EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM113-18965 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Neural_tube_embryo 
Coordinate
chr5:43742840-43745480 
TF binding sites/motifs
Number: 6             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
IRF1MA0050.2chr5:43744617-43744638AAAACAAAACAGAAAGCCAAG-6.2
Nr5a2MA0505.1chr5:43742900-43742915AACTTCAAGGCCAGT+6.21
TCF3MA0522.2chr5:43745223-43745233AACACCTGCT+6.02
TFAP2B(var.2)MA0812.1chr5:43743885-43743896TGCCTCAGGCT-6.14
TFAP2C(var.2)MA0814.1chr5:43743885-43743896TGCCTCAGGCT-6.32
ZEB1MA0103.3chr5:43744240-43744251GGGCAGGTGGG-6.14
Enhancer Sequence
ATTGGGGAGC AAGTATATGG CGGTCAGGAC AACTTTCGGG AGTTTGTTCT CTCTTTCTAC 60
AACTTCAAGG CCAGTATTGA ACTCAAATTC TCAGGCTTGG CAGCAAGTGC CTTTACCCAC 120
TAAGCCAGCT TACTGGCTCC ACCTGTCAGT TTTCTGCCTC CTTTGTTCAC GATTGTAGCT 180
CCACACACTT AACCTGTCCT TTTCTCTGGT GTCCATTGAA GCAGGAAAAT TCTACTCTAC 240
TCTCTCCTCC TCTAGGAAGG CTTAATAGAT TTCTCTAGAC AGTAATGACT ATTCCTTCCT 300
GTGTTCCCAG TAAAAGAGGT GATATGTCCT TATGAGACAC ACACACACAC ACACAAACAC 360
ACACACGATG TATTAGTAAA ATATGCATGT GAAACATGTA AAAATTGGTA AGAGATAGTT 420
GAGATAGTAA ATATAGACAC ACATGCATAC ATGTTACATA TGTGTACATA TACCTACATA 480
CATACACACA TACATACATA TATAAAATCT CCTTGAATTC TTACAGCAAC TCTACATCAT 540
TAGCCCCAAG CTTTCTGAAC AAAAATTCAG GATTCAGCTT CTAAAGACAC ACCAAGACTC 600
AAACATAGGT CTCCTGTTTC CATCAATAAG AAAATGTCTT GGTTATAAAG CCTGTGACAT 660
CTGACTCACT TACCTAACTG CTTTCCCATC TATCGGGGCC TAACTCTGCC CAGGAAATCC 720
AAGGCACATC TGTTGAATAG AATTAATGTG AAGAGGGCTG GCAATTAGAA GGCTTTGGAG 780
ACCCAGCTCT TGGATGAAGG GACAAGGTGC TTTGGAATAA AAGATGAATT AGGTAAGAAG 840
GAACCAATTA GCAGAGGATG CTACAACCTA TGATAAGGAG CTTTAATTTG ATAGGAGACA 900
ATTGGGAGTC ATTCATCGTG GAGCTGGAGA AAGGCAGTGA CAAGCCCCTA ACGACACTCA 960
AGGGCCTTGG AAACCTTTAA TTGCTGCCTC CAATTCTACT TTTGAGTAAA AATGGTGACA 1020
TAGAGGATAA GCTCACATAG CCATATGCCT CAGGCTGTTG TGACCACAGC AAGGTCACTA 1080
GAGGATCATG TGCCCCCTTA TGTACATAGC AGTAATGCTA CAGAGGAGTA GGTGTCTCTT 1140
TCCCTGGTGT CCCTGAACTC AGGTTAAGTA AGGCCTTCTA TTTCTTCTTC ACAATGTCTT 1200
ACATGGCTCC AGGGTTTACG AGGCTCCAAC GAGGCTCTGG GGTGGGGCAG GCAACCACCA 1260
CTGCCACTTC TGACCCATCA GCATCTTCTG CTCCCTAGCC CACTGCACTA ACTAACCCAT 1320
GCCCGAAGAA ACATTTACAG CTCTCAGAAT CTCAGTTTCA GAGGCAGGTG TTTATAACCC 1380
TCCTCTCTAT CTAACTTCAA GGGCAGGTGG GTGTGTCCAG GAGAAGAGAG AGCTGGAAAA 1440
TTCTGCTGAT GAAAATGTCA AGGTTGTTTG GAGGTTTATC TTTTTCTAAG CTTGGGTCCC 1500
TCCATGTCTT TCATCTGCCG CAAGACATGA TGCCGTCCAG TTCCTGGGCC TGGCCTTGCA 1560
CAGTCAGTGA GAGGCGTCAG CAGAGGAGAC TCTGGCTGTT CAGGACAATA GGCCCTTTCT 1620
GGGCAGAGAA TGCAGCGCAG TGTTGTATTA TTTGTGTGGT GAAGGCACAC AACCACTCCC 1680
ATTCCACCAG CCACGTGATA GTACTAACTG CTTAGATGCC AGGGCGATAA GAAGCAAAAA 1740
GCTGGATTCC CCAACCTGAA AAGTAAGAAA ACCAAGTAAA ACAAAACAGA AAGCCAAGTC 1800
ACATCTGATA AAAAGAAAAG GCAGCCGAGG TGTGAGTGGG CGGTGGGGGT TGGCCTCCGA 1860
AATGGCACCA GGTGCATTAA TTACACTTGA TTGCATGTTG GTTTATGGCT GCGGTCACTA 1920
GTGTGCCGCA TTCTGGCCCT GCAGCAGCTG GTCTGAAAGA TATCCTTGGT ATTTCGTTAA 1980
GCAAGATGAA TATTGGCCAG ATGGTGACTT CACGAGGACA TAATTCACGT AGCATTTTCC 2040
TGCCCCGACA CAGGTTTCTC TGAAGGAATC TTGAATGACA CCCCCCGAAC AAAACAGAAC 2100
AAGAAAACTC AAAAGCCCCA AGAAGGCTCA GCCGTAAGTT GAAGATTAAT GGTCTCGACG 2160
GTGTCGCTGA CAGGAGCCCA AATGGCAGTG GGAGACCTGG CTGCACACTG CGGATCTTGC 2220
CAACCCATCT CCCTGTCGCT TGCAGAATGA ACTGACATCA CCCTTGGAGT CTCAGATTCA 2280
CTCTGTAGGG GGGAGGGCTG GCAGAGTCCC GAAATGACAT GCCACAGGAA ACTGGGTCAC 2340
TTTTTTTCTT TTTAATTAAT TTTGTATAGT GTTGGTCTTT GTCAACACCT GCTTTCTCTG 2400
TAATTTGATT GTGATGGTGA GCAAGGAAAT ATATGCCTAC ACATACACAC ATACATAGTC 2460
TGGGTTTTCA CACATTGGGC TGGTCTTCCT GAGTGGGAGA AGGAAAAAGA TCATCTTGGA 2520
AACTCTTGAC ATTGCCACAC CAAGGAACAC TGGTAGAACC AGGGCACCAG CTGAGCAAGC 2580
AAATTGGTTC AGCTCTGGGT TGCCTTAGAG AAAGTTCTTC CCTGGGAGTT ATAAGTAACT 2640