135017749TGCCTCAGGCT-6.32
ZNF263MA0528.1chr5:135015412-135015433GAAGGATGGAGAGAGGGGAGT+6.11
Number of super-enhancer constituents: 1             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_11511chr5:135015148-135018160Placenta
Enhancer Sequence
GATAATGGAC TAAACCTCTG AAACTGTAGG CCAGCCCCCA GTTAAATGTT TTCTTTTTTA 60
GGAGTCAGGG TGTTTCTTCA CAGCAATACA ATAGTGACCA GGGCAATGAT ACATGCATTT 120
AAGCCCAGTG CCGGAAAGGC GGAGACAGGG GGATTCCCTG GAGCTCCCTG GCCAGCCAAC 180
GTAGCCTACT TGGCGATCCT CAGGGCAGTG AAAAAACATG CACACATAGG TGCATACGTG 240
TGCACTGGGA CTACACACAC ATACATGCAC ATGCGTGTGT GCACACAGAT GCAGGCATGT 300
GCACACACTT ACACACACAC ATAACGTGAA CAGAAGAAAG GAAAGAGAAA GTGAAGGATG 360
GAGAGAGGGG AGTAGTAAGA AAGGAAGGGA AATGACAAAG GGAGGGAAGA GAGAGAAGAA 420
AAGGAAGGTA CTGAGGGCTG GTGATATGGT TTAGAAAGTA AAGGAGCTTG CTGCCAAGCC 480
TGAGGACCTG AGTTCAATCC CCAGGCCCCA AATGGTAAGA GAGACCAACC CCAGCAAACA 540
GCCCTCCACA TGTGCATGCA GCACGCATAT GCTCCCTCTC AAAGACAGCG AGTAATAGTT 600
TTTAGAAAGA ACACATACTT ATAGAACCAG GAGCTGAGAA GATAAAATTA ATTTCCCAGA 660
TTCCATCCCA GTCTCAGTGT TGCAGCCATG ACTGAACTGG TCCCAGGGTT GGTTGCCTCT 720
TCCTTACCTC CTAGCCTGGT GGCCCTGCCC TAAAACAACA TTTCCAAGAC CCTGACCTCT 780
GGGGAACAGC GCCTGCTTGC TTCAACTAAC AAAGGAACAC ATGGAGCAGG CAGGAAAGAA 840
CCAAGCCAGC ATTCAGCCAG TCCCTGCTAC CCCAGCCAGG GACTGGAGGG GACCGGAAAG 900
GGGAGGGGGA GGGGAGAATG GTAGCAGGAA GAGGGGAGGA GGCAGAGGGC TGAGCTGGCC 960
CTCTGTGACT CAGCCGGGCT CTGGGACAGA GAATTGGTTG GGGGTGGGGT GGGGGAGGAC 1020
TTGGGAAAGC TGTGACATGT CCATACACTG GCCTCTGGCC ACAGTGCAGC TGATGGCTGA 1080
GGCCATGAAG TGAGAGCCTG CAGTCTGAAG CCAGTTTCAC TCCAAGAGGC CTTAGGATAT 1140
GAAGCCATGT GACAGTCCTT GGGGTTCTCA CCTATCTGGG ATACAGGTAG CACAGGCATG 1200
GTCAGCACAC AGTGATTCCA GCACGAGAGG CAGAGGAAGA AAGACTTCAA GTTCCAGGTG 1260
GACAAAATGG CCTAGCAAGT TTAGACAATT GCCACCAAAC CTGACGGCCT AAGTTGGATC 1320
CTCAGGGCTC AGGTGGTAGA AGGGCAAAAC TGATACATAC ATACACATGC TAAAATGTAA 1380
TAAAATAATA AACCAAGCTT GGAGTATAGC TGGGTCAGGA GAGGGCTTGC CTAGTATGCA 1440
TGAAGCCCTG GGTTCGATCC CCTGCCCTCC TAAACCAGGG TGGGCACACC TGTGATCCCA 1500
AAAGTAGGGA GGTGGGGTGG GAGGATCAGA AGTTCAGGGT TATCCTCAGC TACATAGTGA 1560
GTCTGAGGTC AGCCTGGGCT ATAAAAACAA TTTTAATCTC AGTGCTCAGG AGGCAGGGGG 1620
CTGGGGTCCT GGTGCCTGAA TTGGGAAGCT TGTAAAACCA GGAGTATCCC AGATACTTGA 1680
