EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM113-19629 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Neural_tube_embryo 
Coordinate
chr5:116909020-116911730 
TF binding sites/motifs
Number: 11             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Alx1MA0854.1chr5:116911249-116911266AATAATTAATTAAATCC-6.18
Alx1MA0854.1chr5:116909698-116909715CAGAATTAATTAATTCT-6.2
Alx1MA0854.1chr5:116909699-116909716AGAATTAATTAATTCTT+6.92
Foxd3MA0041.1chr5:116909776-116909788AAACAAACAAAC-6.32
LMX1BMA0703.2chr5:116911254-116911265TTAATTAAATC-6.02
Lhx3MA0135.1chr5:116909700-116909713GAATTAATTAATT+6.29
Lhx3MA0135.1chr5:116909701-116909714AATTAATTAATTC-6.29
Lhx3MA0135.1chr5:116911248-116911261AAATAATTAATTA-6.71
Lhx3MA0135.1chr5:116911251-116911264TAATTAATTAAAT+6
POU6F1MA0628.1chr5:116909702-116909712ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr5:116909702-116909712ATTAATTAAT-6.02
Enhancer Sequence
GACACGGTTC TGTTTTATGT CGTATAGGTG GTTTCTATAC TTTCAGGTCG GAGGGATACT 60
TTTAATAATA AACCTGTCAT TTGGGGACAT CTGTGCCTTT TAAAGATCTT CCCTCCTCCC 120
CAGCTCCAGG CTCCATCTTT TCAGAGTGTC CAGTTCACTC TGGGAGAAGA GGGCTTGAAG 180
TCATAGTGCG AGCAGCCAAA AGCAGAGCTA GTACTGGGGA AAGAGCAGGT TTGACCGGGA 240
GACTTTGTGT TGTGACGAGT GACAACAGAG GCGGTCTGTC TTCCTGCCTT TGTCCTGTCA 300
TCTCTGAACA TCTCCATAAC CAGATATTCC CCCATGACAC TCAAGACACA ATCACTCCCT 360
GCCCAATATC ATCATGATTG GATGGCTCCT AATTTTGCTT TGTTGGCACA TGATTGAGCT 420
ACTAGCTCCC TTACAGTCCA TCTTTGATGA GTTCTTCATC CAGTAGTGAT GTTCATGTGT 480
ACATGGCTCC CTGATCATGC ATAACAGCCT ATACAATGCC CTCAGGTCTC TCACAGATTC 540
ATCACCATCC GGCAATAATG CCTGGTAGTG CTCAGGATTC CCAGAACGCT CAGACTAGGG 600
TTCTCTTCTT TGGGCTGCCC TCACCTCGTC CTCCATCTCA ACCTTAATTC TTCCTGTGAA 660
TTAATACAGG AATTAATTCA GAATTAATTA ATTCTTAATT CTGTTCTGTG GCGAATAGCA 720
AAAGGAAAAC AAAACCAACC AACCAACCAA TCAACTAAAC AAACAAACAA AAAACGGGAG 780
CCCAAGAGTT GGCCAATGAC CAAATAAGAT AGTCTTATCT AACCTGGAAT CCCAGGAACT 840
GAGGGAAGGA TTTGAGGGCT AATGGTTTAT TTTGAGAGAT GAAAGAAAAC CTTGGAGGGA 900
AGAAAGAAAG AGAACCATAT GAGCAAGCAC CTGTAAAAGG TCTGCGGTTA ATACACAGTG 960