CAGAGGTCAG GAGGCCCATG TTACAACTCT CTGGTGACAC TGTTCACACA AGCATTGTCT 1740
GGGAACTTGG GTCTAACAGA AGCAACAGGC CCCTGTGTGC TGTCCTCAAT CGCCACTTAC 1800
TGGGAAGAAA CCCGAGCTCT GTTGCAGGGT TTCCATTTCA GCTGCCTGGG GGTGACCCGC 1860
TCACCACAGG ACAGTAGGAG ACAGGGCCCA GGATTCTGGC CCAGTGAATG CGGTAGTGGC 1920
CTAGAGAGGG GAACAGTGCC AAGTAGAGCA AGAGAAAGCC CAAGTCCTAT GAGGTAATAT 1980
GGCCCCGGGG CAGGGAAGAG GGCAGCAGGA TGTAGGCACC ATGGCCCAGA ACTCCAGCCA 2040
AGCCGCTGGC CCTGGCTCAT TCACTGGGCA CTTCTACCAG GAGATGGTCC CTCGATAAGG 2100
GTGACACTAG ACACTAGACT GACACTAGAC ATGCCCAGCC TCTTTAAAAA ATATATATGT 2160
ATATGTATGT ATATGTATGT ATATATGTAT ATATATGTAT GCATACACAT ACATATGTGT 2220
ATATATAGGG GGGAGGGATA TATGCATGCC CTATGCACGA AGGGTTCCAA CTTGGCAGCA 2280
ACTTGGGGGG TGGGGTCATC TGGTCATTTC TCTCCTTCCA GAAGAAGTCT TCAGGGCTCG 2340
AACTCAGGTC TTCAGGCTTG GCAGCAAGCC CCTTTCCCTG CTGAGCCAGC TTGAGTCCCT 2400
TCTTTTCCAT ATTTGTTATA TAGCCCAAGT TGGTCTCAGG CTTTCCATCC TCCTGCCTCT 2460
TTCTCCCCAG TGCTGAGATT AAGGGCCCAG GACACCATTC TAACTGCATT TGGCTGAGGA 2520
TCAGGGAACA CAGGCAGCTT GCCGTGGGTC ACCGAGAGGT CACCCGATTC CATGACCTCC 2580
CAGCTGAAGA CAAGCAAAGG CTGCGTCTGG GACGGTCCCT CCCTGTGAGT CTTGCCAACT 2640
TCCAGGCAAA AAACAAAGTC CAAGTTTTAA ACCAGCTGTG CCTCAGGCTC GGGAGAATGG 2700
GAGAGATGGA GTCCATCTGC CTGGGTCCCT GTCCCCACCC TTCTCCCATC ACTCTCCCCT 2760
GGTCACCAGG GTCAGCAGGA TGCTGGGAAC AGCCAGGCCC AAGCCTTACA CAGCTGTGTA 2820
ACTCCTGCCA AGCCCACGGT GAAACATGTG AAGAGTGTGA CAGAACAGAT AAGGAAACTG 2880
GTTGGGGTCT TCGGACCCCT TGACAGTGCC TAGAGGCCTG ACCACCATGC GGAGAGGGAC 2940
GGCAGCAGAG ACCAGCGGGA GGCTCTGGGA GAGCCTCCAA GCCAAGGAGC AGCAGCAGCT 3000
AGTCCCTATG CAGACATGAC TTCGGGGTGG GGGGATGGAT GAAGCTGGGA AAAGCAAGCT 3060
GGGGGTGGGT GGCAGACCAG CAGCAAACAG CCCCCCTCTC CCAATCAACC GCCAGCTGTG 3120
GGGTTTATTT GGTTGGTTGT TTGCTTGCTT TTTGATTTGT GAGACAGTCT CTTTAGTTAG 3180
CCCTGGCTCT CCTGAAACTC ATGGAGATAG GCTAGCCTCC AACCGACAAA AAATCTGCCT 3240
CCCCAGTGCT GGGATAAAAG GTGTGTGTAC TACCACCCCT CTGGGGTTTT TGTTTGTTTG 3300
TTTGCTTAAT TATTTATTTT TATTTTATGT GCATTGGTGT TTTGCCTGCC TGCATGTCTA 3360
TGCGAGGGTG TCAGATCCCC TGGAACTAGA GTTACGGACA GTTGTGAGCC ACTATGTGGT 3420
TGCTGGGAAT TGAATTCAGG TCCTCTGGAA GAGCAGCCAG TGCTCTTAAA CACTGAGCCA 3480
TCTCTCCAGT CTACCTTTTT GCTTGTTTGT 3510