GGCAGTGCAG CCCAACCCAA AGGAGGACTT TGGGAATTTG TGTAGAATGT ATATCGTAGA 1020
CTTAACATTA ACCCAAGAGG GAGTGGGCTG GGGACATATG CACCAGCCAT TCAATACTCA 1080
TGGGAAAAAC TGTCCCTAAG GTATGCTAAT TCCTGTCTGT GTTCCCAGTC AGGCAAAGTG 1140
GGCCCTGGCA ACCAGAGGAT ACCATCTGGA AGCTGCAAGT CAGCTGTGAG CCCTGAATTA 1200
GGGAGAAGGA GGGGGATGTG TGGAACGTGT TTGCTTCAAT GTATCCAGTT GATCATGGAG 1260
ATGGGTCAGG CCACTTGCAT TGTGACACAG CTAGGCTTTC TTTAGCCCAT TTAGTGTGTT 1320
TGAAAATAAA TGTGAATGGA CTTCCAATGT ATGCTGAGCA GTGAGGGTTC ACACAACAAC 1380
CCCACTTCTG GTTTTTATTG GACAATTAGA TCTGGGTCCA TATTCCCCCA GAAATGCTTT 1440
GTGTGCTGGG TCCTTAGGGT CAGTACTATT CACATATACT AGCGGTGGGG CCCTTGAGAT 1500
ATTTGAGAAC TTCTGCTCTA AAAGTCCGAG CGCCTCAGAA GGAAGATGAA CACAGCACAC 1560
CTGCTCAGTT TCCTTTCTCC CTTTTAGAAC TAGGAAATAT ATCAGGCTTC TCTCTCATCT 1620
CAATGCTTTA AACCCTTGTT GGACTGTTGC CAATCAAAGG AACCAGGAGA CACTAAGCCA 1680
CAGTCAGACT CCGCATACAA GGGAACCCCT GCTACTCATT TATCATTGCT GTTTGTGTAT 1740
ACGTACGTGC TGTTAGAACT CAGAGGTCAA CACTGGGAGT CTTCCTCAAT CACTTTCCAC 1800
CTTAGTTTGG AGGCAGGGTC TCTCACTGAG AGCATCAGTT CAGCTACACT GACTGAGCAG 1860
GAAGCCCCAG GGACCCTCTG GTGGCTACCT CCCCAGTTCT GGGGTCACAG GAAGGTGCTG 1920
CAGCTCCTGG CTTTGCACAT GGATACTGGC TATCAGACTT GGGACCTCAC GCCTGTATGG 1980
CAGGCGCTCT ACCAACTGAG CCACCTCCAC AGCCCTTACT TGTTCTCCTT ATTAGGACAA 2040
ATTGCTTTCC GTGATTTCAT GGCCACTGCA GGGCAAGGCT AACAAATGTC TCTCCTTTAT 2100
CCTTCCATCA GTTCTGACGA CATAAACCCT CCAAATTCTT CTCTTCCTTC AGCTTAGGAG 2160
TCAGTCATGG GCTCGCTTCA TCTCCATGTT TCTTAACACA CTCGATGTTA ACACTTGGGG 2220
GGGGTTTCAA ATAATTAATT AAATCCCCTC AGCAGGAGCC CTAGCTCCCC CGAGTTTCTC 2280
TGGAATACCT CAGCCCTCCA GGGGAGCCGG CACAGCTATT TATTGTTTTT GTTTCAAATC 2340
ATTATTTAAT CAAGAACGGA GAGGGGGGAA AGGCAACCTC TCACTTACAC TTCAAAATTT 2400
AATTTCGGCT GAATTCCGAG ATCAAGAGGC AGCTCGGTCT AATAGGTTAC AAAAATACAA 2460
TCAAGAAGAG AATTTCAATT AAACTGAACA AGTCCATTTA CGGGGCTTCG AATGGCCCCA 2520
TGGAGAGCGG CAGCTATAAA TTGCTTCTTG CTTCTCTGCC ATATGGGGAG CTGGGCGAGC 2580
TCACATGCTA CAAGGCAGAG AGCTTGCAGC CAGAGGGTCC TGTTCGTTCC TTAAGAAACC 2640
AATCCCTTTG CTTCTCTAAG ACAGAGGGAC TGTTTTCCTT GGTGACATTC CTCTTTCTTT 2700
GACACTAATT 2710